|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
Интеллектуальная Система Тематического Исследования НАукометрических данных |
||
Пупов Данил Владимирович пользователь
кандидат биологических наук с 2010 года
ФГБУН Институт молекулярной генетики РАН
Соавторы: Кульбачинский А.В., Петушков И.В., Есюнина Д.М., Басс И.А., Murakami K.S., Miropolskaya N., Руденская Г.Н., Artsimovitch I., Barinova N., Bau R., Belogurov G.A., Burtnistrova O.A., Feklistov A.показать полностью...
22 статьи, 6 докладов на конференциях, 4 тезисов докладов, 1 диссертация
Количество цитирований статей в журналах по данным
Web of Science: 269,
Scopus: 162
IstinaResearcherID (IRID): 33277308
Деятельность
-
Статьи в журналах
-
- 2022 Effects of natural polymorphisms in SARS-CoV-2 RNA-dependent RNA polymerase on its activity and sensitivity to inhibitors in vitro
- Miropolskaya Nataliya, Kozlov Maxim, Petushkov Ivan, Prostova Maria, Pupov Danil, Esyunina Daria, Kochetkov Sergey, Kulbachinskiy Andrey
- в журнале Biochimie, издательство Elsevier BV (Netherlands) DOI
-
- 2021 Structural basis of ribosomal RNA transcription regulation
- Yeonoh Shin, Qayyum M.Zuhaib, Pupov Danil, Esyunina Daria, Kulbachinskiy Andrey, Murakami Katsuhiko S.
- в журнале Nature communications, издательство Nature Pub. Group (United Kingdom), том 12, № 1 DOI
-
- 2021 Universal functions of the σ finger in alternative σ factors during transcription initiation by bacterial RNA polymerase
- Oguienko Anastasiya, Petushkov Ivan, Pupov Danil, Esyunina Daria, Kulbachinskiy Andrey
- в журнале RNA Biology, издательство Landes Bioscience (United States), с. 1-10 DOI
-
- 2020 Rewiring of growth-dependent transcription regulation by a point mutation in region 1.1 of the housekeeping σ factor
- Pletnev Philipp, Pupov Danil, Pshanichnaya Lizaveta, Esyunina Daria, Petushkov Ivan, Nesterchuk Mikhail, Osterman Ilya, Rubtsova Maria, Mardanov Andrey, Ravin Nikolai, Sergiev Petr, Kulbachinskiy Andrey, Dontsova Olga
- в журнале Nucleic Acids Research, издательство Oxford University Press (United Kingdom), том 48, № 19, с. 10802-10819 DOI
-
- 2019 Distinct effects of DNA lesions on RNA synthesis by Escherichia coli RNA polymerase
- Pupov Danil, Ignatov Artem, Agapov Aleksei, Kulbachinskiy Andrey
- в журнале Biochemical and Biophysical Research Communications, издательство Academic Press (United States), том 510, № 1, с. 122-127 DOI
-
- 2019 The sigma24 Subunit of Escherichia coli RNA Polymerase Can Induce Transcriptional Pausing in vitro
- Shikalov A.B., Esyunina D.M., Pupov D.V., Kulbachinskiy A.V., Petushkov I.V.
- в журнале Biochemistry (Moscow), издательство Pleiades Publishing, Ltd (Road Town, United Kingdom), том 84, № 4, с. 426-434 DOI
-
- 2018 Dual role of the $\upsigma$ factor in primer RNA synthesis by bacterial RNA polymerase
- Esyunina Daria, Pupov Danil, Kulbachinskiy Andrey
- в журнале FEBS Letters, издательство Elsevier BV (Netherlands), том 593, № 3, с. 361-368 DOI
-
- 2018 Region 3.2 of the $\upsigma$ factor controls the stability of rRNA promoter complexes and potentiates their repression by DksA
- Pupov Danil, Petushkov Ivan, Esyunina Daria, Murakami Katsuhiko S., Kulbachinskiy Andrey
- в журнале Nucleic Acids Research, издательство Oxford University Press (United Kingdom), том 46, № 21, с. 11477-11487 DOI
-
- 2017 Interplay between σ region 3.2 and secondary channel factors during promoter escape by bacterial RNA polymerase
- Petushkov I., Esyunina D., Mekler V., Severinov K., Pupov D., Kulbachinsky A., Kulbachinsky A.
- в журнале Biochemical Journal, издательство Portland Press, Ltd. (United Kingdom) DOI
-
- 2016 Lineage-specific variations in the trigger loop modulate RNA proofreading by bacterial RNA polymerases
- Esyunina D., Turtola M., Pupov D., Bass I., Klimašauskas S., Belogurov G., Kulbachinskiy A.
- в журнале Nucleic Acids Research, издательство Oxford University Press (United Kingdom), том 44, № 3, с. 1298-1308
-
- 2016 Regulation of transcription initiation by Gfh factors from Deinococcus radiodurans
- Agapov A., Esyunina D., Pupov D., Kulbachinskiy A.
- в журнале Biochemical Journal, издательство Portland Press, Ltd. (United Kingdom), том 473, № 23, с. 4493-4505 DOI
-
- 2015 Mutations in the CRE pocket of bacterial RNA polymerase affect multiple steps of transcription
- Petushkov Ivan, Pupov Danil, Bass Irina, Kulbachinskiy Andrey
- в журнале Nucleic Acids Research, издательство Oxford University Press (United Kingdom), том 43, № 12, с. 5798-5809 DOI
-
- 2015 Single-stranded DNA aptamers for functional probing of bacterial RNA polymerase
- Pupov D., Kulbachinskiy A.
- в журнале Methods in molecular and cellular biology, издательство Wiley (Singapore), том 1276, с. 165-183
-
- 2014 Distinct functions of the RNA polymerase sigma subunit region 3.2 in RNA priming and promoter escape
- Pupov D., Kuzin I., Bass I., Kulbachinskiy A.
- в журнале Nucleic Acids Research, издательство Oxford University Press (United Kingdom), том 42, № 7, с. 4494-4504
-
- 2014 Structural basis of transcription initiation by bacterial RNA polymerase holoenzyme
- Basu R.S., Warner B.A., Molodtsov V., Pupov D., Esyunina D., Fernández-Tornero C., Kulbachinskiy A., Murakami K.S.
- в журнале Journal of Biological Chemistry, издательство American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc. (United States), том 89, № 35, с. 24549-24559
-
- 2013 Single-strand promoter traps for bacterial RNA polymerase
- Pupov D., Esyunina D., Feklistov A., Kulbachinskiy A.
- в журнале Biochemical Journal, издательство Portland Press, Ltd. (United Kingdom), том 452, № 2, с. 241-248
-
- 2012 Distinct functions of regions 1.1 and 1.2 of RNA polymerase sigma subunits from Escherichia coli and Thermus aquaticus in transcription initiation
- Miropolskaya N., Ignatov A., Bass I., Zhilina E., Pupov D., Kulbachinskiy A.
- в журнале Journal of Biological Chemistry, издательство American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc. (United States), том 287, № 28, с. 23779-23789
-
- 2010 Multiple roles of the RNA polymerase beta' SW2 region in transcription initiation, promoter escape, and RNA elongation
- Pupov D., Miropolskaya N., Sevostyanova An, Bass I., Artsimovitch I., Kulbachinskiy A.
- в журнале Nucleic Acids Research, издательство Oxford University Press (United Kingdom), том 38, с. 5784-5796
-
-
- 2008 Analysis of RNA Cleavage by RNA Polymerases from Escherichia coli and Deinococcus radiodurans
- Pupov D., Barinova N., Kulbachinskiy A.
- в журнале Biochemistry (Moscow), издательство Pleiades Publishing, Ltd (Road Town, United Kingdom), том 73, с. 725-729
-
- 2008 Cysteine proteinases of microorganisms and viruses
- Rudenskaya G.N., Pupov D.V.
- в журнале Biochemistry (Moscow), издательство Pleiades Publishing, Ltd (Road Town, United Kingdom), том 73, № 1, с. 1-13 DOI
-
- 2008 Isolation and properties of Serratia proteamaculans 94 cysteine protease
- Mozhina N.V., Burtnistrova O.A., Pupov D.V., Rudenskaya G.N., Dunaevsky Ya E., Derniduk I.V., Kostrov S.V.
- в журнале Russian Journal of Bioorganic Chemistry, издательство Maik Nauka/Interperiodica Publishing (Russian Federation), том 34, № 3, с. 274-279 DOI
-
-
Доклады на конференциях
-
- 2016 Изучение функци CRE-кармана бактериальной РНК-полимеразы в системах in vitro и in vivo (Стендовый)
- Авторы: Петушков И.В., Пупов Д.В., Кульбачинский А.В.
- V Съезд физиологов СНГ, V Съезд Биохимиков России, Сочи, Россия, 4-8 октября 2016
-
- 2016 Роль Gfh-факторов радиоустойчивой бактерии Deinococcus radiodurans в регуляции инициации транскрипции (Стендовый)
- Авторы: Агапов А.А., Есюнина Д.М., Пупов Д.В., Кульбачинский А.В.
- V Съезд физиологов СНГ, V Съезд Биохимиков России, Сочи, Россия, 4-8 октября 2016
-
- 2016 ВЛИЯНИЕ МУТАЦИЙ В КОР-ФЕРМЕНТЕ И σ-СУБЪЕДИНИЦЕ БАКТЕРИАЛЬНОЙ РНК-ПОЛИМЕРАЗЫ НА СКОРОСТЬ УХОДА С ПРОМОТОРА (Устный)
- Авторы: Петушков И.В., Пупов Д.В., Кульбачинский А.В.
- 20-я Международная Пущинская школа-конференция молодых учёных "Биология - наука XXI века", Пущино, Россия, 18-22 апреля 2016
-
- 2015 ВЛИЯНИЕ МУТАЦИЙ В CRE-КАРМАНЕ БАКТЕРИАЛЬНОЙ РНК- ПОЛИМЕРАЗЫ НА РАЗНЫЕ СТАДИИ ТРАНСКРИПЦИИ (Устный)
- Авторы: Петушков И.В., Кульбачинский А.В., Басс И.А., Пупов Д.В.
- 19 международная пущинская школа-конференция молодых ученых «Биология - наука XXI века», г. Пущино, Россия, 20-24 апреля 2015
-
- 2014 РОЛЬ КОНТАКТОВ β-СУБЪЕДИНИЦЫ БАКТЕРИАЛЬНОЙ РНК-ПОЛИМЕРАЗЫ С НЕМАТРИЧНОЙ ЦЕПЬЮ ДНК НА РАЗНЫХ СТАДИЯХ ТРАНСКРИПЦИИ (Стендовый)
- Авторы: Пупов Д.В., Басс И.А., Кулбачинский А.В., Петушков И.В.
- VI Международная школа молодых ученых по молекулярной генетике "Геномика и системная биология", Звенигород, Россия, 16-21 ноября 2014
-
- 2014 РОЛЬ КОНТАКТОВ БАКТЕРИАЛЬНОЙ РНК-ПОЛИМЕРАЗЫ С НЕМАТРИЧНОЙ ЦЕПЬЮ ДНК В ФОРМИРОВАНИИ ПАУЗ ТРАНСКРИПЦИИ (Устный)
- Авторы: Петушков И.В., Басс И.А., Кульбачинский А.В., Пупов Д.В.
- 18-я Международная Пущинская школа-конференция молодых ученых "Биология - наука 21 века", Пущино, Россия, 21-25 апреля 2014
-
-
Тезисы докладов
-
- 2016 Влияние мутаций в кор-ферменте и σ-субъединице бактериальной РНК-полимеразы на скорость ухода с промотора.БИОЛОГИЯ – НАУКА ХХI ВЕКА: 20-я Международная Пущинская школа-конференция молодых ученых г
- Петушков И.В., Пупов Д.В., Кульбачинский А.В.
- в сборнике БИОЛОГИЯ – НАУКА ХХI ВЕКА: 20-я Международная Пущинская школа-конференция молодых ученых (Пущино, 18 - 22 апреля 2016 г.). Сборник тезисов, серия БИОЛОГИЯ – НАУКА ХХI ВЕКА: 20-я Международная Пущинская школа-конференция молодых ученых (Пущино, 18 - 22 апреля 2016 г.). Сборник тезисов, место издания Пущино, тезисы, с. 143-143
-
- 2016 Изучение функций CRE-кармана бактериальной РНК-полимеразы в системах in vitro и in vivo. Научные труды V Съезда физиологов СНГ, V Съезда биохимиков России
- Петушков И.В., Пупов Д.В., Кульбачинский А.В.
- в сборнике Научные труды V Съезда физиологов СНГ V Съезда биохимиков России Конференции ADFLIM, ACTA NATURAE, серия СПЕЦВЫПУСК, место издания Acta Naturae, ООО «Парк-медиа», том 2, тезисы, с. 49-49
-
- 2015 Влияние мутаций в CRE-кармане бактериальной РНК-полимеразы на разные стадии транскрипции, БИОЛОГИЯ – НАУКА ХХI ВЕКА: 19-я Международная Пущинская школа- конференция молодых ученых.Сборник тезисов
- Петушков И.В., Пупов Д.В., Басс И.А., Кульбачинский А.В.
- в сборнике БИОЛОГИЯ – НАУКА ХХI ВЕКА: 19-я Международная Пущинская школа-конференция молодых ученых (Пущино, 20 - 24 апреля 2015 года). Сборник тезисов, место издания Пущино, тезисы, с. 264-264
-
- 2014 РОЛЬ КОНТАКТОВ БАКТЕРИАЛЬНОЙ РНК-ПОЛИМЕРАЗЫ С НЕМАТРИЧНОЙ ЦЕПЬЮ ДНК В ФОРМИРОВАНИИ ПАУЗ ТРАНСКРИПЦИИ. БИОЛОГИЯ – НАУКА ХХI ВЕКА: 18-я Международная Пущинская школа- конференция молодых ученых
- Петушков И.В., Пупов Д.В., Басс И.А., Кульбачинский А.В.
- в сборнике БИОЛОГИЯ – НАУКА ХХI ВЕКА: 18-я Международная Пущинская школа- конференция молодых ученых (Пущино, 21 - 25 апреля 2014 г.). Сборник тезисов, место издания Пущино, тезисы, с. 269-270
-
-
Диссертация
-
- 2010 Исследование функциональной роли специфических и неспецифических взаимодействий РНК-полимеразы Escherichia coli с ДНК на разных стадиях транскрипции
- Кандидатская диссертация по специальности 03.01.03 - Молекулярная биология (биол. науки)
- Автор: Пупов Данил Владимирович, к.б.н.
- Научный руководитель: Гвоздев Владимир Алексеевич, Кульбачинский Андрей Владимирович, д.б.н., проф. РАН, член-корр. РАН, МГУ имени М.В. Ломоносова
- Защищена в совете Д 501.001.76 при МГУ имени М.В. Ломоносова, Биологический факультет
- Ведущая организация: Институт белка РАН
- Оппоненты: Патрушев Лев Иванович, Туницкая Вера Леонидовна
-