ИСТИНА

Якимов Александр Павлович пользователь

кандидат физико-математических наук с 2019 года

Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого

Соавторы: Никифоров А.А., Светлова М.П., Nerinovski K., Куликова В.А., Ходорковский М.А., Соловьева Л.В., Shabalin K., Кропотов А.В., Khodorkovskii M.A., Нериновский К.Б., Rychkov G.N., Ziegler M., Khodorkovskiy M.a. показать полностью..., Kulikova V., Migaud M.E., Шабалин К.А., Migaud M., Vedyaykin A.D., Петухов М.Г., Artamonova T.O., Dagkessamanskaja A., Dikiy A., Dölle C.g., Ghilarov D., Ilatovskiy A., Konevega A., Kreneva R.A., Linkova N.S., Metelev M., Nerinovski K.a., Niere M.d., Perumov D.A., Pobegalov G.E., Podkorytov I.S., Quéval R., Ramsay E.S., Redpath P.e., Severinov K., Shavlovsky M.M., Shumilina E., Skrynnikov N.R., Zabrodskaya Y.A., Ziegler M., Знобищева Е.А., Исангалин Ф.Ш., Комарова Е.С., Остерман И.А., Петухов М.Г., Поликанов Ю.С., Сергиев П.В., Серебрякова М.В., Судницына Ю.С., Тимковский А.Л., Травин Д.Ю., Уткина И.В., Федечкин С.О., Фирсанов Д.В., Хабибуллина Н.Ф., Хавинсон В.Х.

28 статей, 5 докладов на конференциях, 26 тезисов докладов, 1 патент, 1 свидетельство о регистрации прав на ПО, 1 диссертация

Количество цитирований статей в журналах по данным Web of Science: 73, Scopus: 79
РИНЦ:

IstinaResearcherID (IRID): 575216083

ResearcherID: J-3336-2013

Scopus Author ID: 57196822927

ORCID: 0000-0003-0462-1157

Деятельность

• Статьи в журналах

  • • 2023 Strain Streptomyces sp. P-56 Produces Nonactin and Possesses Insecticidal, Acaricidal, Antimicrobial and Plant Growth-Promoting Traits
    • Boykova Irina, Yuzikhin Oleg, Novikova Irina, Ulianich Pavel, Eliseev Igor, Shaposhnikov Alexander, Yakimov Alexander, Belimov Andrey
    • в журнале Microorganisms, издательство MDPI (Basel, Switzerland), том 11, № 3, с. 764 DOI
  • • 2023 Влияние стимуляции и подавления биосинтеза NAD+ на поддержание плюрипотентности эмбриональных стволовых клеток мыши
    • Антипова М.В., Куликова В.А., Соловьева Л.В., Кропотов А.В., Светлова М.П., Якимов А.П., Нериновский К.Б., Бахмет Е.И., Никифоров А.А.
    • в журнале Цитология, издательство Наука (СПб.), том 65, № 3, с. 273-282 DOI
  • • 2022 A new insight into RecA filament regulation by RecX from the analysis of conformation-specific interactions
    • Alekseev Aleksandr, Pobegalov Georgii, Morozova Natalia, Vedyaykin Alexey, Cherevatenko Galina, Yakimov Alexander, Baitin Dmitry, Khodorkovskii Mikhail
    • в журнале eLife, том 11 DOI
  • • 2022 Purine nucleoside phosphorylase controls nicotinamide riboside metabolism in mammalian cells
    • Kropotov Andrey, Kulikova Veronika, Solovjeva Ljudmila, Yakimov Alexander, Nerinovski Kirill, Svetlova Maria, Sudnitsyna Julia, Plusnina Alena, Antipova Maria, Khodorkovskiy Mikhail, Migaud Marie E., Gambaryan Stepan, Ziegler Mathias, Nikiforov Andrey
    • в журнале Journal of Biological Chemistry, издательство American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc. (United States), том 298, № 12, с. 102615 DOI
  • • 2022 Single-molecule characterization of compressed RecA nucleoprotein filaments
    • Alekseev Aleksandr, Morozova Natalia, Vedyaykin Alexey, Yakimov Alexander, Khodorkovskii Mikhail, Pobegalov Georgii
    • в журнале Biochemical and Biophysical Research Communications, издательство Academic Press (United States), том 614, с. 29-33 DOI
  • • 2021 Equilibrative Nucleoside Transporters Mediate the Import of Nicotinamide Riboside and Nicotinic Acid Riboside into Human Cells
    • Kropotov Andrey, Kulikova Veronika, Nerinovski Kirill, Yakimov Alexander, Svetlova Maria, Solovjeva Ljudmila, Sudnitsyna Julia, Migaud Marie E., Khodorkovskiy Mikhail, Ziegler Mathias, Nikiforov Andrey
    • в журнале International Journal of Molecular Sciences, издательство MDPI (Basel, Switzerland), том 22, № 3, с. 1391 DOI
  • • 2021 Targeting evolution of antibiotic resistance by SOS response inhibition
    • Yakimov Alexander, Bakhlanova Irina, Baitin Dmitry
    • в журнале Computational and Structural Biotechnology Journal, том 19, с. 777-783 DOI
  • • 2020 Single-Molecule Insights into ATP-Dependent Conformational Dynamics of Nucleoprotein Filaments of Deinococcus radiodurans RecA
    • Alekseev Aleksandr, Cherevatenko Galina, Serdakov Maksim, Pobegalov Georgii, Yakimov Alexander, Bakhlanova Irina, Baitin Dmitry, Khodorkovskii Mikhail
    • в журнале International Journal of Molecular Sciences, издательство MDPI (Basel, Switzerland), том 21, № 19, с. 7389 DOI
  • • 2020 Single-molecule analysis reveals two distinct states of the compressed RecA filament on single-stranded DNA
    • Alekseev Aleksandr, Serdakov Maksim, Pobegalov Georgii, Yakimov Alexandr, Bakhlanova Irina, Baitin Dmitry, Khodorkovskii Mikhail
    • в журнале FEBS Letters, издательство Elsevier BV (Netherlands), том 594, № 21, с. 3464-3476 DOI
  • • 2020 Time machine: Can a dye from 1928 be re-purposed for modern, fluorescence-based detection of amyloid-like fibrils?
    • Antimonova O.I., Grudinina N.A., Egorov V.V., Ilyin V.V., Zabrodskaya Y.A., Ramsay E.S., Shabalin K.A., Protasov A.V., Yakimov A.P., Polukeev V.A., Shavlovsky M.M.
    • в журнале Dyes and Pigments, издательство Elsevier BV (Netherlands), том 172, с. 107863 DOI
  • • 2019 Degradation of Extracellular NAD⁺ Intermediates in Cultures of Human HEK293 Cells
    • Kulikova Veronika, Shabalin Konstantin, Nerinovski Kirill, Yakimov Alexander, Svetlova Maria, Solovjeva Ljudmila, Kropotov Andrey, Khodorkovskiy Mikhail, Migaud Marie E., Ziegler Mathias, Nikiforov Andrey
    • в журнале Metabolites, издательство MDPI (Basel, Switzerland), том 9, № 12, с. 293 DOI
  • • 2019 Systematic search for structural motifs of peptide binding to double-stranded DNA
    • Kolchina Nina, Khavinson Vladimir, Linkova Natalia, Yakimov Alexander, Baitin Dmitry, Afanasyeva Arina, Petukhov Michael
    • в журнале Nucleic Acids Research, издательство Oxford University Press (United Kingdom), том 47, № 20, с. 10553-10563 DOI
  • • 2018 Analysis of NAD and NAD-Dependent Protein Deacetylation in Mouse Tissues
    • Solovjeva L.V., Panchenko A.V., Shabalin K.A., Nerinovski K.B., Yakimov A.P., Gubareva E.A., Svetlova M.P., Mudrak O.S., Khodorkovskiy M.A., Nikiforov A.A., Kulikova V.A.
    • в журнале Cell and Tissue Biology, издательство Maik Nauka/Interperiodica Publishing (Russian Federation), том 12, № 6, с. 491-495 DOI
  • • 2018 NAD Metabolome Analysis in Human Cells Using 1H NMR Spectroscopy
    • Shabalin Konstantin, Nerinovski Kirill, Yakimov Alexander, Kulikova Veronika, Svetlova Maria, Solovjeva Ljudmila, Khodorkovskiy Mikhail, Gambaryan Stepan, Cunningham Richard, Migaud Marie, Ziegler Mathias, Nikiforov Andrey
    • в журнале International Journal of Molecular Sciences, издательство MDPI (Basel, Switzerland), том 19, № 12, с. 3906 DOI
  • • 2018 Анализ уровня НАД и НАД-зависимого деацетилирования белков в тканях мышей
    • Соловьева Л.В., Панченко А.В., Шабалин К.А., Нериновский К.Б., Якимов А.П., Губарева Е.А., Светлова М.П., Мудрак О.С., Ходорковский М.А., Никифоров А.А., Куликова В.А.
    • в журнале Цитология, издательство Наука (СПб.), том 60, № 7, с. 558-562 DOI
  • • 2017 Blocking the RecA activity and SOS-response in bacteria with a short α-helical peptide
    • Yakimov Alexander, Pobegalov Georgii, Bakhlanova Irina, Khodorkovskii Mikhail, Petukhov Michael, Baitin Dmitry
    • в журнале Nucleic Acids Research, издательство Oxford University Press (United Kingdom), том 45, № 16, с. 9788-9796 DOI
  • 
    • 2017 Klebsazolicin inhibits 70S ribosome by obstructing the peptide exit tunnel
    • Metelev Mikhail, Osterman Ilya A., Ghilarov Dmitry, Khabibullina Nelli F., Yakimov Alexander, Shabalin Konstantin, Utkina Irina, Travin Dmitry Y., Komarova Ekaterina S., Serebryakova Marina, Artamonova Tatyana, Khodorkovskii Mikhail, Konevega Andrey L., Sergiev Petr V., Severinov Konstantin, Polikanov Yury S.
    • в журнале Nature Chemical Biology, издательство Nature Publishing Group (United Kingdom) DOI
  • • 2016 Design of Stable α-Helical Peptides and Thermostable Proteins in Biotechnology and Biomedicine
    • Yakimov A.P., Afanaseva A.S., Khodorkovskiy M.A., Petukhov M.G.
    • в журнале Acta Naturae (англоязычная версия), издательство Park Media Ltd (Moscow, Russia (Federation)), том 8, № 4, с. 70-81 DOI
  • • 2016 Dynamics and mechanisms of interactions between ring-shaped heterohexameric TIP49a/b protein complexes and double-stranded DNA
    • Afanasyeva A.S., Yakimov A.P., Grigoriev M.Yu, Petukhov M.G.
    • в журнале Cell and Tissue Biology, издательство Maik Nauka/Interperiodica Publishing (Russian Federation), том 10, № 1, с. 47-54 DOI
  • 
    • 2015 Generation, release, and uptake of the NAD precursor nicotinic acid riboside by human cells
    • Kulikova V.a., Shabalin K.a.b, Nerinovski K.a.c, Dölle C.g.h, Niere M.d., Yakimov A.a.b, Redpath P.e., Khodorkovskiy M.a., Migaud M.E.f, Ziegler M.c.d, Nikiforov A.a.g
    • в журнале Journal of Biological Chemistry, издательство American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc. (United States), том 290, № 45, с. 27124-27137 DOI
  • • 2014 Possible Function of the ribT Gene of Bacillus subtilis: Theoretical Prediction, Cloning, and Expression
    • Yakimov A.P., Seregina T.A., Kholodnyak A.A., Kreneva R.A., Mironov A.S., Perumov D.A., Timkovskii A.L.
    • в журнале Acta Naturae (англоязычная версия), издательство Park Media Ltd (Moscow, Russia (Federation)), том 6, № 3, с. 106-109 DOI
  • • 2013 СТРУКТУРНАЯ СТАБИЛЬНОСТЬ ДОМЕНА 6 ВИЛЛИНА В ОТСУТСТВИЕ ИОНОВ КАЛЬЦИЯ
    • Якимов А.П., Федечкин С.О., Нериновский К.Б., Шабалин К.А., Смирнов С.Л.
    • в журнале Научно-технические ведомости Санкт-Петербургского государственного политехнического университета. Физико-математические науки, издательство Федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования "Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого" (Санкт-Петербург), том 170, № 2, с. 149-155
  • • 2012 Large-Scale Conformational Flexibility Determines the Properties of AAA⁺ TIP49 ATPases
    • Petukhov Michael, Dagkessamanskaja Adilia, Bommer Martin, Barrett Tracey, Tsaneva Irina, Yakimov Alexander, Quéval Richard, Shvetsov Alexey, Khodorkovskiy Mikhail, Käs Emmanuel, Grigoriev Mikhail
    • в журнале Structure, издательство Cell Press (United States), том 20, № 8, с. 1321-1331 DOI
  • • 2012 Structural Insights into Interaction between Mammalian Methionine Sulfoxide Reductase B1 and Thioredoxin
    • Dobrovolska Olena, Rychkov Georgy, Shumilina Elena, Nerinovski Kirill, Schmidt Alexander, Shabalin Konstantin, Yakimov Alexander, Dikiy Alexander
    • в журнале Journal of Biomedicine and Biotechnology, издательство Hindawi Publishing Corporation (United States), том 2012, с. 1-9 DOI
  • • 2012 Выделение и изучение химической структуры токсина с инсектицидной активностью из гриба Lecanicillium muscarium
    • Митина Г.В., Юзихин О.С., Исангалин Ф.Ш., Якимов А.П.
    • в журнале Научное приборостроение, том 22, № 2, с. 3-10
  • • 2010 СНИЖЕНИЕ КОНФОРМАЦИОННОЙ ПОДВИЖНОСТИ БЕЛКА МЕТИОНИНСУЛЬФОКСИД-РЕДУКТАЗЫ В1 МЫШИ В РЕЗУЛЬТАТЕ ОКИСЛЕНИЯ
    • Рычков Г.Н., Поваров Н.И., Якимов А.П., Шабалин К.А.
    • в журнале Научно-технические ведомости Санкт-Петербургского государственного политехнического университета. Физико-математические науки, издательство Федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования "Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого" (Санкт-Петербург), том 104, № 3, с. 21-26

• Статьи в сборниках

  • • 2016 NAD metabolome analysis in cultured human cells using 1H NMR spectroscopy
    • Shabalin Konstantin, Nerinovski Kirill, Yakimov Alexandr, Kulikova Veronika, Khodorkovskiy Mikhail, Ziegler Mathias, Nikiforov Andrey
    • в сборнике Proceedings of The 1st International Electronic Conference on Metabolomics, место издания MDPI DOI
  • • 2014 De Novo Design of Stable α-Helices
    • Yakimov Alexander, Rychkov Georgy, Petukhov Michael
    • в сборнике Methods in Molecular Biology, издательство Springer (New York), с. 1-14 DOI

• Доклады на конференциях

  • • 2021 Purine nucleoside phosphorylase controls nicotinamide riboside metabolism in mammalian cells (Устный)
    • Авторы: Nikiforov Andrey, Kulikova Veronika, Yakimov AP, Nerinovski Kirill, Svetlova Maria, Solovjeva Ljudmila, Sudnitsyna Julia, Migaud Marie E., Gambaryan Stepan, Ziegler Mathias, Kropotov Andrey
    • FASEB SRC “NAD+ Metabolism & Signaling” 2021, США, 15-16 июня 2021
  • • 2017 Design of stable α-helical peptides for biotechnology and medicine (Устный)
    • Авторы: Yakimov A., Pobegalov G., Bakhlanova I., Khodorkovskii M., Petukhov M., Baitin D.
    • Future of Biomedicine 2017, Владивосток, Россия, 11-19 сентября 2017
  • • 2015 NAD и его ключевые метаболиты: механизмы образования и взаимодействия внутри- и внеклеточных пулов (Устный)
    • Авторы: Куликова В.А., Шабалин К.А., Никифоров А.А., Нериновский К.Б., Циглер М., Якимов А.П.
    • II Всероссийская конференция «Внутриклеточная сигнализация, транспорт, цитоскелет», Санкт-Петербург, Россия, 20-22 октября 2015
  • • 2015 Generation, release and uptake of the NAD precursor nicotinic acid riboside by human cells (Стендовый)
    • Авторы: Nikiforov A., Kulikova V., Shabalin K., Nerinovski K., Dölle C., Niere M., Yakimov A., Redpath P., Khodorkovskiy M., Migaud M., and Ziegler M.
    • FASEB SRC “NAD Metabolism & Signaling”. August 9 - 14, 2015, Timmendorfer Strand, Germany, Timmendorfer Strand, Германия, 9-14 августа 2015
  • • 2014 SEQOPT: new method and web server for de novo design of stable alpha-helices in peptides and globular proteins (Устный)
    • Авторы: Yakimov A., Rychkov G., Petukhov M.
    • 20th EuroQSAR Understanding Chemical-Biological Interactions, St. Petersburg, Russia - August 31-September 4, Россия, 2014

• Тезисы докладов

  • • 2022 The role of NAD biosynthesis in maintaining pluripotency and differentiation of mouse embryonic stem cells
    • Antipova M., Kulikova V., Kropotov A., Yakimov A., Nerinovski K., Nikiforov A.
    • в сборнике FEBS Open Bio, серия S1, место издания Wiley https://febs.onlinelibrary.wiley.com/toc/22115463/2022/12/S1, том 12, тезисы, с. P-04.5-040
  • • 2021 Изучение механизмов регуляции нуклеопротеиновых филаментов RecA белком RecX методом оптического захвата
    • Алексеев А.А., Знобищева Е.А., Побегалов Г.Е., Якимов А.П., Байтин Д.М., Ходорковский М.А.
    • в сборнике VIII Международная научно-практическая конференция молодых ученых: биофизиков, биотехнологов, молекулярных биологов и вирусологов — 2021: Cб. тез. / АНО «Иннов. центр Кольцово», место издания Новосибирск : ИПЦ НГУ, тезисы, с. 135-136
  • • 2021 Метаболизм никотинамидрибозида - нуклеозидной формы витамина B3 - в клетках человека и животных
    • Кропотов А.В., Куликова В.А., Соловьева Л.В., Светлова М.П., Якимов А.П., Нериновский К.Б., Судницына Ю.С., Гамбарян С.П., Никифоров А.А.
    • в сборнике III Объединенный научный форум физиологов, биохимиков и молекулярных биологов (Сочи, Дагомыс, 3–8 октября 2021), место издания Перо, том 2, тезисы, с. 220-220
  • • 2021 Эффективность различных путей биосинтеза NAD в эмбриональных стволовых клетках мыши E14 в плюрипотентном и дифференцированном состоянии
    • Антипова М.В., Куликова В.А., Светлова М.П., Нериновский К.Б., Якимов А.П., Никифоров А.А.
    • в сборнике III Объединенный научный форум физиологов, биохимиков и молекулярных биологов (Сочи, Дагомыс, 3–8 октября 2021), место издания Перо, том 2, тезисы, с. 267-267
  • • 2020 ИМПОРТ И МЕТАБОЛИЗМ НУКЛЕОЗИДНЫХ ФОРМ ВИТАМИНА B3 КЛЕТКАМИ ЧЕЛОВЕКА
    • Куликова В.А., Кропотов А.В., Нериновский К.Б., Якимов А.П., Гамбарян С.П., Судницына Ю.С., Светлова М.П., Соловьева Л.В., Никифоров А.А.
    • в сборнике Гены и клетки, серия VII молодежная школа-конференция по молекулярной и клеточной биологии Института цитологии РАН Санкт-Петербург, 12–15 октября 2020 г, место издания Санкт-Петербург, том 3, тезисы, с. 55
  • • 2020 Потенциальная роль пирофосфатазы человека NUDT13 в регуляции митохондриального пула NAD
    • Якушева А.В., Кроптов А.В., Нериновский К.Б., Якимов А.П., Никифоров А.А., Куликова В.А.
    • в сборнике Материалы XXI Зимней молодежной школы ПИЯФ по биофизике и молекулярной биологии, место издания НИЦ «Курчатовский институт» - ПИЯФ Гатчина, том 2, тезисы, с. 249-250
  • • 2020 Разработка нового подхода конструирования лигандов белков с помощью модифицированного метода молекулярных фрагментов
    • Колчина Н.В., Якимов А.П., Петухов М.Г.
    • в сборнике Материалы XXI Зимней молодежной школы ПИЯФ по биофизике и молекулярной биологии, место издания НИЦ «Курчатовский институт» - ПИЯФ Гатчина, том 2, тезисы, с. 109-110
  • • 2020 Уточнение значений времен релаксации T1 в ЯМР-приложениях метаболомики
    • Якимов А.П., Шабалин К.А., Нериновский К.Б.
    • в сборнике Материалы XXI Зимней молодежной школы ПИЯФ по биофизике и молекулярной биологии, место издания НИЦ «Курчатовский институт» - ПИЯФ Гатчина, том 2, тезисы, с. 248-249
  • • 2019 STIMULATION OF NAD BIOSYNTHESIS ENHANCES THE EFFICIENCY OF DNA REPAIR IN HUMAN CELLS
    • Svetlova M., Solovjeva L., Kulikova V., Nerinovski K., Yakimov A., Nikiforov A.
    • в сборнике Гены и Клетки - Материалы IV Национального Конгресса по Регенеративной Медицине. Москва, 20–23 ноября 2019 года, место издания Институт Стволовых Клеток Человека Москва, Россия, том 14, тезисы, с. 59-60
  • • 2019 ИНГИБИРОВАНИЕ АКТИВНОСТИ ДНК-СВЯЗЫВАЮЩИХ БЕЛКОВ АЛЬФА-СПИРАЛЬНЫМИ ПЕПТИДАМИ
    • Якимов А.П., Байтин Д.М., Петухов М.Г.
    • в сборнике Гены и Клетки - Материалы IV Национального Конгресса по Регенеративной Медицине. Москва, 20–23 ноября 2019 года, место издания Институт Стволовых Клеток Человека Москва, Россия, том 14, тезисы, с. 72
  • • 2019 Механизмы импорта и утилизации новых форм витамина B3 клетками человека HEK293
    • Куликова В.А., Кропотов А.В., Нериновский К.Б., Якимов А.П., Шабалин К.А., Светлова М.П., Соловьева Л.В., Ходорковский М.А., Никифоров А.А.
    • в сборнике Материалы XX Зимней молодежной школы ПИЯФ по биофизике и молекулярной биологии, 25 февраля – 2 марта 2019 г, место издания НИЦ «Курчатовский институт» – ПИЯФ Санкт-Петербург, тезисы, с. 162-163
  • • 2017 Пептид-ингибитор SOS-ответа у бактерий
    • Якимов А.П., Бахланова И.В., Побегалов Г.Е., Ходорковский М.А., Петухов М.Г., Байтин Д.М.
    • в сборнике Технологическая перспектива в рамках Евразийского пространства: новые рынки и точки экономического роста. Материалы 3-ей Международной научной конференции, тезисы, с. 387-387
  • • 2016 Inhibition of RecA Protein Activities By A Conformationally Stable Alpha-Helical Peptide With Optimized Sequence
    • Yakimov Alexander, Pobegalov Georgii, Bakhlanova Irina, Khodorkovskii Mikhail, Baitin Dmitrii, Petukhov Michael
    • в сборнике 11th International Conference on Protein Stabilisation (ProtStab2016), место издания Istambul, тезисы, с. 100
  • • 2016 Loss of Protein Stability due to Formation of Intermolecular Disulfide Bonds under the Effect of Oxidative Stress: Case Study of the RRM2 Domain from Neuropathological Protein TDP-43
    • Rabdano Sevastyan O., Podkorytov Ivan S., Izmailov Sergei A., Pivovarova Yulia V., Yakimov Alexander P., Yuwen Tairan, Groves Adam, Skrynnikov Nikolai R.
    • в сборнике 60th Annual Meeting of the Biophysical-Society. Biophysical J, издательство Elsevier Inc. (США), том 110, тезисы, с. 210a DOI
  • • 2016 Peptide-based inhibitor of RecA protein activity
    • Yakimov A., Pobegalov G., Bakhlanova I., Khodorkovskii M., Petukhov M., Baitin D.
    • в сборнике The FEBS Journal Special Issue for the 41st FEBS Congress, место издания The FEBS Journal KUŞADASI, TURKEY, том 283, тезисы, с. 236
  • • 2016 Role of C-terminal domain dynamics in RecA protein activities
    • Yakimov A., Karelov D., Kovaleva O., Khodorkovskii M., Baitin D., Petukhov M.
    • в сборнике The FEBS Journal Special Issue for the 41st FEBS Congress, место издания The FEBS Journal KUŞADASI, TURKEY, том 283, тезисы, с. 130
  • • 2016 Исследование эффективности и механизмов синтеза NAD из различных внеклеточных предшественников в культивируемых клетках человека. Сборник тезисов V молодежной конференции по молекулярной и клеточной биологии
    • Куликова В.А., Шабалин К.А., Фирсанов Д.В., Светлова М.П., Якимов А.П., Нериновский К.Б., Ходорковский М.А., Циглер М., Никифоров А.А.
    • в сборнике Сборник тезисов V молодежной конференции по молекулярной и клеточной биологии Института цитологии РАН, том 18, тезисы, с. 38-38
  • • 2016 Количественная спектроскопия ЯМР в приложениях метаболомики
    • Якимов А.П., Куликова В.А., Нериновский К.Б., Никифоров А.А., Шабалин К.А.
    • в сборнике XVII Зимняя молодежная школа по биофизике и молекулярной биологии (Гатчина 29 февраля – 5 марта 2016 г.). Сборник тезисов. 2016, тезисы, с. 101-101
  • • 2016 Расщепление внеклеточного NAD и его метаболитов в культурах клеток человека
    • Куликова В.А., Шабалин К.А., Якимов А.П., Нериновский К.Б., Ходорковский М.А., Циглер М., Никифоров А.А.
    • в сборнике Научные труды «V Съезд биохимиков России» (Сочи – Дагомыс, 4 - 8 октября 2016 г.). ActaNaturae. 2016. Спецвыпуск том 2, тезисы, с. 245-245
  • • 2015 Degradation of extracellular NAD and its metabolites in cultures of human cells
    • Kulikova V., Shabalin K., Yakimov A., Nerinovski K., Nikiforov A., Ziegler M.
    • в сборнике FEBS Congress 2015 "The Biochemical Basis of Life" (July 4 - 9, 2015, Berlin, Germany). FEBS Journal. 2015. 282 (Suppl. 1), место издания Berlin, Germany, тезисы, с. 127-127
  • • 2015 Degradation of extracellular NAD and its metabolites in cultures of human cells
    • Kulikova V., Shabalin K., Yakimov A., Nerinovski K., Nikiforov A., Ziegler M.
    • в сборнике 40th FEBS CongressThe Biochemical Basis of Life. Berlin, Germany - July 4-9, 2015, издательство AKA (Berlin, Germany), том 282, тезисы, с. 127
  • • 2015 Generation, release and uptake of the NAD precursor nicotinic acid riboside by human cells
    • Nikiforov A., Kulikova V., Shabalin K., Nerinovski K., Dölle C., Niere M., Yakimov A., Redpath P., Khodorkovskiy M., Migaud M., Ziegler M.
    • в сборнике FASEB SRC “NAD Metabolism & Signaling” (August 9 - 14, 2015, Timmendorfer Strand, Germany). Abstract book, место издания Timmendorfer Strand, Germany, тезисы, с. 24-24
  • • 2015 NAD и его ключевые метаболиты: механизмы образования и взаимодействия внутри- и внеклеточных пулов
    • Куликова В.А., Шабалин К.А., Якимов А.П., Нериновский К.Б., Циглер М., Никифоров А.А.
    • в сборнике Тезисы докладов и сообщений, представленных на II Всероссийскую конференцию "Внутриклеточная сигнализация, транспорт, цитоскелет" (Санкт-Петербург, 20–22 октября 2015 г.). Цитология. 2015. 57 (9), тезисы, с. 637-638
  • • 2015 Разработка методики для измерения количества внеклеточного NAD и его метаболитов методом ЯМР
    • Якимов А.П., Куликова В.А., Нериновский К.Б., Никифоров А.А., Шабалин К.А.
    • в сборнике Тезисы докладов и сообщений, представленных на II Всероссийскую конференцию "Внутриклеточная сигнализация, транспорт, цитоскелет" (Санкт-Петербург, 20–22 октября 2015 г.). Цитология. 2015. 57 (9), тезисы, с. 668-668
  • • 2013 Dynamics of the dsDNA/TIP49a hexameric complexes
    • Petukhov M., Ilatovskiy A., Artamonova T., Afanasieva A., Yakimov A., Khodorkovskiy M., Kas E., Grigoriev M.
    • в сборнике 38th FEBS Congress, Saint Petersburg, Russia, July 6–11, 2013, серия FEBS Journal 280 (Suppl. 1) (2013) 3–617, издательство Blackwell Publishing Inc. (United Kingdom), том 280, тезисы, с. 156
  • • 2013 SeqOPT: web based server for rational design of conformationally stable alpha-helices in monomeric peptides and globular proteins
    • Yakimov A., Rychkov G., Petukhov M.
    • в сборнике 38th FEBS Congress, Saint Petersburg, Russia, July 6–11, 2013, серия FEBS Journal 280 (Suppl. 1) (2013) 3–617, издательство Blackwell Publishing Inc. (United Kingdom), том 280, тезисы, с. 127-128

• Патенты

  • • 2017 Семейство пептидов - ингибиторов активности белка RecA, блокирующих SOS-ответ у бактерий
    • Авторы: Байтин Дмитрий Михайлович, Бахланова Ирина Витальевна, Петухов Михаил Геннадиевич, Побегалов Георгий Евгеньевич, Ходорковский Михаил Алексеевич, Якимов Александр Павлович
    • #RU2621862C1, 6 июля

• Свидетельства о регистрации прав на программное обеспечение

  • • 2013 Программный комплекс «SeqOPT» (SOFT)
    • Авторы: Якимов Александр Павлович, Петухов Михаил Геннадьевич
    • #2013614525, 20 июня

• Диссертация

  • • 2019 Механизмы ингибирования активности белка RecA и бактериального SOS-ответа с помощью α-спиральных пептидов с оптимизированной последовательностью
    • Кандидатская диссертация по специальности 03.01.02 - Биофизика (физ.-мат. науки)
    • Автор: Якимов Александр Павлович, к.ф.-м.н.
    • Научный руководитель: Петухов Михаил Геннадьевич
    • Защищена в совете Д 212.229.25 при Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого
    • Организация, в которой выполнялась работа: Петербургский институт ядерной физики им. Б. П. Константинова