ИСТИНА

Панин Николай Владимирович пользователь

МГУ имени М.В. Ломоносова, Научно-исследовательский институт физико-химической биологии имени А.Н.Белозерского, Отдел биокинетики, старший научный сотрудник, с 1 декабря 2014

кандидат химических наук с 2014 года

Соавторы: Швядас В.К., Суплатов Д.А., Морозова И.А., Щербакова Т.А., Kudryavtsev P.A., Дробот В.В., Кирилин Е.М., Копылов К.Е., Никулин М.В., Тюрин Е.С., Шаповалова И.В., Chilov G.G., Govorun V.M. показать полностью..., Novikov F.N., Pobeguts O.V., Stroganov O.V., Švedas V.K., Балдин С.М., Бутенко И.О., Гуранда Д.Ф., Кокшарова О.А., Тимофеева А.В., Халиуллин И.Г.

8 статей, 17 докладов на конференциях, 3 тезисов докладов, 9 НИР, 4 патента, 1 диссертация, 9 дипломных работ, 3 курсовые работы

Количество цитирований статей в журналах по данным Web of Science: 39, Scopus: 42

IstinaResearcherID (IRID): 2838362

Деятельность

• Статьи в журналах

  • 
    • 2019 Studying the Possibilities of Using 2-Halogen-Substituted Acetamides As Acyl Donors in Penicillin Acylase-Catalyzed Reactions
    • Panin N.V., Nikulin M.V., Tiurin E.S., Drobot V.V., Morozova I.A., Svedas V.K.
    • в журнале Acta Naturae (англоязычная версия), издательство Park Media Ltd (Moscow, Russia (Federation)), том 11, № 2, с. 77-81 DOI
  • 
    • 2019 Изучение возможностей использования 2-галоген-замещенных ацетамидов в качестве ацильных доноров в реакциях, катализируемых пенициллинацилазами
    • Панин Н.В., Никулин М.В., Тюрин Е.С., Дробот В.В., Морозова И.А., Швядас В.К.
    • в журнале Acta Naturae (русскоязычная версия), издательство Парк-медиа (М.), том 11, № 2, с. 77-81 DOI
  • • 2019 Специфичность пенициллинацилаз в реакциях снятия бензилоксикарбонильной защитной группы в аминокислотах
    • Морозова И.А., Гуранда Д.Ф., Панин Н.В., Швядас В.К.
    • в журнале Acta Naturae (русскоязычная версия), издательство Парк-медиа (М.)
  • • 2016 Modulation Of Enzyme Functional Properties
    • Suplatov D.A., Panin N.K., Kopylov K.E., Švedas V.K.
    • в журнале Acta Naturae (русскоязычная версия), издательство Парк-медиа (М.), том 2, с. 222-223
  • 
    • 2015 The βD484N mutant of penicillin acylase from Escherichia coli is more resistant to inactivation by substrates and can effectively perform peptide synthesis in aqueous medium
    • Shcherbakova T.A., Panin N.V., Suplatov D.A., Shapovalova I.V., Svedas V.K.
    • в журнале Journal of Molecular Catalysis - B Enzymatic, издательство Elsevier BV (Netherlands), том 112, с. 66-68 DOI
  • 
    • 2014 Computational Design of a pH Stable Enzyme: Understanding Molecular Mechanism of Penicillin Acylase's Adaptation to Alkaline Conditions
    • Suplatov D., Panin N., Kirilin E., Shcherbakova T., Kudryavtsev P., Švedas V.
    • в журнале PLoS ONE, издательство Public Library of Science (United States), том 9, № 6, с. e100643 DOI
  • 
    • 2013 Bioinformatic analysis and molecular modeling reveal mutation bD484N to stabilize penicillin acylase and improve its catalytic performance in alkaline medium
    • Panin N., Suplatov D., Kirilin E., Shcherbakova T., Kudravtsev P., Švedas V.
    • в журнале FEBS Journal, издательство Blackwell Publishing Inc. (United Kingdom), том 280, № 1, с. 614 DOI
  • 
    • 2013 Molecular modeling of different substrate-binding modes and their role in penicillin acylase catalysis
    • Novikov Fedor N., Stroganov Oleg V., Khaliullin Ilyas G., Panin Nikolay V., Shapovalova Irina V., Chilov Ghermes G., Svedas Vytas K.
    • в журнале FEBS Journal, издательство Blackwell Publishing Inc. (United Kingdom), том 280, с. 115-126 DOI

• Доклады на конференциях

  • • 2019 Molecular modeling of penicillin acylase mutant with increased specificity to bromoacetamide as acyl donor (Стендовый)
    • Авторы: Дробот В.В., Швядас В.К., Панин Н.В., Кирилин Е.М.
    • 12th International Conference “Biocatalysis: Fundamentals and Applications”, Санкт Петербург, Россия, 24-28 июня 2019
  • • 2019 Penicillin acylase in chemoenzymatic synthesis of peptidomimetics (Стендовый)
    • Авторы: Morozova I.A., Panin N.V., Svedas V.K.
    • 12th International Conference “Biocatalysis: Fundamentals and Applications”, Санкт Петербург, Россия, 24-28 июня 2019
  • • 2018 Инженерная энзимология: новые возможности использования ферментов при модуляции их функциональных свойств (Пленарный)
    • Авторы: Швядас В.К., Суплатов Д.А., Панин Н.В., Гуранда Д.Ф.
    • Международный Форум "Биотехнология: состояние и перспективы развития. Науки о жизни" (BIOTECH WORLD 2018), Москва, Гостиный двор, Ильинка, 4, Россия, 23-25 мая 2018
  • • 2018 Разработка технологии ферментативного получения универсальной бета-лактамной платформы (Стендовый)
    • Авторы: Панин Н., Дробот В., Никулин М., Тюрин Е., Швядас В.
    • Международный Форум "Биотехнология: состояние и перспективы развития. Науки о жизни" (BIOTECH WORLD 2018), Москва, Гостиный двор, Ильинка, 4, Россия, 23-25 мая 2018
  • • 2017 Improved variants of penicillin acylase E.coli for stereoselective acylation of amino alcohols in aqueous medium (Стендовый)
    • Авторы: Panin N., Aksenova V., Zabilskaya A., Svedas V.
    • Biocatalysis-2017: Fundamentals & applications. June 25-30, 2017, Moscow Region, Russian Federation., Истра, Россия, 25-30 июля 2017
  • • 2016 Design of stabilized penicillin acylase variants and their applications for synthesis (Устный)
    • Авторы: Panin N., Shcherbakova T., Suplatov D., Švedas V.
    • 22nd International Conference "INPEC-2016" (International Network of Protein Engineering Centers). Daejeon, Republic of Korea, 2016, November 6-10, Daejeon, Корея, Республика, 6-10 ноября 2016
  • • 2016 Modulation Of Enzyme Functional Properties (Устный)
    • Авторы: Suplatov D.A., Švedas V.K., Kopylov K.E., Panin N.K.
    • V Съезд физиологов СНГ, V Съезд Биохимиков России, Сочи, Россия, 4-8 октября 2016
  • • 2015 Bioinformatic analysis of diverse protein superfamilies to design improved enzymes (Устный)
    • Авторы: Suplatov D., Panin N., Švedas V., Khaliullin I., Shcherbakova T.
    • Moscow Conference on Computational Molecular Biology (MCCMB'15), Москва, МГУ им. М.В. Ломоносова, Россия, 16-19 июля 2015
  • • 2015 Рациональный дизайн ферментов с использованием методов биоинформатики и молекулярного моделирования (Устный)
    • Авторы: Швядас В.К., Суплатов Д.А., Панин Н.В., Халиуллин И.Г.
    • VIII Московский международный конгресс «Биотехнология: Состояние и перспективы развития», Москва, Россия, 17-20 марта 2015
  • • 2014 Computational design of stabilized penicillin acylase to improve its catalytic performance (Устный)
    • Авторы: Švedas V., Panin N., Shcherbakova T., Suplatov D.
    • ProtStab 2014 - 10th International Conference on Protein Stabilisation, Stresa, Lake Maggiore, Italy, Италия, 2014
  • • 2014 Computationally designed βD484 variant of penicillin acylase from Escherichia coli is stabilized in alkaline medium and resistant to inactivation by substrates in highly concentrated reaction mixtures
    • Авторы: Panin N., Shcherbakova T., Suplatov D., Švedas V.
    • INPEC-2014, Russia (Sankt-Petersburg), Россия, 2014
  • • 2014 Design of novel biocatalysts with improved functional properties based on bioinformatic analysis of diverse enzyme families and molecular modeling (Устный)
    • Авторы: Švedas V., Khaliullin I., Panin N., Suplatov D.
    • INPEC-2014, Russia (Sankt-Petersburg), Россия, 2014
  • • 2014 Knowledge-based design of enzyme functional properties (Устный)
    • Авторы: Suplatov D., Švedas V., Khaliullin I., Panin N.
    • XIII International Conference of Lithuanian Biochemical Society dedicated to the 50th anniversary of FEBS, Birstonas, Lithuania, Литва, 2014
  • • 2013 Bioinformatic analysis and molecular modeling reveal mutation bD484N to stabilize penicillin acylase and improve its catalytic performance in alkaline medium (Стендовый)
    • Авторы: Panin N., Suplatov D., Švedas V., Shcherbakova T., Kudravtsev P., Kirilin E.
    • International Conference BIOCATALYSIS-2013: Fundamentals & Applications, July 2-5, Moscow , 2013
  • • 2013 Rational design of penicillin acylase based on bioinformatic analysis and molecular modeling to improve enzyme catalytic performance in alkaline medium
    • Авторы: Kirilin E., Shcherbakova T., Kudravtsev P., Švedas V., Panin N., Suplatov D.
    • Enzyme Engineering XXII, 2013, September 22-26, Japan (Toyama), Japan (Toyama), Япония, 2013
  • • 2014 Bioinformatic analysis of sequence and structural data to study structure-function relationship in diverse protein superfamilies and develop novel enzyme engineering strategies (Устный)
    • Авторы: Khaliullin I., Suplatov D., Švedas V., Panin N.
    • 9th International Conference "Biocatalysis -2013: Fundamentals & Applications", July 2-5, 2013, Moscow, Россия, 2-5 июля 2013
  • • 2010 Engineering of catalytic properties and stereoselectivity of penicillin acylase (Устный)
    • Авторы: Tishkov V., Panin N.Švedas V, Savin S., Yasnaya A.
    • XIV International Conference “INPEC-2010” (International Network of Protein Engineering Centres), Uppsala, Sweden, October 6-9, 2010, Уппсала, Швеция, 6-9 октября 2010

• Тезисы докладов

  • • 2019 Экологические функции метаболитов цианобактерий
    • Кокшарова О.А., Панин Н.В., Тимофеева А.В., Бутенко И.О., Побегуц О.В., Говорун В.М.
    • в сборнике Всероссийская конференция с международным участием «Микробиология: вопросы экологии, физиологии, биотехнологии»,, место издания Москва, тезисы, с. 63-63
  • • 2017 Использование методов биоинформатики и молекулярного моделирования для поиска путей модуляции функциональных свойств ферментов
    • Суплатов Д.А., Балдин С.М., Панин Н.К., Швядас В.К.
    • в сборнике Acta Naturae. СПЕЦВЫПУСК. Международная научная конференция по биоорганической химии "XII чтения памяти академика Юрия Анатольевича Овчинникова" и VIII Российский симпозиум "Белки и пептиды", место издания Перо Москва, ИБХ РАН, 18-22 сентября 2017, тезисы, с. 121-121
  • • 2016 Modulation of enzyme functional properties
    • Suplatov D.A., Panin N.K., Kopylov K.E., Švedas V.K.
    • в сборнике ACTA NATURAE, серия СПЕЦВЫПУСК, том 2, тезисы, с. 222-223

• НИРы

  • • 13 ноября 2020 - 31 января 2021 Синтез субстрата омега-амидазы α-кето-глутарамата и кето-аналога селенометионина α-кето-метил-селено-бутирата
    • Научно-исследовательский институт физико-химической биологии имени А.Н.Белозерского
    • Руководитель: Швядас В.К. Ответственный исполнитель: Никулин М.В. Участники НИР: Балдин С.М., Гуранда Д.Ф., Дробот В.В., Панин Н.В., Суплатов Д.А., Успенская Т.В., Щербакова Т.А.
  • • 1 января 2019 - 31 декабря 2022 Поиск регуляторов биологических процессов, воздействующих на белки, ферменты, полиферментные комплексы и рецепторные системы
    • Научно-исследовательский институт физико-химической биологии имени А.Н.Белозерского
    • Руководитель: Швядас В.К. Ответственный исполнитель: Муронец В.И. Участники НИР: Астахова А.А., Балдин С.М., Баринова К.В., Буник В.И., Вирясов М.Б., Вирясова Г.М., Голенкина Е.А., Гуранда Д.Ф., Дарбинян Т.Г., Дробот В.В., Калмыков П.В., Кирилин Е.М., Кочетов Г.А., Курочкина Л.П., Магретова Н.Н., Мельникова А.К., Мичурина В.Н., Никулин М.В., Нилов Д.К., Орлов В.Н., Панин Н.В., Пирожкова Е.Б., Позднякова Н.В., Поздышев Д.В., Севостьянова И.А., Семенюк П.И., Сергеева М.Г., Соловьев В.В., Соловьева О.Н., Стройлова Ю.Ю., Судьина Г.Ф., Суплатов Д.А., Успенская Т.В., Чистяков Д.В., Шмальгаузен Е.В., Щербакова Т.А.
  • • 15 августа 2018 - 31 декабря 2020 Установление взаимосвязи между структурой и функциональными свойствами белков/ферментов на основе интеллектуального анализа информационных ресурсов и разработка предсказательных алгоритмов
    • Научно-исследовательский институт физико-химической биологии имени А.Н.Белозерского
    • Руководитель: Суплатов Д.А. Ответственные исполнители: Воеводин В.В., Герасева Е.П., Дробот В.В., Лукашевич Н.В., Никулин М.В., Панин Н.В., Попова Н.Н., Тимонина Д.С., Шарапова Я.А., Швядас В.К. Участники НИР: Воеводин В.В., Дробот В.В., Лукашевич Н.В., Никулин М.В., Панин Н.В., Попова Н.Н., Тимонина Д.С., Шарапова Я.А., Швядас В.К.
  • • 31 июля 2017 - 31 июля 2019 Дизайн биокатализаторов для синтеза новых антибактериальных препаратов
    • Научно-исследовательский институт физико-химической биологии имени А.Н.Белозерского
    • Руководитель: Панин Н.В. Участники НИР: Дробот В.В., Никулин М.В., Щербакова Т.А.
  • • 21 апреля 2017 - 31 декабря 2019 Использование пенициллинацилазы для стереоселективного синтеза пептидов и пептидомиметиков
    • Научно-исследовательский институт физико-химической биологии имени А.Н.Белозерского
    • Руководитель: Панин Н.В. Ответственный исполнитель: Щербакова Т.А. Участники НИР: Аксёнова В.А., Вавилова А.м., Морозова И.А., Панина А.М., Тюрин Е.С.
  • • 1 января 2017 - 31 декабря 2019 Регуляторная роль нейротоксичной небелковой аминокислоты бета-N-метиламин-L-аланина (БМАА) в метаболизме цианобактерий и растений.
    • Лаборатория электрогенных фотопроцессов
    • Руководитель: Кокшарова О.А. Ответственные исполнители: Панин Н.В., Попова А.А., Сафронова Н.А., Тимофеева А.В.
  • • 1 января 2014 - 31 декабря 2018 Центр биомедицинских исследований, Компонент по инфекционным заболеваниям
    • Отдел биокинетики
    • Руководитель: Швядас В.К. Участники НИР: Балдин С.М., Кирилин Е.М., Мисюра Н.М., Муронец В.И., Никулин М.В., Нилов Д.К., Панин Н.В., Суплатов Д.А., Успенская Т.В., Халиуллин И.Г., Шаповалова И.В., Щербакова Т.А.
  • • 1 января 2014 - 23 декабря 2016 Получение мутантных форм пенициллинацилазы и Д-аминопептидазы с улучшенными каталитическими свойствами при помощи методов компьютерного дизайна и генетической инженерии
    • Факультет биоинженерии и биоинформатики
    • Руководитель: Швядас В.К. Участники НИР: Балдин С.М., Белый Т.С., Мисюра Н.М., Морозова И.А., Никулин М.В., Панин Н.В., Суплатов Д.А., Тажигулов Р.Н., Шаповалова И.В., Щербакова Т.А.
  • • 1 января 2013 - 31 декабря 2018 Управление биологическими процессами путем воздействия низкомолекулярными регуляторами на ферменты, полиферментные комплексы, рецепторные системы и другие супрамолекулярные структуры
    • Научно-исследовательский институт физико-химической биологии имени А.Н.Белозерского
    • Руководитель: Швядас В.К. Участники НИР: Астахова А.А., Балдин С.М., Буник В.И., Вирясова Г.М., Голенкина Е.А., Гуранда Д.Ф., Дарбинян Т.Г., Дробот В.В., Загряжская А.Н., Кирилин Е.М., Ливенский А.Д., Никулин М.В., Нилов Д.К., Панин Н.В., Пирожкова Е.Б., Сергеева М.Г., Судьина Г.Ф., Суплатов Д.А., Успенская Т.В., Чистяков Д.В., Щербакова Т.А.

• Патенты

  • • 2016 СПОСОБ УЛУЧШЕНИЯ КАТАЛИТИЧЕСКИХ СВОЙСТВ ПЕНИЦИЛЛИНАЦИЛАЗЫ ИЗ ESCHERICHIA COLI И ПРИМЕНЕНИЕ МУТАНТНОЙ ПЕНИЦИЛЛИНАЦИЛАЗЫ
    • Авторы: Гуранда Дорел Феодорович, Ямскова Ольга Александровна, Панин Николай Владимирович, Швядас Витаутас-Юозапас Каятоно
    • #2576002, 27 февраля
  • • 2016 Способ улучшения каталитических свойств пенициллинацилазы
    • Авторы: Гуранда Д.Ф., Ямскова О.В., Панин Н.В., Швядас В.К.
    • #2575304, 20 февраля
  • • 2015 Мутант пенициллинацилазы из E.coli с улучшенными свойствами
    • Авторы: Суплатов Д., Кудрявцев П., Панин Н., Щербакова Т., Швядас В.
    • #RU 2564578 С2, 10 октября
  • • 2015 Способ синтеза пептидов, в том числе бета-лактамных антибиотиков, при использовании варианта пенициллинацилазы
    • Авторы: Щербакова Т.А., Панин Н.В., Гуранда Д.Ф., Швядас В.К.
    • #RU 2537845 С2, 10 января

• Диссертация

  • • 2014 Направленный мутагенез пенициллинацилазы из Escherichia coli для изменения каталитических свойств и стабильности
    • Кандидатская диссертация по специальности 02.00.15 - Кинетика и катализ (хим. науки)
    • Автор: Панин Н.В., к.х.н., МГУ имени М.В. Ломоносова
    • Научные руководители: Швядас В.К., д.х.н., проф., МГУ имени М.В. Ломоносова, Гуранда Д.Ф., к.х.н., МГУ имени М.В. Ломоносова
    • Защищена в совете Д 501.001.59 при МГУ имени М.В. Ломоносова, Химический факультет
    • Организация, в которой выполнялась работа: НИИ ФХБ им.А.Н.Белозерского МГУ, ФББ МГУ
    • Ведущая организация: Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт биохимии имени А.Н. Баха Российской академии наук
    • Оппоненты: Кочетков К.А., Мирошников К.А.

• Руководство дипломными работами

  • • 2020 ВВЕДЕНИЕ ПРИРОДНЫХ ДИСУЛЬФИДНЫХ МОСТИКОВ В СТРУКТУРУ ПЕНИЦИЛЛИНАЦИЛАЗЫ Escherichia coli И ИХ ВЛИЯНИЕ НА КАТАЛИТИЧЕСКУЮ АКТИВНОСТЬ И СТАБИЛЬНОСТЬ
    • Научный руководитель: Панин Николай Владимирович
    • Автор: Панина Анна Михайловна (Бакалавр)
  • • 2019 «Использование галоген-замещенных ацетамидов в реакциях ферментативного ацилирования ядер β-лактамных антибиотиков, катализируемых пенициллинацилазой из E.coli»
    • Научные руководители: Швядас В.К., Панин Н.В.
    • Автор: Тюрин Е.С. (Магистр)
  • • 2015 Синтез и разделение энантиомерно чистых бета-фенилаланинолов
    • Научный руководитель: Никулин М.В., Панин Н.В.
    • Автор: Дробот В.В. (Бакалавр)
  • • 2015 Изучение закономерностей инактивации пенициллинацилазы из E.coli
    • Научные руководители: Щербакова Т.А., Панин Н.В.
    • Автор: Морозова Ирина Александровна (Специалист)
  • • 2014 Экспресс-методика определения цефадроксила для целей биоинженерии пенициллинацилазы из E.Coli
    • Научные руководители: Швядас В.К., Панин Н.В.
    • Автор: Дробот В.В. (Бакалавр)
  • • 2014 Определение цефадроксила в реакционной смеси при помощи ВЭЖХ.
    • Научный руководитель: Панин Н.В.
    • Автор: Чернышов В.Д. (Бакалавр)
  • • 2014 Изучение роли специфических аминокислотных остатков подсемейств гидролаз с N-концевым нуклеофилом в механизме действия пенициллинацилазы E.coli методами генетической инженерии
    • Научные руководители: Швядас В.К., Панин Н.В.
    • Автор: Белый Тарас Сергеевич (Специалист)
  • • 2013 Энантиоселективность мутантных форм пенициллинацилазы из E.coli в реакциях ацилирования аминоспиртов
    • Научные руководители: Швядас В.К., Панин Н.В.
    • Автор: Забильская Анастасия Викторовна (Специалист)
  • • 2013 Определение комплексных кинетических параметров реакции синтеза ампициллина, катализируемой пенициллинацилазой из Escherichia coli и ее мутантными формами
    • Научные руководители: Швядас В.К., Панин Н.В.
    • Автор: Балдин С.М. (Бакалавр)

• Руководство курсовыми работами

  • • 2017 Определение концентрационной константы равновесия ацильного переноса в реакции ферментативного синтеза пенициллина
    • Научный руководитель: Панин Николай Владимирович
    • Автор: Тюрин Е.С. (Бакалавр)
  • • 2015 Синтез оптически активных (R)- и (S)-фенилглицинолов
    • Научные руководители: Никулин М.В., Панин Н.В.
    • Автор: Аксенова В.А. (Специалист)
  • • 2015 Синтез и разделение энантиомерно чистых бета-фенилаланинолов
    • Научные руководители: Никулин М.В., Панин Н.В.
    • Автор: Дробот В.В. (Специалист)