Разработка соединений двойного действия – ингибиторов сигнального пути Wnt для терапии рака толстой и прямой кишкиНИР

Development of the dual inhibitors targeting Wnt signaling as colorectal cancer therapeutics

Источник финансирования НИР

грант РФФИ

Этапы НИР

# Сроки Название
1 11 сентября 2018 г.-31 августа 2019 г. 2018-2019 Разработка соединений двойного действия – ингибиторов сигнального пути Wnt для терапии рака толстой и прямой кишки
Результаты этапа: На основе имеющихся экспериментальных данных были построены надежные пространственные молекулярные модели ферментов-мишеней, а также фармакофорные модели и модели связи структура-активность для их ингибиторов. С использованием этих моделей проведен широкомасштабный виртуальный скрининг более 2 миллионов коммерчески доступных соединений и с помощью многоэтапного анализа отобраны десятки перспективных структур. В результате обширных экспериментальных исследований были отработаны методики определения активности in vitro для танкиразы и PI3K и ex vivo для танкиразы, а среди семи отобранных соединений найдено 2 активных ингибитора танкиразы, один из которых проявил активность в наномолярном диапазоне концентраций и является перспективным для дальнейших исследований. Параллельно индийской группой осуществлялась разработка синтетических подходов и синтез потенциальных ингибиторов танкиразы и PI3K, отобранных по результатам выполненного российской группой молекулярного моделирования, а южноафриканской группой разрабатывались полимерные наносистемы с конъюгированными антителами для облегчения доставки соединений-кандидатов к биомишеням. Для прогнозирования активности ингибиторов танкиразы применен новый подход к прямому анализу траекторий молекулярной динамики комплексов лиганд-мишень с помощью глубоких нейронных сетей. В высокорейтинговом журнале опубликована совместная статья. План первого этапа проекта успешно выполнен.
2 1 сентября 2019 г.-31 октября 2020 г. 2019-2020 Разработка соединений двойного действия – ингибиторов сигнального пути Wnt для терапии рака толстой и прямой кишки
Результаты этапа: Проведен анализ характера связывания ингибиторов-кандидатов с биомишенями методами молекулярной динамики. Уточнены фармакофорные модели и модели связи «структура–активность» для ингибиторов танкиразы и PI3K на основе полученных экспериментальных данных биологических испытаний. Проведена оптимизация структур, отобранных по результатам биологических испытаний соединений, с целью улучшения их активности, а также фармакокинетических свойств и профиля токсичности. Выполнен дизайн потенциальных двойных ингибиторов танкиразы и PI3K с учетом синтетического задела зарубежных партнеров. Определена ингибиторная активности в отношении танкиразы для 11 соединений in vitro с применением коммерчески доступных наборов реагентов. Отобраны ингибиторы-кандидаты для дальнейшей оптимизации структуры. Исследованы возможности определения активности танкиразы ex vivo в органах и тканях подопытных животных.
3 1 ноября 2020 г.-30 сентября 2022 г. Разработка соединений двойного действия – ингибиторов сигнального пути Wnt для терапии рака толстой и прямой кишки
Результаты этапа: Уточнены модели связывания ингибиторов-кандидатов с биомишенями и модели связи «структура–активность» для ингибиторов танкиразы на основе полученных экспериментальных данных биологических испытаний. Выполнены поиск и оптимизация структур перспективных ингибиторов. Определена ингибиторная активность в отношении танкиразы и PI3K для большой серии предложенных соединений in vitro с применением коммерчески доступного набора реагентов, а также ex vivo по активности эндогенной танкиразы в органах и тканях подопытных животных. Найден ряд соединений с высокой активностью, отобраны перспективные соединения-лидеры.

Прикрепленные к НИР результаты

Для прикрепления результата сначала выберете тип результата (статьи, книги, ...). После чего введите несколько символов в поле поиска прикрепляемого результата, затем выберете один из предложенных и нажмите кнопку "Добавить".