Студитский Василий Михайлович
пользователь
Количество цитирований статей в журналах по данным
Web of Science: 3735,
Scopus: 4051
IstinaResearcherID (IRID): 1678145
Деятельность
Статьи в журналах
New properties of Drosophila scs and scs' insulators
Kyrchanova O. ,
Leman D. ,
Parshikov A. ,
Fedotova A.,
Studitsky V. ,
Maksimenko O. ,
Georgiev ,
P
в журнале PLoS ONE , издательство Public Library of Science (United States) , том 8, с. e62690
2022
Electron microscopy analysis of ATP-independent nucleosome unfolding by FACT
Sivkina Anastasiia L. ,
Karlova Maria G. ,
Valieva Maria E. ,
McCullough Laura L. ,
Formosa Timothy ,
Shaytan Alexey K. ,
Feofanov Alexey V. ,
Kirpichnikov Mikhail P. ,
Sokolova Olga S. ,
Studitsky Vasily M.
в журнале Communications Biology , издательство Springer Nature (Switzerland) , том 5, № 1
DOI
2022
Enhanced PARP-1 binding and remodeling ofnucleosomes flanked by linker hairpins
Koshkina D. ,
Maluchenko N. ,
Kotova E. ,
Lys A. ,
Korovina A. ,
Feofanov A. ,
Studitsky V.
в журнале FEBS open bio , издательство John Wiley & Sons Inc. (United States) , том 12, № S1, с. 259-260
DOI
2022
Hmo1 Protein Affects the Nucleosome Structure and Supports the Nucleosome Reorganization Activity of Yeast FACT
Malinina Daria K. ,
Sivkina Anastasiia L. ,
Korovina Anna N. ,
McCullough Laura L. ,
Formosa Tim ,
Kirpichnikov Mikhail P. ,
Studitsky Vasily M. ,
Feofanov Alexey V.
в журнале Cells , издательство MDPI (Basel, Switzerland) , том 11, № 19, с. 2931
DOI
2022
Human PARP1 Facilitates Transcription through a Nucleosome and Histone Displacement by Pol II In Vitro
Kotova Elena Y. ,
Hsieh Fu-Kai ,
Chang Han-Wen ,
Maluchenko Natalia V. ,
Langelier Marie-France ,
Pascal John M. ,
Luse Donal S. ,
Feofanov Alexey V. ,
Studitsky Vasily M.
в журнале International Journal of Molecular Sciences , издательство MDPI (Basel, Switzerland) , том 23, № 13, с. 7107
DOI
2022
Mechanism of curaxin-dependent nucleosome unfolding by FACT
Volokh Olesya I. ,
Sivkina Anastasia L. ,
Moiseenko Andrey V. ,
Popinako Anna V. ,
Karlova Maria G. ,
Valieva Maria E. ,
Kotova Elena Y. ,
Kirpichnikov Mikhail P. ,
Formosa Timothy ,
Studitsky Vasily M. ,
Sokolova Olga S.
в журнале Frontiers in Molecular Biosciences , издательство Frontiers Media S.A. (Lausanne, Switzerland) , том 9
DOI
2022
N-Terminal Tails of Histones H2A and H2B Differentially Affect Transcription by RNA Polymerase II In Vitro
Chang Han-Wen ,
Feofanov Alexey V. ,
Lyubitelev Alexander V. ,
Armeev Grigory A. ,
Kotova Elena Y. ,
Hsieh Fu-Kai ,
Kirpichnikov Mikhail P. ,
Shaytan Alexey K. ,
Studitsky Vasily M.
в журнале Cells , издательство MDPI (Basel, Switzerland) , том 11, № 16
DOI
2022
Na+ and K+ Ions Differently Affect Nucleosome Structure, Stability, and Interactions with Proteins
Andreeva Tatyana V. ,
Maluchenko Natalya V. ,
Sivkina Anastasiia L. ,
Chertkov Oleg V. ,
Valieva Maria E. ,
Kotova Elena Y. ,
Kirpichnikov Mikhail P. ,
Studitsky Vasily M. ,
Feofanov Alexey V.
в журнале Microscopy and Microanalysis , издательство Cambridge University Press (United Kingdom) , том 28, № 1, с. 243-253
DOI
2022
Structure of an Intranucleosomal DNA Loop That Senses DNA Damage during Transcription
Gerasimova Nadezhda S. ,
Volokh Olesya I. ,
Pestov Nikolay A. ,
Armeev Grigory A. ,
Kirpichnikov Mikhail P. ,
Shaytan Alexey K. ,
Sokolova Olga S. ,
Studitsky Vasily M.
в журнале Cells , издательство MDPI (Basel, Switzerland) , том 11, № 17, с. 2678
DOI
2021
Histone H3/H4 tetrasome structure: analysis by spFRET microscopy
Sivkina Anastasiia ,
Maluchenko Nataliya ,
Malinina Daria ,
Lys Aleksandra ,
Korovina Anna ,
Feofanov Alexey ,
Studitsky Vasily ,
Kirpichnikov Mikhail
в журнале Microscopy and Microanalysis , издательство Cambridge University Press (United Kingdom) , том 27, № S1, с. 1736-1737
DOI
2021
Influence of Linker DNA on Nucleosome Structure according to Single-Particle Fluorescence Microscopy Data
Andreeva T.V. ,
Lyubitelev A.V. ,
Malyuchenko N.V. ,
Studitsky V.M. ,
Kirpichnikov M.P. ,
Feofanov A.V.
в журнале Moscow University Biological Sciences Bulletin , издательство Allerton Press (New York, N.Y., United States) , том 76, № 3, с. 118-122
DOI
2021
Mechanisms of Nucleosome Reorganization by PARP1
Maluchenko Natalya V. ,
Nilov Dmitry K. ,
Pushkarev Sergey V. ,
Kotova Elena Y. ,
Gerasimova Nadezhda S. ,
Kirpichnikov Mikhail P. ,
Langelier Marie-France ,
Pascal John M. ,
Akhtar Md Sohail ,
Feofanov Alexey V. ,
Studitsky Vasily M.
в журнале International Journal of Molecular Sciences , издательство MDPI (Basel, Switzerland) , том 22, № 22
DOI
2021
Role of the Nhp6 Protein in Nucleosome Unfolding by the FACT Factor
Sivkina A.L. ,
Feofanov A.V. ,
Kirpichnikov M.P. ,
Akhtar M.S. ,
Studitsky V.M.
в журнале Moscow University Biological Sciences Bulletin , издательство Allerton Press (New York, N.Y., United States) , том 76, № 4, с. 191-195
DOI
2020
Determining the Binding Constant of LANA Protein Fragment with Nucleosome
Novikov R.V. ,
Bondarenko E.A. ,
Malyuchenko N.V. ,
Feofanov A.V. ,
Studitsky V.M. ,
Shaytan A.K.
в журнале Moscow University Biological Sciences Bulletin , издательство Allerton Press (New York, N.Y., United States) , том 75, № 4, с. 252-256
DOI
2020
Molecular mechanisms of PARP-1 inhibitor 7-methylguanine
Nilov D. ,
Maluchenko N. ,
Kurgina T. ,
Pushkarev S. ,
Lys A. ,
Kutuzov M. ,
Gerasimova N. ,
Feofanov A. ,
Švedas V. ,
Lavrik O. ,
Studitsky V.M.
в журнале International Journal of Molecular Sciences , издательство MDPI (Basel, Switzerland) , том 21, № 6, с. E2159-E2159
DOI
2020
The Effect of Gossypol on the Structure of Nucleosomes
Malyuchenko N.V. ,
Koshkina D.O. ,
Korovina A.N. ,
Gerasimova N.S. ,
Kirpichnikov M.P.,
Studitsky V.M. ,
Feofanov A.V.
в журнале Moscow University Biological Sciences Bulletin , издательство Allerton Press (New York, N.Y., United States) , том 75, № 3, с. 142-146
DOI
2020
Влияние госсипола на структуру нуклеосом
Малюченко Н.В. ,
Кошкина Д.О. ,
Коровина Анна Николаевна ,
Герасимова Н.С. ,
Феофанов А.В. ,
Студитский В.М. ,
Кирпичников М.П.
в журнале Вестник Московского университета. Серия 16: Биология , издательство Изд-во Моск. ун-та (М.) , том 75, № 3, с. 170-175
2019
7-Methylguanine Traps PARP-1 on Nucleosomes: spFRET Microscopy Study
Maluchenko Natalya ,
Nilov Dmitry ,
Feofanov Alexey ,
Lys Alexandra ,
Kutuzov Mikhail ,
Gerasimova Nadezhda ,
Studitsky Vasily
в журнале Microscopy and Microanalysis , издательство Cambridge University Press (United Kingdom) , том 25, № S2, с. 1282-1283
DOI
2019
DNA-PROTEIN IN-TERACTIONS – NEW OPPORTUNITIES FOR STRUCTURAL RESEARCH
Sokolova O.S. ,
Moiseenko A.V. ,
Loiko N. ,
Danilova Ya ,
Tereshkina K. ,
Malyuchenko N.V. ,
Feofanov A.V. ,
Krupyansky Yu F. ,
Studitsky V.M.
в журнале Acta Naturae (англоязычная версия) , издательство Park Media Ltd (Moscow, Russia (Federation)) , том 2, № S, с. 8
2019
PARP1 Binding to DNA Breaks and Hairpins Alters Nucleosome Structure
Maluchenko N.V. ,
Kotova E.Ju ,
Kirpichnikov M.P. ,
Studitsky V.M. ,
Feofanov A.V.
в журнале Moscow University Biological Sciences Bulletin , издательство Allerton Press (New York, N.Y., United States) , том 74, № 3, с. 200-206
DOI
2019
The anti-cancer drugs curaxins target spatial genome organization
Kantidze O.L. ,
Luzhin A.V. ,
Nizovtseva E.V. ,
Safina A.,
Valieva M.E. ,
Golov A.K. ,
Velichko A.K.,
Lyubitelev A.V. ,
Feofanov A.V. ,
Gurova K.V. ,
Studitsky V.M. ,
Razin S.V.
в журнале Nature communications , издательство Nature Pub. Group (United Kingdom) , том 10, № 1, с. 1441
DOI
2019
Флуоресцентная микроскопия одиночных нуклеосом в структурных исследованиях ДНК-белковых комплексов
Феофанов А.В. ,
Малюченко Н.В. ,
Валиева М.Е. ,
Герасимова Н.С. ,
Любителев А.В. ,
Армеев Г.А. ,
Чертков О.В. ,
Шайтан А.К. ,
Котова Е.Ю. ,
Студитский В.М. ,
Кирпичников М.П.
в журнале Acta Naturae (русскоязычная версия) , издательство Парк-медиа (М.) , том 2, с. 56-56
2018
7-Methylguanine: a natural DNA repair inhibitor and a promising anticancer compound
Nilov D. ,
Kirsanov K. ,
Antoshina E. ,
Maluchenko N. ,
Feofanov A. ,
Kurgina T. ,
Zakharenko A. ,
Khodyreva S. ,
Gerasimova N. ,
Studitsky V. ,
Lavrik O. ,
Švedas V.
в журнале FEBS open bio , издательство John Wiley & Sons Inc. (United States) , том 8, № Supplement S1, с. 271-272
DOI
2018
Functional roles of the DNA-binding HMGB domain in the histone chaperone FACT in nucleosome reorganization
McCullough Laura L. ,
Connell Zaily ,
Xin Hua ,
Studitsky Vasily M. ,
Feofanov Alexey V. ,
Valieva Maria E. ,
Formosa Tim
в журнале Journal of Biological Chemistry , издательство American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc. (United States) , том 293, № 16, с. 6121-6133
DOI
2018
Mechanism of FACT removal from transcribed genes by anticancer drugs curaxins
Chang Han-Wen ,
Valieva Maria E. ,
Safina Alfiya ,
Chereji Răzvan V. ,
Wang Jianmin ,
Kulaeva Olga I. ,
Morozov Alexandre V. ,
Kirpichnikov Mikhail P. ,
Feofanov Alexey V. ,
Gurova Katerina V. ,
Studitsky Vasily M.
в журнале Science Advances , том 4, № 11, с. eaav2131
DOI
2018
Multiple Conformations of Compact Dinucleosomes: Analysis by Electron Microscopy
Maria Valieva ,
Oleg Chertkov ,
Maria Karlova ,
Kirpichnikov Mikhail P. ,
Feofanov Alexey V. ,
Sokolova Olga S. ,
Vasily Studitsky
в журнале Microscopy and Microanalysis , издательство Cambridge University Press (United Kingdom) , том 24, № S1, с. 1242-1243
DOI
2018
Structural interpretation of DNA-protein hydroxyl-radical footprinting experiments with high resolution using HYDROID
Шайтан А.К. ,
Xiao H. ,
Армеев Г.А. ,
Gaykalova D.A. ,
Комарова Г.А. ,
Carl Wu ,
Студитский В.М. ,
Landsman D. ,
Panchenko A.R.
в журнале Nature Protocols , издательство Nature Publishing Group (United Kingdom) , том 13, № 1, с. 2535-2556
DOI
2018
Targeting single-strand DNA breaks for DNA repair
Герасимова Н.С. ,
Малюченко Н.В. ,
Султанов Д.Ч. ,
Валиева М.Е. ,
Котова Е.Ю. ,
Феофанов А.В. ,
Студитский В.М.
в журнале FEBS open bio , издательство John Wiley & Sons Inc. (United States) , том 8, № Supplement S1, с. 144
DOI
2018
Памяти Александра Сергеевича Холодова
Четверушкин Б.Н. ,
Тыртышников Е.Е. ,
Кудрявцев Н.Н.,
Дымников В.П.,
Журавлев Ю.И. ,
Сон Е.Э. ,
Рудаков К.В. ,
Евтушенко Ю.Г.,
Жижченко А.Б. ,
Гуляев Ю.В.,
Бугаев А.С.,
Коновалов А.Н.,
Маслов В.П.,
Бердышев В.М.,
Семенов А.Л. ,
Моисеев Е.И.,
Петров И.Б.,
Флеров Ю.А. ,
Поспелов И.Г. ,
Кабанихин С.И. ,
Якобовский М.В. ,
Тишкин В.Ф. ,
Василевский Ю.В. ,
Шананин А.А. ,
Гущин В.А.,
Никитин И.С. ,
Лобанов А.И. ,
Демченко В.В. ,
Ступицкий Е.Л. ,
Якушев В.Л.,
Бабаков А.В.,
Шевелев Ю.Д. ,
Ишанов С.А. ,
Рябенький В.С.
в журнале Математическое моделирование , издательство Российская академия наук (Москва) , том 30, № 1, с. 135-136
2017
Nucleosome-free DNA regions differentially affect distant communication in chromatin
Nizovtseva E.V. ,
Clauvelin N. ,
Todolli S. ,
Polikanov Y.S. ,
Kulaeva O.I. ,
Wengrzynek S. ,
Olson W.K. ,
Studitsky V.M.
в журнале Nucleic Acids Research , издательство Oxford University Press (United Kingdom) , том 45, № 6, с. 3059-3067
DOI
2017
Stabilization of Nucleosomes by Histone Tails and by FACT Revealed by spFRET Microscopy
Valieva Maria E. ,
Gerasimova Nadezhda S. ,
Kudryashova Kseniya S. ,
Kozlova Anastasia L. ,
Kirpichnikov Mikhail P. ,
Qi Hu ,
Maria Victoria Botuyan ,
Georges Mer ,
Feofanov Alexey V. ,
Studitsky Vasily M.
в журнале Cancers , издательство MDPI (Basel, Switzerland) , том 9, № 1
DOI
2017
Unfolding of core nucleosomes by PARP-1 revealed by spFRET microscopy
Daniel Sultanov ,
Nadezhda Gerasimova ,
Kseniya Kudryashova ,
Natalya Maluchenko ,
Elena Kotova ,
Marie-France Langelier ,
John Pascal ,
Mikhail Kirpichnikov ,
Alexey Feofanov ,
Vasily Studitsky
в журнале AIMS Genetics , том 4, № 1, с. 21-31
DOI
2017
Поли(АДФ-рибоза)-полимераза 1 и ее взаимодействия с нуклеосомами: анализ методом FRET-микроскопии одиночных частиц
Феофанов А.В. ,
Султанов Д.Ч. ,
Герасимова Н.С. ,
Кудряшова К.С. ,
Малюченко Н.В. ,
Котова Е.Ю. ,
Студитский В.М. ,
Кирпичников М.П.
в журнале Acta Naturae (англоязычная версия) , издательство Park Media Ltd (Moscow, Russia (Federation)) , № спецвыпуск , с. 94
2017
Поли(АДФ-рибоза)-полимераза 1 и ее взаимодействия с нуклеосомами: анализ методом FRET-микроскопии одиночных частиц
Феофанов А.В. ,
Султанов Д.Ч. ,
Герасимова Н.С. ,
Кудряшова К.С. ,
Малюченко Н.В. ,
Котова Е.Ю. ,
Студитский В.М. ,
Кирпичников М.П.
в журнале Acta Naturae (русскоязычная версия) , издательство Парк-медиа (М.) , № СПЕЦВЫПУСК, с. 94
2016
Change in linker DNA conformation upon histone H1.5 binding to nucleosome: Fluorescent microscopy of single complexes
Lyubitelev A.V. ,
Kudryashova K.S. ,
Mikhaylova M.S. ,
Malyuchenko N.V. ,
Chertkov O.V. ,
Studitsky V.M. ,
Feofanov A.V. ,
Kirpichnikov M.P.
в журнале Moscow University Biological Sciences Bulletin , издательство Allerton Press (New York, N.Y., United States) , том 71, № 2, с. 108-113
2016
Experimental setup for the study of immobilized single nucleosomes using total internal reflection fluorescence
Kudryashova K.S. ,
Chertkov O.V. ,
Ivanov Ya O. ,
Studitskiy V.M. ,
Feofanov A.V.
в журнале Moscow University Biological Sciences Bulletin , издательство Allerton Press (New York, N.Y., United States) , том 71, № 2, с. 97-101
DOI
2016
INHIBITING THE PRO-TUMOR AND TRANSCRIPTION FACTOR FACT: MECHANISMS
Maluchenko N.V. ,
Valieva M.E. ,
Gerasimova N.S. ,
Kitashov A.V. ,
Kirpichnikov M.P. ,
Studitsky V.M. ,
Chang H.W.,
Kozinova M.T. ,
Georgiev P.G.
в журнале Molecular Biology , издательство Maik Nauka/Interperiodica Publishing (Russian Federation) , том 50, № 4, с. 532-541
2016
Large-Scale ATP-Independent Nucleosome Unfolding by a Histone Chaperone
Valieva M.E. ,
Armeev G.A. ,
Kudryashova K.S. ,
Gerasimova N.S. ,
Shaytan A.K. ,
Kulaeva O.I. ,
McCullough L.L. ,
Formosa T. ,
Georgiev P.G. ,
Kirpichnikov M.P. ,
Studitsky V.M. ,
Feofanov A.V.
в журнале Nature Structural and Molecular Biology , издательство Nature Publishing Group (United Kingdom) , том 23, № 12, с. 1111-1116
DOI
2016
Linker histones structure and functions
Lyubitelev A.V. ,
Nikitin D.V. ,
Shaytan A.K. ,
Studitsky V.M. ,
Kirpichnikov M.P.
в журнале Biochemistry (Moscow) , издательство Pleiades Publishing, Ltd (Road Town, United Kingdom) , том 81, № 3, с. 213-223
DOI
2016
Single-particle fluorescent microscopy analysis of nucleosomes and their complexes with linker histone H1.5
Feofanov A. ,
Lyubitelev A. ,
Kudryashova K. ,
Mikhaylova M. ,
Chertkov O. ,
Studitsky V. ,
Kirpichnikov M.
в журнале FEBS Journal , издательство Blackwell Publishing Inc. (United Kingdom) , том 283, № Suppl. 1, с. 42
DOI
2016
Study of RNA Polymerase Transcription Through Nucleosome Using the Cryo-Electron Microscopy Approach
Volokh O.I. ,
Hsieh F.K. ,
Karlova M.G. ,
Trifonova E.S. ,
Studitsky V.M. ,
Sokolova O.S.
в журнале Moscow University Biological Sciences Bulletin , издательство Allerton Press (New York, N.Y., United States) , том 71, № 1, с. 34-38
DOI
2016
ИЗМЕНЕНИЕ КОНФОРМАЦИИ ЛИНКЕРНОЙ ДНК ПРИ СВЯЗЫВАНИИ ГИСТОНА Н1.5 C НУКЛЕОСОМОЙ: ФЛУОРЕСЦЕНТНАЯ МИКРОСКОПИЯ ОДИНОЧНЫХ КОМПЛЕКСОВ
Любителев А.В. ,
Кудряшова К.С. ,
Михайлова М.С. ,
Малюченко Н.В. ,
Чертков О.В. ,
Студитский В.М. ,
Феофанов А.В. ,
Кирпичников М.П.
в журнале Вестник Московского университета. Серия 16: Биология , издательство Изд-во Моск. ун-та (М.) , № 2, с. 49-54
2016
Механизмы ингибирования проопухолевого и транскрипционного фактора FACT
Малюченко Н.В. ,
Чанг Х.В.,
Козинова М.Т. ,
Валиева М.Е. ,
Герасимова Н.С. ,
Киташов А.В. ,
Кирпичников М.П. ,
Георгиев П.Г. ,
Студитский В.М.
в журнале Молекулярная биология , том 50, № 4, с. 1-12
DOI
2015
Development of fluorescently labeled mononucleosomes to study transcription mechanisms by method of microscopy of single complexes
Kudryashova K.S. ,
Nikitin D.V. ,
Chertkov O.V. ,
Gerasimova N.S. ,
Valieva M.E. ,
Studitsky V.M. ,
Feofanov A.V.
в журнале Moscow University Biological Sciences Bulletin , издательство Allerton Press (New York, N.Y., United States) , том 70, № 4, с. 189-193
2015
Molecular mechanisms of DNA transcription regulation by a factor PARP1
Maluchenko N. ,
Kulaeva O.I. ,
Kotova E. ,
Chupyrkina A. ,
Nikitin D. ,
Kirpichnikov M.P. ,
Studitsky V.M.
в журнале Molecular Biology , издательство Maik Nauka/Interperiodica Publishing (Russian Federation) , том 49, № 1, с. 99-113
2015
Nucleosome positioning and composition modulate in silico chromatin flexibility
Clauveli ,
N,
Lo P. ,
Kulaeva O.I. ,
Nizovtseva E.V. ,
Diaz-Montes J.,
Zola J. ,
Parashar M. ,
Studitsky V.M. ,
Olson W.K.
в журнале J. Physics: Condensed Matter , том 27, с. 064112
2015
Preparation of mononucleosomal templates for analysis of transcription with RNA polymerase using spFRET. Methods in Molecular Biology. Chromatin protocols
Kudryashova K.S. ,
Chertkov O. ,
Nikitin D. ,
Pestov N. ,
Kulaeva O.I. ,
Efremenko A. ,
Solonin A.S. ,
Kirpichnikov M.P. ,
Studitsky V.М. ,
Feofanov A.V.
в журнале Methods in molecular and cellular biology , издательство Wiley (Singapore) , том 1288, с. 395-412
DOI
2015
Repair of chromatinized DNA
Gerasimova N.S. ,
Pestov N.A. ,
Kulaeva O.I. ,
Nikitin D.V. ,
Kirpichnikov M.P. ,
Studitsky V.M.
в журнале Moscow University Biological Sciences Bulletin , издательство Allerton Press (New York, N.Y., United States) , том 70, № 3, с. 122-126
DOI
2015
Structural analysis of nucleosomal barrier to transcription
Gaykalova Daria A. ,
Kulaeva Olga I. ,
Olesya Volokh ,
Shaytan Alexey K. ,
Fu-Kai Hsieh ,
Kirpichnikov Mikhail P. ,
Sokolova Olga S. ,
Studitsky Vasily M.
в журнале Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America , издательство National Academy of Sciences (United States) , том 112, № 43, с. E5787-E5795
DOI
2014
Analysis of the mechanism of nucleosome survival during transcription
Chang HW ,
Kulaeva OI,
Shaytan AK ,
Kibanov M.,
Kuznedelov K. ,
Severinov KV,
Kirpichnikov MP ,
Clark DJ ,
Studitsky VM
в журнале Nucleic Acids Research , издательство Oxford University Press (United Kingdom) , том 42, № 3, с. 1619-1627
2013
Molecular Mechanisms of Transcription Through a Nucleosome by RNA polymerase II
Kulaeva O.I. ,
Maluchenko N. ,
Nikitin D. ,
Demidenko A. ,
Chertkov O. ,
Efimova N. ,
Kirpichnikov M.P. ,
Studitsky V.M.
в журнале Molecular Biology , издательство Maik Nauka/Interperiodica Publishing (Russian Federation) , том 47, № 5, с. 655-666
DOI
2012
Internucleosomal interactions mediated by histone tails allow distant communication in chromatin
Kulaeva O.I. ,
Zheng G. ,
Polikanov Y.S. ,
Colasanti A.V. ,
Clauvelin N. ,
Mukhopadhyay S. ,
Sengupta A.M. ,
Studitsky V.M. ,
Olson W.K.
в журнале Journal of Biological Chemistry , издательство American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc. (United States) , том 287, № 24, с. 20248-20257
2012
Molecular mechanisms of chromatin transcription by RNA polymerase III. Part 1
Studitskii V.M. ,
Orlovskii I.V. ,
Chertkov O.V. ,
Efimova N.S. ,
Loginova M.A. ,
Kulaeva O.I.
в журнале Moscow University Biological Sciences Bulletin , издательство Allerton Press (New York, N.Y., United States) , том 67, № 3-4, с. 96-100
DOI
2012
Molecular mechanisms of transcription through chromatin by RNA polymerase III: Part 2
Studitskii V.M. ,
Orlovskii I.V. ,
Chertkov O.V. ,
Efimova N.S. ,
Loginova M.A. ,
Kulaeva O.I.
в журнале Moscow University Biological Sciences Bulletin , издательство Allerton Press (New York, N.Y., United States) , том 67, № 3-4, с. 101-106
DOI
2009
Mechanism of chromatin remodeling and recovery during passage of RNA polymerase II
Kulaeva O.I. ,
Gaykalova D.A. ,
Pestov N.A. ,
Golovastov V.V. ,
Vassylyev D.G. ,
Artsimovitch I. ,
Studitsky V.M.
в журнале Nature Structural and Molecular Biology , издательство Nature Publishing Group (United Kingdom) , том 16, № 12, с. 1272-1278
2007
Probability of the site juxtaposition determines the rate of protein-mediated DNA looping
Polikanov Y.S. ,
Bondarenko V.A. ,
Tchernaenko V. ,
Jiang Y.I. ,
Lutter L.C. ,
Vologodskii A. ,
Studitsky V.M.
в журнале Biophysical Journal , издательство Biophysical Society (United States) , том 93, № 8, с. 2726-2731
2006
Mechanism of polymerase II transcription repression by the histone variant macroH2A
Doyen C.M. ,
An W. ,
Angelov D. ,
Bondarenko V. ,
Mietton F. ,
Studitsky V.M. ,
Hamiche A. ,
Roeder R.G. ,
Bouvet P. ,
Dimitrov S.
в журнале Molecular and Cellular Biology , издательство American Society for Microbiology (United States) , том 26, № 3, с. 1156-1164
2006
Nucleolin is a histone chaperone with FACT-like activity and assists remodeling of nucleosomes
Angelov D. ,
Bondarenko V.A. ,
Almagro S. ,
Menoni H. ,
Mongelard F. ,
Hans F. ,
Mietton F. ,
Studitsky V.M. ,
Hamiche A. ,
Dimitrov S. ,
Bouvet P.
в журнале EMBO Journal , издательство Nature Publishing Group (United Kingdom) , том 25, № 8, с. 1669-1679
2006
Nucleosomes can form a polar barrier to transcript elongation by RNA polymerase II
Bondarenko V.A. ,
Steele L.M. ,
Ujvari A. ,
Gaykalova D.A. ,
Kulaeva O.I. ,
Polikanov Y.S. ,
Luse D.S. ,
Studitsky V.M.
в журнале Molecular Cell , издательство Cell Press (United States) , том 24, № 3, с. 469-479
2004
SWI/SNF remodeling and p300-dependent transcription of histone variant H2ABbd nucleosomal arrays
Angelov D. ,
Verdel A. ,
An W. ,
Bondarenko V. ,
Hans F. ,
Doyen C.M. ,
Studitsky V.M. ,
Hamiche A. ,
Roeder R.G. ,
Bouvet P. ,
Dimitrov S.
в журнале EMBO Journal , издательство Nature Publishing Group (United Kingdom) , том 23, № 19, с. 3815-3824
2003
Communication over a large distance: enhancers and insulators
Bondarenko V.A. ,
Liu Y.V. ,
Jiang Y.I. ,
Studitsky V.M.
в журнале Biochemistry (Moscow), Supplement Series A: Membrane and Cell Biology , издательство Pleiades Publishing, Ltd (Road Town, United Kingdom) , том 81, № 3, с. 241-251
2002
Activation of the glnA, glnK, and nac promoters as Escherichia coli undergoes the transition from nitrogen excess growth to nitrogen starvation
Atkinson M.R. ,
Blauwkamp T.A. ,
Bondarenko V. ,
Studitsky V. ,
Ninfa A.J.
в журнале Japanese Journal of Bacteriology , издательство Business Center for Academic Societies Japan/Nihon Gakkai Jimu Senta (Japan) , том 184, № 19, с. 5358-5363
Статьи в сборниках
2018
Effects of Histone Chaperones FACT and PARP1 on Nucleosome Structure and Transcription
Sultanov D.C. ,
Valieva M.E. ,
Maluchenko N.V. ,
Kotova E. ,
Gerasimova N.S. ,
Armeev G.A. ,
Hsieh F.K.,
Kudryashova Ksenia S. ,
Kirpichnikov M.P. ,
Shaytan A.K. ,
Feofanov A.V. ,
Studitsky V.M.
в сборнике Abstracts of Cold Spring Harbor Laboratory international meeting on “THE PARP FAMILY & ADP-RIBOSYLATION” 2018 , место издания США , с. 76
2017
Complexes of nucleosomal nanoparticles with proteins: spFRET microscopy study of olaparib and PARP-1 binding to core nucleosomes
Gerasimova N.S. ,
Valieva M.E. ,
Sultanov D.Ch ,
Kudryashova K.S. ,
Maluchenko N.V. ,
Kotova E.S. ,
Kirpichnikov M.P. ,
Studitsky V.M. ,
Feofanov A.V.
в сборнике Microscopy and imaging science: practical approaches to applied research , место издания Formatex Research Center Spain , с. 55-61
2017
Single-particle FRET microscopy of immobilized nucleosomes: technique development
Feofanov A.V. ,
Chertkov O.V. ,
Kudryashova K.S. ,
Ivanov Y.O. ,
Studitsky V.M. ,
Kirpichnikov M.P.
в сборнике 3rd International Multidisciplinary Microscopy and Microanalysis Congress (InterM): Proceedings, Oludeniz, Turkey, 19-23 October 2015 , серия Springer Proceedings in Physics , место издания Springer , том 186, с. 17-23
DOI
2015
Analysis of nucleosome transcription using single-particle FRET
Feofanov A.V. ,
Kudryashova K.S. ,
Chertkov O.V. ,
Nikitin D.V. ,
Pestov N.A. ,
Kulaeva O.I. ,
Studitsky V.M. ,
Kirpichnikov M.P.
в сборнике "2nd International Multidisciplinary Microscopy and Microanalysis Congress"; E.K. Polychroniadis, A.Y. Oral, M. Ozer, Eds., , серия Springer Proceedings in Physics , место издания Springer , том 164, с. 255-260
DOI
Доклады на конференциях
2022
Изучение взаимодействий нуклеосом-белковых комплексов с противоопухолевыми соединениями методом spFRET-микроскопии
(Устный)
Авторы:
Феофанов А.В. ,
Малюченко Н.В. ,
Валиева М.Е. ,
Сивкина А.Л. ,
Герасимова Н.С. ,
Коровина А.Н. ,
Студитский В.М. ,
Кирпичников М.П.
III Объединенный Научный Форум Физиологов, Биохимиков И Молекулярных Биологов , Сочи, Россия, 3-7 октября 2022
2021
Nucleosome complexes with proteins and drugs through the prism of spFRET microscopy
(Приглашенный)
Авторы:
Feofanov Alexey V. ,
Maluchenko Natalya V. ,
Gerasimova Nadezhda S. ,
Lys Alexandra A. ,
Koshkina Darya O. ,
Valieva Maria E. ,
Studitsky Vasily М. ,
Kirpichnikov Mikhail P.
Smart NanoMaterials 2021 Advances, Innovation and Applications , Париж, Франция, 7-10 декабря 2021
2021
Histone H3/H4 tetrasome structure: analysis by spFRET microscopy
(Стендовый)
Авторы:
Sivkina Anastasiia ,
Maluchenko Nataliya ,
Malinina Daria ,
Lys Aleksandra ,
Korovina Anna ,
Feofanov Alexey ,
Studitsky Vasily ,
Kirpichnikov Mikhail
Microscopy and Microanalysis 2021 , Online, США, 1 августа - 5 октября 2021
2021
Single particle FRET microscopy: shedding light on drug interactions with nucleosome-protein complexes.
(Приглашенный)
Авторы:
Feofanov A.V. ,
Maluchenko N.V. ,
Gerasimova N.S. ,
Lys A.A. ,
Koshkina D.O. ,
Valieva M.E. ,
Studitsky V.М. ,
Kirpichnikov M.P.
The 3nd European conference on Novel Photonic, Optoelectronic and Electronic Materials SPb-POEM2021 (Hybrid Onsite-Online Conference) , Санкт-Петербург, Россия, 25-28 мая 2021
2020
Study of anticancer drugs affecting nucleosomal structure using spFRET approach
(Приглашенный)
Авторы:
Feofanov A.V. ,
Maluchenko N.V. ,
Gerasimova N.S. ,
Lys A.A. ,
Koshkina D.O. ,
Valieva M.E. ,
Studitsky V.М. ,
Kirpichnikov M.P.
The 2nd European conference on Novel Photonic, Optoelectronic and Electronic Materials SPb-POEM2020 (On-line Conference) , Санкт-Петербург, Россия, 27-30 апреля 2020
2019
Role of C-terminal domains of yeast FACT complex in nucleosome unfolding
(Стендовый)
Авторы:
Kozlova A.L. ,
Valieva M.E. ,
Studitsky V.M. ,
Sokolova O.S. ,
Feofanov A.V. ,
Kotova E.Yu
школа молодых ученых «Генетика и эпигенетика: механизмы, структура, функция» , Москва, Россия, 10-11 октября 2019
2019
ДНК-белковые взаимодействия – новые возможности для структурных исследований
(Устный)
Авторы:
Соколова О.С. ,
Моисеенко А.В. ,
Данилова Я. ,
Лойко Н. ,
Терешкина К. ,
Малюченко Н.В. ,
Феофанов А.В. ,
Крупянский Ю.Ф. ,
Студитский В.М.
II Объединенный научный форум, включающий VI Cъезд физиологов СНГ, VI Съезд биохимиков России и IX Российский симпозиум «Белки и пептиды» , Дагомыс, Россия, 1-6 октября 2019
2019
Флуоресцентная микроскопия одиночных нуклеосом в структурных исследованиях ДНК-белковых комплексов
(Устный)
Авторы:
Феофанов А.В. ,
Малюченко Н.В. ,
Валиева М.Е. ,
Герасимова Н.С. ,
Любителев А.В. ,
Армеев Г.А. ,
Чертков О.В. ,
Шайтан А.К. ,
Котова Е.Ю. ,
Студитский В.М. ,
Кирпичников М.П.
II Объединенный научный форум, включающий VI Cъезд физиологов СНГ, VI Съезд биохимиков России и IX Российский симпозиум «Белки и пептиды» , Дагомыс, Россия, 1-6 октября 2019
2019
Studies of PARP inhibitors in the mononucleosome system
(Стендовый)
Авторы:
Maluchenko N.V. ,
Feofanov A.V. ,
Koshkina D.O. ,
Gerasimova N.S. ,
Studitsky V.M.
The 44th FEBS Congress, Krakow, Poland, July 6-11. , Краков, Польша, 6-11 июля 2019
2018
Effect of Na+ and K+ on nucleosome structure and function.
(Устный)
Авторы:
Feofanov A.V. ,
Andreeva T.V. ,
Lyubitelev A.V. ,
Kirpichnikov M.P. ,
Valieva M.E. ,
Malyuchenko N.V. ,
Studitsky V.М. ,
Chertkov O.V.
State-of-the-art Trends of Scientific Research of Artificial and Natural Nanoobjects (STRANN-2018) , Москва, Россия, 17-19 октября 2018
2018
Structural rearrangements in mononucleosomes induced by potassium and sodium ions: single particle FRET analysis
(Приглашенный)
Авторы:
Feofanov A.V. ,
Lyubitelev A.V. ,
Chertkov O.V. ,
Andreeva T.V. ,
Malyuchenko N.V. ,
Valieva M.E. ,
Studitsky V.М. ,
Kirpichnikov M.P.
International Conference on Photonics Research , Kemer, Турция, 7-12 октября 2018
2018
7-Methylguanine: a natural DNA repair inhibitor and a promising anticancer compound
(Стендовый)
Авторы:
Antoshina E. ,
Maluchenko N. ,
Nilov D. ,
Kirsanov K. ,
Feofanov A. ,
Kurgina T. ,
Zakharenko A. ,
Khodyreva S. ,
Gerasimova N. ,
Studitsky V. ,
Lavrik O. ,
Švedas V.
The 43th FEBS Congress , Прага, Чехия, 7-12 июля 2018
2018
Single-particle FRET Microscopy of Structural Rearrangements in Nucleosomes Induced by Some Nuclear Proteins
(Приглашенный)
Авторы:
Kudryashova K.S. ,
Kotova E.Y. ,
Studitsky V.М. ,
Kirpichnikov M.P. ,
Maluchenko N.V. ,
Valieva M.E. ,
Sultanov D.C. ,
Gerasimova N.S. ,
Chertkov O.V. ,
Armeev G.A. ,
Feofanov A.V. ,
Shaytan A.K.
5th International Congress on Microscopy & Spectroscopy ( INTERM 2018) , Oludeniz, Турция, 24-30 апреля 2018
2018
Effects of Histone Chaperones FACT and PARP1 on Nucleosome Structure and Transcription
(Приглашенный)
Авторы:
Sultanov D.C. ,
Valieva M.E. ,
Maluchenko N.V. ,
Kotova E. ,
Gerasimova N.S. ,
Armeev G.A. ,
Hsieh F.K. ,
Kudryashova K.S. ,
Kirpichnikov M.P. ,
Feofanov A.V. ,
Studitsky ,
Shaytan A.K.
Cold Spring Harbor Laboratory international meeting on “THE PARP FAMILY & ADP-RIBOSYLATION” , Cold Spring Harbor Laboratory, США, 3-6 апреля 2018
2017
nucleosome’s stability in volatile buffer
(Стендовый)
Авторы:
Valieva Maria E. ,
Gerasimova Nadezhda S. ,
Armeev Grigori A. ,
Maluchenko Natalia V. ,
Kudryashova Kseniya S. ,
Feofanov Alexey V. ,
Studitsky Vasily M. ,
Shaytan Alexey K.
"Biology at Advanced Laser Light Sources" workshop at European XFEL , Гамбург, European XFEL, Германия, 30 ноября - 1 декабря 2017
2017
Поли(АДФ-рибоза)-полимераза 1 и ее взаимодействия с нуклеосомами: анализ методом FRET-микроскопии одиночных частиц
(Устный)
Авторы:
Феофанов А.В. ,
Султанов Д.Ч. ,
Герасимова Н.С. ,
Кирпичников М.П. ,
Малюченко Н.В. ,
Котова Е.Ю. ,
Студитский В.М. ,
Кудряшова К.С.
12th International Scientific Conference on Bioorganic Chemistry devoted to the Memory of Professor Ovchinnikov/Международная научная конференция "XII чтения памяти академика Юрия Анатольевича Овчинникова" VIII Российский симпозиум "Белки и пептиды" , Москва, Россия, 18-22 сентября 2017
2017
Взаимодействия фермента РАRР1 с нуклеосомными наночастицами: исследования методом флуоресцентной микроскопии одиночных молекул и их комплексов.
(Устный)
Авторы:
Феофанов А. ,
Герасимова Н. ,
Султанов Д. ,
Кирпичников М. ,
Котова Е. ,
Студитский В. ,
Малюченко Н.
VIII Съезд Российского фотобиологического общества. Всероссийская конференция "Современные проблемы фотобиологии" , пос. Шепси, Краснодарский край, Россия, 10-15 сентября 2017
2017
Large-Scale ATP-independent nucleosome unfolding by a histone chaperone FACT
(Стендовый)
Авторы:
Shaytan A.K. ,
Valieva M.E. ,
Armeev G.A. ,
Kudryashova K.S. ,
Gerasimova N.S. ,
Kulaeva O.I. ,
McCullough L.L. ,
Formosa T. ,
Studitsky V.M. ,
Feofanov A.V.
Chromatin and Epigenetics , Гейдельберг, Германия, 3-6 мая 2017
2016
Stabilization of Tailless Nucleosome by Human FACT
(Стендовый)
Авторы:
Valieva M.E. ,
Герасимова Надежда Сергеевна ,
Kudryashova K.S. ,
Kozlova A. ,
Hu Q. ,
Botuyan M.V. ,
Mer G. ,
Feofanov A.V. ,
Studitsky V.M.
Международный научный семинар и практическая школа Экспрессия генов , Москва, Ленинские горы д.1 стр.73, Россия, 7-9 декабря 2016
2016
Chromatin Transcription: Epigenetics, Cancer & Aging
(Устный)
Авторы:
Valieva Maria E. ,
Gerasimova Nadezhda S. ,
Armeev Grigori A. ,
Kudryashova Kseniya S. ,
Nikitin Dmitry V. ,
Chertkov Oleg V. ,
Kulaeva Olga I. ,
Feofanov Alexey V. ,
Kirpichnikov Mikhail P. ,
Studitsky Vasily M. ,
Shaytan Alexey K.
II Международная научная конференция «Наука будущего» , Казань, Россия, 20-23 сентября 2016
2016
FRET microscopy of single nucleosomal nanoparticles and their complexes with proteins.
(Устный)
Авторы:
Feofanov A.V. ,
Kudryashova K.S. ,
Lyubitelev A.V. ,
Mikhaylova M.S. ,
Kirpichnikov M.P. ,
Malyuchenko N.V. ,
Chertkov O.V. ,
Studitsky V.М. ,
Gerasimova N.S.
V International Scientific Conference STRANN 2016 , Санкт-Петербург, Россия, 26-29 апреля 2016
2015
Interactions of nucleosomes with proteins: single-particle FRET analysis
(Приглашенный)
Авторы:
Feofanov A.V. ,
Kudryashova K.S. ,
Lyubitelev A.V. ,
Studitsky V.М. ,
Nikitin D.V. ,
Kirpichnikov M.P. ,
Chertkov O.V.
V International Symposium “Topical Problems of Biophotonics” (TPB-2015), 20 – 24 July, 2015 Nizhny Novgorod, Russia , Nizhny Novgorod, Россия, 20-24 июля 2015
2014
Structural Analysis of the Strong Nucleosomal Barrier to Transcription by Pol II
(Стендовый)
Авторы:
Gaykalova D.A. ,
Volokh O.I. ,
Kulaeva O.I. ,
Hsieh F. ,
Kirpichnikov M.P. ,
Sokolova O.S. ,
Studitsky V.M. ,
Shaytan A.K.
Gordon Research Conference , Bentley University Waltham, MA, США, 8-13 июня 2014
2013
DNA damage by benzo[a]pyrene impairs DNA methylation by mammalian Dnmt3a DNA methyltransferase: a way to in vivo approximation
(Стендовый)
Авторы:
Lukashevich O.V. ,
Ryabova Ju Y. ,
Efimova N.S. ,
Gromova E.S. ,
Studitsky V.M. ,
Cherepanova N.A. ,
Kolbanovsky A. ,
Kirsanova O.V.
Biocatalysis-2013, Fundamentals & Applications , Moscow, Russia, Россия, 2013
2013
DNA damage by benzo[a]pyrene impairs DNA methylation by mammalian Dnmt3a DNA methyltransferase: a way to in vivo approximation
Авторы:
Lukashevich O.V. ,
Efimova N.S. ,
Kirsanova O.V. ,
Studitsky V.M. ,
Cherepanova N.A. ,
Kolbanovsky A. ,
Geacintov N.E. ,
Gromova E.S. ,
Ryabova J.Y.
International Conf. "Biocatalysis-2013": Fundamentals and Application , Moscow, Россия, 2013
2013
DNA damage by benzo[a]pyrene impairs DNA methylation by mammalian Dnmt3a DNA methyltransferase: a way to in vivo approximation
(Стендовый)
Авторы:
Lukashevich O.V. ,
Ryabova Ju Y. ,
Efimova N.S. ,
Kirsanova O.V. ,
Studitsky V.M. ,
Cherepanova N.A. ,
Kolbanovsky A. ,
Geacintov N.E. ,
Gromova and E.S
INTERNATIONAL CONFERENCE BIOCATALYSIS-2013 FUNDAMENTALS & APPLICATIONS , Москва, Россия, 2-5 июля 2013
2013
DNA damage by benzo[a]pyrene impairs DNA methylation by mammalian Dnmt3a DNA methyltransferase: a way to in vivo approximation
(Стендовый)
Авторы:
Lukashevich O.V. ,
Ryabova Ju Y. ,
Efimova N.S. ,
Kirsanova O.V. ,
Gromova and E.S ,
Cherepanova N.A. ,
Kolbanovsky A. ,
Geacintov N.E. ,
Studitsky V.M.
INTERNATIONAL CONFERENCE BIOCATALYSIS-2013 FUNDAMENTALS & APPLICATIONS , Москва, Россия, 2-5 июля 2013
Тезисы докладов
2022
Nucleosome reorganization by PARP-1
Maluchenko N.V. ,
Nilov D.K. ,
Koshkina D.O. ,
Lys A.A. ,
Geraskina O. ,
Korovina A.N. ,
Feofanov A.V. ,
Studitsly V.
в сборнике BIOINFORMATICS OF GENOME REGULATION AND STRUCTURE/systems biology (BGRS/SB-2022) The Thirteenth International Multiconference Abstracts , место издания Institute of Cytology and Genetics, the Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences Novosibirsk: ICG SB RAS , тезисы, с. 1005
DOI
2022
Исследование действия кверцетина на нуклеосомы методом флуоресцентной микроскопии одиночных частиц
Андреева Т.В. ,
Любителев А.В. ,
Студитский В.М. ,
Феофанов А.В.
в сборнике Успехи молекулярной онкологии. Материалы VII Всероссийской конференции по молекулярной онкологии 21–23 декабря 2022 г., Москва , серия 4 , место издания Издательский дом «АБВ-пресс» НИИ Канцерогенеза ФГБУ «НМИЦ онкологии им. Н.Н. Блохина» Минздрава России, Москва , том 9, тезисы, с. 86
2020
HUMAN PARP1 UNFOLDS NUCLEOSOMES AND FACILITATES TRANSCRIPTION THROUGH CHROMATIN BY POL II
Kotova Elena ,
Maluchenko Natalia V. ,
Pascal John M. ,
Feofanov Alexey V. ,
Studitsky Vasily M.
в сборнике THE PARP FAMILY and ADP-RIBOSYLATION , серия Abstracts of papers presented at the 2020 virtual meeting , издательство Cold Spring Harbor Laboratory (Cold Spring Harbor, NY, United States) , тезисы, с. 116-116
2020
ИНГИБИТОРЫ ПОЛИ-АДФ-РИБОЗО-ПОЛИМЕРАЗЫ-1 И ИХ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ С НУКЛЕОСОМАМИ
Малюченко Н.В. ,
Нилов Д.К. ,
Кошкина Д.О. ,
Лыс А.А. ,
Студитский В.М. ,
Феофанов А.В.
в сборнике Сборник тезисов докладов Шестой Междисциплинарной конференции «Молекулярные и Биологические аспекты Химии, Фармацевтики и Фармакологии» , серия МОБИ-ХимФарма , издательство Общество с ограниченной ответственностью Издательство Перо (Москва) , том 1, тезисы, с. 68-68
2019
Исследование ингибирующего действия госсипола на PARP-1
Малюченко Н.В. ,
Герасимова Н.С. ,
Котова Е.Ю. ,
Феофанов А.В. ,
Студитский В.М.
в сборнике ACTA NATURAE , серия СПЕЦВЫПУСК Научные Труды II Объединенного научного форума (VI Съезд физиологов СНГ, VI Съезд биохимиков России, IX Российский симпозиум "Белки и пептиды") , место издания Перо Москва , том 2, тезисы, с. 23-23
2019
Поиск молекулярных поверхностей̆PARP-1 для разработки новых ингибиторов фермента
Кошкина Д.О. ,
Малюченко Н.В. ,
Любителев А.В. ,
Феофанов А.В. ,
Студитский В.М.
в сборнике ACTA NATURAE , серия СПЕЦВЫПУСК Научные Труды II Объединенного научного форума (VI Съезд физиологов СНГ, VI Съезд биохимиков России, IX Российский симпозиум "Белки и пептиды") , место издания Перо Москва , том 2, тезисы, с. 226-226
2018
Single-particle FRET Microscopy of Structural Rearrangements in Nucleosomes Induced by Some Nuclear Proteins
Feofanov V. ,
Maluchenko N.V. ,
Valieva M.E. ,
Sultanov D.C. ,
Gerasimova N.S. ,
Chertkov O.V. ,
Armeev G.A. ,
Shaytan A.K. ,
Kudryashova K.S. ,
Kotova E.Y. ,
Studitsky V.М. ,
Kirpichnikov M.P.
в сборнике Book of abstracts of 5th International Congress on Microscopy & Spectroscopy (INTERM 2018) , место издания Turkey , тезисы, с. 55
2018
Structural rearrangements in mononucleosomes induced by potassium and sodium ions: single particle FRET analysis
Feofanov A.V. ,
Lyubitelev A.V. ,
Chertkov O.V. ,
Andreeva T.V. ,
Malyuchenko N.V. ,
Valieva M.E. ,
Studitsky V.М. ,
Kirpichnikov M.P.
в сборнике Book of Abstracts Interphotonics 2018 , место издания Kemer, Antalya , тезисы, с. 59
2017
Взаимодействия фермента РАRР1 с нуклеосомными наночастицами: исследования методом флуоресцентной микроскопии одиночных молекул и их комплексов
Феофанов А. ,
Герасимова Н. ,
Султанов Д. ,
Малюченко Н. ,
Котова Е. ,
Студитский В. ,
Кирпичников М.
в сборнике VIII Съезд Российского фотобиологического общества. Материалы съезда Под ред. И.И.Проскурякова, И.А. Найденова , серия ISBN 978-5-9905822-3-1 , место издания Пущино , тезисы, с. 110
2017
Взаимодействия фермента РАRР1 с нуклеосомными наночастицами: исследования методом флуоресцентной микроскопии одиночных молекул и их комплексов
Феофанов А. ,
Герасимова Н.С. ,
Султанов Д. ,
Малюченко Н. ,
Котова Е.Ю. ,
Студитский В.М. ,
Кирпичников М.
в сборнике VIII Съезд Российского фотобиологического общества. Материалы съезда Под ред. И.И.Проскурякова, И.А. Найденова , серия ISBN 978-5-9905822-3-1 , место издания Пущино , тезисы, с. 110
2017
Структурные исследования процессов транскрипции хроматина
Sokolova О.S. ,
Volokh О.I. ,
Gerasimova N.S. ,
Armeev G.А. ,
Shaytan А.К.,
Studitsky V.М.
в сборнике Acta Naturae, Международная научная конференция по биоорганической химии "XII чтения памяти академика Юрия Анатольевича Овчинникова" и VIII Российский симпозиум "Белки и пептиды" , серия СПЕЦВЫПУСК , место издания ИБХ РАН Перо Москва , тезисы, с. 95
2016
Изучение взаимодействия белкового фактора PARP-1 с коровой частью нуклеосомы методом spFRET-микроскопии
Султанов Д.Ч. ,
Михайлова М.С. ,
Валиева М.Е. ,
Герасимова Н.С. ,
Кудряшова К.С. ,
Феофанов А.В. ,
Студитский В.М.
в сборнике Материалы XXVIII Зимней молодежной научной школы «Перспективные направления физико-химической биологии и биотехнологии», 8-11 февраля 2016, Москва , место издания Москва , тезисы, с. 85
2016
Моделирование динуклеосом на промоторе с использованием ДНК-матриц, адаптированных для spFRET-микроскопии
Валиева М.Е. ,
Герасимова Н.С. ,
Кудряшова К.С. ,
Феофанов А.В. ,
Студитский В.М.
в сборнике Материалы XXVIII Зимней молодежной научной школы «Перспективные направления физико-химической биологии и биотехнологии», 8-11 февраля 2016, Москва , место издания Москва , тезисы, с. 7
2016
Разработка метода флуоресцентной микроскопии одиночных молекул для изучения взаимодействий белкового фактора PARP-1 с нуклеосомами
Михайлова М.С. ,
Кудряшова К.С. ,
Любителев А.В. ,
Герасимова Н.С. ,
Феофанов А.В. ,
Студитский В.М.
в сборнике Материалы XXVIII Зимней молодежной научной школы «Перспективные направления физико-химической биологии и биотехнологии», 8-11 февраля 2016, Москва , место издания Москва , тезисы, с. 99
2013
DNA damage by benzo[a]pyrene impairs DNA methylation by mammalian Dnmt3a DNA methyltransferase: a way to in vivo approximation
Lukashevich O.V. ,
Ryabova J.Y. ,
Efimova N.S. ,
Kirsanova O.V. ,
Studitsky V.M. ,
Cherepanova N.A. ,
Kolbanovsky A. ,
Geacintov N.E. ,
Gromova E.S.
в сборнике Abstracts of International Conference "Biocatalysis-2013: Fundamentals & Applications" , место издания Moscow , тезисы, с. 86-86
2013
Исследование нуклеосом и элонгационных комплексов методами атомистического компьютерного моделирования», VII Московский международный конгресс, Биотехнология: состояние и перспективы развития, 19-22 марта 2013, материалы конгресса
Шайтан А.К. ,
Армеев Г.А. ,
Блинов В.Н. ,
Севенюк А.А.,
Студитский В.М.«
в сборнике VII Московский международный конгресс, "Биотехнология: состояние и перспективы развития Москва, 19-22 марта 2013 г. Материалы Конгресса , место издания ЗАО «Экспо-биохим-технологии», РХТУ им. Д.И.Менделеева г.Москва , том 1, тезисы, с. 251-251
НИРы
29 сентября 2021 - 31 декабря 2023
Новые системы и уровни редактирования геномов: от нуклеотидной последовательности к пространственной организации (биологический факультет)
Биологический факультет
Руководитель:
Студитский В.М.
Ответственный исполнитель:
Каменский П.А.
Участники НИР:
Армеев Г.А. ,
Афонин Д.А. ,
Багров Д.В. ,
Балева М.В. ,
Волох О.И. ,
Вьюшков В.С. ,
Галдина Г.В. ,
Герасимов Е.С. ,
Герасимова Н.С. ,
Гилязова А.В. ,
Глухов Г.С. ,
Грибкова А.К. ,
Замалутдинова С.В. ,
Карлова М.Г. ,
Карпова О.И. ,
Кирпичников М.П. ,
Князева А.С. ,
Коровина А.Н. ,
Левицкий С.А. ,
Ломов Н.А. ,
Любителев А.В. ,
Малюченко Н.В. ,
Маслакова А.А. ,
Петрова Е.В. ,
Пиунова У.Е. ,
Разин С.В. ,
Рамонова А.А. ,
Рубцов М.А. ,
Соколова О.С. ,
Станишнева-Коновалова Т.Б. ,
Ульянов С.В. ,
Феофанов А.В. ,
Чичерин И.В. ,
Шайтан А.К. ,
Шайтан К.В.
22 марта 2021 - 31 декабря 2024
Молекулярные механизмы действия эпигенетически активных полифенолов и кураксинов – перспективных соединений для противоопухолевой терапии
Кафедра биоинженерии
Руководители:
Малюченко Н.В. ,
Студитский В.М.
Ответственные исполнители:
Герасимова Н.С. ,
Коровина А.Н. ,
Малюченко Н.В.
Участники НИР:
Андреева Т.В. ,
Бондаренко Е.А. ,
Гераськина О.В. ,
Кошкина Д.О. ,
Малинина Д.К. ,
Орлов Н.А. ,
Саулина А.А. ,
Черникова П.А.
1 января 2021 - 31 декабря 2025
Физико-химические основы молекулярной биоинженерии
Кафедра биоинженерии
Руководитель:
Кирпичников М.П.
Ответственные исполнители:
Лобакова Е.С. ,
Шайтан К.В.
Участники НИР:
Айдналиева Н.В. ,
Алескерова Л.Э. ,
Алипкина С.И. ,
Аргентова В.В. ,
Армеев Г.А. ,
Архипова А.Ю. ,
Ахаев Д.Н. ,
Багров Д.В. ,
Барский Е.Л. ,
Баулина О.И. ,
Боздаганян М.Е. ,
Бонарцев А.П. ,
Бондаренко Е.А. ,
Буракова О.В. ,
Васильева С.Г. ,
Вахрушева А.В. ,
Волох О.И. ,
Гапизов С.Ш. ,
Герасимова Н.С. ,
Гераськина О.В. ,
Глухов А.И. ,
Глухов Г.С. ,
Горелова О.А. ,
Грибкова А.К. ,
Дольникова Г.А. ,
Жаркова И.И. ,
Зайцев П.А. ,
Зайцева А.А. ,
Карлова М.Г. ,
Качер Ю.Г. ,
Князева А.С. ,
Коровина А.Н. ,
Кошкина Д.О. ,
Кудрявцев А.В. ,
Кудряцев А.В. ,
Кудряшова К.С. ,
Лукьянов А.А. ,
Любителев А.В. ,
Люкманова Е.Н. ,
Малинина Д.К. ,
Малюченко Н.В. ,
Мариловцева Е.В. ,
Налобин Д.С. ,
Никишин И.И. ,
Новоселецкий В.Н. ,
Орехов Ф.С. ,
Орлов Н.А. ,
Панченко Л.А. ,
Петушкова Ю.А. ,
Петушкова Ю.П. ,
Рамонова А.А. ,
Саванина Я.В. ,
Саулина А.А. ,
Селях И.О. ,
Семенова Л.Р. ,
Сивкина А.Л. ,
Сингх-Пальчевская Л.Р. ,
Соколова А.И. ,
Соколова О.С. ,
Соловченко А.Е. ,
Соловченко О.В. ,
Станишнева-Коновалова Т.Б. ,
Студитский В.М. ,
Суханова Ю.А. ,
Трифонова Е.С. ,
Утешинская Л.В. ,
Федоренко Т.А. ,
Феофанов А.В. ,
Чеканов К.А. ,
Чивкунова О.Б. ,
Шайтан А.К. ,
Шапиро Т.Н. ,
Шибзухова К.А. ,
Шиловский Г.А. ,
Щербаков П.Н. ,
Яголович А.В.
1 марта 2019 - 31 декабря 2021
Изучение взаимодействия С-концевого домена РНК-полимеразы II и хроматина в элонгации транскриптов через нуклеосому
Кафедра биоинженерии
Руководитель:
Студитский В.М.
Ответственные исполнители:
Герасимова Н.С. ,
Коровина А.Н.
Участники НИР:
Андреева Т.В. ,
Афонин Д.А. ,
Бондаренко Е.А. ,
Голяева В.Е. ,
Дралкина М.Г. ,
Коровина А.Н. ,
Косарим Н.А. ,
Кошкина Д.О. ,
Любителев А.В. ,
Малинина Д.К. ,
Малюченко Н.В. ,
Мариловцева Е.В. ,
Сивкина А.Л.
2 мая 2017 - 31 декабря 2018
Эпигенетические механизмы и регуляция транскрипции: структурно-функциональный анализ и разработка новых методов исследования
Биологический факультет
Руководитель:
Кирпичников М.П.
Ответственный исполнитель:
Шайтан К.В.
Участники НИР:
Алескерова Л.Э. ,
Армеев Г.А. ,
Багров Д.В. ,
Волох О.И. ,
Герасимова Н.С. ,
Ефременко А.В. ,
Иванова М.А. ,
Иванова М.А. ,
Карлова М.Г. ,
Киташов А.В. ,
Любителев А.В. ,
Малюченко Н.В. ,
Никитин Д.В. ,
Сивкина А.Л. ,
Соколова О.С. ,
Студитский В.М. ,
Феофанов А.В. ,
Чертков О.В. ,
Шайтан А.К.
1 января 2016 - 31 декабря 2020
Физико-химические основы молекулярной биоинженерии
Кафедра биоинженерии
Руководитель:
Кирпичников М.П.
Участники НИР:
Айдналиева Н.В. ,
Алескерова Л.Э. ,
Аргентова В.В. ,
Армеев Г.А. ,
Архипова А.Ю. ,
Асланян Р.Р. ,
Ахаев Д.Н. ,
Багров Д.В. ,
Барский Е.Л. ,
Баулина О.И. ,
Боздаганян М.Е. ,
Бонарцев А.П. ,
Бондаренко Е.А. ,
Буракова О.В. ,
Валиева М.Е. ,
Васильева С.Г. ,
Вахрушева А.В. ,
Волох О.И. ,
Волынцева А.Д. ,
Герасимова Н.С. ,
Гераськина О.В. ,
Глухов А.И. ,
Глухов Г.С. ,
Гончаренко А.В. ,
Гончарук М.В. ,
Гончарук С.А. ,
Гордеев С.А. ,
Горелова О.А. ,
Долгих Д.А. ,
Дольникова Г.А. ,
Жаркова И.И. ,
Зайцева А.А. ,
Иванова М.А. ,
Карлова М.Г. ,
Коровина А.Н. ,
Кошкина Д.О. ,
Кузьменков А.И. ,
Лобакова Е.С. ,
Лукьянов А.А. ,
Любителев А.В. ,
Малюченко Н.В. ,
Мариловцева Е.В. ,
Мойсенович А.М. ,
Мойсенович М.М. ,
Налобин Д.С. ,
Никитин Д.В. ,
Новоселецкий В.Н. ,
Орехов Ф.С. ,
Орлова А.А. ,
Панченко Л.А. ,
Петушкова Ю.А. ,
Петушкова Ю.П. ,
Попова С.С. ,
Пугачева Т.Т. ,
Рамонова А.А. ,
Саванина Я.В. ,
Савилова З.Д. ,
Селях И.О. ,
Семенова Л.Р. ,
Сивкина А.Л. ,
Соколова О.С. ,
Соловченко А.Е. ,
Соловченко О.В. ,
Станишнева-Коновалова Т.Б. ,
Студитский В.М. ,
Суханова Ю.А. ,
Тамбиев А.Х. ,
Трифонова Е.С. ,
Утешинская Л.В. ,
Федоренко Т.А. ,
Феофанов А.В. ,
Чеканов К.А. ,
Чемерис А.С. ,
Чертков О.В. ,
Чивкунова О.Б. ,
Шайтан А.К. ,
Шайтан К.В. ,
Шебанова А.С. ,
Шибзухова К.А. ,
Щербаков П.Н. ,
Яголович А.В. ,
герасимова н.с.
1 декабря 2010 - 31 декабря 2012
Эукариотическое транскрибирование: механизмы генетических и эпигенетических процессов и разработка регуляторов для биоинженерии
Биологический факультет
Руководитель:
Студитский В.М.
Участники НИР:
Аргентова В.В. ,
Армеев Г.А. ,
Багров Д.В. ,
Волох О.И. ,
Герасимова Н.С. ,
Глухов Г.С. ,
Демиденко А.В. ,
Ефременко А.В. ,
Ефремов Ю.М. ,
Иванова М.А. ,
Киташов А.В. ,
Кудряшова К.С. ,
Кулаева О.И. ,
Малюченко Н.В. ,
Маслакова А.А. ,
Никитин Д.В. ,
Орловский И.В. ,
Печникова Е.В. ,
Роскошная А.С. ,
Рубцов М.А. ,
Соколова О.С. ,
Феофанов А.В. ,
Чертков О.В. ,
Шайтан А.К.
1 января 2006 - 31 декабря 2015
Физико-химические основы молекулярной биоинженерии
Кафедра биоинженерии
Руководитель:
Кирпичников М.П.
Участники НИР:
Аргентова В.В. ,
Архипова А.Ю. ,
Асланян Р.Р. ,
Багров Д.В. ,
Барский Е.Л. ,
Баулина О.И. ,
Бонарцев А.П. ,
Буракова О.В. ,
Васильева С.Г. ,
Гончаренко А.В. ,
Гончарук М.В. ,
Гончарук С.А. ,
Горелова О.А. ,
Дольникова Г.А. ,
Лобакова Е.С. ,
Лукьянов А.А. ,
Малюченко Н.В. ,
Мойсенович М.М. ,
Несов А.В. ,
Никитин Д.В. ,
Новоселецкий В.Н. ,
Панченко Л.А. ,
Петушкова Ю.А. ,
Петушкова Ю.П. ,
Попова С.С. ,
Саванина Я.В. ,
Селях И.О. ,
Семенова Л.Р. ,
Соколова О.С. ,
Соловченко А.Е. ,
Соловченко О.В. ,
Станишнева-Коновалова Т.Б. ,
Студитский В.М. ,
Тамбиев А.Х. ,
Трифонова Е.С. ,
Федоренко Т.А. ,
Чеканов К.А. ,
Чемерис А.С. ,
Чертков О.В. ,
Чивкунова О.Б. ,
Шайтан А.К. ,
Шайтан К.В. ,
Шебанова А.С. ,
Яголович А.В.
Патенты
Отчеты
2012
Итоговый, этап №3
Авторы:
Малюченко Н.В. ,
Студитский В.М. ,
Демиденко А.В. ,
Киташов А.В. ,
Кулаева О.И. ,
Аргентова Виктория Витальевна ,
Багров Д.В. ,
Ефимова Н.С. ,
Никитин Дмитрий Валерьевич ,
Соколова О.С. ,
Феофанов А.В. ,
Шайтан А.К.
#5, 227 с.
Руководство диссертациями
Диссертация
Руководство дипломными работами