ИСТИНА

Есюнина Дарья Михайловна пользователь

Соавторы: Кульбачинский А.В., Петушков И.В., Пупов Д.В., Aravin A.A., Агапов А.А., Miropolskaya N., Кузьменко А.В., Murakami K.S., Severinov K., Миропольская Н.А., Простова М.А., Belogurov G., Berdygulova Z. показать полностью..., Brodolin K., Feklistov A., Ignatov A., Kropocheva E.V., Kuznedelov K., Lisitskaya L., Lisitskaya L., Liu Y., Minakhin L., Mukhamedyarov D., Musabirov A.A., Nickels B.E., Ninova M., Oguienko A., Olina A., Patel D., Qayyum M.Z., Shikalov A.B., Teplova M.V., Turtola M., Yeonoh S., Донцова О.А., Жилина Е.В., Козлов М.В., Кочетков С.Н., Кудинова А.Г., Марданов А.В., Нестерчук М.В., Олина А.В., Оловников И.А., Остерман И.А., Петрова М.А., Плетнёв Ф.И., Равин Н.В., Рубцова М.П., Рязанский С.С., Сергиев П.В.

29 статей, 7 докладов на конференциях, 1 диссертация

Количество цитирований статей в журналах по данным Web of Science: 134, Scopus: 167

IstinaResearcherID (IRID): 1001405

Деятельность

• Статьи в журналах

  • • 2023 Effects of natural polymorphisms in SARS-CoV-2 RNA-dependent RNA polymerase on its activity and sensitivity to inhibitors in vitro
    • Miropolskaya Nataliya, Kozlov Maxim, Petushkov Ivan, Prostova Maria, Pupov Danil, Esyunina Daria, Kochetkov Sergey, Kulbachinskiy Andrey
    • в журнале Biochimie, издательство Elsevier BV (Netherlands), том 206, с. 81-88 DOI
  • • 2022 Effects of natural RNA modifications on the activity of SARS-CoV-2 RNA-dependent RNA polymerase
    • Petushkov Ivan, Esyunina Daria, Kulbachinskiy Andrey
    • в журнале FEBS Journal, издательство Blackwell Publishing Inc. (United Kingdom) DOI
  • • 2022 Prokaryotic Argonaute Proteins as a Tool for Biotechnology
    • Kropocheva E.V., Lisitskaya L.A., Agapov A.A., Musabirov A.A., Kulbachinskiy A.V., Esyunina D.M.
    • в журнале Molecular Biology, издательство Maik Nauka/Interperiodica Publishing (Russian Federation), том 56, № 6, с. 854-873 DOI
  • • 2022 Suppressor mutations in Escherichia coli RNA polymerase alter transcription initiation but do not affect translesion RNA synthesis in vitro
    • Miropolskaya Nataliya, Petushkov Ivan, Esyunina Daria, Kulbachinskiy Andrey
    • в журнале Journal of Biological Chemistry, издательство American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc. (United States), том 298, № 7, с. 102099 DOI
  • 
    • 2021 A programmable pAgo nuclease with universal guide and target specificity from the mesophilic bacterium Kurthia massiliensis
    • Kropocheva Ekaterina, Kuzmenko Anton, Aravin Alexei A., Esyunina Daria, Kulbachinskiy Andrey
    • в журнале Nucleic Acids Research, издательство Oxford University Press (United Kingdom), том 49, № 7, с. 4054-4065 DOI
  • 
    • 2021 Structural basis of ribosomal RNA transcription regulation
    • Yeonoh Shin, Qayyum M.Zuhaib, Pupov Danil, Esyunina Daria, Kulbachinskiy Andrey, Murakami Katsuhiko S.
    • в журнале Nature communications, издательство Nature Pub. Group (United Kingdom), том 12, № 1 DOI
  • 
    • 2021 Universal functions of the σ finger in alternative σ factors during transcription initiation by bacterial RNA polymerase
    • Oguienko Anastasiya, Petushkov Ivan, Pupov Danil, Esyunina Daria, Kulbachinskiy Andrey
    • в журнале RNA Biology, издательство Landes Bioscience (United States), с. 1-10 DOI
  • 
    • 2020 Antitermination protein P7 of bacteriophage Xp10 distinguishes different types of transcriptional pausing by bacterial RNA polymerase
    • Prostova M., Kulbachinskiy A., Esyunina D.
    • в журнале Biochimie, издательство Elsevier BV (Netherlands), том 170, с. 57-64 DOI
  • • 2020 DNA targeting and interference by a bacterial Argonaute nuclease
    • Kuzmenko Anton, Oguienko Anastasiya, Esyunina Daria, Yudin Denis, Petrova Mayya, Kudinova Alina, Maslova Olga, Ninova Maria, Ryazansky Sergei, Leach David, Aravin Alexei A., Kulbachinskiy Andrey
    • в журнале Nature, издательство Nature Publishing Group (United Kingdom) DOI
  • 
    • 2020 Factor-specific effects of mutations in the active site of RNA polymerase on RNA cleavage
    • Miropolskaya Nataliya, Kulbachinskiy Andrey, Esyunina Daria
    • в журнале Biochemical and Biophysical Research Communications, издательство Academic Press (United States), том 523, № 1, с. 165-170 DOI
  • 
    • 2020 Genome-wide DNA sampling by Ago nuclease from the cyanobacterium Synechococcus elongatus
    • Olina Anna, Kuzmenko Anton, Ninova Maria, Aravin Alexei A., Kulbachinskiy Andrey, Esyunina Daria
    • в журнале RNA Biology, издательство Landes Bioscience (United States), том 17, № 5, с. 677-688 DOI
  • • 2020 Recognition of double-stranded DNA by the Rhodobacter sphaeroides Argonaute protein
    • Lisitskaya Lidia, Petushkov Ivan, Esyunina Daria, Aravin Alexei, Kulbachinskiy Andrey
    • в журнале Biochemical and Biophysical Research Communications, издательство Academic Press (United States) DOI
  • 
    • 2020 Rewiring of growth-dependent transcription regulation by a point mutation in region 1.1 of the housekeeping σ factor
    • Pletnev Philipp, Pupov Danil, Pshanichnaya Lizaveta, Esyunina Daria, Petushkov Ivan, Nesterchuk Mikhail, Osterman Ilya, Rubtsova Maria, Mardanov Andrey, Ravin Nikolai, Sergiev Petr, Kulbachinskiy Andrey, Dontsova Olga
    • в журнале Nucleic Acids Research, издательство Oxford University Press (United Kingdom), том 48, № 19, с. 10802-10819 DOI
  • 
    • 2020 Role of the trigger loop in translesion RNA synthesis by bacterial RNA polymerase
    • Agapov Aleksei, Ignatov Artem, Turtola Matti, Belogurov Georgiy, Esyunina Daria, Kulbachinskiy Andrey
    • в журнале Journal of Biological Chemistry, издательство American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc. (United States), том 295, № 28, с. 9583-9595 DOI
  • 
    • 2019 Gre-family factors modulate DNA damage sensing by Deinococcus radiodurans RNA polymerase
    • Agapov Aleksei, Esyunina Daria, Kulbachinskiy Andrey
    • в журнале RNA Biology, издательство Landes Bioscience (United States), с. 1-10 DOI
  • 
    • 2019 Interactions in the active site of Deinococcus radiodurans RNA polymerase during RNA proofreading
    • Esyunina Daria, Kulbachinskiy Andrey
    • в журнале Biochemical and Biophysical Research Communications, издательство Academic Press (United States), том 509, № 1, с. 161-166 DOI
  • 
    • 2019 The sigma24 Subunit of Escherichia coli RNA Polymerase Can Induce Transcriptional Pausing in vitro
    • Shikalov A.B., Esyunina D.M., Pupov D.V., Kulbachinskiy A.V., Petushkov I.V.
    • в журнале Biochemistry (Moscow), издательство Pleiades Publishing, Ltd (Road Town, United Kingdom), том 84, № 4, с. 426-434 DOI
  • 
    • 2018 Accommodation of Helical Imperfections in Rhodobacter sphaeroides Argonaute Ternary Complexes with Guide RNA and Target DNA
    • Liu Yiwei, Esyunina Daria, Olovnikov Ivan, Teplova Marianna, Kulbachinskiy Andrey, Aravin Alexei A., Patel Dinshaw J.
    • в журнале Cell reports, издательство Cell Press (United States), том 24, № 2, с. 453-462 DOI
  • 
    • 2018 Argonaute Proteins and Mechanisms of RNA Interference in Eukaryotes and Prokaryotes
    • Olina A.V., Kulbachinskiy A.V., Aravin A.A., Esyunina D.M.
    • в журнале Biochemistry (Moscow), издательство Pleiades Publishing, Ltd (Road Town, United Kingdom), том 83, № 5, с. 483-497 DOI
  • 
    • 2018 Dual role of the $\upsigma$ factor in primer RNA synthesis by bacterial RNA polymerase
    • Esyunina Daria, Pupov Danil, Kulbachinskiy Andrey
    • в журнале FEBS Letters, издательство Elsevier BV (Netherlands), том 593, № 3, с. 361-368 DOI
  • 
    • 2018 Region 3.2 of the $\upsigma$ factor controls the stability of rRNA promoter complexes and potentiates their repression by DksA
    • Pupov Danil, Petushkov Ivan, Esyunina Daria, Murakami Katsuhiko S., Kulbachinskiy Andrey
    • в журнале Nucleic Acids Research, издательство Oxford University Press (United Kingdom), том 46, № 21, с. 11477-11487 DOI
  • 
    • 2017 Conserved functions of the trigger loop and Gre factors in RNA cleavage by bacterial RNA polymerases
    • Miropolskaya Nataliya, Esyunina Daria, Kulbachinskiy Andrey
    • в журнале Journal of Biological Chemistry, издательство American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc. (United States), том 292, № 16, с. 6744-6752 DOI
  • 
    • 2017 Gfh factors and NusA cooperate to stimulate transcriptional pausing and termination
    • Agapov Aleksei, Olina Anna, Esyunina Daria, Kulbachinskiy Andrey
    • в журнале FEBS Letters, издательство Elsevier BV (Netherlands), том 591, № 6, с. 946-953 DOI
  • • 2017 Interplay between σ region 3.2 and secondary channel factors during promoter escape by bacterial RNA polymerase
    • Petushkov I., Esyunina D., Mekler V., Severinov K., Pupov D., Kulbachinsky A., Kulbachinsky A.
    • в журнале Biochemical Journal, издательство Portland Press, Ltd. (United Kingdom) DOI
  • 
    • 2016 Regulation of transcription initiation by Gfh factors from Deinococcus radiodurans
    • Agapov A., Esyunina D., Pupov D., Kulbachinskiy A.
    • в журнале Biochemical Journal, издательство Portland Press, Ltd. (United Kingdom), том 473, № 23, с. 4493-4505 DOI
  • 
    • 2013 Single-strand promoter traps for bacterial RNA polymerase
    • Pupov D., Esyunina D., Feklistov A., Kulbachinskiy A.
    • в журнале Biochemical Journal, издательство Portland Press, Ltd. (United Kingdom), том 452, № 2, с. 241-248
  • 
    • 2012 A novel phage-encoded transcription antiterminator acts by suppressing bacterial RNA polymerase pausing
    • Berdygulova Z., Esyunina D., Miropolskaya N., Mukhamedyarov D., Kuznedelov K., Nickels B.E., Severinov K., Kulbachinskiy A., Minakhin L.
    • в журнале Nucleic Acids Research, издательство Oxford University Press (United Kingdom), том 40, № 9, с. 4052-4063
  • 
    • 2012 Structural transitions in the transcription elongation complexes of bacterial RNA polymerase during sigma-dependent pausing
    • Zhilina E., Esyunina D., Brodolin K., Kulbachinskiy A.
    • в журнале Nucleic Acids Research, издательство Oxford University Press (United Kingdom), том 40, № 7, с. 3078-3091

• Статьи в сборниках

  • • 2016 Transcriptional pausing induced by alternative sigma subunits of Escherichia coli RNA polymerase
    • Petushkov I., Esyunina D., Kulbachinskiy A.
    • в сборнике Special Issue: 41st FEBS Congress, Molecular and Systems Biology for a Better Life, серия FEBS Journal, место издания Blackwell Publishing Inc United Kingdom, том 283, с. 205-206 DOI

• Доклады на конференциях

  • • 2017 Роль факторов транскрипции и репарации Deinococcus radiodurans в регуляции активности РНК-полимеразы на поврежденных матрицах (Стендовый)
    • Авторы: Агапов А.А., Кульбачинский А.В., Есюнина Д.М.
    • XXIX Зимняя молодежная научная школа "Перспективные направления физико-химической биологии и биотехнологии" , Россия, 7-10 февраля 2017
  • • 2016 ИЗУЧЕНИЕ СИГМА38-ЗАВИСИМЫХ ПАУЗ ТРАНСКРИПЦИИ У БАКТЕРИИ ESCHERICHIA COLI (Стендовый)
    • Авторы: Есюнина Д.М., Кульбачинский А.В., Петушков И.В.
    • VII Международная школа молодых ученых по молекулярной генетике «ГЕНОМИКА И БИОЛОГИЯ ЖИВЫХ СИСТЕМ», Звенигород, Россия, 14-18 ноября 2016
  • • 2016 Роль белков NusA и Gfh в регуляции пауз и терминации транскрипции у Deinococcus radiodurans (Стендовый)
    • Авторы: Агапов А.А., Кульбачинский А.В., Есюнина Д.М., Олина А.В.
    • VII Международная школа молодых ученых по молекулярной генетике «ГЕНОМИКА И БИОЛОГИЯ ЖИВЫХ СИСТЕМ», Звенигород, Россия, 14-18 ноября 2016
  • • 2016 Роль Gfh-факторов радиоустойчивой бактерии Deinococcus radiodurans в регуляции инициации транскрипции (Стендовый)
    • Авторы: Агапов А.А., Кульбачинский А.В., Пупов Д.В., Есюнина Д.М.
    • V Съезд физиологов СНГ, V Съезд Биохимиков России, Сочи, Россия, 4-8 октября 2016
  • • 2016 Gfh factors stimulate transcriptional pausing and termination by Deinococcus radiodurans RNA polymerase (Стендовый)
    • Авторы: Agapov A., Kulbachinskiy A., Esyunina D.
    • 41st FEBS Congress on Molecular and Systems Biology for a Better Life, Kusadasi, Турция, 3-9 сентября 2016
  • • 2016 Влияние Gfh-факторов радиоустойчивой бактерии Deinococcus radiodurans на инициацию транскрипции (Устный)
    • Авторы: Агапов А.А., Кульбачинский А.В., Есюнина Д.М.
    • 20-я Международная Пущинская школа-конференция молодых учёных "Биология - наука XXI века", Пущино, Россия, 18-22 апреля 2016
  • • 2015 Транскрипционные свойства Gre-подобных факторов радиоустойчивой бактерии Deinococcus radiodurans (Стендовый)
    • Авторы: Агапов А.А., Кульбачинский А.В., Есюнина Д.М.
    • 19 международная пущинская школа-конференция молодых ученых «Биология - наука XXI века», г. Пущино, Россия, 20-24 апреля 2015

• Диссертация

  • • 2013 Особенности реакции расщепления РНК и регуляции активности у РНК-полимераз Deinococcus radiodurans, Thermus aquaticus и Thermus thermophilus
    • Кандидатская диссертация по специальности 03.01.03 - Молекулярная биология (биол. науки)
    • Автор: Есюнина Дарья Михайловна
    • Научный руководитель: Кульбачинский Андрей Владимирович, д.б.н., проф. РАН, член-корр. РАН, МГУ имени М.В. Ломоносова
    • Защищена в совете Д 501.001.76 при МГУ имени М.В. Ломоносова, Биологический факультет
    • Оппоненты: Сергиев Петр Владимирович, Шпаковский Георгий Вячеславович