Выберите категорию обращения:
Общие вопросы
Отчеты
Рейтинги
Мониторинговый отчёт
Диссертационные советы
Конкурсы
Ввод данных
Структура организаций
Аспирантура
Научное оборудование
Импорт педагогической нагрузки
Журналы и импакт-факторы
Тема обращения:
Описание проблемы:
Введите почтовый адрес:
ИСТИНА
Войти в систему
Регистрация
Интеллектуальная Система Тематического Исследования НАукометрических данных
Главная
Поиск
Статистика
О проекте
Помощь
В связи с техническими работами в центре обработки данных, часть прикреплённых файлов в настоящее время недоступна.
скрыть
отправить сообщение
Первушин Дмитрий Давидович
пользователь
МГУ имени М.В. Ломоносова
,
Факультет биоинженерии и биоинформатики
, доцент, с 1 сентября 2009
кандидат физико-математических наук с 2002 года
Прежние места работы
(Нажмите для отображения)
МГУ имени М.В. Ломоносова
,
Научно-исследовательский институт физико-химической биологии имени А.Н.Белозерского
, 1 июля 2009 - 31 августа 2009
Соавторы:
Djebali S.
,
Kopell N.
,
Davis C.A.
,
Frankish A.
,
Gingeras T.R.
,
Guigó R.
,
Миронов А.А.
,
Breschi A.
,
Budnik I.
,
Dobin A.
,
Guigo R.
,
Harrow J.
,
Whittington M.A.
показать полностью...
,
Скворцов Д.А.
,
Ardlie K.
,
Beer M.A.
,
Denisov S.V.
,
Ferreira P.
,
Flicek P.
,
Graveley B.
,
Guigó R.
,
Ivanov T.
,
Kalinina M.A.
,
Kalmykova S.
,
Lagarde J.
,
Lisitskaya L.
,
Netoff T.I.
,
Petryszak R.
,
Sammeth M.
,
Sloan C.
,
Zakharova N.
,
Банникова В.А.
,
Буренина О.Ю.
,
Гельфанд М.С.
,
Елкина Д.А.
,
Кульбачинский А.В.
,
Морозов Д.А.
,
Морозова О.Н.
,
Транкова Н.А.
,
Abbs S.
,
Adams L.
,
Aguet F.
,
Alessandra B.
,
Alex D.
,
Alexander R.
,
Alver B.
,
Amador R.
,
Amadoz A.
,
Amrhein H.
,
Andrea T.
,
Antoshechkin I.
,
Arif H.
,
Auerbach R.
,
Baikang P.
,
Bansal M.
,
Bates D.
,
Beal K.
,
Bell K.
,
Bender М.
,
Berry A.
,
Bickel P.
,
Blobel G.
,
Boeck M.
,
Boley N.
,
Booth B.
,
Borsari B.
,
Boyle A.
,
Brazma A.
,
Brenner S.
,
Brown J.
,
Buhl E.H.
,
Bussotti G.
,
Byron R.
,
Börgers C.
,
Calvo M.
,
Canfield T.
,
Cantor C.R.
,
Cao X.
,
Carbonell-Caballero J.
,
Cavalleri G.
,
Cayting P.
,
Cedric N.
,
Celniker S.
,
Ceulemans B.
,
Chang C.F.
,
Cheng C.
,
Cheng Y.
,
Cherbas L.
,
Cherbas P.
,
Chris Z.
,
Cline M.
,
Curado J.
,
Davis R.C.
,
De Bruijn M.
,
DeLuca
,
DeSalvo G.
,
Denas O.
,
Dermitzakis E.T.
,
Di_C D.A.
,
Diegel M.
,
Diekhans M.
,
Disteche C.
,
Dogan N.
,
Dopazo J.
,
Drenkow J.
,
Drenkow J.
,
Duff M.
,
Dunn D.R.
,
Dwyer D.J.
,
Edsall L.
,
Eichler E.
,
Einav Y.
,
Erickson D.
,
Euskirchen G.
,
Ewing B.
,
Fang G.
,
Fastuca M.
,
Fastuca M.
,
Favorov A.
,
Feingold E.
,
Feingold E.
,
Fisher-Aylor K.
,
Fitzgerald S.
,
Fonseca N.
,
GTEx C.
,
Gao G.
,
Gerstein M.
,
Getz G.
,
Gilbert D.
,
Gillis J.
,
Giovanni B.
,
Giste E.
,
Goddeau D.
,
Goldmann J.
,
Gonzalez J.
,
Gonzalez J.
,
Good P.
,
Good P.
,
Gosh S.
,
Groudine M.
,
Grozeva D.
,
Hamdan F.
,
Hammonds A.
,
Hansen R.
,
Hardison R.
,
Harmanci A.
,
Haugen E.
,
Herrero J.L.
,
Hidalgo M.
,
Hillier L.
,
Hoskins R.
,
Howald C.
,
Hu M.L.
,
Huaien W.
,
Huang T.H.
,
Hubbard T.
,
Humbert R.
,
Huynh C.
,
Irizarry R.
,
Jain D.
,
Jansen C.
,
Jean M.
,
Jha S.W.
,
Johnson R.
,
Jones R.
,
Jonghe P.
,
Jorg D.
,
Josefowicz S.
,
Julien L.
,
Kahveci T.
,
Kasper D.
,
Kaufman
,
Kawli T.
,
Keiller D.
,
Keller C.
,
Kellis M.
,
Kent W.
,
Khrameeva E.
,
Kirilusha A.
,
Kirkup V.
,
Kitchen R.
,
Kuan S.
,
Kundaje A.
,
Kutyavin T.
,
Lacerda d.B.
,
Ladewig E.
,
Lai E.
,
Lakomova D.
,
Lappalainen T.
,
Learned K.
,
Lee D.
,
Lei-Hoon S.
,
Lench N.
,
Leng M.J.
,
Lepine A.
,
LeroyP
,
Levasseur D.
,
Li S.
,
Lian J.
,
Liang J.
,
Lin S.
,
Lin Y.
,
Love M.
,
Lowdon R.
,
Lucy R.F.
,
Ma R.
,
Ma Z.
,
MacCoss M.
,
Malerba P.
,
Malladi V.
,
Maltseva L.
,
Margasyuk S.
,
Marinov G.
,
Mark G.
,
Mason C.
,
May G.
,
McCleary D.
,
McWhirter R.
,
Meagan F.
,
Melé M.
,
Merrihew G.
,
Minassian B.
,
Mironov A.
,
Mironov A.
,
Mishra T.
,
Monlong J.
,
Morozova O.
,
Morrissey C.
,
Mortazavi A.
,
Mortazavi A.
,
Mudge J.
,
Murad R.
,
Muñoz-Aguirre M.
,
Navia C.E.
,
Neph S.
,
Neri F.
,
Niarchou A.
,
Nikolaienko O.
,
Notredame C.
,
Nurtdinov R.N.
,
Oliveira C.
,
Oliveira P.
,
Oliver B.
,
Olson S.
,
Olsson S.
,
Orkin S.
,
Pablo P.B.
,
Papayannopoulou T.
,
Park P.K.
,
Pazin M.
,
Pazin M.
,
Pei B.
,
Perrimon N.
,
Petrova M.
,
Petrovski S.
,
Pham K.L.
,
Pichugina M.
,
Pignatelli M.
,
Pimenova E.
,
Pope B.
,
Popov Y.
,
Prieto P.
,
Raker V.A.
,
Ramalho S.M.
,
Rasmussen M.
,
Reh T.
,
Reinke V.
,
Ren B.
,
Reverter F.
,
Reverter F.
,
Reymond A.
,
Ritchie G.
,
Robinson G.
,
Roderic G.
,
Rogers A.
,
Roovers J.
,
Rosenbloom K.
,
Rotstein H.
,
Rozowsky J.
,
Rubtsov P.
,
Rudensky A.Y.
,
Ryba T.
,
Rynes E.
,
Samstein R.
,
Sanchis-Juan A.
,
Sandstrom R.
,
Sarah D.
,
Saunders G.
,
Schlesinger F.
,
See L.C.
,
Segrè A.
,
Selleri L.
,
Sethi A.
,
Severgina L.
,
Shen Y.
,
Sisodiya S.
,
Sisu C.
,
Skoultchi A.
,
Slack F.
,
Snyder M.
,
Sodaei R.
,
Sousa A.
,
Stamatoyannopoulos J.
,
Stamberger H.
,
Steward C.
,
Stitziel N.O.
,
Stoiber M.
,
Strasbourger P.
,
Suganthi B.
,
Sullivan T.
,
Suner M.
,
Sushentsev N.
,
Sá G.C.
,
Tanzer A.
,
Tanzer A.
,
Tapanari E.
,
Taylor J.
,
Teng M.
,
Thompson O.
,
Thurman R.
,
Tort A.
,
Traub R.D.
,
Treuting P.
,
Trout D.
,
Tsyplakov A.
,
Uszczynska B.
,
Uszczynska-Ratajczak B.
,
Vierstra J.
,
Viola M.
,
VitsiosD
,
Vlasenok M.A.
,
Vong S.
,
Wan K.
,
Wang G.
,
Wang H.
,
Wang S.
,
Wang T.C.
,
Waterston R.
,
Watkins K.
,
Weckhuysen S.
,
Wei X.
,
Weiss M.
,
Weissman S.
,
Wen C.K.
,
Wen J.
,
Wilken M.
,
Williams D.
,
Wold B.
,
Wright P.
,
Xue C.
,
Yan K.
,
Yang L.
,
Ye Z.
,
Yip K.
,
Young T.
,
Yue F.
,
Zakharova N.
,
Zaleski C.
,
Zaleski C.
,
Zhan L.
,
Zhang Y.
,
Zheng H.
,
Zhong S.
,
Zhou X.Y.
,
and T Gloveli M.W.
,
Çubuk C.
,
Донцова О.А.
,
Кубарева Е.А.
,
Миронов А.В.
,
Морозов Д.
,
Сабо П.
,
Чигарева И.А.
,
Шафер М.А.
37 статей
,
7 докладов на конференциях
,
2 тезисов докладов
,
1 НИР
,
1 членство в программном комитете
,
5 дипломных работ
,
5 учебных курсов
Количество цитирований статей в журналах по данным Web of Science: 2857, Scopus: 3024
IstinaResearcherID (IRID): 4473614
ResearcherID:
H-5252-2015
Scopus Author ID:
6508273626
ORCID:
0000-0003-0543-9760
Деятельность
Статьи в журналах
2023
Tissue-specific regulation of gene expression via unproductive splicing
Mironov Alexei
,
Petrova Marina
,
Margasyuk Sergey
,
Vlasenok Maria
,
Mironov Andrey A.
,
Skvortsov Dmitry
,
Pervouchine Dmitri D.
в журнале
Nucleic Acids Research
, издательство
Oxford University Press
(United Kingdom)
DOI
2021
An extended catalogue of tandem alternative splice sites in human tissue transcriptomes
Mironov Aleksei
,
Denisov Stepan
, Gress Alexander, Kalinina Olga V.,
Pervouchine Dmitri D.
в журнале
PLoS Computational Biology
, издательство
Public Library of Science
(United States)
, том 17, № 4, с. e1008329-e1008329
DOI
2021
Conserved long-range base pairings are associated with pre-mRNA processing of human genes
Kalmykova Svetlana
,
Kalinina Marina
,
Denisov Stepan
,
Mironov Alexey
,
Skvortsov Dmitry
,
Guigó Roderic
,
Pervouchine Dmitri
в журнале
Nature communications
, издательство
Nature Pub. Group
(United Kingdom)
, том 12, № 1
DOI
2021
Multiple competing RNA structures dynamically control alternative splicing in the human ATE1 gene
Kalinina Marina
,
Skvortsov Dmitry
,
Kalmykova Svetlana
,
Ivanov Timofei
,
Dontsova Olga
,
Pervouchine Dmitri D.
в журнале
Nucleic Acids Research
, издательство
Oxford University Press
(United Kingdom)
, том 49, № 1, с. 479-490
DOI
2019
Circular exonic RNAs: When RNA structure meets topology
Pervouchine Dmitri D.
в журнале
Biochimica et Biophysica Acta - Gene Regulatory Mechanisms
, издательство
Elsevier BV
(Netherlands)
, том 1862, № 11-12, с. 194384
DOI
2019
Integrativetranscriptomic analysis suggests new autoregulatory splicing events coupled with nonsense-mediated mRNA decay
Pervouchine D.
,
Popov Y.
,
Berry A.
,
Borsari B.
,
Frankish A.
,
Guigó R.
в журнале
Nucleic Acids Research
, издательство
Oxford University Press
(United Kingdom)
, том 47, № 10, с. 5293-5306
DOI
2019
Re-annotation of 191 developmental andepileptic encephalopathy-associated genes unmasks de novo variants in SCN1A
Steward CA
,
Roovers J.
,
Suner MM
,
Gonzalez JM
,
Uszczynska-Ratajczak B.
,
Pervouchine D.
,
Fitzgerald S.
,
Viola M.
,
Stamberger H.
,
Hamdan FF
,
Ceulemans B.
,
LeroyP
,
Nava C.
,
Lepine A.
,
Tapanari E.
,
Keiller D.
,
Abbs S.
,
Sanchis-Juan A.
,
Grozeva D.
,
Rogers AS
,
Diekhans M.
,
Guigó R.
,
Petryszak R.
,
Minassian BA
,
Cavalleri G.
,
VitsiosD
,
Petrovski S.
,
Harrow J.
,
Flicek P.
,
Lucy Raymond F.
,
Lench NJ
,
Jonghe P.
,
Mudge JM
,
Weckhuysen S.
,
Sisodiya SM
,
Frankish A.
в журнале
Genome Medicine
, издательство
BioMed Central
(London)
, том 4, № 31
DOI
2019
Urinary biomarkers of latent inflammation and fibrosis in children with vesicoureteral reflux
Morozova O.
,
Morozov D.
,
Pervouchine D.
,
Einav Y.
,
Lakomova D.
,
Zakharova N.
, Severgina L., Maltseva L.,
Budnik I.
в журнале
International Urology and Nephrology
, издательство
Springer Nature
(Switzerland)
, том 52, с. 603-610
DOI
2018
An Evolutionary Mechanism for the Generation of Competing RNA Structures Associated with Mutually Exclusive Exons
Ivanov TM
,
Pervouchine DD
в журнале
Genes
, издательство
MDPI
(Basel, Switzerland)
, том 17, № 9, с. E356
2018
Hypoxic renal injury in newborns withabdominal compartment syndrome (clinical and experimental study)
Morozov D.
,
Morozova O.
,
Pervouchine D.
,
Severgina L.
,
Tsyplakov A.
,
Zakharova N.
,
Sushentsev N.
,
Maltseva L.
,
Budnik I.
в журнале
Pediatric Research
, издательство
Lippincott Williams & Wilkins Ltd.
(United States)
, том 83, № 2, с. 520-526
DOI
2018
The effects of death and post-mortem cold ischemia on human tissue transcriptomes
Ferreira PG
,
Muñoz-Aguirre M.
,
Reverter F.
,
Sá Godinho CP
,
Sousa A.
,
Amadoz A.
,
Sodaei R.
,
Hidalgo MR
,
Pervouchine D.
,
Carbonell-Caballero J.
,
Nurtdinov R.
,
Breschi A.
,
Amador R.
,
Oliveira P.
,
Çubuk C.
,
Curado J.
,
Aguet F.
,
Oliveira C.
,
Dopazo J.
,
Sammeth M.
,
Ardlie KG
,
Guigó R.
в журнале
Nature communications
, издательство
Nature Pub. Group
(United Kingdom)
, том 13, № 9, с. 490
2018
Towards Long-Range RNA Structure Prediction in Eukaryotic Genes
Pervouchine DD
в журнале
Genes
, издательство
MDPI
(Basel, Switzerland)
, том 15, № 9, с. E302
2016
A benchmark for RNA-seq quantification pipelines
Teng M.
,
Love MI
,
Davis CA
,
Djebali S.
,
Dobin A.
,
Graveley BR
,
Li S.
,
Mason CE
,
Olson S.
,
Pervouchine D.
,
Sloan CA
,
Wei X.
,
Zhan L.
,
Irizarry RA
в журнале
Genome Biology
, издательство
BioMed Central
(London)
, том 17, № 1, с. 74
DOI
2016
Gene-specific patterns of expression variation across organs and species
Breschi A.
,
Djebali S.
,
Gillis J.
,
Pervouchine DD
,
Dobin A.
,
Davis CA
,
Gingeras TR
,
Guigo R.
в журнале
Genome Biology
, издательство
BioMed Central
(London)
, том 17, № 1, с. 151
DOI
2016
Urinary cytokines as markers of latent inflammation in children with chronic pyelonephritis and anorectal malformations
Morozov D.
,
Morozova O.
,
Budnik I.
,
Pervouchine D.
,
Pimenova E.
,
Zakharova N.
в журнале
Journal of Pediatric Urology
, издательство
Elsevier BV
(Netherlands)
, том 16, с. S1477-5131
DOI
2015
Comparison of GENCODE and RefSeq gene annotation and the impact of reference geneset on variant effect prediction
Frankish A.
,
Uszczynska B.
,
Ritchie GR
,
Gonzalez JM
,
Pervouchine D.
,
Petryszak R.
,
Mudge JM
,
Fonseca N.
,
Brazma A.
,
Guigo R.
,
Harrow J.
в журнале
BMC Genomics
, издательство
BioMed Central
(London)
, том 16, № Suppl 8, с. S2
DOI
2015
Enhanced transcriptome maps from multiple mouse tissues reveal evolutionary constraint in gene expression
Pervouchine Dmitri D.
,
Sarah Djebali
,
Alessandra Breschi
,
Davis Carrie A.
,
Pablo Prieto Barja
,
Alex Dobin
,
Andrea Tanzer
,
Julien Lagarde
,
Chris Zaleski
,
Lei-Hoon See
,
Meagan Fastuca
,
Jorg Drenkow
,
Huaien Wang
,
Giovanni Bussotti
,
Baikang Pei
,
Suganthi Balasubramanian
,
Jean Monlong
,
Arif Harmanci
,
Mark Gerstein
,
Beer Michael A.
,
Cedric Notredame
,
Roderic Guigo
,
Gingeras Thomas R.
в журнале
Nature communications
, издательство
Nature Pub. Group
(United Kingdom)
, том 6, № 5903, с. 1-11
DOI
2015
Human genomics. The human transcriptome across tissues and individuals
Melé M.
,
Ferreira PG
,
Reverter F.
,
DeLuca DS
,
Monlong J.
,
Sammeth M.
,
Young TR
,
Goldmann JM
,
Pervouchine DD
,
Sullivan TJ
,
Johnson R.
,
Segrè AV
,
Djebali S.
,
Niarchou A.
,
GTEx Consortium
,
Wright FA
,
Lappalainen T.
,
Calvo M.
,
Getz G.
,
Dermitzakis ET
,
Ardlie KG
,
Guigó R.
в журнале
Science
, издательство
American Association for the Advancement of Science
(United States)
, том 348, № 6235, с. 660-5
DOI
2014
A comparative encyclopedia of DNA elements in the mouse genome" Nature
Yue F.
,
Cheng Y.
,
Breschi A.
,
Vierstra J.
, Wu W.,
Ryba T.
,
Sandstrom R.
,
Ma Z.
,
Davis C.
,
Pope BD
,
Shen Y.
,
Pervouchine DD
,
Djebali S.
,
Thurman RE
, Kaul R.,
Rynes E.
,
Kirilusha A.
,
Marinov GK
,
Williams BA
,
Trout D.
,
Amrhein H.
,
Fisher-Aylor K.
,
Antoshechkin I.
,
DeSalvo G.
,
See LH
,
Fastuca M.
,
Drenkow J.
,
Zaleski C.
,
Dobin A.
,
Prieto P.
,
Lagarde J.
,
Bussotti G.
,
Tanzer A.
,
Denas O.
, Li K.,
Bender MA
, Zhang M.,
Byron R.
,
Groudine MT
,
McCleary D.
,
Pham L.
,
Ye Z.
,
Kuan S.
,
Edsall L.
, Wu YC,
Rasmussen MD
,
Bansal MS
,
Kellis M.
,
Keller CA
,
Morrissey CS
,
Mishra T.
,
Jain D.
,
Dogan N.
, Harris RS,
Cayting P.
,
Kawli T.
,
Boyle AP
,
Euskirchen G.
,
Kundaje A.
,
Lin S.
,
Lin Y.
,
Jansen C.
,
Malladi VS
,
Cline MS
,
Erickson DT
,
Kirkup VM
,
Learned K.
,
Sloan CA
,
Rosenbloom KR
,
Lacerda de_Sousa B.
,
Beal K.
,
Pignatelli M.
,
Flicek P.
,
Lian J.
,
Kahveci T.
,
Lee D.
,
Kent WJ
,
Ramalho Santos M.
,
Herrero J.
,
Notredame C.
, Johnson A.,
Vong S.
, Lee K.,
Bates D.
,
Neri F.
,
Diegel M.
,
Canfield T.
,
Sabo PJ
,
Wilken MS
,
Reh TA
,
Giste E.
,
Shafer A.
,
Kutyavin T.
,
Haugen E.
,
Dunn D.Reynolds AP
,
Neph S.
,
Humbert R.
,
Hansen RS
,
De Bruijn M.
,
Selleri L.
,
Rudensky A.
,
Josefowicz S.
,
Samstein R.
,
Eichler EE
,
Orkin SH
,
Levasseur D.
,
Papayannopoulou T.
,
Chang KH
,
Skoultchi A.
,
Gosh S.
,
Disteche C.
,
Treuting P.
, Wang Y.,
Weiss MJ
,
Blobel GA
,
Cao X.
,
Zhong S.
,
Wang T.
,
Good PJ
,
Lowdon RF
,
Adams LB
,
Zhou XQ
,
Pazin MJ
,
Feingold EA
,
Wold B.
,
Taylor J.
,
Mortazavi A.
,
Weissman SM
,
Stamatoyannopoulos JA
,
Snyder MP
,
Guigo R.
,
Gingeras TR
,
Gilbert DM
,
Hardison RC
,
Beer MA
,
Ren B.
в журнале
Nature
, издательство
Nature Publishing Group
(United Kingdom)
, том 515, № 7527, с. 355-64
DOI
2014
Comparative analysis of the transcriptome across distant species" Nature
Gerstein MB
,
Rozowsky J.
,
Yan KK
,
Wang D.
,
Cheng C.
,
Brown JB
,
Davis CA
,
Hillier L.
,
Sisu C.
, Li JJ,
Pei B.
,
Harmanci AO
,
Duff MO
,
Djebali S.
,
Alexander RP
,
Alver BH
,
Auerbach R.
,
Bell K.
,
Bickel PJ
,
Boeck ME
,
Boley NP
,
Booth BW
,
Cherbas L.
,
Cherbas P.
,
Di_C Dobin A.
,
Drenkow J.
,
Ewing B.
,
Fang G.
,
Fastuca M.
,
Feingold EA
,
Frankish A.
,
Gao G.
,
Good PJ
,
Guigó R.
,
Hammonds A.
,
Harrow J.
,
Hoskins RA
,
Howald C.
,
Hu L.
,
Huang H.
,
Hubbard TJ
,
Huynh C.
,
Jha S.
,
Kasper D.
, Kato M.,
Kaufman TC
,
Kitchen RR
,
Ladewig E.
,
Lagarde J.
,
Lai E.
,
Leng J.
,
Lu Z.
,
MacCoss M.
,
May G.
,
McWhirter R.
,
Merrihew G.
, Miller DM,
Mortazavi A.
,
Murad R.
,
Oliver B.
,
Olson S.
,
Park PJ
,
Pazin MJ
,
Perrimon N.
,
Pervouchine D.
,
Reinke V.
,
Reymond A.
,
Robinson G.
, Samsonova A.,
Saunders GI
,
Schlesinger F.
,
Sethi A.
,
Slack FJ
, Spencer WC,
Stoiber MH
,
Strasbourger P.
,
Tanzer A.
,
Thompson OA
,
Wan KH
,
Wang G.
,
Wang H.
,
Watkins KL
,
Wen J.
,
Wen K.
,
Xue C.
,
Yang L.
,
Yip K.
,
Zaleski C.
,
Zhang Y.
,
Zheng H.
,
Brenner SE
,
Graveley BR
,
Celniker SE
,
Gingeras TR
,
Waterston R.
в журнале
Nature
, издательство
Nature Publishing Group
(United Kingdom)
, том 512, № 7515, с. 445-8
DOI
2014
IRBIS: a systematic search for conserved complementarity
Pervouchine DD
в журнале
RNA
, том 20, № 10, с. 1519-1531
DOI
2013
Intron-centric estimation of alternative splicing from RNA-seq data
Pervouchine D.D.
, Knowles D.G., Guigo R.
в журнале
Bioinformatics
, издательство
Oxford University Press
(United Kingdom)
, том 29, № 2, с. 273-274
DOI
2012
Evidence for widespread association of mammalian splicing and conserved long-range RNA structures
Pervouchine DD
,
Khrameeva EE
,
Pichugina MY
,
Nikolaienko OV
,
Gelfand MS
,
Rubtsov PM
,
Mironov AA
в журнале
RNA
, том 18, № 1, с. 1-15
DOI
2009
Modulation of alternative splicing by long-range RNA structures in Drosophila
Raker Veronica A.
,
Mironov Andrei A.
,
Gelfand Mikhail S.
,
Pervouchine Dmitri D.
в журнале
Nucleic Acids Research
, издательство
Oxford University Press
(United Kingdom)
, том 37, № 14, с. 4533-4544
2006
Low-dimensional maps encoding dynamics in entorhinal cortex and hippocampus
Pervouchine D.D.
,
Netoff T.I.
, Rotstein H.G., White J.A., Cunningham M.O.,
Whittington M.A.
,
Kopell N.J.
в журнале
Neural Computation
, издательство
MIT Press
(United States)
, том 18, № 11, с. 2617-2650
2006
Neuronal metabolism governs cortical network response state
Cunningham M.O.,
Pervouchine D.D.
, Racca C.,
Kopell N.J.
, Davies C.H.,
Jones R.S.
,
Traub R.D.
,
Whittington M.A.
в журнале
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
, издательство
National Academy of Sciences
(United States)
, том 103, № 14, с. 5597-5601
2006
RNAKinetics: a web server that models secondary structure kinetics of an elongating RNA
Danilova L.V.,
Pervouchine D.D.
,
Favorov A.V.
,
Mironov A.A.
в журнале
Journal of Bioinformatics and Computational Biology
, издательство
Imperial College Press
(United Kingdom)
, том 4, № 2, с. 589-596
2005
Slow and fast inhibition and an H-current interact to create a theta rhythm in a model of CA1 interneuron network
Rotstein H.G.,
Pervouchine D.D.
, Acker C.D., Gillies M.J., White J.A.,
Buhl E.H.
,
Whittington M.A.
,
Kopell N.
в журнале
Journal of Clinical Neurophysiology
, издательство
Lippincott Williams & Wilkins Ltd.
(United States)
, том 94, № 2, с. 1509-1518
2004
Engineered riboregulators enable post-transcriptional control of gene expression
Isaacs F.J.,
Dwyer D.J.
, Ding C.,
Pervouchine D.D.
,
Cantor C.R.
, Collins J.J.
в журнале
Nature Biotechnology
, издательство
Nature Publishing Group
(United Kingdom)
, том 22, № 7, с. 841-847
2004
Hierarchy of closures of matrix pencils
Pervouchine DD
в журнале
Journal of Lie Theory
, издательство
Heldermann Verlag
(Germany)
, том 14, № 2, с. 443-479
2004
IRIS: intermolecular RNA interaction search
Pervouchine D.D.
в журнале
Genome informatics series : proceedings of the . Workshop on Genome Informatics. Workshop on Genome Informatics
, издательство
Universal Academy Press
(Japan)
, том 15, № 2, с. 92-101
2003
On the normalization of RNA equilibrium free energy to the length of the sequence
Pervouchine D.D.
, Graber J.H., Kasif S.
в журнале
Nucleic Acids Research
, издательство
Oxford University Press
(United Kingdom)
, том 31, № 9, с. e49
2003
Structural location of disease-associated single-nucleotide polymorphisms
Stitziel N.O.
, Tseng Y.Y.,
Pervouchine D.
,
Goddeau D.
, Kasif S.,
Liang J.
в журнале
Journal of Molecular Biology
, издательство
Academic Press
(United States)
, том 327, № 5, с. 1021-1030
2002
On the closures of orbits of fourth order matrix pencils
Pervushin DD
в журнале
Izvestiya. Mathematics
, издательство
American Mathematical Society
(United States)
, том 66, № 5, с. 1047-1055
2000
Invariants and orbits of the standard (SL4(C)xSL4(C)xSL2(C))-module
Pervushin DD
в журнале
Izvestiya. Mathematics
, издательство
American Mathematical Society
(United States)
, том 64, № 5, с. 1003-1015
Статьи в сборниках
2010
Gamma and Theta Rhythms in Biophysical Models of Hippocampal Circuits
Kopell N.
,
Börgers C.
,
Pervouchine D.
,
Malerba P.
,
Tort A.
в сборнике
Hippocampal Microcircuits: A Computational Modeller's Resource Book
, серия
Eds. V. Cutsuridis, B.P. Graham, S. Cobb, I. Vida
, место издания
Springer
, с. 15
2007
Multiple rhythms and switches in the nervous system
Kopell NJ
,
Pervouchine DD
,
Rotstein HG
,
Netoff TI
,
and T Gloveli MA Whittington
в сборнике
Proceedings of The Second International Symposium on the Frontiers of Applied Mathematics
, серия
Conference in honor of the 90th birthday of C.C. Lin
, место издания
Din-Yu Hsieh, Meirong Zhang & Weitao Sun. eds., World Scientific Publishing Co Beijing
, с. 1-18
Доклады на конференциях
2019
КОРОТКИЕ НЕКОДИРУЮЩИЕ РНК – ПРОДУКТЫ ТРАНСКРИПЦИИ 6S РНК В БАКТЕРИИ RHODOBACTER SPHAEROIDES
(Стендовый)
Авторы:
Елкина Д.А.
,
Буренина О.Ю.
,
Банникова В.А.
,
Транкова Н.А.
,
Лисицкая Л.А.
,
Кульбачинский А.В.
,
Первушин Д.Д.
,
Кубарева Е.А.
II Объединенный научный форум, включающий VI Cъезд физиологов СНГ, VI Съезд биохимиков России и IX Российский симпозиум «Белки и пептиды»
, Дагомыс, Россия, 1-6 октября 2019
2015
Biases in the Annotation of Nonsense-Mediated Decay Events
(Устный)
Авторы:
Dmitri Pervouchine
,
Barbara Uszczynska
,
Andrew Berry
,
Roderic Guigo
,
Jennifer Harrow
,
Adam Frankish
Computational Analysis of RNA Structure and Function
, Benasque, Испания, 19-31 июля 2015
2015
Reconstructing the transcriptional profile of a tissue from the transcriptional profiles of primary cells
(Стендовый)
Авторы:
Pervouchine DD
,
Breschi A.
,
Djebali S.
,
Gingeras TR
,
Dobin A.
,
Lagarde J.
,
Guigó R.
,
Davis CA
Cold Spring Harbor annual ENCODE meeting
, Cold Spring HArbor, США, 7-11 марта 2015
2014
Common organizational and regulatory features of the human and mouse transcriptomes
Авторы:
Gingeras Thomas R.
,
Roderic Guigo
,
Julien Lagarde
,
Alex Dobin
,
Pablo Prieto Barja
,
Davis Carrie A.
,
Alessandra Breschi
,
Sarah Djebali
,
Pervouchine Dmitri D.
Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB)
, Boston, USA, 2014
2014
О нахождении консервативных комплементарных участков без использования множественного выравнивания последовательностей
Автор:
Первушин ДД
Информационные технологии и системы (ИТиС'14)
, Нижний Новгород, 2014
1996
Reversibility of polycation interaction with large phospholipid bilayer vesicles
Авторы:
Rimskaya-Korsakova M.N.
,
Efimova A.A.
,
Pervushin D.D.
11 International conference "Surface Forses"
, Moscow, Russia, Россия, 1996
1996
Reversibility of polycation-induced structural rearrangements in small and large liposomes
(Устный)
Авторы:
Pervushin D.D.
,
Efimova A.A.
,
Rimskaya-Korsakova M.N.
,
Yaroslavov A.A.
POC-96 7th International conference on polymer supported reactions in organic chemistry
, Wroclaw, Poland, Польша, 1996
Тезисы докладов
2019
КОРОТКИЕ НЕКОДИРУЮЩИЕ РНК – ПРОДУКТЫ ТРАНСКРИПЦИИ 6S РНК В БАКТЕРИИ RHODOBACTER SPHAEROIDES
Елкина Д.А.
,
Буренина О.Ю.
,
Банникова В.А.
,
Транкова Н.А.
,
Лисицкая Л.А.
,
Кульбачинский А.В.
,
Первушин Д.Д.
, Кубарева Е.А.
в сборнике
Acta Naturae (русскоязычная версия)
, место издания
Перо М М
, том 1, тезисы, с. 22-22
2019
Короткие некодирующие РНК - продукты транскрипции 6S РНК в бактерии Rhodobacter sphaeroides
Елкина Д.А.
,
Буренина О.Ю.
,
Банникова В.А.
,
Транкова Н.А.
,
Лисицкая Л.А.
,
Кульбачинский А.В.
,
Первушин Д.Д.
,
Кубарева Е.А.
в сборнике
Acta Naturae спецвыпуск
, том 2, тезисы, с. 22-22
НИРы
1 марта 2021 - 31 декабря 2024
Генетические технологии создания моделей заболеваний, обусловленных нарушениями функционирования РНК
Химический факультет
Руководитель:
Донцова О.А.
Ответственные исполнители:
Каменский П.А.
,
Первушин Д.Д.
,
Рубцова М.П.
Участие в программных комитетах конференций
7 сентября 2014
Computational Methods for Structural RNAs – CMSR'14
Член программного комитета
Strasbourg, France, Франция
Руководство дипломными работами
2021
Изучение механизмов кросс-регуляции экспрессии РНК-связывающих белков через непродуктивный сплайсинг и их нарушений в раке
Научный руководитель:
Первушин Д.Д.
Автор: Маргасюк С.Д. (Специалист)
2020
Малые бактериальные некодирующие РНК как антисенс-регуляторы экспрессии генов
Научные руководители:
Первушин Д.Д.
,
Кубарева Е.А.
Автор: Транкова Н.А., (Специалист)
2013
Исследование вторичной структуры РНК с помощью методов высокопроизводительного секвенирования
Научные руководители:
Первушин Д.Д.
,
Миронов А.А.
Автор: Курочкин Илья (Специалист)
2012
Изучение роли антисенс-РНК в регуляции сплайсинга
Научные руководители:
Первушин Д.Д.
,
Миронов А.А.
Автор: Климова Е. (Специалист)
2010
Исследование состояния медленного сна, вызванного периодической визуальной стимуляцией
Научные руководители:
Первушин Д.Д.
,
Пигарев И.Н.
Автор: Хайруллин А. (Специалист)
Авторство учебных курсов
2019
Введение в математическую статистику
Автор:
Первушин Д.Д.
2019
Введение в математическую статистику
Автор:
Первушин Д.Д.
2010
Прикладная статистика
Автор:
Первушин Дмитрий Давидович
дистанционный курс
2010
Линейная Алгебра
Автор:
Первушин Д.Д.
курс на иностранном языке
2009
Методы прикладной статистики в биологии и медицине
Автор:
Первушин Д.Д.
курс на иностранном языке
Преподавание учебных курсов
8 февраля 2021 - 31 мая 2021
Прикладная статистика
МГУ имени М.В. Ломоносова
,
Факультет биоинженерии и биоинформатики
обязательная, базовой части, лекции
8 февраля 2020 - 31 мая 2020
Введение в математическую статистику
МГУ имени М.В. Ломоносова
,
Факультет биоинженерии и биоинформатики
обязательная, базовой части, лекции, 28 часов
1 сентября 2019 - 31 декабря 2019
Методы прикладной статистики в биологии и медицине
МГУ имени М.В. Ломоносова
,
Факультет биоинженерии и биоинформатики
обязательная, базовой части, лекции, 28 часов
1 сентября 2019 - 31 декабря 2019
Методы прикладной статистики в биологии и медицине
МГУ имени М.В. Ломоносова
,
Факультет биоинженерии и биоинформатики
обязательная, базовой части, лекции, 28 часов
1 сентября 2018 - 31 декабря 2018
Методы прикладной статистики в биологии и медицине
МГУ имени М.В. Ломоносова
,
Факультет биоинженерии и биоинформатики
обязательная, базовой части, лекции, 28 часов
1 сентября 2017 - 31 декабря 2017
Методы прикладной статистики в биологии и медицине
МГУ имени М.В. Ломоносова
,
Факультет биоинженерии и биоинформатики
обязательная, базовой части, лекции, 28 часов
5 октября 2015 - 28 октября 2015
Методы прикладной статистики в биологии и медицине
МГУ имени М.В. Ломоносова
,
Факультет биоинженерии и биоинформатики
обязательная, по выбору (спецкурс), лекции, 28 часов
3 октября 2014 - 27 октября 2014
Методы прикладной статистики в биологии и медицине
МГУ имени М.В. Ломоносова
,
Факультет биоинженерии и биоинформатики
обязательная, по выбору (спецкурс), лекции, 20 часов
5 октября 2013 - 24 декабря 2013
Методы прикладной статистики в биологии и медицине
МГУ имени М.В. Ломоносова
,
Факультет биоинженерии и биоинформатики
обязательная, по выбору (спецкурс), лекции, 20 часов