Структура и свойства белковНИР

Proteins structure and function

Источник финансирования НИР

госбюджет, раздел 0110 (для тем по госзаданию)

Этапы НИР

# Сроки Название
1 1 января 2016 г.-31 декабря 2016 г. Структура и свойства белков
Результаты этапа: Проанализировано влияние природы предшественников на продукцию полимеров, осуществляемую Azotobacter chroococcum 7B. Показано, что меняя состав и концентрацию предшественников, удается получать разные по длине и свойствам полимеры, которые можно использовать для выращивания культур клеток. Осуществлен синтез полимеров поли(3-гидроксибутирата), поли(3-гидроксибутират-ко-3-гидроксивалерат) и поли(3-гидроксибутират-ко-3-гидроксивалерат). Исследованы структура и свойства полученных полимеров. Установлено, что указанные полимеры легко подвергаются биодеградации и могут быть применимы для различных биомедицинских целей. Исследован механизм действия нового антибиотика амикумацина А. Установлено место связывания амикумацина на рибосоме и показано, что он связывается с рибосомальной и информационной РНК. Определена структура комплекса амикумацина А с рибосомой дрожжей с разрешение 3.1 ангстрем. Показано, что раковые клетки более чувствительны к действию амикумацина, чем нормальные клетки. Поэтому указанный антибиотик может быть в будущем использован в качестве препарата для лечения злокачественных перерождений. Исследован процесс сканирования РНК рибосомой. Ранее считалось, что узнавание старт кодона AUG в последовательности мРНК является необходимым и достаточным условием для начала трансляции. Эта точка зрения была опровергнута и было показано, что, если заингибировать ГТРазу, то рибосома продолжит сканирование и будет искать следующий старт-кодон. На самом деле определение точки инициации трансляции определяется гидролизом ГТР фактором инициации eIF5 и присоединением большой субъединицы рибосомы к комплексу мРНК-малая субъединица рибосомы. Белок СD150 является костимуляторным рецептором, экспрессируемым на многих гемопоэтических клетках. Избыточная экспрессия CD150 может приводить к аутоиммуным реакциям и лейкемии. Проанализировано влияние нескольких транскрипционных факторов на экспрессию гена CD150. Установлено, что наибольшее влияние на экспрессию этого белка оказывает ранний фактор-1 В-клеток (EBF-1). Проведено исследование мРНК вируса иммунодефицита человека и предпринята попытка ответить на вопрос, содержит ли вирусная мРНК так называемые участки IRES, т.е. участки посадки мРНК на рибосому, не зависящие от процессирования и РНК и наличия кэпов. Установлено, что в случае мРНК вируса иммунодефицита человека роль участков IRES в регуляции трансляции ничтожно мала. Подготовлен и опубликован обзор, посвященный выявлению участков IRES в структуре мРНК и обсуждаются проблемы, касающиеся независимой от кэпирования и зависящей только от наличия IRES транскрипции. Изучено влияние автоантител на выявление и определение в крови больных с инфарктом миокарда компонентов тропонина. Установлено, что автоантитела способны взаимодействовать с компонентами тропонина, находящимися в составе полного тропонинового комплекса, освобождающегося из кардиомиоцитов при инфаркте миокарда. Наличие автоантител может приводить к занижению концентрации тропонина I в крови больных в 5-10% случаев. Для того чтобы избежать указанного эффекта необходимо использовать антитела специфичные для эпитопов, отличных от эпитопов, узнаваемых автоантителами. Натрийуретический пептид широко используется при диагностике различных сердечно сосудистых заболеваний. Однако, имеющиеся коммерческие иммунохимические наборы зачастую дают сильно различающиеся данные, что не позволяет с точностью определять концентрацию натрийуретического пептида в крови. Были созданы различные калибраторы, в качестве которых использовали натрийуретический пептид, полученный в бактериях, аналогичный пептид с гистидиновымы хвостами, химически синтезированный пептид, негликозилированный пептид, а также гликозилированный пептид полученный в эукариотических клетках и гликозизированный пропептид, полученный в эукариотических клетках. Установлено, что гликозилированный пептид, полученный в эукариотических клетках, является наилучшим и самым надежным калибратором. Изучена доступность про-BNP (пронатрийуретический пептид В) для неприлизана. Установлено, что про-BNP достаточно устойчив к неприлизину и поэтому использование фармакологических препаратов, ингибирующих активность неприлизина не должно сказываться на определении BNP в крови больных с различными сердечно-сосудистыми заболеваниями. Это обусловлено тем, что в крови этих больных в основном циркулирует пропетид. Тем не менее, при разработке иммунохимических методов диагностики желательно использовать такие антитела, которые узнают эпитопы, которые не разрушаются при действии неприлизина. Исследована роль различных посттрансляционных модификаций на структуру и свойства ключевого фермента гликолиза глицеральдегид-3-фосфат дегидрогеназы. Проанализированы процессы фосфорилирования, гликирования, окисления, глутатионилирования, гомоцистеинилирования на ферментативную активность и агрегацию фермента. Установлено, что модификация SH групп сопровождается ингибированием ферментативной активности и диссоциацией кофактора. Оба эти процесса способствуют агрегации фермента и его транслокации в ядро, следствие чего может быть развитие процессов апоптоза. Агрегированная глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназа способна взаимодействовать с синуклеином и амилоидогенными пептидами, влияя на образование амилоидных агрегатов и ингибируя активность внутриклеточных шаперонов. Установлено, что малые молекулы, препятствующие агрегации глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназы, могут применяться в терапевтических целях при моделировании процессов, происходящих при окислительном стрессе. Установлено, что мягкое окисление ослабляет взаимодействие глицеральдегид-3-фосфатдегирогеназы с изатином, компонентов входящим в состав некоторых лекарственных препаратов.
2 1 января 2017 г.-31 декабря 2017 г. Структура и свойства белков
Результаты этапа: Проведено исследование структуры и физико-химических свойств нескольких мутантных форм двух малых белков теплового шока, экспрессия которых коррелирует с развитием врожденных заболеваний человека. Установлено, что анализируемые мутации сопровождаются изменением термической стабильности и устойчивости к протеолизу. Анализируемые мутации зачастую сопровождаются изменением взаимодействия малых белков теплового шока с белками-партнерами и белками-субстратами, что в конечном итоге может сопровождаться накоплением частично денатурированных белков в клетке и к развитию различных патологических процессов. Получены данные о структуре полноразмерного малого белка теплового шока, что создает предпосылки для понимания механизма функционировании этой группы белков и в будущем для разработки фармакологических соединений, способных регулировать активность этих белков.
3 1 января 2018 г.-31 декабря 2018 г. Структура и свойства белков
Результаты этапа: Выявлены особенности использования двух систем, направленных на определение маркеров сердечно сосудистых заболеваний. Установлено, что протеолитическая деградация тропонина I, освободившегося в кровь, не сказывается на эффективности его определения моноклональными антителами, разработанными в нашей лаборатории. Установлена роль гликозилирования в протеолитической деградации белка , связывающего инсулиноподобный фактор роста. Проведенные исследования позволили приблизиться к пониманию роли N-концевого домена в формировании олигомеров малых белков теплового шока и показать, что консервативный участок играет разную роль в функционировании малых белков теплового шока, относящихся к двум разным подсемействам. Опровергнута бытовавшая в литературе точка зрения, согласно которой метилглиоксаль избирательно модифицирует определенные участки в структуре малого белка теплового шока HspB1 и при этом в клетке накапливается HspB1, содержащий в своем составе аргпиримидин. ИСТИНА 3
4 1 января 2019 г.-31 декабря 2019 г. Структура и свойства белков
Результаты этапа:
5 1 января 2020 г.-31 декабря 2020 г. Структура и свойства белков
Результаты этапа:
6 1 января 2021 г.-31 декабря 2021 г. Структура и свойства белков
Результаты этапа:

Прикрепленные к НИР результаты

Для прикрепления результата сначала выберете тип результата (статьи, книги, ...). После чего введите несколько символов в поле поиска прикрепляемого результата, затем выберете один из предложенных и нажмите кнопку "Добавить".