Выберите категорию обращения:
Общие вопросы
Отчеты
Рейтинги
Мониторинговый отчёт
Диссертационные советы
Конкурсы
Ввод данных
Структура организаций
Аспирантура
Научное оборудование
Импорт педагогической нагрузки
Журналы и импакт-факторы
Тема обращения:
Описание проблемы:
Введите почтовый адрес:
ИСТИНА
Войти в систему
Регистрация
Интеллектуальная Система Тематического Исследования НАукометрических данных
Главная
Поиск
Статистика
О проекте
Помощь
В связи с техническими работами в центре обработки данных, часть прикреплённых файлов в настоящее время недоступна.
скрыть
отправить сообщение
открыть новую версию профиля
Копылов Кирилл Евгеньевич
пользователь
МГУ имени М.В. Ломоносова
,
Факультет биоинженерии и биоинформатики
, аспирант, с 1 октября 2017
МГУ имени М.В. Ломоносова
,
Научно-исследовательский вычислительный центр
,
4.07.Лаборатория информатики
, младший научный сотрудник, с 1 апреля 2021
МГУ имени М.В. Ломоносова
,
Университетская гимназия (школа-интернат)
, специалист, с 1 апреля 2021, по совместительству
Прежние места работы
(Нажмите для отображения)
МГУ имени М.В. Ломоносова
,
Химический факультет
, специалист, 1 ноября 2014 - 31 января 2023
МГУ имени М.В. Ломоносова
,
Факультет биоинженерии и биоинформатики
, старший лаборант, 1 октября 2014 - 1 октября 2015, по совместительству
Соавторы:
Швядас В.К.
,
Суплатов Д.А.
,
Воеводин В.В.
,
Попова Н.Н.
,
Шарапова Я.А.
,
Demiyanova A.S.
,
Нойманн (Вдовенко) М.М.
,
Сахаров И.Ю.
,
Шегай М.В.
,
Злобин А.С.
,
Кирилин Е.М.
,
Панин Н.В.
,
Krotov V.V.
показать полностью...
,
Lyashenko A.
,
Дробот В.В.
,
Кузьменко Н.Е.
,
Никитина Н.А.
,
Олейниченко А.В.
,
Пичугина Д.А.
,
Починок И.В.
,
Рыжова О.Н.
,
Тимонина Д.С.
,
Щербакова Т.А.
,
Эльдаров М.А.
18 статей
,
13 докладов на конференциях
,
1 тезисы доклада
,
8 НИР
Количество цитирований статей в журналах по данным Web of Science: 66, Scopus: 72
РИНЦ:
IstinaResearcherID (IRID): 7878569
ResearcherID:
AGZ-6428-2022
Scopus Author ID:
56110041900
ORCID:
0000-0001-8650-9120
Деятельность
Статьи в журналах
2023
Conformational transitions induced by NADH binding promote reduction half-reaction in 2-hydroxybiphenyl-3-monooxygenase catalytic cycle
Kopylov Kirill
,
Kirilin Evgeny
,
Svedas Vytas
в журнале
Biochemical and Biophysical Research Communications
, издательство
Academic Press
(United States)
, том 639, с. 77-83
DOI
2021
PLUMED plugin integration into high performance pmemd program for enhanced molecular dynamics simulations
Drobot V.V.
,
Kirilin E.M.
,
Kopylov K.E.
,
Pochinok I.V.
,
Švedas V.K.
в журнале
Supercomputing Frontiers and Innovations
, том 8, № 4, с. 94-99
DOI
2019
CASBench: A Benchmarking Set of Proteins with Annotated Catalytic and Allosteric Sites in Their Structures
Zlobin A.
,
Suplatov D.
,
Kopylov K.
,
Švedas V.
в журнале
Acta Naturae (англоязычная версия)
, издательство
Park Media Ltd
(Moscow, Russia (Federation))
, том 11, № 1(40), с. 74-80
DOI
2019
CASBench: эталонный набор белков с аннотированными каталитическим и аллостерическим сайтами в их структурах
Злобин А.
,
Суплатов Д.
,
Копылов К.
,
Швядас В.
в журнале
Acta Naturae (русскоязычная версия)
, издательство
Парк-медиа
(М.)
, том 11, № 1(40), с. 74-80
DOI
2019
Human p38α Mitogen-Activated Protein Kinase in the Asp168-Phe169-Gly170-in (DFG-in) state can bind allosteric inhibitor Doramapimod
Suplatov D.A.
,
Kopylov K.E.
,
Sharapova Y.A.
,
Švedas V.
в журнале
Journal of Biomolecular Structure and Dynamics
, издательство
Adenine Press
(United States)
, том 37, № 8, с. 2049-2060
DOI
2019
Молекулярная динамика в силовом поле FF14SB в воде TIP4P-Ew, и в силовом поле FF15IPQ в воде SPC/Eb: сравнительный анализ на GPU и CPU
Суплатов Д.А.
,
Шарапова Я.А.
,
Попова Н.Н.
,
Копылов К.Е.
,
Воеводин Вл В.
,
Швядас В.К.
в журнале
Вестник Южно-Уральского государственного университета. Серия "Вычислительная математика и информатика"
, том 8, № 1, с. 71-88
DOI
2018
Mustguseal: a Server for Multiple Structure-Guided Sequence Alignment of Protein Families
Suplatov D.A.
,
Kopylov K.E.
,
Popova N.N.
,
Voevodin Vl V.
,
Švedas V.K.
в журнале
Bioinformatics
, издательство
Oxford University Press
(United Kingdom)
, том 34, № 9, с. 1583-1585
DOI
2018
Test of Computational Approaches for Gold-Thiolate Clusters Calculation using Lomonosov Supercomputer
Nikitina Nadezhda N.
,
Pichugina Daria A.
,
Oleynichenko Alexander V.
,
Ryzhova Oxana N.
,
Kopylov Kirill E.
,
Krotov Vladimir V.
,
Kuzmenko Nikolay E.
в журнале
Supercomputing Frontiers and Innovations
, том 5, № 4, с. 83-88
DOI
2018
The visualCMAT: a web-server to select and interpret correlated mutations/co-evolving residues in protein families
Dmitry Suplatov
,
Yana Sharapova
,
Daria Timonina
,
Kirill Kopylov
,
Vytas Švedas
в журнале
Journal of Bioinformatics and Computational Biology
, издательство
Imperial College Press
(United Kingdom)
, том 16, № 2, с. 1840005
DOI
2017
Гибридные вычислительные кластеры для изучения структуры, функции и регуляции белков
Суплатов Д.А.
,
Попова Н.Н.
,
Копылов К.Е.
,
Шегай М.В.
,
Воеводин Вл В.
,
Швядас В.К.
в журнале
Вестник Южно-Уральского государственного университета. Серия "Вычислительная математика и информатика"
, том 6, № 4, с. 74-90
DOI
2016
Modulation Of Enzyme Functional Properties
Suplatov D.A.
,
Panin N.K.
,
Kopylov K.E.
,
Švedas V.K.
в журнале
Acta Naturae (русскоязычная версия)
, издательство
Парк-медиа
(М.)
, том 2, с. 222-223
2014
Chemiluminescent Determination of Hydrogen Peroxide using FeIII-TAML activator, a Potent Peroxidase Mimicking Enzyme
Vdovenko M.M.
,
Demiyanova A.S.
,
Kopylov K.E.
,
Sakharov I.Yu
в журнале
Journal of Analytical & Bioanalytical Techniques
, том 5, № 4, с. 39-39
DOI
2014
Chemiluminescent determination of hydrogen peroxide using FeIII-TAML activator, a potent peroxidase mimicking enzyme
Vdovenko M.M.
,
Demiyanova A.S.
,
Kopylov K.E.
,
Sakharov I.Yu
в журнале
Luminescence : the journal of biological and chemical luminescence
, издательство
John Wiley & Sons Inc.
(United States)
, том 29, № SI, Suppl. 1, с. 102-102
DOI
2014
FeIII–TAMLactivator: A potent peroxidase mimic for chemiluminescent determination of hydrogen peroxide
Vdovenko Marina M.
,
Demiyanova Alexandra S.
,
Kopylov Kirill E.
,
Sakharov Ivan Yu
в журнале
Talanta
, издательство
Elsevier BV
(Netherlands)
, том 125, с. 361-365
DOI
2014
Probing the Substrate Specificity and Intersubunit Interactions of Brevundimonas Diminuta Glutaryl Acylase with Site-Directed Mutagenesis
Eldarov M.
,
Lyashenko A.
,
Sherbakova T.
,
Suplatov D.
,
Kopylov K.
,
Švedas V.
в журнале
American Journal of Biochemistry and Biotechnology
, издательство
Science Publications
(United States)
, том 10, № 3, с. 169-179
DOI
Статьи в сборниках
2018
Молекулярная динамика в силовом поле FF14SB в воде TIP4P-Ew, и в силовом поле FF15IPQ в воде SPC/Eb:сравнительный анализ на GPU и CPU
Суплатов Д.А.
,
Шарапова Я.А.
,
Попова Н.Н.
,
Копылов К.Е.
,
Воеводин Вл В.
,
Швядас В.К.
в сборнике
Суперкомпьютерные дни в России: Труды международной конференции (24-25 сентября 2018 г., г. Москва)
, место издания
Издательство МГУ Москва
, с. 705-716
2017
Гибридные вычислительные кластеры для изучения структуры, функции и регуляции белков
Суплатов Д.А.
,
Попова Н.Н.
,
Копылов К.Е.
,
Шегай М.В.
,
Воеводин В.В.
,
Швядас В.К.
в сборнике
Труды международной конференции. СУПЕРКОМПЬЮТЕРНЫЕ ДНИ В РОССИИ. Москва, 25-26 сентября 2017 г
, место издания
Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова (Издательский Дом (Типография) (Москва)
, с. 544-556
2015
High-performance computing in bioinformatic analysis of protein superfamilies to design enzymes with new properties
Suplatov D.
,
Popova N.
,
Kopylov K.
,
Shegai M.
,
Voevodin V.
,
Švedas V.
в сборнике
Суперкомпьютерные дни в России: Труды международной конференции (28-29 сентября 2015 г., г. Москва)
, место издания
Изд-во МГУ Москва
, с. 537-537
Доклады на конференциях
2023
Моделирование структуры подвижных участков белка с помощью GPU-ускоренной метадинамики с коллективными переменными на основе вариационных автоэнкодеров
(Стендовый)
Авторы:
Копылов К.Е.
,
Кирилин Е.М.
,
Швядас В.К.
IX ежегодная Междунароная конференция "Суперкомпьютерные дни в России"
, Москва, МГУ имени М.В. Ломоносова, Россия, 25-26 сентября 2023
2020
Использование MPI- и GPU-ускоренного комбинированного метода квантовой механики, молекулярной механики и метадинамики для моделирования стадии окисления субстрата в каталитическом цикле 2-гидроксибифенил-3-монооксигеназы из Pseudomonas azelaica
(Стендовый)
Авторы:
Копылов К.Е.
,
Кирилин Е.М.
,
Швядас В.К.
Суперкомпьютерные дни в России 2020
, Москва, Россия, 21-22 сентября 2020
2017
Гибридные вычислительные кластеры для изучения структуры, функции и регуляции белков
(Устный)
Авторы:
Шегай М.В.
,
Воеводин Вл В.
,
Копылов К.Е.
,
Суплатов Д.А.
,
Попова Н.Н.
,
Швядас В.К.
Суперкомпьютерные дни в России 2017
, Москва, Россия, 25-26 сентября 2017
2017
Allosteric inhibitor Doramapimod can bind to human p38α MAP Kinase even when the activation loop is in the DFG-in state
(Стендовый)
Авторы:
Dmitry Suplatov
,
Vytas Švedas
,
Yana Sharapova
,
Kirill Kopylov
Moscow Conference on Computational Molecular Biology (MCCMB'17)
, Москва, Россия, 27-30 июля 2017
2016
Modulation Of Enzyme Functional Properties
(Устный)
Авторы:
Suplatov D.A.
,
Švedas V.K.
,
Kopylov K.E.
,
Panin N.K.
V Съезд физиологов СНГ, V Съезд Биохимиков России
, Сочи, Россия, 4-8 октября 2016
2016
GPU-accelerated analysis of linear trends in a protein motion
(Стендовый)
Авторы:
Suplatov D.
,
Kopylov K.
,
Švedas V.
Международная конференция "Суперкомпьютерные дни в России 2016"
, Москва, Россия, 26-27 сентября 2016
2016
Изучение механизма распознавания субстратов с участием подвижных элементов структуры активных центров ферментов 3-гидроксибензоатгидроксилазы и 2-гидроксибифенил-3-монооксигеназы с использованием суперкомпьютера
(Стендовый)
Авторы:
Копылов К.Е.
,
Суплатов Д.А.
,
Швядас В.К.
Международная конференция "Суперкомпьютерные дни в России 2016"
, Москва, Россия, 26-27 сентября 2016
2016
Statistical Analysis Of Linear Trends In Protein Motion To Study Induced Conformational Changes In Protein Structures
(Устный)
Авторы:
Suplatov D.
,
Kopylov K.
,
Mironov A.А.
,
Švedas V.
International Symposium «Systems Biology and Bioinformatics»
, г. Санкт-Петербург, Россия, 30 июня - 2 июля 2016
2015
High-performance computing in bioinformatic analysis of protein superfamilies to design enzymes with new properties
(Стендовый)
Авторы:
Suplatov D.
,
Popova N.
,
Kopylov K.
,
Shegai M.
,
Voevodin V.
,
Švedas V.
Международная конференция "Суперкомпьютерные дни в России 2015"
, Москва, Россия, 28-29 сентября 2015
2014
Chemiluminescent Determination of Hydrogen Peroxide using FeIII-TAML activator, a Potent Mimicking Enzyme
(Стендовый)
Авторы:
Vdovenko Marina M.
,
Sakharov Ivan Yu
,
Kopylov Kirill E.
,
Demiyanova Alexandra S.
The 18th International Symposium on Bioluminescence and Chemiluminescence
, Uppsala, Sweden, Швеция, 2014
2014
Chemiluminescent Determination of Hydrogen Peroxide using FeIII-TAML activator, a Potent Peroxidase Mimicking Enzyme
(Устный)
Авторы:
Vdovenko Marina M.
,
Sakharov Ivan Yu
,
Kopylov Kirill E.
,
Demiyanova Alexandra S.
5 International conference and exhibition on Analycal and Bioanalycal Techniques
, Beijing, 2014
2014
Каталитическое окисление люминола в присутствии FeIII-ТАМЛ, нового миметика пероксидазы, как индикаторная реакция для хемилюминесцентного определения пероксида водорода
(Стендовый)
Авторы:
Демьянова А.С.
,
Сахаров И.Ю.
,
Копылов К.Е.
,
Вдовенко М.М.
IX Всероссийская конференция по анализу объектов окружающей среды «Экоаналитика-2014»
, Светлогорск, Россия, 23-28 июня 2014
2013
Chemiluminescent detection of hydrogen peroxide and benzoyl peroxide using peroxidase-mimicking FeIII-TAML activator as catalyst
Авторы:
Demiyanova A.
,
Kopylov K.
,
Sakharov I.
,
Vdovenko M.
Euroanalysis 2013
, Warzaw, Poland, Польша, 2013
Тезисы докладов
2016
Modulation of enzyme functional properties
Suplatov D.A.
,
Panin N.K.
,
Kopylov K.E.
,
Švedas V.K.
в сборнике
ACTA NATURAE
, серия
СПЕЦВЫПУСК
, том 2, тезисы, с. 222-223
НИРы
17 марта 2021 - 31 декабря 2024
Разработка и реализация принципов суперкомпьютерного кодизайна для развития сквозных цифровых технологий и создания высокопроизводительных вычислительных платформ для предсказательного моделирования и применения искусственного интеллекта: от микромира, до живых организмов и Земной системы
4.07.Лаборатория информатики
Руководитель:
Швядас В.К.
Ответственные исполнители:
Антонов А.С.
,
Воеводин В.В.
,
Кирилин Е.М.
Участники НИР:
Балдин С.М.
,
Богомолов В.Ю.
,
Варенцов А.И.
,
Воеводин В.В.
,
Волков Е.В.
,
Гащук Е.М.
,
Дебольский А.В.
,
Добров Б.В.
,
Дробот В.В.
,
Жуматий С.А.
,
Игнатенко А.П.
,
Кирилин Е.М.
,
Коннов С.И.
,
Копылов К.Е.
,
Лукашевич Н.В.
,
Лыкосов В.Н.
,
Медведев А.И.
,
Молокоедов В.С.
,
Мортиков Е.В.
,
Нилов Д.К.
,
Панин Н.В.
,
Поддъяков И.Д.
,
Подшивалов Д.Д.
,
Полюхов А.А.
,
Попов С.М.
,
Пушкарев С.В.
,
Рубцова Ю.В.
,
Серов В.А.
,
Сидоров И.Ю.
,
Смирнов А.В.
,
Смирнов В.А.
,
Степаненко В.М.
,
Стефанов К.С.
,
Суязова В.И.
,
Тихомиров М.М.
,
Чернышев Д.И.
,
Чернышев Р.В.
,
Чухарев Ф.С.
,
Шайхисламов Д.И.
,
Шоков В.Н.
,
Щербакова Т.А.
,
Яковлев Р.В.
1 января 2021 - 31 декабря 2025
Разработка программных средств поддержки жизненного цикла и обеспечения эффективности суперкомпьютерных приложений, систем и центров
4.08.Лаборатория параллельных информационных технологий
Руководитель:
Воеводин В.В.
Ответственные исполнители:
Антонов А.С.
,
Воеводин В.В.
,
Соболев С.И.
Участники НИР:
Антонова А.П.
,
Афанасьев И.В.
,
Балдин С.М.
,
Винокуров В.И.
,
Винокуров В.И.
,
Гамаюнова Т.С.
,
Герасимова А.А.
,
Домрачева Д.А.
,
Дробот В.В.
,
Жуматий С.А.
,
Кирилин Е.М.
,
Копылов К.Е.
,
Крымский С.А.
,
Кулагин А.В.
,
Кулагин А.В.
,
Кулагин А.В.
,
Кулагин А.В.
,
Кулагин А.В.
,
Лалетина А.А.
,
Леоненков С.Н.
,
Личманов Д.И.
,
Лутков Г.А.
,
Майер Р.В.
,
Макарова-Землянская Т.Б.
,
Матвеев А.Д.
,
Мещеряков А.О.
,
Мокров К.С.
,
Никитенко Д.А.
,
Нилов Д.К.
,
Паокин А.В.
,
Попов С.М.
,
Разлогова Е.Э.
,
Рощина О.П.
,
Сетяев А.В.
,
Сетяев А.В.
,
Сидоров И.Ю.
,
Степанов Д.А.
,
Стефанов К.С.
,
Тарумова Н.Т.
,
Тимошкин М.А.
,
Тыркалов Е.О.
,
Фатеев И.Д.
,
Худолеева А.А.
,
Шайхисламов Д.И.
,
Швец П.А.
,
Швядас В.К.
,
Шоков В.Н.
1 января 2020 - 31 декабря 2023
Методы структурирования трудноформализуемых предметных областей на основе автоматизированного формирования больших графов знаний и онтологий по разнородным потокам текстовых данных
4.04.Лаборатория анализа информационных ресурсов
Руководитель:
Добров Б.В.
Ответственный исполнитель:
Лукашевич Н.В.
Участники НИР:
Артемова Е.Л.
,
Архипенко К.В.
,
Балдин С.М.
,
Батура Т.В.
,
Болдырев И.А.
,
Браславский П.И.
,
Быстрицкий Д.К.
,
Быстрицкий Н.Д.
,
Волков Е.В.
,
Герасимова А.А.
,
Гращенков П.В.
,
Дробот В.В.
,
Иванов В.В.
,
Кирилин Е.М.
,
Коннов С.И.
,
Копылов К.Е.
,
Кремнева М.Д.
,
Лютикова Е.А.
,
Майоров В.Д.
,
Макаров-Землянский Н.В.
,
Мячина А.В.
,
Нилов Д.К.
,
Подшивалов Д.Д.
,
Пушкарев С.В.
,
Рубцова Ю.В.
,
Сидоров А.В.
,
Скворцов Н.А.
,
Смирнов В.А.
,
Тихомиров М.М.
,
Тутубалина Е.В.
,
Чернышев Д.И.
,
Чухарев Ф.С.
,
Швядас В.К.
,
Шелманов А.О.
,
Штернов С.В.
1 марта 2017 - 31 декабря 2019
Поиск новых решений ресурсоемких задач биоинформатики и молекулярного моделирования с использованием GPU-ускорителей
Кафедра суперкомпьютеров и квантовой информатики
Руководитель:
Воеводин В.В.
Ответственный исполнитель:
Попова Н.Н.
Участники НИР:
АНТОНОВ А.А.
,
Копылов К.Е.
,
Суплатов Д.А.
,
Теплов А.М.
,
Швядас В.К.
1 января 2017 - 31 декабря 2017
Биоинформатический анализ суперсемейств белков для поиска и характеристики функциональных и регуляторных центров связывания лигандов
Факультет биоинженерии и биоинформатики
Руководитель:
Суплатов Д.А.
Ответственные исполнители:
Злобин А.С.
,
Копылов К.Е.
,
Николаева Д.Д.
,
Шарапова Я.А.
1 января 2016 - 31 декабря 2017
Биоинформатический анализ суперсемейств белков для поиска и характеристики функциональных и регуляторных центров связывания лигандов
Научно-исследовательский институт физико-химической биологии имени А.Н.Белозерского
Руководитель:
Суплатов Д.А.
Участники НИР:
Злобин А.С.
,
Копылов К.Е.
,
Медведев Д.О.
,
Николаева Д.Д.
,
Шарапова Я.А.
1 января 2014 - 31 декабря 2016
Технологии суперкомпьютерного кодизайна для решения ресурсоемких вычислительных задач биокатализа
Кафедра суперкомпьютеров и квантовой информатики
Руководитель:
Воеводин В.В.
Участники НИР:
Антонов А.С.
,
Воеводин В.В.
,
Копылов К.Е.
,
Ожигов Ю.И.
,
Попова Н.Н.
,
Суплатов Д.А.
,
Чернявский А.Ю.
,
Швец П.А.
,
Швядас В.К.
15 марта 2013 - 31 декабря 2015
Новые эффективные миметики пероксидазы и их использование в аналитической химии
Кафедра химической энзимологии
Руководитель:
Сахаров И.Ю.
Участники НИР:
Грибас А.В.
,
Демьянова А.С.
,
Копылов К.Е.
,
Нойманн (Вдовенко) М.М.
,
Ускова Н.А.