Выберите категорию обращения:
Общие вопросы
Отчеты
Рейтинги
Мониторинговый отчёт
Диссертационные советы
Конкурсы
Ввод данных
Структура организаций
Аспирантура
Научное оборудование
Импорт педагогической нагрузки
Журналы и импакт-факторы
Тема обращения:
Описание проблемы:
Введите почтовый адрес:
ИСТИНА
Войти в систему
Регистрация
Интеллектуальная Система Тематического Исследования НАукометрических данных
Главная
Поиск
Статистика
О проекте
Помощь
В связи с техническими работами в центре обработки данных, часть прикреплённых файлов в настоящее время недоступна.
скрыть
отправить сообщение
Тимонина Дарья Сергеевна
пользователь
Прежние места работы
(Нажмите для отображения)
МГУ имени М.В. Ломоносова
,
Факультет биоинженерии и биоинформатики
, аспирант, 1 октября 2017 - 1 сентября 2021
МГУ имени М.В. Ломоносова
,
Научно-исследовательский институт физико-химической биологии имени А.Н.Белозерского
,
Отдел биокинетики
,
Лаборатория ферментативных модификаций физиологически активных соединений
, ведущий специалист, 2 мая 2023 - 14 июля 2023, по совместительству
Соавторы:
Суплатов Д.А.
,
Шарапова Я.А.
,
Швядас В.К.
,
Fesko K.
,
Воеводин В.В.
,
Муронец В.И.
,
Шмальгаузен Е.В.
,
Копылов К.Е.
,
Попова Н.Н.
,
Сыпченко И.В.
11 статей
,
4 доклада на конференциях
,
2 НИР
,
1 диссертация
Количество цитирований статей в журналах по данным Web of Science: 18, Scopus: 22
IstinaResearcherID (IRID): 79489156
Деятельность
Статьи в журналах
2022
Analysis of Multiple Protein Alignments Using 3D-Structural Information on the Orientation of Amino Acid Side-Chains
Timonina D.S.
,
Suplatov D.A.
в журнале
Molecular Biology
, издательство
Maik Nauka/Interperiodica Publishing
(Russian Federation)
, том 56, № 4, с. 610-615
DOI
2022
Анализ множественных выравниваний белков с использованием 3D-структурной информации по ориентации боковых цепей аминокислот
Тимонина Д.С.
,
Суплатов Д.А.
в журнале
Молекулярная биология
, том 56, № 4, с. 663-670
DOI
2021
Bioinformatic analysis of subfamily-specific regions in 3D-structures of homologs to study functional diversity and conformational plasticity in protein superfamilies
Timonina Daria
,
Sharapova Yana
,
Švedas Vytas
,
Suplatov Dmitry
в журнале
Computational and Structural Biotechnology Journal
, том 19, с. 1302-1311
DOI
2019
Assessing protein flexibility in computational enzymology: conformational sampling or 3D-motif analysis
Sharapova Y.
,
Suplatov D.
,
Timonina D.
,
Schmalhausen E.
,
Fesko K.
,
Muronets V.
,
Voevodin V.
,
Svedas V.
в журнале
FEBS open bio
, издательство
John Wiley & Sons Inc.
(United States)
, том 9, № S1, с. 46-46
DOI
2019
Open-access Mustguseal platform for bioinformatic analysis in computational enzymology
Suplatov D.
,
Sharapova Y.
,
Timonina D.
,
Schmalhausen E.
,
Fesko K.
,
Popova N.
,
Muronets V.
,
Voevodin V.
,
Svedas V.
в журнале
FEBS open bio
, издательство
John Wiley & Sons Inc.
(United States)
, том 9, № S1, с. 276-276
DOI
2019
Yosshi: a web-server for disulfide engineering by bioinformatic analysis of diverse protein families
Suplatov D.A.
,
Timonina D.S.
,
Sharapova Y.A.
,
Švedas V.K.
в журнале
Nucleic Acids Research
, издательство
Oxford University Press
(United Kingdom)
DOI
2018
The visualCMAT: a web-server to select and interpret correlated mutations/co-evolving residues in protein families
Dmitry Suplatov
,
Yana Sharapova
,
Daria Timonina
,
Kirill Kopylov
,
Vytas Švedas
в журнале
Journal of Bioinformatics and Computational Biology
, издательство
Imperial College Press
(United Kingdom)
, том 16, № 2, с. 1840005
DOI
2018
Лиувиллева классификация интегрируемых геодезических потоков в потенциальном поле на двумерных многообразиях вращения: торе и бутылке Клейна
Тимонина Дарья Сергеевна
в журнале
Математический сборник
, издательство
МИАН
(Москва)
, том 209, № 11, с. 103-136
DOI
2017
Topological classification of Integrable geodesic flows in a potential field on the torus of revolution
Timonina D.S.
в журнале
Lobachevskii Journal of Mathematics
, издательство
Kazanskii Gosudarstvennyi Universitet/Kazan State University
(Russian Federation)
, том 38, № 6, с. 1108-1120
2017
Лиувиллева классификация интегрируемых геодезических потоков на торе вращения в потенциальном поле
Тимонина Д.С.
в журнале
Вестник Московского университета. Серия 1: Математика. Механика
, издательство
Изд-во Моск. ун-та
(М.)
, № 3, с. 35-43
2015
Замкнутые геодезические на кусочно гладких поверхностях вращения постоянной кривизны
Сыпченко И.В.
,
Тимонина Д.С.
в журнале
Математический сборник
, издательство
МИАН
(Москва)
, том 206, № 5, с. 127-160
Доклады на конференциях
2019
Open-access Mustguseal platform to explore protein superfamilies
(Стендовый)
Авторы:
Dmitry Suplatov
,
Yana Sharapova
,
Daria Timonina
,
Elena Schmalhausen
,
Vytas Švedas
,
Nina Popova
,
Vladimir Muronets
,
Vladimir Voevodin
,
Kateryna Fesko
Moscow Conference on Computational Molecular Biology (MCCMB)
, Москва, Россия, 27-30 июля 2019
2019
Yosshi: the bioinformatic approach to protein disulfide engineering
(Стендовый)
Авторы:
Yana Sharapova
,
Vytas Švedas
,
Daria Timonina
,
Dmitry Suplatov
Moscow Conference on Computational Molecular Biology (MCCMB)
, Москва, Россия, 27-30 июля 2019
2019
Assessing protein flexibility in computational enzymology: conformational sampling or 3D-motif analysis?
(Устный)
Авторы:
Sharapova Y.
,
Suplatov D.
,
Timonina D.
,
Schmalhausen E.
,
Fesko K.
,
Muronets V.
,
Voevodin V.
,
Svedas V.
The 44th FEBS Congress, Krakow, Poland, July 6-11.
, Краков, Польша, 6-11 июля 2019
2019
Open-access Mustguseal platform for bioinformatic analysis in computational enzymology
(Стендовый)
Авторы:
Suplatov D.
,
Sharapova Y.
,
Timonina D.
,
Schmalhausen E.
,
Fesko K.
,
Popova N.
,
Muronets V.
,
Voevodin V.
,
Svedas V.
The 44th FEBS Congress, Krakow, Poland, July 6-11.
, Краков, Польша, 6-11 июля 2019
НИРы
31 января 2020 - 31 декабря 2022
Комплексный подход к разработке и оптимизации ресурсоемких приложений сравнительного анализа белков для высокопроизводительных вычислительных систем
Кафедра суперкомпьютеров и квантовой информатики
Руководитель:
Воеводин В.В.
Участники НИР:
Суплатов Д.А.
,
Тарумова Н.Т.
,
Тимонина Д.С.
,
Тимохин И.А.
,
Шегай М.В.
15 августа 2018 - 31 декабря 2021
Установление взаимосвязи между структурой и функциональными свойствами белков/ферментов на основе интеллектуального анализа информационных ресурсов и разработка предсказательных алгоритмов
Научно-исследовательский институт физико-химической биологии имени А.Н.Белозерского
Руководитель:
Суплатов Д.А.
Ответственные исполнители:
Воеводин В.В.
,
Герасева Е.П.
,
Дробот В.В.
,
Лукашевич Н.В.
,
Никулин М.В.
,
Панин Н.В.
,
Попова Н.Н.
,
Тимонина Д.С.
,
Шарапова Я.А.
,
Швядас В.К.
Участники НИР:
Воеводин В.В.
,
Дробот В.В.
,
Лукашевич Н.В.
,
Никулин М.В.
,
Панин Н.В.
,
Попова Н.Н.
,
Тимонина Д.С.
,
Шарапова Я.А.
,
Швядас В.К.
Диссертация
2023
Биоинформатический анализ суперсемейств белков на уровне 3D-структурной организации с использованием методов машинного обучения
Кандидатская диссертация по специальности 1.5.8 - Математическая биология, биоинформатика (биол. науки)
Автор:
Тимонина Дарья Сергеевна
Научный руководитель:
Швядас В.К.
, д.х.н., проф., МГУ имени М.В. Ломоносова
Защищена в совете
МГУ.015.10(03.04)
МГУ имени М.В. Ломоносова, Научно-исследовательский институт физико-химической биологии имени А.Н.Белозерского
Организация, в которой выполнялась работа:
МГУ имени М.В. Ломоносова
Оппоненты:
Попинако Анна Владимировна
,
Мирошников Константин Анатольевич
,
Шайтан Константин Вольдемарович