ИСТИНА

Кошкина Дарья Олеговна пользователь

МГУ имени М.В. Ломоносова, Биологический факультет, Кафедра биоинженерии, аспирант, с 14 января 2017

МГУ имени М.В. Ломоносова, Биологический факультет, Кафедра биоинженерии, аспирант, с 1 октября 2021

МГУ имени М.В. Ломоносова, Биологический факультет, Кафедра биоинженерии, младший научный сотрудник, с 19 ноября 2021

Соавторы: Малюченко Н.В., Студитский В.М., Феофанов А.В., Саулина А.А., Коровина А.Н., Герасимова Н.С., Кирпичников М.П., Гераськина О.В., Любителев А.В., Нилов Д.К., Коровина А.А., Котова Е.Ю.

11 статей, 19 докладов на конференциях, 5 тезисов докладов, 6 НИР

Количество цитирований статей в журналах по данным Web of Science: 4, Scopus: 0

IstinaResearcherID (IRID): 113252268

Деятельность

• Статьи в журналах

  • • 2022 Enhanced PARP-1 binding and remodeling ofnucleosomes flanked by linker hairpins
    • Koshkina D., Maluchenko N., Kotova E., Lys A., Korovina A., Feofanov A., Studitsky V.
    • в журнале FEBS open bio, издательство John Wiley & Sons Inc. (United States), том 12, № S1, с. 259-260 DOI
  • • 2022 Interactions of PARP1 Inhibitors with PARP1-Nucleosome Complexes
    • Maluchenko Natalya, Koshkina Darya, Korovina Anna, Studitsky Vasily, Feofanov Alexey
    • в журнале Cells, издательство MDPI (Basel, Switzerland), том 11, № 21, с. 3343 DOI
  • • 2021 Microscopic Analyses of Liquid-Liquid Phase Separation Induced by Linker Histone H1.0
    • Geraskina Olga, Maluchenko Natalya, Studitsky Vasily, Gerasimova Nadezhda, Koshkina Daria, Feofanov Alexey
    • в журнале International Journal of Biomedicine, том 11, № Suppl1, с. 21-22 DOI
  • 
    • 2021 Poly(ADP-Ribosyl) Code Functions
    • Maluchenko N.V., Koshkina D.O., Feofanov A.V., Studitsky V.M., Kirpichnikov M.P.
    • в журнале Acta Naturae (англоязычная версия), издательство Park Media Ltd (Moscow, Russia (Federation)), том 13, № 2, с. 58-69 DOI
  • • 2021 ФУНКЦИНИРОВАНИЕ КОДА ПОЛИ(АДФ-РИБОЗИЛ)ИРОВАНИЯ
    • Малюченко Н.В., Кошкина Д.О., Феофанов А.В., Студитский В.М., Кирпиников М.П.
    • в журнале Acta Naturae (русскоязычная версия), издательство Парк-медиа (М.), том 13, № 2, с. 58-69 DOI
  • 
    • 2020 The Effect of Gossypol on the Structure of Nucleosomes
    • Malyuchenko N.V., Koshkina D.O., Korovina A.N., Gerasimova N.S., Kirpichnikov M.P., Studitsky V.M., Feofanov A.V.
    • в журнале Moscow University Biological Sciences Bulletin, издательство Allerton Press (New York, N.Y., United States), том 75, № 3, с. 142-146 DOI
  • • 2020 Влияние госсипола на структуру нуклеосом
    • Малюченко Н.В., Кошкина Д.О., Коровина Анна Николаевна, Герасимова Н.С., Феофанов А.В., Студитский В.М., Кирпичников М.П.
    • в журнале Вестник Московского университета. Серия 16: Биология, издательство Изд-во Моск. ун-та (М.), том 75, № 3, с. 170-175
  • 
    • 2019 Studies of PARP inhibitors in the mononucleosome system
    • Maluchenko N., Feofanov A., Koshkina D., Герасимова Н.С., Studitsky V.
    • в журнале FEBS open bio, издательство John Wiley & Sons Inc. (United States), том 9, № Suppl. 1, с. 148-148
  • • 2019 Влияние PARP1 на структуру двухлинкерных нуклеосом
    • Кошкина Д.О., Малюченко Н.В., Феофанов А.В., Студитский В.М.
    • в журнале Успехи молекулярной онкологии, издательство АБВ-пресс (М.), том 6, № 4, с. 153-153
  • • 2019 Мононуклеосомная система скрининга ингибиторов поли(АДФ-рибоза)полимеразы-1
    • Малюченко Н.В., Кошкина Д.О., Лыс А.А., Студитский В.М., Феофанов А.В.
    • в журнале Успехи молекулярной онкологии, издательство АБВ-пресс (М.), том 6, № 4, с. 154-154
  • • 2019 Поиск молекулярных поверхностей PARP-1 для разработки новых ингибиторов фермента
    • Кошкина Д.О., Малюченко Н.В., Любителев А.В., Феофанов А.В., Студитский В.М.
    • в журнале Acta Naturae (русскоязычная версия), издательство Парк-медиа (М.), том 2, с. 226-226

• Доклады на конференциях

  • • 2022 Влияние ингибиторов на образование комплексов PARP1-нуклеосома (Стендовый)
    • Авторы: Малюченко Н.В., Кошкина Д.О., Лыс А.А., Коровина А.Н., Студитский В.М., Феофанов А.В.
    • V11 Всероссийская конференция по молекулярной онкологии, Москва, РОНЦ, Россия, 21-23 декабря 2022
  • • 2022 Nanobiophotonics in the studies of drug-chromatin interactions: single-particle FRET microscopy approach (Приглашенный)
    • Авторы: Feofanov A.V., Maluchenko N.V., Lys A.A., Koshkina D.O., Lyubitelev A.V., Studitsky V.М., Kirpichnikov M.P.
    • Международная конференция по медицинской оптике (MEDOPTICS2022), Олюдениз, Турция, 12-19 октября 2022
  • • 2022 Инженерная биология: конструирование полезных микроорганизмов (Устный)
    • Авторы: Князева Анастасия Сергеевна, Кошкина Дарья Олеговна
    • XVII Всероссийский Фестиваль НАУКА 0+, Москва, Россия, 7-9 октября 2022
  • • 2022 ВЛИЯНИЕ ЛИНКЕРНОГО ГИСТОНА Н1.0 НА СТРУКТУРУ НУКЛЕОСОМ (Стендовый)
    • Авторы: Малюченко Н.В., Кошкина Д.О., Феофанов А.В., Студитский В.М.
    • III Объединенный Научный Форум Физиологов, Биохимиков И Молекулярных Биологов, Сочи, Россия, 3-7 октября 2022
  • • 2022 Enhanced PARP-1 binding and remodeling ofnucleosomes flanked by linker hairpins (Стендовый)
    • Авторы: Koshkina D., Maluchenko N., Kotova E., Lys A., Korovina A., Feofanov A., Studitsky V.
    • IUBMB–FEBS–PABMB Congress, Лиссабон, Португалия, 9-14 июля 2022
  • • 2021 ИССЛЕДОВАНИЕ ДЕЙСТВИЯ КУРАКСИНА CBL0137 НА КОМПЛЕКСЫ PARP-1 С НУКЛЕОСОМОЙ (Стендовый)
    • Авторы: Малюченко Н.В., Кошкина Д.О., Лыс А.А., Студитский В.М., Феофанов А.В.
    • VI Всероссийская Конференция по молекулярной онкологии, Москва, Россия, 21-23 декабря 2021
  • • 2021 Nucleosome complexes with proteins and drugs through the prism of spFRET microscopy (Приглашенный)
    • Авторы: Feofanov Alexey V., Maluchenko Natalya V., Gerasimova Nadezhda S., Lys Alexandra A., Koshkina Darya O., Valieva Maria E., Studitsky Vasily М., Kirpichnikov Mikhail P.
    • Smart NanoMaterials 2021 Advances, Innovation and Applications, Париж, Франция, 7-10 декабря 2021
  • • 2021 Microscopic Analyses of Liquid-Liquid Phase Separation Induced by Linker Histone H1.0 (Стендовый)
    • Авторы: Geraskina Olga, Maluchenko Natalya, Studitsky Vasily, Gerasimova Nadezhda, Koshkina Daria, Feofanov Alexey
    • Криоэлектронная микроскопия 2021: достижения и перспективы (RUSSIAN INTERNATIONAL СONFERENCE ON CRYOELECTRON MICROSCOPY 2021; RICCEM2021), Москва, Россия, 30 мая - 2 июня 2021
  • • 2021 Single particle FRET microscopy: shedding light on drug interactions with nucleosome-protein complexes. (Приглашенный)
    • Авторы: Feofanov A.V., Maluchenko N.V., Gerasimova N.S., Lys A.A., Koshkina D.O., Valieva M.E., Studitsky V.М., Kirpichnikov M.P.
    • The 3nd European conference on Novel Photonic, Optoelectronic and Electronic Materials SPb-POEM2021 (Hybrid Onsite-Online Conference), Санкт-Петербург, Россия, 25-28 мая 2021
  • • 2020 ИНГИБИТОРЫ ПОЛИ-АДФ-РИБОЗО-ПОЛИМЕРАЗЫ-1 И ИХ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ С НУКЛЕОСОМАМИ (Устный)
    • Авторы: Малюченко Н.В., Нилов Д.К., Кошкина Д.О., Лыс А.А., Студитский В.М., Феофанов А.В.
    • VI Междисциплинарная конференция "Молекулярные и биологические аспекты химии, фармацевтики и фармакологии" МОБИ-ХИМФАРМА 2020, Нижний Новгород, Россия, 27-30 сентября 2020
  • • 2020 Разработка тест системы ингибиторов на основе мононуклеосомных наночастиц (Стендовый)
    • Авторы: Кошкина Д.О., Малюченко Н.В., Лыс А.А., Студитский В.М., Феофанов А.В.
    • XXVIII Российская конференция по электронной микроскопии "Современные методы электронной, зондовой микроскопии и комплементарных методов исследований наноструктур и наноматериалов", Черноголовка, Россия, 7-10 сентября 2020
  • • 2020 Study of anticancer drugs affecting nucleosomal structure using spFRET approach (Приглашенный)
    • Авторы: Feofanov A.V., Maluchenko N.V., Gerasimova N.S., Lys A.A., Koshkina D.O., Valieva M.E., Studitsky V.М., Kirpichnikov M.P.
    • The 2nd European conference on Novel Photonic, Optoelectronic and Electronic Materials SPb-POEM2020 (On-line Conference), Санкт-Петербург, Россия, 27-30 апреля 2020
  • • 2019 Влияние PARP1 на структуру двухлинкерных нуклеосом (Стендовый)
    • Авторы: Кошкина Д.О., Малюченко Н.В., Феофанов А.В., Студитский В.М.
    • V Всероссийская конференция по молекулярной онкологии, Москва, Россия, 16-23 декабря 2019
  • • 2019 Поиск молекулярных поверхностей PARP-1 для разработки новых ингибиторов фермента (Стендовый)
    • Авторы: Кошкина Д.О., Малюченко Н.В., Любителев А.В., Феофанов А.В., Студитский В.М.
    • школа молодых ученых «Генетика и эпигенетика: механизмы, структура, функция», Москва, Россия, 10-11 октября 2019
  • • 2019 Поиск молекулярных поверхностей PARP-1 для разработки новых ингибиторов фермента (Стендовый)
    • Авторы: Кошкина Д.О., Малюченко Н.В., Любителев А.В., Феофанов А.В., Студитский В.М.
    • II Объединенный научный форум, включающий VI Cъезд физиологов СНГ, VI Съезд биохимиков России и IX Российский симпозиум «Белки и пептиды», Дагомыс, Россия, 1-6 октября 2019
  • • 2019 Studies of PARP inhibitors in the mononucleosome system (Стендовый)
    • Авторы: Maluchenko N.V., Feofanov A.V., Koshkina D.O., Gerasimova N.S., Studitsky V.M.
    • The 44th FEBS Congress, Krakow, Poland, July 6-11., Краков, Польша, 6-11 июля 2019
  • • 2019 Влияние PARP-1 на структуру нуклеосом (Устный)
    • Авторы: Малюченко Н.В., Кошкина Дарья Олеговна, Герасимова Надежда Сергеевна, Феофанов А.В., Студитский В.М.
    • «Ломоносовские чтения - 2019». Секция «Биология», Москва, МГУ, Россия, 15-25 апреля 2019
  • • 2019 Влияние PARP-1 на структуру двухлинкерных нулклеосом (Стендовый)
    • Авторы: Кошкина Д.О., Малюченко Н.В., Феофанов А.В., Студитский В.М.
    • Международная научная конференция студентов, аспирантов и молодых учёных «Ломоносов-2019», Москва, Россия, 11 апреля 2019
  • • 2018 PARP-1 - сенсор разрывов (Устный)
    • Авторы: Кошкина Д.О., Малюченко Н.В.
    • Всероссийский фестиваль науки НАУКА 0+ (Москва, Россия, 12-14 октября 2018), Москва, МГУ, Россия, 12-14 октября 2018

• Тезисы докладов

  • • 2022 Nucleosome reorganization by PARP-1
    • Maluchenko N.V., Nilov D.K., Koshkina D.O., Lys A.A., Geraskina O., Korovina A.N., Feofanov A.V., Studitsly V.
    • в сборнике BIOINFORMATICS OF GENOME REGULATION AND STRUCTURE/systems biology (BGRS/SB-2022) The Thirteenth International Multiconference Abstracts, место издания Institute of Cytology and Genetics, the Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences Novosibirsk: ICG SB RAS, тезисы, с. 1005 DOI
  • • 2022 Влияние ингибиторов на образование комплексов PARP1-нуклеосома
    • Малюченко Н.В., Кошкина Д.О., Лыс А.А., Коровина А.Н., Студитский В.М., Феофанов А.В.
    • в сборнике УСПЕХИ МОЛЕКУЛЯРНОЙ ОНКОЛОГИИ, место издания Москва, том 9, тезисы, с. 116-116
  • • 2020 ИНГИБИТОРЫ ПОЛИ-АДФ-РИБОЗО-ПОЛИМЕРАЗЫ-1 И ИХ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ С НУКЛЕОСОМАМИ
    • Малюченко Н.В., Нилов Д.К., Кошкина Д.О., Лыс А.А., Студитский В.М., Феофанов А.В.
    • в сборнике Сборник тезисов докладов Шестой Междисциплинарной конференции «Молекулярные и Биологические аспекты Химии, Фармацевтики и Фармакологии», серия МОБИ-ХимФарма, издательство Общество с ограниченной ответственностью Издательство Перо (Москва), том 1, тезисы, с. 68-68
  • • 2020 Разработка тест системы ингибиторов на основе мононуклеосомных наночастиц
    • Кошкина Д.О., Малюченко Н.В., Лыс А.А., Студитский В.М., Феофанов А.В.
    • в сборнике XXVIII Российская конференция по электронной микроскопии «Современные методы электронной, зондовой микроскопии и комплементарных методов исследованиях наноструктур и наноматериалов». г. Черноголовка, 7-10 сентября 2020 г, место издания ФНИЦ «Кристаллография и фотоника» РАН Черноголовка, том 3, тезисы DOI
  • • 2019 Поиск молекулярных поверхностей̆PARP-1 для разработки новых ингибиторов фермента
    • Кошкина Д.О., Малюченко Н.В., Любителев А.В., Феофанов А.В., Студитский В.М.
    • в сборнике ACTA NATURAE, серия СПЕЦВЫПУСК Научные Труды II Объединенного научного форума (VI Съезд физиологов СНГ, VI Съезд биохимиков России, IX Российский симпозиум "Белки и пептиды"), место издания Перо Москва, том 2, тезисы, с. 226-226

• НИРы

  • • 27 июня 2023 - 1 декабря 2025 Поиск и изучение новых ингибиторов PARP на основе природных азотистых оснований, как потенциальных лекарственных соединений
    • Отдел биокинетики
    • Руководители: Коровина А.Н., Нилов Д.К. Ответственный исполнитель: Щербакова Т.А. Участники НИР: Кошкина Д.О., Лобанова А.А., Малинина Д.К., Панин Н.В.
  • • 22 марта 2021 - 31 декабря 2024 Молекулярные механизмы действия эпигенетически активных полифенолов и кураксинов – перспективных соединений для противоопухолевой терапии
    • Кафедра биоинженерии
    • Руководители: Малюченко Н.В., Студитский В.М. Ответственные исполнители: Герасимова Н.С., Коровина А.Н., Малюченко Н.В. Участники НИР: Андреева Т.В., Бондаренко Е.А., Гераськина О.В., Кошкина Д.О., Малинина Д.К., Орлов Н.А., Саулина А.А., Черникова П.А.
  • • 1 января 2021 - 31 декабря 2026 Физико-химические основы молекулярной биоинженерии
    • Кафедра биоинженерии
    • Руководитель: Кирпичников М.П. Ответственные исполнители: Лобакова Е.С., Шайтан К.В. Участники НИР: Айдналиева Н.В., Алескерова Л.Э., Алипкина С.И., Аргентова В.В., Армеев Г.А., Архипова А.Ю., Ахаев Д.Н., Багров Д.В., Барский Е.Л., Баулина О.И., Боздаганян М.Е., Бонарцев А.П., Бондаренко Е.А., Буракова О.В., Васильева С.Г., Вахрушева А.В., Волох О.И., Гапизов С.Ш., Герасимова Н.С., Гераськина О.В., Глухов Г.С., Горелова О.А., Грибкова А.К., Дольникова Г.А., Жаркова И.И., Зайцев П.А., Зайцева А.А., Карлова М.Г., Качер Ю.Г., Князева А.С., Коровина А.Н., Кошкина Д.О., Кудрявцев А.В., Кудряцев А.В., Кудряшова К.С., Лукьянов А.А., Любителев А.В., Люкманова Е.Н., Малинина Д.К., Малюченко Н.В., Мариловцева Е.В., Налобин Д.С., Никишин И.И., Новоселецкий В.Н., Орехов Ф.С., Орлов Н.А., Панченко Л.А., Петушкова Ю.А., Петушкова Ю.П., Рамонова А.А., Саванина Я.В., Саулина А.А., Селях И.О., Семенова Л.Р., Сивкина А.Л., Сингх-Пальчевская Л.Р., Соколова А.И., Соколова О.С., Соловченко А.Е., Соловченко О.В., Станишнева-Коновалова Т.Б., Студитский В.М., Суханова Ю.А., Трифонова Е.С., Утешинская Л.В., Федоренко Т.А., Феофанов А.В., Чеканов К.А., Чивкунова О.Б., Шайтан А.К., Шапиро Т.Н., Шибзухова К.А., Шиловский Г.А., Щербаков П.Н., Яголович А.В.
  • • 1 марта 2019 - 31 декабря 2021 Изучение взаимодействия С-концевого домена РНК-полимеразы II и хроматина в элонгации транскриптов через нуклеосому
    • Кафедра биоинженерии
    • Руководитель: Студитский В.М. Ответственные исполнители: Герасимова Н.С., Коровина А.Н. Участники НИР: Андреева Т.В., Афонин Д.А., Бондаренко Е.А., Голяева В.Е., Дралкина М.Г., Коровина А.Н., Косарим Н.А., Кошкина Д.О., Любителев А.В., Малинина Д.К., Малюченко Н.В., Мариловцева Е.В., Сивкина А.Л.
  • • 11 августа 2017 - 27 ноября 2020 Механизм взаимодействия PARP-1 с хроматином
    • Кафедра биоинженерии
    • Руководитель: Феофанов А.В. Ответственный исполнитель: Малюченко Н.В. Участники НИР: Армеев Г.А., Валиева М.Е., Герасимова Н.С., Гераськина О.В., Иванова М.А., Коровина А.Н., Кошкина Д.О., Любителев А.В., Никитин Д.В., Саулина А.А., Чертков О.В., Шайтан А.К.
  • • 1 января 2016 - 31 декабря 2020 Физико-химические основы молекулярной биоинженерии
    • Кафедра биоинженерии
    • Руководитель: Кирпичников М.П. Участники НИР: Айдналиева Н.В., Алескерова Л.Э., Аргентова В.В., Армеев Г.А., Архипова А.Ю., Асланян Р.Р., Ахаев Д.Н., Багров Д.В., Барский Е.Л., Баулина О.И., Боздаганян М.Е., Бонарцев А.П., Бондаренко Е.А., Буракова О.В., Валиева М.Е., Васильева С.Г., Вахрушева А.В., Волох О.И., Волынцева А.Д., Герасимова Н.С., Гераськина О.В., Глухов А.И., Глухов Г.С., Гончаренко А.В., Гончарук М.В., Гончарук С.А., Гордеев С.А., Горелова О.А., Долгих Д.А., Дольникова Г.А., Жаркова И.И., Зайцева А.А., Иванова М.А., Карлова М.Г., Коровина А.Н., Кошкина Д.О., Кузьменков А.И., Лобакова Е.С., Лукьянов А.А., Любителев А.В., Малюченко Н.В., Мариловцева Е.В., Мойсенович А.М., Мойсенович М.М., Налобин Д.С., Никитин Д.В., Новоселецкий В.Н., Орехов Ф.С., Орлова А.А., Панченко Л.А., Петушкова Ю.А., Петушкова Ю.П., Попова С.С., Пугачева Т.Т., Рамонова А.А., Саванина Я.В., Савилова З.Д., Селях И.О., Семенова Л.Р., Сивкина А.Л., Соколова О.С., Соловченко А.Е., Соловченко О.В., Станишнева-Коновалова Т.Б., Студитский В.М., Суханова Ю.А., Тамбиев А.Х., Трифонова Е.С., Утешинская Л.В., Федоренко Т.А., Феофанов А.В., Чеканов К.А., Чемерис А.С., Чертков О.В., Чивкунова О.Б., Шайтан А.К., Шайтан К.В., Шебанова А.С., Шибзухова К.А., Щербаков П.Н., Яголович А.В., герасимова н.с.