Выберите категорию обращения:
Общие вопросы
Отчеты
Рейтинги
Мониторинговый отчёт
Диссертационные советы
Конкурсы
Ввод данных
Структура организаций
Аспирантура
Научное оборудование
Импорт педагогической нагрузки
Журналы и импакт-факторы
Тема обращения:
Описание проблемы:
Введите почтовый адрес:
ИСТИНА
Войти в систему
Регистрация
Интеллектуальная Система Тематического Исследования НАукометрических данных
Главная
Поиск
Статистика
О проекте
Помощь
В связи с техническими работами в центре обработки данных, часть прикреплённых файлов в настоящее время недоступна.
скрыть
отправить сообщение
Кубарева Елена Александровна
пользователь
МГУ имени М.В. Ломоносова
,
Научно-исследовательский институт физико-химической биологии имени А.Н.Белозерского
,
Отдел химии нуклеиновых кислот
, главный научный сотрудник, с 1 декабря 1993
доктор химических наук с 2008 года
профессор по специальности № 02.00.10 - биоорганическая химия с 17 сентября 2010 г.
Соавторы:
Орецкая Т.С.
,
Монахова М.В.
,
Буренина О.Ю.
,
Шабарова З.А.
,
Громова Е.С.
,
Hartmann R.K.
,
Романова Е.А.
,
Елкина Д.А.
,
Долинная Н.Г.
,
Никифорова (Абросимова) Л.А.
,
Карягина-Жулина А.С.
,
Friedhoff P.
,
Рязанова А.Ю.
показать полностью...
,
Волков Е.М.
,
Зверева М.Э.
,
Зацепин Т.С.
,
Павлова А.В.
,
Метелев В.Г.
,
Пингоуд А.
,
Савицкая В.Ю.
,
Алексеевский А.В.
,
Petrauskene O.V.
,
Артюх Р.И.
,
Воробьева О.В.
,
Перевязова Т.А.
,
Судьина А.Е.
,
Klug G.
,
Rao D.
,
Вирясов М.Б.
,
Железная Л.А.
,
Романенков А.С.
,
Ташлицкий В.Н.
,
Hoch P.G.
,
Pingoud V.
,
Trikin R.M.
,
Ивановская М.Г.
,
Кузнецова С.А.
,
Мигур А.Ю.
,
Трефилов В.С.
,
Шефлян Г.Я.
,
Beckmann B.M.
,
Cech D.
,
Pein C.D.
,
Зубин Е.М.
,
Кисиль О.В.
,
Тимченко М.А.
,
Юнусова А.К.
,
Bujnicki J.M.
,
Hianik T.
,
Milakina М.
,
Wende W.
,
Lechner M.
,
Nevinsky G.A.
,
Schierling B.
,
Астафурова (Андреева) Н.А.
,
Банникова В.А.
,
Бревнов М.Г.
,
Готтих М.Б.
,
Качалова Г.С.
,
Козлов И.А.
,
Лаптев Г.Ю.
,
Лунин В.Г.
,
Польшаков В.И.
,
Проценко А.С.
,
Самсонова А.Р.
,
Ян Ф.
,
Bartunik H.D.
,
Damm K.
,
Evguenieva-Hackenberg E.
,
Grünweller A.
,
Heinze R.J.
,
Kanevsky I.A.
,
Kozlov I.A.
,
Lavrova N.V.
,
Norkin M.
,
Ryazanova E.M.
,
Thi H.L.
,
Thoelken C.
,
Vinogradova N.L.
,
Yunusova А.К.
,
Борисова А.
,
Вальтер Й.
,
Гавшина А.В.
,
Елов А.А.
,
Казанова Е.В.
,
Крынецкая Н.Ф.
,
Ларионова Е.Е.
,
Набережнов Д.С.
,
Нестерчук М.В.
,
Пенкина А.М.
,
Писарев Э.К.
,
Секерина С.А.
,
Траутнер Т.
,
Федотова Е.А.
,
Якушкина Ю.В.
,
Bach S.
,
Belkov V.M.
,
Geyer H.
,
Grman I.
,
Hoch P.G.
,
Karpova E.A.
,
Konarev P.V.
,
Krynetskaya N.F.
,
Lueder G.
,
Lurz R.
,
Lyashchuk A.M.
,
Molochkov N.V.
,
Müller K.M.
,
Nikol’skaya I.V.
,
Perevoztchikova S.
,
Schloter M.
,
Svergun D.I.
,
Turutin D.V.
,
Weber L.
,
Winkler I.
,
Агаева З.
,
Анашкин В.А.
,
Вебер Л.
,
Гинцбург А.Л.
,
Гончар Д.А.
,
Зигангирова Н.А.
,
Камалов А.А.
,
Карпов А.С.
,
Колесников И.В.
,
Кучеренко В.В.
,
Лау П.К.
,
Логачёва М.Д.
,
Максименко А.В.
,
Никольская И.И.
,
Никулова А.А.
,
Оглоблина А.М.
,
Панова В.В.
,
Перевозчикова С.А.
,
Потапов В.К.
,
Разумихин М.В.
,
Садыкова В.С.
,
Семкина А.С.
,
Сныга В.Г.
,
Солонин А.С.
,
Стрекаловских В.В.
,
Устюгов А.А.
,
Хартман Р.К.
,
Шилкин Е.С.
,
Якубовская М.Г.
,
Antsypovich S.I.
,
Bhagwat A.S.
,
Biertümpfel C.
,
Borisova O.A.
,
Borovikova I.I.
,
Bur'ianov I.
,
Calvez-Kelm F.L.
,
Chernykh I.S.
,
Conzelmann C.
,
Ecke T.
,
Ellis J.S.
,
Epple M.
,
Fedorova O.
,
Fedotova Е.
,
Gabbara S.
,
Gajdos V.
,
Geyer R.
,
Guschlbauer W.
,
Hahn J.
,
Hahn J.
,
Hentschel A.
,
Hosen I.
,
Karpova E.A.
,
Khodoun M.
,
Khomyakova E.A.
,
Kinzebach S.
,
Kokkinidis M.
,
Korepina J.
,
Kosaretskiy E.M.
,
Kosaretskiy Е.M.
,
Kosinski J.
,
Kovtun A.
,
Kubatova N.
,
Kunetsky V.
,
Kuzubov A.
,
Le T.H.
,
Li P.
,
Lisitskaya L.
,
Litvinova A.
,
Malvy C.
,
Manel A.
,
Meyer-Zaika W.
,
Migur M.Y.
,
Molochkov N.
,
Morgan R.
,
Muller S.
,
Naroditsky B.S.
,
Naroditsky B.S.
,
Nikol’skaia I.I.
,
Noel A.
,
Novoselov K.A.
,
Pavlova A.
,
Perry S.A.
,
Pingoud A.
,
Polouchine N.
,
Pozmogova G.E.
,
Prymak O.
,
Pushkareva M.
,
Rao N.D.
,
Salas M.
,
Schwalbe H.
,
Sharma C.M.
,
Smirnov I.P.
,
Spirin P.V.
,
Stengel G.
,
Tanaka H.
,
Thalmann S.
,
Thole H.
,
Thompson M.
,
Timofeyeva N.
,
Titov M.
,
Urbanke C.
,
Vasilenko N.L.
,
Vian E.
,
Vinogradova M.N.
,
Vorobjeva O.V.
,
Weber M.H.
,
Weisert A.
,
Wiegard J.C.
,
Wyszynski M.W.
,
Xu S.Y.
,
von Boeselager R.F.
,
Агапкина Ю.Ю.
,
Ажикина Т.Л.
,
Аксянов Е.А.
,
Алексеев Я.И.
,
Анисенко А.Н.
,
Антипова О.М.
,
Арутюнян А.М.
,
Баландина Г.Н.
,
Баратова Л.А.
,
Бартуник Х.Д.
,
Бачева А.В.
,
Белоусова Е.А.
,
Боровикова И.И.
,
Бурьянов Я.И.
,
Величко Т.И.
,
Воронина О.Л.
,
Генатуллина А.И.
,
Головин А.В.
,
Головин А.В.
,
Григоров А.С.
,
Гришин А.В.
,
Громенко Е.В.
,
Грязнов С.М.
,
Дегтярев С.Х.
,
Донцова О.А.
,
Ершова А.С.
,
Камалов Д.М.
,
Кимура К.
,
Кихара Х.
,
Клуг Г.
,
Конарев П.В.
,
Королев С.П.
,
Королева О.Н.
,
Коршунова Г.А.
,
Косарецкий Е.М.
,
Круг А.
,
Кузнецов Н.А.
,
Кузнецова Л.Г.
,
Кульбачинский А.В.
,
Лавренова Г.И.
,
Лаврик О.И.
,
Лаврова Н.В.
,
Ларионова Е.Е.
,
Литвинова А.В.
,
Лойко А.Г.
,
Лящук А.М.
,
Макарова Т.Н.
,
Маруяма А.
,
Масаки И.
,
Мацкеплишвили С.Т.
,
Меренкова И.Н.
,
Милакина М.А.
,
Молочков Н.В.
,
Нарышкин Н.А.
,
Новосёлов К.А.
,
Оловников И.А.
,
Павлова Л.В.
,
Пенин А.Н.
,
Первушин Д.Д.
,
Первушина Е.В.
,
Перри С.А.
,
Прасолов В.С.
,
Прокофьев М.А.
,
Пятраускене О.В.
,
Рогулин Е.А.
,
Родина Е.В.
,
Рязанова Е.М.
,
Свергун Д.И.
,
Сейо К.
,
Серазев Т.В.
,
Сергеев А.В.
,
Сергеев В.Н.
,
Сергиев П.В.
,
Скворцов Д.А.
,
Склянкина В.А.
,
Спирин А.С.
,
Спирин С.А.
,
Судьина Г.Ф.
,
Сысоев О.Н.
,
Таран Е.А.
,
Тивтикян А.С.
,
Тимофеев Н.А.
,
Тимошик М.С.
,
Тимченко A.A.
,
Транкова Н.А.
,
Тулаева Е.Р.
,
Турутин Д.В.
,
Тхи Х.Л.
,
Федорова О.С.
,
Федорова О.А.
,
Филиппова И.Ю.
,
Цех Д.
,
ЦытовичА В.
,
Шилов И.А.
,
Шпанченко О.В.
,
колесников к.к.
186 статей
,
2 книги
,
70 докладов на конференциях
,
68 тезисов докладов
,
10 НИР
,
1 патент
,
11 наград
,
6 членств в программных комитетах
,
2 членства в диссертационных советах
,
14 диссертаций
,
36 дипломных работ
,
20 курсовых работ
,
7 учебных курсов
,
1 выступление в СМИ
Количество цитирований статей в журналах по данным Web of Science: 1400, Scopus: 1483
РИНЦ:
IstinaResearcherID (IRID): 603046
ResearcherID:
I-3184-2012
Scopus Author ID:
7004479023
Деятельность
Статьи в журналах
2023
Conserved G-quadruplex-forming sequences in mammalian TERT promoters and their effect on mutation frequency
Panova V.V.
,
Dolinnaya N.G.
,
Novoselov K.A.
,
Savitskaya V.Y.
,
Chernykh I.S.
,
Kubareva E.A.
,
Alexeevski A.V.
,
Zvereva M.I.
в журнале
Life
, издательство
MDPI
(Basel, Switzerland)
, том 13, № 7, с. 1478
DOI
2023
New DNA plasmid model for studying DNA mismatch repair response to the G4 structure
Pavlova A.V.
,
Dolinnaya N.G.
,
Zvereva M.I.
,
Kubareva E.A.
,
Monakhova M.V.
в журнале
International Journal of Molecular Sciences
, издательство
MDPI
(Basel, Switzerland)
, том 24, № 2, с. 1061
DOI
2023
Surfactin: its biological activity and possibilityof application in agriculture
Kisil O.V.
,
Trefilov V.S.
,
Sadykova V.S.
,
Zvereva M.E.
,
Kubareva E.A.
в журнале
Applied Biochemistry and Microbiology
, издательство
Maik Nauka/Interperiodica Publishing
(Russian Federation)
, том 59, № 1, с. 1-13
DOI
2023
pilE G-QuadruplexIs recognized and preferentially bound but not processed by the MutL endonuclease from Neisseria gonorrhoeae mismatch repair pathway
Savitskaya V.Y.
,
Strekalovskikh V.V.
,
Snyga V.G.
,
Monakhova M.V.
,
Arutyunyan A.M.
,
Dolinnaya N.G.
,
Kubareva E.A.
в журнале
International Journal of Molecular Sciences
, издательство
MDPI
(Basel, Switzerland)
, том 24, № 7, с. 6167
DOI
2023
Сурфактин: биологическая активность и возможность применения в сельском хозяйстве
Кисиль О.В.
,
Трефилов В.С.
,
Садыкова В.С.
,
Зверева М.Э.
,
Кубарева Е.А.
в журнале
Прикладная биохимия и микробиология
, издательство
ФГБУ "Издательство "Наука"
(Москва)
, том 59, № 1, с. 3-16
DOI
2022
G-quadruplex formed by the promoter region of the hTERT gene: structure-driven effects on DNA mismatch repair functions
Pavlova A.V.
,
Savitskaya V.Yu
,
Dolinnaya N.G.
,
Monakhova M.V.
,
Litvinova A.V.
,
Kubareva E.A.
,
Zvereva M.I.
в журнале
BIOMEDICINES
, том 10, № 8, с. 1871
DOI
2022
Impact of G-quadruplex structures on methylation of model substrates by DNA methyltransferase Dnmt3a
Loiko A.G.
,
Sergeev A.V.
,
Genatullina A.I.
,
Monakhova M.V.
,
Kubareva E.A.
,
Dolinnaya N.G.
,
Gromova E.S.
в журнале
International Journal of Molecular Sciences
, издательство
MDPI
(Basel, Switzerland)
, том 23, № 18
DOI
2022
Involvement of E. coli 6S RNA in oxidative stress response
Burenina O.Y.
,
Elkina D.A.
, Ovcharenko A.,
Bannikova V.A.
,
Schlüter M.A.C
,
Oretskaya T.S.
,
Hartmann R.K.
,
Kubareva E.A.
в журнале
International Journal of Molecular Sciences
, издательство
MDPI
(Basel, Switzerland)
, том 23, № 7, с. 3653
DOI
2022
Neisseria gonorrhoeae: DNA repair systems and their role in pathogenesis
Savitskaya V.Yu
,
Monakhova M.V.
,
Iakushkina I.V.
,
Borovikova I.I.
,
Kubareva E.A.
в журнале
Biochemistry (Moscow)
, издательство
Pleiades Publishing, Ltd
(Road Town, United Kingdom)
, том 87, № 9, с. 965-982
DOI
2022
Reactive acrylamide-modified DNA traps for accurate cross-linking with cysteine residues in DNA–protein complexes using mismatch repair protein MutS as a model
Monakhova M.V.
,
Kubareva Е.A.
,
Kolesnikov K.K.
,
Anashkin V.A.
,
Kosaretskiy Е.M.
,
Zvereva M.I.
,
Romanova E.A.
,
Friedhoff P.
,
Oretskaya T.S.
,
Zatsepin T.S.
в журнале
Molecules
, издательство
MDPI
(Basel, Switzerland)
, том 27, № 8, с. 2438
DOI
2022
Бактерия Neisseria gonorrhoeae: системы репарации ДНК и их роль в патогенезе
Савицкая В.Ю.
,
Монахова М.В.
,
Якушкина Ю.В.
,
Боровикова И.И.
,
Кубарева Е.А.
в журнале
Биохимия
, издательство
ИКЦ «Академкнига»
(Москва)
, том 87, № 9, с. 1182-1202
DOI
2021
DNA with a 2-pyridyldithio group at the C2' atom: a promising tool for the crosslinking of the MutS protein preserving its functional activity
Perry S.A.
,
Kubareva E.A.
,
Monakhova M.V.
,
Trikin R.M.
,
Kosaretskiy E.M.
,
Romanova E.A.
,
Metelev V.G.
,
Friedhoff P.
,
Oretskaya T.S.
в журнале
Russian Journal of Bioorganic Chemistry
, издательство
Maik Nauka/Interperiodica Publishing
(Russian Federation)
, том 47, № 2, с. 446-459
DOI
2021
Detection of small products of transcription from 6S RNA (pRNA) by “mirror-like” northern blot hybridization
Burenina O.Y.
,
Oretskaya T.S.
,
Kubareva E.A.
в журнале
Russian Journal of Bioorganic Chemistry
, издательство
Maik Nauka/Interperiodica Publishing
(Russian Federation)
, том 47, № 2, с. 477-481
DOI
2021
Impact of G-quadruplexes on the regulation of genome integrity, DNA damage and repair
Pavlova A.V.
,
Kubareva E.A.
,
Monakhova M.V.
,
Zvereva M.I.
,
Dolinnaya N.G.
в журнале
Biomolecules
, издательство
MDPI
(Basel, Switzerland)
, том 11, № 9, с. 1284
DOI
2021
Kinetic аnalysis of the interaction of nicking endonuclease BspD6I with DNA
Abrosimova L.A.
,
Kuznetsov N.A.
,
Astafurova N.A.
,
Samsonova A.R.
,
Karpov A.S.
,
Perevyazova T.A.
,
Oretskaya T.S.
,
Fedorova O.S.
,
Kubareva E.A.
в журнале
Biomolecules
, издательство
MDPI
(Basel, Switzerland)
, том 11, № 10, с. 1420
DOI
2021
MutL protein from the Neisseria gonorrhoeae mismatch repair system: interaction with ATP and DNA
Monakhova M.V.
,
Milakina M.A.
,
Savitskaya V.Yu
,
Romanova E.A.
,
Rao D.N.
,
Kubareva E.A.
в журнале
Molecular Biology
, издательство
Maik Nauka/Interperiodica Publishing
(Russian Federation)
, том 55, № 2, с. 254-268
DOI
2021
Белок MutL из системы репарации мисматчей бактерии Neisseria gonorrhoeae: взаимодействие с ATP и ДНК
Монахова М.В.
,
Милакина М.А.
,
Савицкая В.Ю.
,
Романова Е.А.
,
Rao D.N.
,
Кубарева Е.А.
в журнале
Молекулярная биология
, том 55, № 2, с. 289-304
DOI
2021
Биоинформатический анализ соматических мутаций в контексте образования G-квадруплексов в промоторе гена TERT и в других онкогенах
Панова В.В.
,
Тулаева Е.Р.
,
Новоселов К.А.
,
Кубарева Е.А.
,
Зверева М.Э.
,
Алексеевский А.В.
в журнале
Успехи молекулярной онкологии
, издательство
АБВ-пресс
(М.)
, том 8, № 4, с. 26
DOI
2021
Взаимосвязь возникновения драйверных мутаций с наличием G-квадруплексных структур в ДНК при канцерогенезе на примере промоторной области гена TERT
Павлова А.В.
,
Писарев Э.К.
,
Монахова М.В.
,
Кубарева Е.А.
,
Зверева М.Э.
в журнале
Успехи молекулярной онкологии
, издательство
АБВ-пресс
(М.)
, том 8, № 4, с. 17-18
DOI
2021
ДНК с 2-пиридилдитиогруппой при С2'-атоме – перспективные инструменты для фиксации белка MutS с сохранением его функциональной активности
Перри С.А.
,
Кубарева Е.А.
,
Монахова М.В.
,
Трикин Р.М.
,
Косарецкий Е.М.
,
Романова Е.А.
,
Метелев В.Г.
,
Фридхофф П.
,
Орецкая Т.С.
в журнале
Биоорганическая химия
, издательство
Российская академия наук
(Москва)
, том 47, № 2, с. 235-249
DOI
2021
Детекция малых пРНК – продуктов транскрипции 6S РНК – с помощью нозерн-блот-гибридизации в "зеркальном" варианте
Буренина О.Ю.
,
Орецкая Т.С.
,
Кубарева Е.А.
в журнале
Биоорганическая химия
, издательство
Российская академия наук
(Москва)
, том 47, № 2, с. 270-275
DOI
2021
Необычный характер взаимодействия ключевых белков системы репарации «мисматчей» с фрагментом промотора гена TERT, содержащим G-квадруплексы
Павлова А.В.
,
Савицкая В.Ю.
,
Монахова М.В.
,
Зверева М.Э.
,
Кубарева Е.А.
в журнале
Успехи молекулярной онкологии
, издательство
АБВ-пресс
(М.)
, том 8, № 4, с. 25
DOI
2020
Activating telomerase TERT promoter mutations and their application for the detection of bladder cancer
Zvereva M.
,
Pisarev E.
,
Hosen I.
,
Kisil O.
,
Matskeplishvili S.
,
Kubareva E.
,
Kamalov D.
,
Tivtikyan A.
,
Manel A.
,
Vian E.
,
Kamalov A.
,
Kamalov A.
,
Ecke T.
,
Calvez-Kelm F.L.
в журнале
International Journal of Molecular Sciences
, издательство
MDPI
(Basel, Switzerland)
, том 21, № 17, с. 6034-6052
DOI
2020
Functional specifics of the MutL protein of the DNA mismatch repair system in different organisms
Monakhova M.V.
,
Milakina M.A.
,
Trikin R.M.
,
Oretskaya T.S.
,
Kubareva E.A.
в журнале
Russian Journal of Bioorganic Chemistry
, издательство
Maik Nauka/Interperiodica Publishing
(Russian Federation)
, том 46, № 6, с. 875-890
DOI
2020
Probing the DNA-binding center of the MutL protein from the Escherichia coli mismatch repair system via crosslinking and Förster resonance energy transfer
Monakhova M.
,
Ryazanova A.
,
Kunetsky V.
,
Li P
,
Shilkin E.
,
Kisil O.
,
Rao D.N.
,
Oretskaya T.
,
Friedhoff P.
,
Kubareva E.
в журнале
Biochimie
, издательство
Elsevier BV
(Netherlands)
, том 171, с. 43-54
DOI
2020
Responses of DNA mismatch repair proteins to a stable G-quadruplex embedded into a DNA duplex structure
Pavlova A.
,
Monakhova M.V.
,
Ogloblina A.M.
,
Andreeva N.A.
,
Laptev G.Yu
,
Polshakov V.I.
,
Gromova E.S.
,
Zvereva M.I.
,
Yakubovskaya M.G.
,
Oretskaya T.S.
,
Kubareva E.A.
,
Dolinnaya N.G.
в журнале
International Journal of Molecular Sciences
, издательство
MDPI
(Basel, Switzerland)
, том 21, № 22
DOI
2020
Similarities and differences between 6S RNAs from Bradyrhizobium japonicum and Sinorhizobium meliloti
Burenina O.Y.
,
Elkina D.A.
,
Migur M.Y.
,
Oretskaya T.S.
,
Evguenieva-Hackenberg E.
,
Hartmann R.K.
,
Kubareva E.A.
в журнале
Journal of Microbiology
, издательство
Han-Gug Misaengmul Hag-hoe/The Microbiological Society of Korea
(Korea, Republic of)
, том 58, с. 945-956
DOI
2020
The role of cysteine residues in the Interaction of nicking endonuclease BspD6I with DNA
Abrosimova L.A.
,
Samsonova A.R.
,
Perevyazova T.A.
,
Yunusova A.K.
,
Artyukh R.I.
,
Romanova E.A.
,
Zheleznaya L.A.
,
Oretskaya T.S.
,
Kubareva E.A.
в журнале
Molecular Biology
, издательство
Maik Nauka/Interperiodica Publishing
(Russian Federation)
, том 54, № 4, с. 599-610
DOI
2020
Особенности функционирования белка MutL из системы репарации “мисматчей” различных организмов
Монахова М.В.
,
Милакина М.А.
,
Трикин Р.М.
,
Орецкая Т.С.
,
Кубарева Е.А.
в журнале
Биоорганическая химия
, издательство
Российская академия наук
(Москва)
, том 46, № 6, с. 563-579
DOI
2020
Роль остатков цистеина во взаимодействии никующей эндонуклеазы BspD6I с ДНК
Абросимова Л.А.
,
Самсонова А.Р.
,
Перевязова Т.А.
,
Юнусова А.К.
,
Артюх Р.И.
,
Романова Е.А.
,
Орецкая Т.С.
,
Кубарева Е.А.
в журнале
Молекулярная биология
, том 54, № 4, с. 667-679
DOI
2019
Interaction of proteins from E. coli DNA mismatch repair system with DNA fragment containing G-quadruplex
Pavlova A.V.
,
Monakhova M.
,
Dolinnaya N.
,
Laptev G.
,
Polshakov V.
,
Kubareva E.
в журнале
FEBS open bio
, издательство
John Wiley & Sons Inc.
(United States)
, том 9, № Suppl. 1, с. 273-274
DOI
2019
Nicking endonucleases as unique tools for biotechnology and gene engineering
Abrosimova L.A.
,
Kisil O.V.
,
Romanova E.A.
,
Oretskaya T.S.
,
Kubareva E.A.
в журнале
Russian Journal of Bioorganic Chemistry
, издательство
Maik Nauka/Interperiodica Publishing
(Russian Federation)
, том 45, № 5, с. 303-320
DOI
2019
Synthesis of beta-diketone DNA derivatives for affinity modification of proteins
Monakhova M.V.
,
Kubareva E.A.
,
Romanova E.A.
,
Semkina A.S.
,
Naberezhnov D.S.
,
Rao D.N.
,
Zatsepin T.S.
,
Oretskaya T.S.
в журнале
Russian Journal of Bioorganic Chemistry
, издательство
Maik Nauka/Interperiodica Publishing
(Russian Federation)
, том 45, № 2, с. 144-154
DOI
2019
Никующие эндонуклеазы как уникальные инструменты в биотехнологии и генетической инженерии
Абросимова Л.А.
,
Кисиль О.В.
,
Романова Е.А.
,
Орецкая Т.С.
,
Кубарева Е.А.
в журнале
Биоорганическая химия
, издательство
Российская академия наук
(Москва)
, том 45, № 5, с. 451-471
DOI
2019
Синтез фрагментов ДНК, содержащих β-дикетогруппу для аффинной модификации белков
Монахова М.В.
,
Кубарева Е.А.
,
Романова Е.А.
,
Семкина А.С.
,
Набережнов Д.С.
,
Рао Д.Н.
,
Зацепин Т.С.
,
Орецкая Т.С.
в журнале
Биоорганическая химия
, издательство
Российская академия наук
(Москва)
, том 45, № 3, с. 303-314
DOI
2019
Сравнение структуры и свойств никующей эндонуклеазы BspD6I и ее мутантной формы, не содержащей остатки цистеина
Абросимова Л.А.
,
Артюх Р.И.
,
Перевязова Т.А.
,
Юнусова А.К.
,
Агаева З.Ф.
,
Ларионова Е.Е.
,
Орецкая Т.С.
,
Кубарева Е.А.
в журнале
Acta Naturae (русскоязычная версия)
, издательство
Парк-медиа
(М.)
, том 2, с. 261
2018
6S RNA as a transcription regulator in Rhodobacter sphaeroides
Elkina D.
,
Weber L.
,
Burenina O.
,
Kubareva E.
,
Hartmann R.
,
Klug G.
в журнале
FEBS open bio
, издательство
John Wiley & Sons Inc.
(United States)
, том 8, № Suppl. 1, с. 117
DOI
2018
A study on endonuclease BspD6I and its stimulus-responsive switching by modified oligonucleotides
Abrosimova LA
,
Migur AY
,
Kubareva EA
,
Zatsepin TS
,
Gavshina AV
,
Yunusova AK
,
Perevyazova TA
,
Pingoud A.
,
Oretskaya TS
в журнале
PLoS ONE
, издательство
Public Library of Science
(United States)
, том 13, № 11, с. e0207302
DOI
2018
Endonuclease activity of protein MutL from Rhodobacter sphaeroides mismatch repair system
Monakhova M.V.
,
Penkina A.I.
,
Pavlova A.V.
,
Lyaschuk A.M.
,
Kucherenko V.V.
,
Alexeevsky A.V.
,
Lunin V.G.
,
Friedhoff P.
,
Klug G.
,
Oretskaya T.S.
,
Kubareva E.A.
в журнале
Biochemistry (Moscow)
, издательство
Pleiades Publishing, Ltd
(Road Town, United Kingdom)
, том 83, № 3, с. 281-293
DOI
2018
Interaction of mismatch repair proteins and G-quadruplexes in DNA
Pavlova A.
,
Monakhova M.
,
Laptev G.
,
Dolinnaya N.
,
Polshakov V.
,
Oretskaya T.
,
Kubareva E.
в журнале
FEBS open bio
, издательство
John Wiley & Sons Inc.
(United States)
, том 8, № Suppl. 1, с. 129
DOI
2018
Kinetic basis of the bifunctionality of SsoII DNA methyltransferase
Timofeyeva N.A.
,
Ryazanova A.Yu
,
Norkin M.V.
,
Oretskaya T.S.
, Fedorova O.S.,
Kubareva E.A.
в журнале
Molecules
, издательство
MDPI
(Basel, Switzerland)
, том 23, с. 1192
DOI
2018
Properties of MutL protein from the Rhodobacter sphaeroides mismatch repair system
Monakhova M.
,
Pavlova A.
,
Alekseevski А.
,
Milakina М.
,
Oretskaya Т.
,
Kubareva Е.
в журнале
FEBS open bio
, издательство
John Wiley & Sons Inc.
(United States)
, том 8, № Suppl. 1, с. 393
DOI
2018
Restriction endonuclease BspD6II, a new thermophilic isoschizomer of Eco57I
Perevyazova T.A.,
Yunusova А.К.
,
Artyukh R.I.
,
Viryasov M.B.
,
Kubareva E.A.
,
Zheleznaya L.A.
в журнале
Russian Journal of Bioorganic Chemistry
, издательство
Maik Nauka/Interperiodica Publishing
(Russian Federation)
, том 44, № 6, с. 640-645
2018
Studying of DNA binding proteins using crosslinking reaction with the participation of the cysteine residues
Abrosimova L.
,
Monakhova M.
,
Zheleznaya L.
,
Oretskaya T.
,
Rao D.
,
Kubareva E.
в журнале
FEBS open bio
, издательство
John Wiley & Sons Inc.
(United States)
, том 8, № Suppl. 1, с. 390
DOI
2018
Характеристика эндонуклеазной функции белка MutL из системы репарации «мисматчей» Rhodobacter sphaeroides
Монахова М.В.
,
Пенкина А.И.
,
Павлова А.В.
,
Лящук А.М.
,
Кучеренко В.В.
,
Алексеевский А.В.
,
Лунин В.Г.
,
Фридхофф П.
,
Клуг Г.
,
Орецкая Т.С.
,
Кубарева Е.А.
в журнале
Биохимия
, издательство
ИКЦ «Академкнига»
(Москва)
, том 83, № 3, с. 404-418
2018
Эндонуклеаза рестрикции BspD6II - новый термофильный изошизомер фермента Eco57I
Перевязова Т.А.
,
Юнусова А.К.
,
Артюх Р.И.
,
Вирясов М.Б.
,
Кубарева Е.А.
,
Железная Л.А.
в журнале
Биоорганическая химия
, издательство
Российская академия наук
(Москва)
, том 44, № 6, с. 648-654
2017
6S RNA in Rhodobacter sphaeroides: 6S RNA and pRNA transcript levels peak in late exponential phase and gene deletion causes a high salt stress phenotype
Elkina D.
,
Weber L.
,
Lechner M.
,
Burenina O.
,
Weisert A.
,
Kubareva E.
,
Hartmann R.K.
,
Klug G.
в журнале
RNA Biology
, издательство
Landes Bioscience
(United States)
, том 14, № 11, с. 1627-1637
DOI
2017
Conserved small mRNA with an unique, extended Shine-Dalgarno sequence
Hahn J.
,
Thalmann S.
,
Migur A.
,
von Boeselager R.F.
,
Kubatova N.
,
Kubareva E.
,
Schwalbe H.
,
Evguenieva-Hackenberg E.
в журнале
RNA Biology
, издательство
Landes Bioscience
(United States)
, том 14, № 10, с. 1353-1363
DOI
2017
Non-coding RNAs as transcriptional regulators in eukaryotes
Burenina O.Y.
,
Oretskaya T.S.
,
Kubareva E.A.
в журнале
Acta Naturae (англоязычная версия)
, издательство
Park Media Ltd
(Moscow, Russia (Federation))
, том 9, № 4 (35), с. 13-25
2017
Novel small (non)coding RNAs with an extended Shine-Dalgarno sequence
Burenina O.
,
Hahn J.
,
Korepina J.
,
Kubareva E.
,
Evguenieva-Hackenberg E.
в журнале
FEBS Journal
, издательство
Blackwell Publishing Inc.
(United Kingdom)
, том 284, с. 296-297
DOI
2017
Некодирующие РНК, регулирующие транскрипцию в клетках эукариот
Буренина О.Ю.
,
Орецкая Т.С.
,
Кубарева Е.А.
в журнале
Acta Naturae (русскоязычная версия)
, издательство
Парк-медиа
(М.)
, том 9, № 4 (35), с. 13-26
2016
Peculiarities of the interaction of the restriction endonuclease BspD6I with DNA containing its recognition site
Abrosimova L.A.
,
Kubareva E.A.
,
Migur A.Y.
,
Gavshina A.V.
,
Ryazanova A.Y.
,
Norkin M.V.
,
Perevyazova T.A.
,
Wende W.
,
Hianik T.
,
Zheleznaya L.A.
,
Oretskaya T.S.
в журнале
Biochimica et Biophysica Acta - Proteins and Proteomics
, издательство
Elsevier BV
(Netherlands)
, том 1864, с. 1072-1082
DOI
2015
Chromatographic isolation of the functionally active MutS protein covalently linked to deoxyribonucleic acid
Monakhova M.
,
Ryazanova A.
,
Hentschel A.
,
Viryasov M.
,
Oretskaya T.
,
Friedhoff P.
,
Kubareva E.
в журнале
Journal of Chromatography A
, издательство
Elsevier BV
(Netherlands)
, том 1389, с. 19-27
DOI
2015
Comparative transcriptome and proteome analyses of Bacillus subtilis 6S-1 and 6S-2 RNAs deletion strains
Burenina O.Y.
,
Thoelken C.
, Logacheva M.D.,
Elkina D.A.
,
Lechner M.
,
Hoch P.G.
,
Oretskaya T.S.
,
Kubareva E.A.
,
Hartmann R.K.
в журнале
FEBS Journal
, издательство
Blackwell Publishing Inc.
(United Kingdom)
, том 282, с. 43
DOI
2015
Impact of RNA isolation protocols on RNA detection by northern blotting
Damm K.
,
Bach S.
,
Müller K.M.
,
Klug G.
,
Burenina O.Y.
,
Kubareva E.A.
,
Grünweller A.
,
Hartmann R.K.
в журнале
Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
, издательство
Humana Press, Inc.
(United States)
, том 1296, с. 29-38
DOI
2015
Improved Northern blot detection of small RNAs using EDC crosslinking and DNA/LNA probes
Damm K.
,
Bach S.
,
Müller K.M.
,
Klug G.
,
Burenina O.Y.
,
Kubareva E.A.
,
Grünweller A.
,
Hartmann R.K.
в журнале
Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
, издательство
Humana Press, Inc.
(United States)
, том 1296, с. 41-51
DOI
2015
Phenotypic characterization and complementation analysis of Bacillus subtilis 6S RNA single and double deletion mutants
Hoch P.G.
,
Burenina O.Y.
,
Weber M.H.W
,
Elkina D.A.
,
Nesterchuk M.V.
,
Sergiev P.V.
,
Hartmann R.H.
,
Kubareva E.A.
в журнале
Biochimie
, издательство
Elsevier BV
(Netherlands)
, том 117, с. 87-99
DOI
2015
Small noncoding 6S RNAs of bacteria
Burenina O.Y.
,
Elkina D.A.
,
Hartmann R.K.
,
Oretskaya T.S.
,
Kubareva E.A.
в журнале
Biochemistry (Moscow)
, издательство
Pleiades Publishing, Ltd
(Road Town, United Kingdom)
, том 80, № 11, с. 1429-1446
DOI
2015
Thymidine glycol: the effect on DNA structure and DNA binding by site-specific proteins
Kubareva E.A.
,
Yang F.
,
Ryazanova A.Yu
,
Dolinnaya N.G.
,
Golovin A.V.
,
Molochkov N.V.
,
Romanova E.A.
,
Karpova E.A.
,
Zatsepin T.S.
,
Oretskaya T.S.
в журнале
Natural Science
, том 7, № 11, с. 491-509
DOI
2015
Малые некодирующие 6S РНК бактерий
Буренина О.Ю.
,
Елкина Д.А.
,
Хартманн Р.К.
,
Орецкая Т.С.
,
Кубарева Е.А.
в журнале
Биохимия
, издательство
ИКЦ «Академкнига»
(Москва)
, том 80, № 11, с. 1641-1661
2015
Разработка ингибиторов никующей эндонуклеазы BspD6I на основе синтетических фрагментов ДНК
Абросимова Л.А.
,
Мигур А.Ю.
,
Кубарева Е.А.
, Венде В.,
Железная Л.А.
,
Орецкая Т.С.
в журнале
Известия ВУЗов. Прикладная химия и биотехнология
, том 2, № 13, с. 48-59
2014
Flexibility of the linker between the domains of DNA methyltransferase SsoII revealed by small-angle X-ray scattering: implications for transcription regulation in SsoII restriction-modification system
Konarev P.V.
,
Kachalova G.S.
,
Ryazanova A.Yu
,
Kubareva E.A.
,
Karyagina A.S.
,
Bartunik H.D.
,
Svergun D.I.
в журнале
PLoS ONE
, издательство
Public Library of Science
(United States)
, том 9, № 4, с. e93453
DOI
2014
Is thymidine glycol containing DNA a substrate of E. coli DNA mismatch repair system?
Perevozchikova S.A.
,
Trikin R.M.
,
Heinze R.J.
,
Romanova E.A.
,
Oretskaya T.S.
,
Friedhoff P.
,
Kubareva E.A.
в журнале
PLoS ONE
, издательство
Public Library of Science
(United States)
, том 9, № 8, с. e104963
DOI
2014
Mechanistic comparison of Bacillus subtilis 6S-1 and 6S-2 RNAs - commonalities and differences
Burenina O.Y.
,
Hoch P.G.
,
Damm K.
,
Salas M.
,
Zatsepin T.S.
,
Lechner M.
,
Oretskaya T.S.
,
Kubareva E.A.
,
Hartmann R.K.
в журнале
RNA
, том 20, № 3 , с. 348-359
DOI
2013
DNA methyltransferase SsoII: a balance between DNA methylation and transcription repression
Ryazanova A.
,
Migur A.
,
Norkin M.
,
Timofeyeva N.
,
Fedorova O.
,
Kubareva E.
в журнале
FEBS Journal
, издательство
Blackwell Publishing Inc.
(United Kingdom)
, том 280, с. 127
2013
Design of photocontrolled biomolecules based on azobenzene derivatives
Zatsepin T.S.
,
Abrosimova L.A.
,
Monakhova M.V.
,
Thi Hien Le
,
Pingoud A.
,
Kubareva E.A.
,
Oretskaya T.S.
в журнале
Russian Chemical Reviews
, издательство
Turpion - Moscow Ltd.
(United Kingdom)
, том 82, № 10, с. 942-963
DOI
2013
Influence of thymidine glycol on DNA mismatch repair
Kubareva E.
,
Perevoztchikova S.
,
Trikin R.
,
Heinze R.
,
Romanova E.
,
Oretskaya T.
,
Friedhoff P.
в журнале
FEBS Journal
, издательство
Blackwell Publishing Inc.
(United Kingdom)
, том 280, с. 64
2013
Interaction of Bacillus subtilis 6S-1 and 6S-2 RNAs with RNA polymerase – comparative functional analyses and proteomics of 6S-1/2 knockout strains
Burenina O.Y.
,
Hoch P.G.
,
Kubareva E.A.
,
Hartmann R.K.
в журнале
FEBS Journal
, издательство
Blackwell Publishing Inc.
(United Kingdom)
, том 280, с. 37
2013
Light dependent activity of restriction endonucleases
Abrosimova L.
,
Monakhova M.
,
Schierling B.
,
Volkov E.
,
Romanova E.
,
Wende W.
,
Pingoud A.
,
Kubareva E.
,
Oretskaya T.
в журнале
FEBS Journal
, издательство
Blackwell Publishing Inc.
(United Kingdom)
, том 280, с. 597
2013
Modern aspects of the structural and functional organization of the DNA mismatch repair system
Perevoztchikova S.A.
,
Romanova E.A.
,
Oretskaya T.S.
,
Friedhoff P.
,
Kubareva E.A.
в журнале
Acta Naturae (англоязычная версия)
, издательство
Park Media Ltd
(Moscow, Russia (Federation))
, том 5, № 3 (18), с. 17-34
2013
Peculiarities of the regulation of gene expression in the Ecl18kI restriction–modification system
Burenina O.Yu
,
Fedotova E.A.
,
Ryazanova A.Yu
,
Protsenko A.S.
, Zakharova M.V.,
Karyagina A.S.
,
Solonin A.S.
,
Oretskaya T.S.
,
Kubareva E.A.
в журнале
Acta Naturae (англоязычная версия)
, издательство
Park Media Ltd
(Moscow, Russia (Federation))
, том 5, № 2 (17), с. 70-80
2013
Regulation of activity of transcription factor NF-kappaB by synthetic oligonucleotides
Metelev V.G.
,
Kubareva E.A.
,
Oretskaya T.S.
в журнале
Biochemistry (Moscow)
, издательство
Pleiades Publishing, Ltd
(Road Town, United Kingdom)
, том 78, № 8, с. 867-878
DOI
2013
Thermo-switchable activity of the restriction endonuclease SsoII achieved by site-directed enzyme modification
Abrosimova L.A.
,
Monakhova M.V.
,
Migur A.Yu
,
Wende W.
, Pingoud A.,
Kubareva E.A.
,
Oretskaya T.S.
в журнале
IUBMB Life
, издательство
Taylor & Francis
(United Kingdom)
, том 65, № 12, с. 1012-1016
DOI
2013
Thymidine glycol: the effect on DNA molecular structure and enzymatic processing
Dolinnaya N.G.
,
Kubareva E.A.
,
Romanova E.A.
,
Trikin R.M.
,
Oretskaya T.S.
в журнале
Biochimie
, издательство
Elsevier BV
(Netherlands)
, том 95, № 2, с. 134-147
DOI
2013
Создание фоторегулируемых биологических молекул на основе производных азобензол
Зацепин Т.С.
,
Абросимова Л.А.
,
Монахова М.В.
,
Тхи Хиен Ле
,
Пингуд А.
,
Кубарева Е.А.
,
Орецкая Т.С.
в журнале
Успехи химии
, издательство
АНО «Успехи химии»
(Москва)
, том 82, № 10, с. 942-963
2012
2′-Мodified oligoribonucleotides containing 1,2-diol and aldehyde groups. Synthesis and properties
Khomyakova E.A.,
Zubin E.M.
,
Pavlova L.V.
, Kazanova E.V.,
Smirnov I.P.
,
Pozmogova G.E.
,
Muller S.
,
Dolinnaya N.G.
,
Kubareva E.A.
,
Hartmann R.K.
,
Oretskaya T.S.
в журнале
Russian Journal of Bioorganic Chemistry
, издательство
Maik Nauka/Interperiodica Publishing
(Russian Federation)
, том 38, № 5, с. 488-499
DOI
2012
Covalently trapping MutS on DNA to study DNA mismatch recognition and signaling
Heinze R.J.
,
Sekerina S.
,
Winkler I.
,
Biertümpfel C.
,
Oretskaya T.S.
,
Kubareva E.
,
Friedhoff P.
в журнале
Molecular BioSystems
, издательство
Royal Society of Chemistry
(United Kingdom)
, том 8, № 7, с. 1861-1864
2012
Oligomerization of site-specific nicking endonuclease BspD6I at high protein concentrations
Sekerina S.A.
,
Grishin A.V.
,
Ryazanova A.Yu
,
Artyukh R.I.
,
Rogulin E.A.
,
Yunusova A.K.
,
Oretskaya T.S.
,
Zheleznaya L.A.
,
Kubareva E.A.
в журнале
Russian Journal of Bioorganic Chemistry
, издательство
Maik Nauka/Interperiodica Publishing
(Russian Federation)
, том 38, № 4, с. 376-382
DOI
2011
Crosslinking of (cytosine-5)-DNA methyltransferase SsoII and its complexes with specific DNA duplexes provides an insight into their structures
Ryazanova A.Yu
,
Winkler I.
,
Friedhoff P.
,
Viryasov M.B.
,
Oretskaya T.S.
,
Kubareva E.A.
в журнале
Nucleosides, Nucleotides and Nucleic Acids
, издательство
Marcel Dekker Inc.
(United States)
, том 30, № 7-8, с. 632-650
DOI
2011
In vivo and in vitro analysis of 6S RNA-templated short transcripts in Bacillus subtilis
Beckmann B.M.
,
Burenina O.Y.
,
Hoch P.G.
,
Kubareva E.A.
,
Sharma C.M.
,
Hartmann R.K.
в журнале
RNA Biology
, издательство
Landes Bioscience
(United States)
, том 8, № 5, с. 839-849
DOI
2011
Restriction endonuclease SsoII with photoregulated activity - a "molecular gate" approach
Thi Hien Le
,
Zatsepin T.S.
,
Schierling B.
,
Volkov E.M.
,
Wende W.
,
Pingoud A.
,
Kubareva E.A.
,
Oretskaya T.S.
в журнале
Bioconjugate Chemistry
, издательство
American Chemical Society
(United States)
, том 22, № 7, с. 1366-1373
DOI
2011
The study of the interaction of (cytosine-5)-DNA methyltransferase SsoII with DNA by acoustic method
Ryazanova A.Yu
,
Kubareva E.A.
,
Grman I.
,
Lavrova N.V.
,
Ryazanova E.M.
,
Oretskaya T.S.
,
Hianik T.
в журнале
The Analyst
, издательство
Royal Society of Chemistry
(United Kingdom)
, том 136, № 6, с. 1227-1233
DOI
2010
2′-aldehyde oligonucleotides: Synthesis and use for affinity modification of DNA-recognizing proteins
Khomyakova E.A.
,
Kazanova E.V.
,
Zubin E.M.
,
Kubareva E.A.
,
Molochkov N.V.
,
Ryazanova E.M.
,
Oretskaya T.S.
в журнале
Russian Journal of Bioorganic Chemistry
, издательство
Maik Nauka/Interperiodica Publishing
(Russian Federation)
, том 36, № 3, с. 315-324
DOI
2010
Controlling the enzymatic activity of a restriction enzyme by light
Schierling B.
,
Noel A-J
,
Wende W.
,
Le T.H.
,
Volkov E.
,
Kubareva E.
,
Oretskaya T.
,
Kokkinidis M.
,
Pingoud A.
в журнале
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
, издательство
National Academy of Sciences
(United States)
, том 107, № 4, с. 1361-1366
2010
DNA polymerases beta and lyambda bypass thymine glycol in gapped DNA structures
Belousova E.A.
, Maga G.,
Yang F.
,
Kubareva E.A.
,
Romanova E.A.
, Lebedeva N.A.,
Oretskaya T.S.
,
Lavrik O.I.
в журнале
Biochemistry
, издательство
American Chemical Society
(United States)
, том 49, с. 4695-4704
2010
Secondary structure of SsoII-like (cytosine-5)-DNA methyltransferases N-terminal region determined by Circular dichroism spectroscopy
Riazanova A.Yu
,
Molochkov N.V.
,
Abrosimova L.A.
,
Alekseevsky A.V.
,
Kariagina A.S.
,
Protsenko A.S.
,
Friedhoff P.
,
Oretskaya T.S.
,
Kubareva E.A.
в журнале
Molecular Biology
, издательство
Maik Nauka/Interperiodica Publishing
(Russian Federation)
, том 44, № 5, с. 807-816
DOI
2009
Deamination of 5-methylcytosine residues in mammalian cells
Gromenko E.V.
,
Spirin P.V.
,
Kubareva E.A.
,
Romanova E.A.
,
Prassolov V.S.
,
Shpanchenko O.V.
,
Dontsova O.A.
в журнале
Acta Naturae (англоязычная версия)
, издательство
Park Media Ltd
(Moscow, Russia (Federation))
, том 1, № 3, с. 121-124
2009
Design and synthesis of 2-functionalised Oligonucleotides. Their application for covalent trapping the protein-DNA complexes
Dolinnaya N.G.
,
Zubin E.M.
,
Kubareva E.A.
,
Zatsepin T.S.
,
Oretskaya T.S.
в журнале
Current Organic Chemistry
, издательство
Bentham Science Publishers
(Netherlands)
, том 13, № 11, с. 1029-1049
DOI
2009
Detection of DNA damage: effect of thymidine glycol residues on the thermodynamic, substrate and interfacial acoustic properties of oligonucleotide duplexes
Yang F.
,
Romanova E.
,
Kubareva E.
,
Dolinnaya N.
,
Gajdoš V.
,
Burenina O.
,
Fedotova E.
,
Ellis J.S.
,
Oretskaya T.
,
Hianik T.
,
Thompson M.
в журнале
The Analyst
, издательство
Royal Society of Chemistry
(United Kingdom)
, том 134, № 1, с. 41-51
DOI
2009
New azobenzene derivatives for directed modification of proteins
Thi Hien Le
,
Schierling B.
,
Ryazanova A.Yu
,
Zatsepin T.S.
,
Volkov E.M.
,
Kubareva E.A.
,
Velichko T.I.
,
Pingoud A.
,
Oretskaya T.S.
в журнале
Russian Journal of Bioorganic Chemistry
, издательство
Maik Nauka/Interperiodica Publishing
(Russian Federation)
, том 35, № 5, с. 549-555
DOI
2009
SsoII-like DNA-methyltransferase Ecl18kI: Interaction between regulatory and methylating functions
Fedotova E.A.
,
Protsenko A.S.
, Zakharova M.V.,
Lavrova N.V.
,
Alekseevsky A.V.
,
Oretskaya T.S.
,
Karyagina A.S.
,
Solonin A.S.
,
Kubareva E.A.
в журнале
Biochemistry (Moscow)
, издательство
Pleiades Publishing, Ltd
(Road Town, United Kingdom)
, том 74, № 1, с. 85-91
DOI
2008
Low-molecular weight inhibitors of NF-kappaB signaling pathways
Dolinnaya N.G.
,
Kubareva E.A.
,
Kazanova E.V.
,
Zigangirova N.A.
,
Naroditsky B.S.
,
Gintsburg A.L.
,
Oretskaya T.S.
в журнале
Russian Chemical Reviews
, издательство
Turpion - Moscow Ltd.
(United Kingdom)
, том 77, № 11, с. 967-981
2008
Low-molecular-weight inhibitors of NF-κB signalling pathways
Dolinnaya N.G.
,
Kubareva E.A.
,
Kazanova E.V.
,
Zigangirova N.A.
,
Naroditsky B.S.
,
Gintsburg A.L.
, Oretskaya T.S.
в журнале
Uspekhi khimii, издательство MEZHDUNARODNAYA KNIGA, 39 DIMITROVA UL., 113095 MOSCOW, RUSSIA
, том 77, № 11, с. 1036-1052
2008
Synthesis and characteristics of modified DNA fragments containing thymidine glycol residues
Fedotova E.A.
,
Yang F.
,
Kubareva E.A.
,
Romanova E.A.
,
Protsenko A.S.
,
Viryasov M.B.
,
Hianik T.
,
Oretskaya T.S.
в журнале
Russian Journal of Bioorganic Chemistry
, издательство
Maik Nauka/Interperiodica Publishing
(Russian Federation)
, том 34, № 2, с. 215-222
DOI
2007
A model of restriction endonuclease MvaI in complex with DNA: a template for interpretation of experimental data and a guide for specificity engineering
Kosinski J.
,
Kubareva E.
,
Bujnicki J.M.
в журнале
Proteins: Structure, Function and Bioinformatics
, издательство
Wiley-Liss Inc
(United States)
, том 68, № 1, с. 324-336
DOI
2007
Functionalisation of calcium phosphate nanoparticles by oligonucleotides and their application for gene silencing
Sokolova V.,
Kovtun A.
,
Prymak O.
,
Meyer-Zaika W.
,
Kubareva E.A.
,
Romanova E.A.
,
Oretskaya T.S.
, Heumann R.,
Epple M.
в журнале
Journal of Materials Chemistry
, издательство
Royal Society of Chemistry
(United Kingdom)
, том 17, № 8, с. 721-727
2006
Analysis of conserved hydrophobic cores in proteins and supramolecular complexes
Karyagina A.
,
Ershova A.
,
Titov M.
,
Olovnikov I.
,
Aksianov E.
,
Ryazanova A.
,
Kubareva E.
,
Spirin S.
,
Alexeevski A.
в журнале
Journal of Bioinformatics and Computational Biology
, издательство
Imperial College Press
(United Kingdom)
, том 4, № 2, с. 357-372
DOI
2006
Structure-based cross-linking of NF-kappaB p50 homodimer and decoy bearing a novel 2'-disulfide trapping site
Metelev V.
,
Romanenkov A.
,
Kubareva E.
,
Zubin E.
,
Polouchine N.
,
Zatsepin T.
,
Molochkov N.
,
Oretskaya T.
в журнале
IUBMB Life
, издательство
Taylor & Francis
(United Kingdom)
, том 58, № 11, с. 654-658
DOI
2006
Исследование структуры урацил-ДНК-гликозилазы из E.coli и ее комплексов с негидролизуемыми аналогами субстратов растворе методом синхротронного малоуглового рентгеновского рассеяния
Тимченко A.A.
,
Кубарева E.A.
,
Волков E.M.
,
Воронина О.Л.
,
Лунин В.Г.
,
Гончар Д.А.
,
Дегтярев С.Х.
,
Тимченко М.А.
,
Кихара Х.
,
Кимура К.
в журнале
Биофизика
, издательство
ФГБУ "Издательство "Наука"
(Москва)
, том 51, № 1, с. 5-12
2005
Affinity modification of the restriction endonuclease SsoII by 2'-aldehyde-containing double stranded DNAs
Sud’ina A.E.
,
Zatsepin T.S.
,
Pingoud V.
,
Pingoud A.
,
Oretskaya T.S.
,
Kubareva E.A.
в журнале
Biochemistry (Moscow)
, издательство
Pleiades Publishing, Ltd
(Road Town, United Kingdom)
, том 70, № 8, с. 941-947
DOI
2005
Analysis of DNA-protein interactions in complexes of transcription factor NF-kappa B with DNA
Romanenkov A.S.
,
Ustyugov A.A.
,
Zatsepin T.S.
,
Nikulova A.A.
,
Kolesnikov I.V.
,
Metelev V.G.
,
Oretskaya T.S.
,
Kubareva E.A.
в журнале
Biochemistry (Moscow)
, издательство
Pleiades Publishing, Ltd
(Road Town, United Kingdom)
, том 70, № 11, с. 1212-1222
DOI
2005
Covalent binding of modified nucleic acids with proteins as a method of investigation of specific protein-nucleic acid interactions
Zatsepin T.S.
,
Dolinnaya N.G.
,
Kubareva E.A.
,
Ivanovskaya M.G.
,
Metelev V.G.
,
Oretskaya T.S.
в журнале
Успехи химии
, издательство
АНО «Успехи химии»
(Москва)
, том 74, № 1, с. 84-103
2005
Crystallization and preliminary crystallographic analysis of the (cytosine-5)-DNA methyltransferase NlaX from Neisseria lactamica
Kachalova G.S.
,
Artyukh R.I.
,
Lavrova M.V.
,
Ryazanova E.M.
,
Karyagina A.S.
,
Kubareva E.A.
,
Bartunik H.D.
в журнале
Acta Crystallographica Section F: Structural Biology and Crystallization Communications
, издательство
International Union of Crystallography
(United Kingdom)
, том 61, № 9, с. 852-854
2005
Identification of base-specific contacts in protein-DNA complexes by photocrosslinking and mass spectrometry: a case study using the restriction endonuclease SsoII
Pingoud V.
,
Geyer H.
,
Geyer R.
,
Kubareva E.
,
Bujnicki J.M.
,
Pingoud A.
в журнале
Molecular BioSystems
, издательство
Royal Society of Chemistry
(United Kingdom)
, том 1, с. 135-141
2005
Specificity changes in the evolution of type II restriction endonucleases: a biochemical and bioinformatics analysis of restriction enzymes that recognize unrelated sequences
Pingoud V.
,
Sudina A.
,
Geyer H.
,
Bujnicki J.M.
,
Lurz R.
,
Luder G.
,
Morgan R.
,
Kubareva E.
,
Pingoud A.
в журнале
Journal of Biological Chemistry
, издательство
American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc.
(United States)
, том 280, № 6, с. 4289-4298
2005
Анализ белково-нуклеиновых контактов в комплексах фактора транскрипции NF-KB с ДНК
Романенков А.С.
,
Устюгов А.А.
,
Зацепин Т.С.
,
Никулова А.А.
,
Колесников И.В.
,
Метелев В.Г.
,
Орецкая Т.С.
,
Кубарева Е.А.
в журнале
Биохимия
, издательство
ИКЦ «Академкнига»
(Москва)
, том 70, № 11, с. 1474-1487
DOI
2004
Detection of glycosylase, endonuclease and methyltransferase enzyme activities using immobilized oligonucleotides
Sudina A.
,
Volkov E.
,
Oretskaya T.
,
Naryshkin N.
,
Ivanovskaya M.
,
Kubareva E.
в журнале
IUBMB Life
, издательство
Taylor & Francis
(United Kingdom)
, том 56, № 3, с. 139-143
2003
Activation of NF-kappa B transcription factor in human neutrophils by sulphatides and L-selectin cross-linking
Turutin D.V.
,
Kubareva E.A.
,
Pushkareva M.A.
, Ullrich V.,
Sud’ina G.F.
в журнале
FEBS Letters
, издательство
Elsevier BV
(Netherlands)
, том 536, № 1-3, с. 241-245
DOI
2003
Computer modeling of complex of (C5-cytosine)-DNA methyltransferase SsoII with target and regulatory DNAs
Kayagina A.S.
,
Alexeevski A.V.
,
Golovin A.V.
,
Spirin S.A.
,
Vorob’eva O.V.
,
Kubareva E.A.
в журнале
Biophysics
, издательство
Maik Nauka/Interperiodica Publishing
(Russian Federation)
, том 48, № 1, с. 45-55
2003
Covalent binding of Cys142 from SsoII methyltransferase with DNA duplexes, containing a phosphoryldisulfide internucleotide group
Vorob’eva O.V.
,
Romanenkov A.S.
,
Metelev V.G.
,
Kariagina A.S.
, Lavrova N.V.,
Oretskaia T.S.
,
Kubareva E.A.
в журнале
Molecular Biology
, издательство
Maik Nauka/Interperiodica Publishing
(Russian Federation)
, том 37, № 5, с. 906-915
2003
DNA duplexes containing 2'-deoxy-2'-iodoacetamidouridine as reagents for affinity modification of proteins
Borisova O.A.
,
Romanenkov A.S.
,
Metelev V.G.
,
Kubareva E.A.
,
Zubin E.M.
,
Timchenko M.A.
,
Oretskaya T.S.
в журнале
Molecular Biology
, издательство
Maik Nauka/Interperiodica Publishing
(Russian Federation)
, том 37, № 3, с. 456-463
DOI
2003
PspGI, a type II restriction endonuclease from the extreme thermophile Pyrococcus sp.: structural and functional studies to investigate an evolutionary relationship with several mesophilic restriction enzymes
Pingoud V.
,
Conzelmann C.
,
Kinzebach S.
,
Sudina A.
,
Metelev V.
,
Kubareva E.
,
Bujnicki J.M.
,
Lurz R.
,
Lueder G.
,
Xu S.Y.
,
Pingoud A.
в журнале
Journal of Molecular Biology
, издательство
Academic Press
(United States)
, том 329, № 5, с. 913-929
DOI
2003
Specific conjugation of DNA binding proteins to DNA templates through thiol-disulfide exchange
Metelev V.G.
,
Kubareva E.A.
,
Vorob'eva O.V.
,
Romanenkov A.S.
,
Oretskaya T.S.
в журнале
FEBS Letters
, издательство
Elsevier BV
(Netherlands)
, том 538, № 1-3, с. 48-52
DOI
2003
The synthesis and properties of oligodeoxyribonucleotides with single mono- and diphosphoryldithio internucleotide links
Metelev V.G.
,
Kubareva E.A.
,
Romanova E.A.
,
Oretskaya T.S.
в журнале
Russian Journal of Bioorganic Chemistry
, издательство
Maik Nauka/Interperiodica Publishing
(Russian Federation)
, том 29, № 1, с. 50-55
DOI
2003
Новый метод тестирования активности ферментов репарации, рестрикции и модификации с помощью олигонуклеотидов, иммобилизованных на полимерном носителе
Кубарева Е.А.
,
Судьина А.Е.
в журнале
Наукоемкие технологии
, издательство
Издательство "Радиотехника"
(Москва)
, № 1, с. 64-71
2003
Синтез и свойства олигодезоксирибонуклеотидов, содержащих фосфорилдисульфидную группировку в заданном положении углеводофосфатного остова
Романенков А.С.
,
Борисова О.А.
,
Кубарева Е.А.
,
Орецкая Т.С.
,
Метелев В.Г.
в журнале
Вестник Московского университета. Серия 2: Химия
, издательство
Издательский дом МГУ
(Москва)
, том 44, № 3, с. 208-213
2002
An analysis of methyltransferase SsoII-DNA contacts in the enzyme-substrate complex
Vorob’eva O.V.
,
Kariagina A.S.
,
Volkov E.M.
,
Viriasov M.B.
,
Oretskaya T.S.
,
Kubareva E.A.
в журнале
Russian Journal of Bioorganic Chemistry
, издательство
Maik Nauka/Interperiodica Publishing
(Russian Federation)
, том 28, № 5, с. 363-370
DOI
2002
Crosslinking of transcription factor NF-kappa B with a DNA ligand bearing the 2 '-aldehyde group
Turutin D.V.
,
Zatsepin T.S.
,
Timchenko M.A.
,
Kubareva E.A.
,
Oretskaya T.S.
в журнале
Molekulyarnaya Biologiya
, том 36, № 5, с. 705-707
DOI
2002
Determination of methylation site of DNA-methyltransferase NlaX by a hybrid method
Kubareva E.A.
,
Walter J.
,
Karyagina A.S.
,
Vorob'eva O.V.
,
Lau P.C.K
,
Trautner T.
в журнале
BioTechniques
, издательство
Eaton Publishing Co.
(United States)
, том 33, № 3, с. 526-531
2002
Evolutionary relationship between different subgroups of restriction endonucleases
Pingoud V.
,
Kubareva E.
,
Stengel G.
,
Friedhoff P.
,
Bujnicki J.M.
,
Urbanke C.
,
Sudina A.
,
Pingoud A.
в журнале
Journal of Biological Chemistry
, издательство
American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc.
(United States)
, том 277, № 16, с. 14306-14314
2001
Determination of a non-methylated deoxycytidine residue in the recognition site of DNA-methyltransferases
Kubareva E.A.
,
Walter J.
,
Vorob'eva O.V.
,
Razumikhin M.V.
,
Karyagina A.S.
,
Lau P.C.K
,
Trautner T.
в журнале
Biochemistry (Moscow)
, издательство
Pleiades Publishing, Ltd
(Road Town, United Kingdom)
, том 66, № 12, с. 1356-1360
DOI
2000
An express method of testing activity of a repair enzyme, uracil-DNA-glycosylase
Sudina A.E.
,
Volkov E.M.
,
Oretskaya T.S.
, Degtyarev S.K.,
Gonchar D.A.
,
Kubareva E.A.
в журнале
Bioorganicheskaya Khimiya
, издательство
Izdatel'stva Nauka
(Russian Federation)
, том 26, № 6, с. 442-447
2000
Analysis of DNA-protein contacts in a complex between methyltransferase SsoII and a promoter region of the SsoII restriction-modification genes
Vorob’eva O.V.
, Vasil’ev S.A.,
Kariagina A.S.
,
Oretskaya T.S.
,
Kubareva E.A.
в журнале
Molecular Biology
, издательство
Maik Nauka/Interperiodica Publishing
(Russian Federation)
, том 34, № 6, с. 921-926
DOI
2000
Identification of a base-specific contact between the restriction endonuclease SsoII and its recognition sequence by photocross-linking
Kubareva E.A.
,
Thole H.
,
Karyagina A.S.
,
Oretskaya T.S.
,
Pingoud A.
,
Pingoud V.
в журнале
Nucleic Acids Research
, издательство
Oxford University Press
(United Kingdom)
, том 28, № 5, с. 1085-1091
2000
The repair enzyme uracil-DNA-glycosylase: study of the mechanism of functioning using modified analogues of DNA
Sudina A.E.
,
Volkov E.M.
,
Kubareva E.A.
в журнале
Moscow University Chemistry Bulletin
, издательство
Allerton Press Inc.
(United States)
, с. 122-124
2000
Взаимодействие фталоцианинового комплекса кобальта с ДНК-дуплексами
Тимченко М.А.
,
Первушина Е.В.
,
Ташлицкий В.Н.
,
Кубарева Е.А.
,
Крынецкая Н.Ф.
в журнале
Молекулярная биология
, том 34, № 1, с. 101-109
1999
A model of EcoRII restriction endonuclease action: the active complex is most likely formed by one protein subunit and one DNA recognition site
Karpova E.A.
,
Kubareva E.A.
,
Shabarova Z.A.
в журнале
IUBMB Life
, издательство
Taylor & Francis
(United Kingdom)
, том 48, № 1, с. 91-98
DOI
1998
Conformational transition of restriction endonuclease MvaI-substrate complex under the influence of Mg2+ probed by DNA-protein cross-linking studies
Sheflyan G.Y.
,
Kubareva E.A.
,
Gromova E.S.
,
Shabarova Z.A.
в журнале
Bioconjugate Chemistry
, издательство
American Chemical Society
(United States)
, том 9, № 6, с. 703-707
DOI
1998
Cross-linked DNA duplexes - Exonuclease stability and interaction with the nucleic transcription factor of the kappa light-chain enhancer (NF-kappa B)
Antsypovich S.I.
,
Kubareva E.A.
,
Tashlitsky V.N.
,
Oretskaya T.S.
,
Shabarova Z.A.
в журнале
European Journal of Biochemistry
, том 255, № 2, с. 414-421
DOI
1998
DNA-methyltransferase SsoII interaction with own promoter region binding site
Shilov I.
,
Tashlitsky V.
,
Khodoun M.
, Vasil’ev S.,
Alekseev Ya
,
Kuzubov A.
,
Kubareva E.
,
Karyagina A.
в журнале
Nucleic Acids Research
, издательство
Oxford University Press
(United Kingdom)
, том 26, № 11, с. 2659-2664
1998
Restriction endonucleases can be used to confirm a structure of unusual DNA duplexes
Maksimenko A.V.
,
Gottikh M.B.
,
Kubareva E.A.
, Fedorova O.A.,
Shabarova Z.A.
в журнале
Biological Chemistry
, издательство
Walter de Gruyter GmbH & Co. KG
(Germany)
, том 379, № 4-5, с. 625-630
1998
Role of DNA definite structural elements in interaction with repair enzyme uracil-DNA glycosylase
Kubareva E.A.
,
Vasilenko N.L.
,
Vorobjeva O.V.
,
Volkov E.M.
,
Oretskaya T.S.
,
Korshunova G.A.
,
Nevinsky G.A.
в журнале
Biochemistry and molecular biology international
, издательство
Taylor & Francis
(United Kingdom)
, том 46, № 3, с. 597-606
1998
Transition-metal complexes as inhibitors of proteins recognizing double-stranded fragments of nucleic acids
Krynetskaya N.F.
,
Kubareva E.A.
,
Timchenko M.A.
,
Belkov V.M.
,
Shabarova Z.A.
в журнале
Biochemistry (Moscow)
, издательство
Pleiades Publishing, Ltd
(Road Town, United Kingdom)
, том 63, № 9, с. 1068-1073
1998
Взаимодействие димера субъединицы р50 фактора транскрипции NF-kB c ДНК
Козлов И.А.
,
Кубарева Е.А.
в журнале
Успехи биологической химии
, том 38, с. 77-93
1998
Ингибирование фактора транскрипции NF-kB модифицированными фрагментами ДНК и их ассоциатами с фталоцианиновыми комплексами переходных металлов
Кубарева Е.А.
,
Крынецкая Н.Ф.
,
Шабарова З.А.
в журнале
Российский химический журнал
, издательство
Химия
(М.)
, том 42, № 5, с. 153-162
1998
Применение синтетических олигонуклеотидов для ингибирования активности фактора транскрипции NF-kB
Козлов И.А.
,
Кубарева Е.А.
,
Шабарова З.А.
в журнале
Молекулярная биология
, том 32, № 3, с. 389-400
1997
Design of new reagents on the base of DNA duplexes for irreversible inhibition of transcription factor NF-kB
Kozlov I.A.
,
Kubareva E.A.
,
Ivanovskaya M.G.
,
Shabarova Z.A.
в журнале
Antisense & nucleic acid drug development
, издательство
Mary Ann Liebert, Inc.
(New Rochelle, NY, United States)
, том 7, № 4, с. 279-289
DOI
1997
Ковалентное связывание ДНК-дуплексов, содержащих ацилфосфатную или замещенную пирофосфатную группировку, с фактором транскрипции NF-kB
Ивановская М.Г.
,
Козлов И.А.
,
Кубарева Е.А.
,
Таран Е.А.
,
Серазев Т.В.
,
Шабарова З.А.
в журнале
Молекулярная биология
, том 31, № 3, с. 436-445
1997
Определение положения контактов фактора транскрипции NF-kB методом региоселективного ковалентного связывания
Козлов И.А.
,
Кубарева Е.А.
,
Ивановская М.Г.
,
Шабарова З.А.
в журнале
Молекулярная биология
, том 31, № 1, с. 65-75
1997
Циклические олигонуклеотиды. II. Изучение закономерностей образования полициклических соединений
Максименко А.В.
, Федорова О.А.,
Готтих М.Б.
,
Кубарева Е.А.
,
Шабарова З.А.
в журнале
Биоорганическая химия
, издательство
Российская академия наук
(Москва)
, том 23, № 2, с. 127-133
1996
Cross-linking of SsoII restriction endonuclease to cognate and non-cognate DNAs
Sheflyan G.Ya
,
Kubareva E.A.
,
Kuznetsova S.A.
,
Karyagina A.S.
,
Nikolskaya I.I.
,
Gromova E.S.
,
Shabarova Z.A.
в журнале
FEBS Letters
, издательство
Elsevier BV
(Netherlands)
, том 390, № 3, с. 307-310
DOI
1996
Methods for the covalent attachment of nucleic acids and their derivatives to proteins
Sheflyan G.Ya
,
Kubareva E.A.
,
Gromova E.S.
в журнале
Успехи химии
, издательство
АНО «Успехи химии»
(Москва)
, том 65, № 8, с. 763-781
1996
NF-kB p50 subunit cross-linking to DNA duplexes, containing a monosubstituted pyrophosphate internucleotide bond
Kubareva E.A.
, Fedorova O.A.,
Gottikh M.B.
,
Tanaka H.
,
Malvy C.
,
Shabarova Z.A.
в журнале
FEBS Letters
, издательство
Elsevier BV
(Netherlands)
, том 381, № 1, с. 35-38
DOI
1996
Synthesis and properties of a covalently linked DNA duplex containing a recognition site for transcription factor NF-kappa B
Kozlov I.A.
,
Ivanovskaya M.G.
,
Kubareva E.A.
,
Volkov E.M.
,
Shabarova Z.A.
в журнале
Molecular Biology
, издательство
Maik Nauka/Interperiodica Publishing
(Russian Federation)
, том 30, № 4, с. 503-508
1995
Chemical cross-linking of MvaI and EcoRII enzymes to DNA duplexes containing a monosubstituted pyrophosphate internucleotide bond
Sheflyan G.Ya
,
Kubareva E.A.
,
Volkov E.M.
,
Oretskaya T.S.
,
Gromova E.S.
,
Shabarova Z.A.
в журнале
Gene
, издательство
Elsevier BV
(Netherlands)
, том 157, № 1,2, с. 187-190
DOI
1995
Influence of a single modification of the DNA sugar-phosphate backbone on the functioning of restriction endonucleases EcoRII, MvaI, and BstN1
Brevnov M.G.
,
Kubareva E.A.
,
Volkov E.M.
,
Romanova E.A.
,
Oretskaya T.S.
,
Gromova E.S.
,
Shabarova Z.A.
в журнале
Molecular Biology
, издательство
Maik Nauka/Interperiodica Publishing
(Russian Federation)
, том 29, № 6, с. 770-773
1995
Interaction of the MvaI and SsoII methyltransferases with DNAs altered at the central base pair of recognition sequence
Brevnov M.G.
,
Kubareva E.A.
,
Romanova E.A.
,
Volkov E.M.
,
Karyagina A.S.
,
Nikolskaya I.I.
,
Gromova E.S.
в журнале
Gene
, издательство
Elsevier BV
(Netherlands)
, том 157, № 1-2, с. 149-152
DOI
1995
Modified substrates as probes for studying uracil-DNA glycosylase
Kubareva E.A.
,
Volkov E.M.
,
Vinogradova N.L.
,
Kanevsky I.A.
,
Oretskaya T.S.
,
Kuznetsova S.A.
,
Brevnov M.G.
,
Gromova E.S.
,
Nevinsky G.A.
,
Shabarova Z.A.
в журнале
Gene
, издательство
Elsevier BV
(Netherlands)
, том 157, № 1, с. 167-171
DOI
1995
Modified substrates as probes for studying uracil-DNA glycosylase
Kubareva EA
,
Volkov EM
,
Vinogradova NL
,
Kanevsky IA
, Oretskaya TS,
Kuznetsova SA
,
Brevnov MG
,
Gromova ES
,
Nevinsky GA
,
Shabarova ZA
в журнале
Gene
, издательство
Elsevier BV
(Netherlands)
, том 157, № 1-2, с. 167-171
1995
Use of UV spectroscopy for the study of nucleic acid cleavage by E. coli RNase H and restriction endonucleases
Petrauskene O.V.
,
Krynetskaya N.F.
,
Tashlitsky V.N.
,
Belkov V.M.
,
Kubareva E.A.
,
Gromova E.S.
,
Guschlbauer W.
,
Shabarova Z.A.
в журнале
Biochemistry and molecular biology international
, издательство
Taylor & Francis
(United Kingdom)
, том 37, № 6, с. 1127-1135
1994
AFFINITY MODIFICATION OF RESTRICTION-ENDONUCLEASE ECORII BY DNA DUPLEX CONTAINING A MONOSUBSTITUTED PYROPHOSPHATE INTERNUCLEOTIDE BOND
Shabarova Z.A.
,
Sheflyan G.Y.
,
Kuznetsova S.A.
,
Kubareva E.A.
,
Sysoev O.N.
,
Ivanovskaya M.G.
,
Gromova E.S.
в журнале
Bioorganicheskaya Khimiya
, издательство
Izdatel'stva Nauka
(Russian Federation)
, том 20, № 4, с. 413-419
1993
Peculiarities of the binding of restriction endonuclease EcoRII to synthetic DNA duplexes
Karpova E.A.,
Kubareva E.A.
,
Gromova E.S.
,
Buryanov Ya I.
в журнале
Biochemistry and molecular biology international
, издательство
Taylor & Francis
(United Kingdom)
, том 29, № 1, с. 113-121
1993
SYNTHETIC DNA DUPLEXES AS A TOOL IN STUDYING THE MECHANISM OF ECORII ACTIVATION
Petrauskene O.V.
,
Kubareva E.A.
,
Gromova E.S.
,
Pein C.D.
,
Cech D.
,
Shabarova Z.A.
в журнале
Molecular Biology
, издательство
Maik Nauka/Interperiodica Publishing
(Russian Federation)
, том 27, № 3, с. 301-307
1993
The cysteine conserved among DNA cytosine methylases is required for methyl transfer, but not for specific DNA binding
Wyszynski M.W.
,
Gabbara S.
,
Kubareva E.A.
,
Romanova E.A.
,
Oretskaya T.S.
,
Gromova E.S.
,
Shabarova Z.A.
,
Bhagwat A.S.
в журнале
Nucleic Acids Research
, издательство
Oxford University Press
(United Kingdom)
, том 21, № 2, с. 295-301
1993
Взаимодействие эндонуклеазы рестрикции MvaI с синтетическими ДНК-дуплексами: температурный оптимум и энергия активации ферментативной реакции, эффективные константы скорости и энергия активации процесса термоинактивации фермента
Шефлян Г.Я.
,
Кубарева Е.А.
,
Ташлицкий В.Н.
в журнале
Вестник Московского университета. Серия 2: Химия
, издательство
Издательский дом МГУ
(Москва)
, том 34, № 5, с. 516-520
1993
Исследование гидролиза ДНК-дуплексов, содержащих 5-фтордезоксицитидин, эндонуклеазами рестрикции
Шефлян Г.Я.
,
Кубарева Е.А.
,
Громова Е.С.
,
Шабарова З.А.
в журнале
Биохимия
, издательство
ИКЦ «Академкнига»
(Москва)
, том 53, № 11, с. 1806-1811
1992
Change in the cleavage site of synthetic substrates of SsoII restriction endonucleases upon introduction of non-nucleotide inserts in the recognition segment
Kubareva E.A.
,
Piatrauskene O.V.
,
Kariagina A.S.
,
Nikol’skaia I.I.
,
Gromova E.S.
в журнале
Bioorganicheskaya Khimiya
, издательство
Izdatel'stva Nauka
(Russian Federation)
, том 18, № 8, с. 1131-1134
1992
Cleavage of synthetic substrates containing non-nucleotide inserts by restriction endonucleases. Change in the cleavage specificity of endonuclease SsoII
Kubareva E.A.
,
Petrauskene O.V.
,
Karyagina A.S.
,
Tashlitsky V.N.
,
Nikolskaya I.I.
,
Gromova E.S.
в журнале
Nucleic Acids Research
, издательство
Oxford University Press
(United Kingdom)
, том 20, № 17, с. 4533-4538
1992
Formation of two types of enzyme-substrate complexes during the interaction of EcoRII restriction enzyme with synthetic DNA-duplexes
Karpova E.A.
,
Kubareva E.A.
,
Bur'ianov Ia I.
,
Gromova E.S.
в журнале
Molecular Biology
, издательство
Maik Nauka/Interperiodica Publishing
(Russian Federation)
, том 26, № 5, с. 993-998
1992
Mechanism of the interaction of EcoRII restriction endonuclease with two recognition sites. Probing of modified DNA duplexes as activators of the enzyme
Petrauskene O.V.
,
Kubareva E.A.
,
Gromova E.S.
,
Shabarova Z.A.
в журнале
European Journal of Biochemistry
, том 208, № 3, с. 617-622
1992
SYNTHESIS OF OLIGODEOXYRIBONUCLEOTIDES CONTAINING 5-FLUORO-2'-DEOXYCYTIDINE
Kubareva E.A.
,
Romanova E.A.
,
Oretskaya T.S.
,
Gromova E.S.
,
Shabarova Z.A.
в журнале
Bioorganicheskaya Khimiya
, издательство
Izdatel'stva Nauka
(Russian Federation)
, том 18, № 5, с. 748-750
1991
Oligonucleotide cleavage by restriction endonucleases MvaI and EcoRII: a comprehensive study on the influence of structural parameters on the enzyme-substrate interaction
Kubareva E.A.
,
Gromova E.S.
,
Pein С.D.
,
Krug A.
,
Oretskaya T.S.
,
Cech D.
,
Shabarova Z.A.
в журнале
Biochimica et Biophysica Acta - Proteins and Proteomics
, издательство
Elsevier BV
(Netherlands)
, том 1088, № 3, с. 395-400
DOI
1991
Peculiarities of recognition of CC / GG sequences in DNA by restriction endonucleases Mva I and Eco RII
Gromova E.S.
,
Kubareva E.A.
,
Vinogradova M.N.
,
Oretskaya T.S.
,
Shabarova Z.A.
в журнале
Journal of Molecular Recognition
, издательство
John Wiley & Sons Inc.
(United States)
, том 4, с. 133-141
DOI
1991
SYNTHESIS OF OLIGODEHYDROXYRIBONUCLEOTIDES, CONTAINING 4-N-(EPSILON-AMINOHEXYL)-5-METHYLDEHYDROXYCYTIDINE
Volkov E.M.
,
Kubareva E.A.
,
Tashlitskii V.N.
,
Oretskaya T.S.
в журнале
Khimiia prirodnykh soedinenii
, том 5, с. 698-704
1991
Spectrophotometric method of studying the cleavage of DNA-duplexes by restriction endonucleases
Piatrauskene O.V.
,
Kubareva E.A.
,
Gromova E.S.
в журнале
Molecular Biology
, издательство
Maik Nauka/Interperiodica Publishing
(Russian Federation)
, том 25, № 5, с. 1424-1426
DOI
1991
THE SYNTHESIS AND PROPERTIES DNA-DUPLEXES WITH 9-[1'-HYDROXY-2'-(HYDROXYMETHYL)ETHOXY]METHYLGUANINE
Romanova E.A.
,
Kuznetsova L.G.
,
Kubareva E.A.
,
Tsytovich A.V.
,
Merenkova I.N.
,
Oretskaya T.S.
,
Gromova E.S.
,
Shabarova Z.A.
в журнале
Bioorganicheskaya Khimiya
, издательство
Izdatel'stva Nauka
(Russian Federation)
, том 17, № 12, с. 1640-1648
1991
Расщепление субстратов конкатемерного типа эндонуклеазами рестрикции MvaI и SsoII
Громова Е.А.
,
Кубарева Е.А.
,
Елов А.А.
, Акатова Е.А., Никольская И.И.,
Шабарова З.А.
в журнале
Биохимия
, издательство
ИКЦ «Академкнига»
(Москва)
, том 56, № 3, с. 552-559
1990
CLEAVAGE OF SUBSTRATES CONTAINING MODIFIED AMINO-GROUPS IN HETEROCYCLIC BASES BY MVAI AND ECORII RESTRICTION ENDONUCLEASES
Kubareva E.A.
,
Gromova E.S.
,
Romanova E.A.
,
Oretskaya T.S.
,
Shabarova Z.A.
в журнале
Bioorganicheskaya Khimiya
, издательство
Izdatel'stva Nauka
(Russian Federation)
, том 16, № 4, с. 501-506
1990
SYNTHESIS OF OLIGODEHYDROXYRIBONUCLEOTIDES CONTAINING 1,2-DIDEHYDROXY-D-RIBOFURANOSE
Volkov E.M.
,
Kubareva E.A.
,
Sergeev V.N.
,
Oretskaya T.S.
в журнале
Khimiia prirodnykh soedinenii
, том 3, с. 417-419
1988
The influence of modifications on the cleavage of oligonucleotide duplexes by EcoRII and MvaI endonucleases
Cech D.
,
Pein C.D.
,
Kubareva E.A.
,
Gromova E.S.
,
Oretskaya Т.S.
,
Shabarova Z.A.
в журнале
Nucleosides & nucleotides
, издательство
M. Dekker
(New York, N.Y., United States)
, том 7, № 5, с. 585-588
DOI
1988
The role of modifications in oligonucleotides in sequence recognition by MvaI restriction endonuclease
Kubareva E.A.
,
Pein C.D.
,
Gromova E.S.
,
Kuznetsova S.A.
,
Shabarova Z.A.
,
Tashlitzki V.N.
,
Cech D.
в журнале
European Journal of Biochemistry
, том 175, № 3, с. 615-618
DOI
1987
CHANGES IN THE SYNTHESIS ORDER OF OLIGODEOXYRHIBONUCLEOTIDES ON VIKTORIYA-2 AND VIKTORIYA-4M SYNTHESIZING MACHINES
Oretskaya T.S.
,
Kubareva E.A.
,
Gryaznov S.M.
, Lomakin A.I.,
Potapov V.K.
в журнале
Khimiia prirodnykh soedinenii
, том 1, с. 153-155
1987
INTERACTION OF ECORII RESTRICTION AND MODIFICATION ENZYMES WITH SYNTHETIC DNA FRAGMENTS .10. HYDROLYSIS OF SUBSTRATES WITH STRUCTURAL ANOMALIES
Kubareva E.A.
,
Gromova E.S.
,
Oretskaya T.S.
,
Shabarova Z.A.
в журнале
Bioorganicheskaya Khimiya
, издательство
Izdatel'stva Nauka
(Russian Federation)
, том 13, № 9, с. 1205-1211
1987
STUDY OF THE MECHANISM OF CLEAVAGE OF THE DNA DUPLEXES BY RESTRICTION ENDONUCLEASE MVAI
Gromova E.S.
,
Kubareva E.A.
,
Pein C.D.
,
Oretskaya T.S.
,
Shabarova Z.A.
,
Cech D.
,
Prokofiev M.A.
в журнале
Доклады Академии наук
, издательство
ФГБУ "Издательство "Наука"
(Москва)
, том 295, № 6, с. 1493-1497
1987
Взаимодействие ферментов рестрикции и модификации EcoRII с синтетическими фрагментами ДНК. Синтез субстратов с одним участком узнавания
Кузнецова С.А.
,
Кубарева Е.А.
,
Орецкая Т.С.
,
Долинная Н.Г.
,
Крынецкая Н.Ф.
,
Громова Е.С.
,
Шабарова З.А.
,
Цех Д.
в журнале
Биополимеры и клетка
, издательство
Наукова Думка
(Киев)
, том 3, № 6, с. 283-289
1986
Interaction of EcoRII restriction and modification enzyme with synthetic DNA fragments. IV. DNA duplexes with phosphoamide and pyrophosphate internucleotide bonds--the substrates for the study of single-strand breaks
Gromova E.S.
,
Elov A.A.
,
Kubareva E.A.
,
Metelev V.G.
,
Shabarova Z.A.
в журнале
Molecular Biology
, издательство
Maik Nauka/Interperiodica Publishing
(Russian Federation)
, том 20, № 1, с. 29-40
1985
Interaction of EcoRII restriction and modification enzymes with synthetic DNA fragments. V. Study of single-stranded cleavages
Yolov A.A.
,
Gromova E.S.
,
Kubareva E.A.
,
Potapov V.K.
,
Shabarova Z.A.
в журнале
Nucleic Acids Research
, издательство
Oxford University Press
(United Kingdom)
, том 13, № 24, с. 8969-8981
DOI
Статьи в сборниках
2022
G-quadruplex formed by the promoter region of the hTERT gene: structure-driven effects on DNA mismatch repair functions
Pavlova A.
,
Savitskaya V.
,
Dolinnaya N.
,
Monakhova M.
,
Litvinova A.
,
Zvereva M.
,
Kubareva Е.
в сборнике
Bioinformatics of genome regulation and structure/systems biology (BGRS/SB-2022): The Thirteenth International Multiconference (04–08 July, 2022, Novosibirsk, Russia); Abstracts
, место издания
ICG SB RAS Novosibirsk
, с. 1011-1012
DOI
2021
Effect of G-quadruplexes on DNA mismatch repair pathway
Kubareva Е.
,
Pavlova A.
,
Monakhova M.
,
Zvereva M.
,
Dolinnaya N.
в сборнике
Encyclopedia
, серия
Biochemistry & Molecular Biology
, издательство
MDPI
(Basel, Switzerland)
, с. 15927
2021
Northern blot detection of tiny RNAs
Wiegard J.C.
,
Schlüter M.A.C
,
Burenina O.Y.
,
Kubareva E.A.
,
Klug G.
,
Grünweller A.
,
Hartmann R.K.
в сборнике
Methods in Molecular Biology
, серия
Small Non-Coding RNAs
, место издания
Humana New York, NY
, том 2300, с. 41-58
DOI
2021
Структурные особенности опухолевой ДНК с потенциалом для неинвазивной диагностики рака (на примере области промотора гена TERT)
Павлова А.В.
,
Писарев Е.В.
,
Монахова М.В.
,
Кубарева Е.А.
,
Зверева М.Э.
в сборнике
III ОБЪЕДИНЕННЫЙ НАУЧНЫЙ ФОРУМ ФИЗИОЛОГОВ, БИОХИМИКОВ И МОЛЕКУЛЯРНЫХ БИОЛОГОВ. НАУЧНЫЕ ТРУДЫ
, место издания
«Перо» г. Москва
, том 2, с. 19
2015
Рестриктазы. Рестрикции-модификации процесс
Кубарева Е.А.
в сборнике
Большая Российская Энциклопедия
, место издания
Москва
, том 28, с. 431-431
2012
Diverse domains of (cytosine-C5)-DNA methyltransferases: structural and functional characterization
Ryazanova A.Yu
,
Abrosimova L.A.
,
Oretskaya T.S.
,
Kubareva E.A.
в сборнике
Methylation: from DNA, RNA and histones to diseases and treatment
, место издания
InTech Rijeka, Croatia
, с. 29-69
DOI
2012
Эндонуклеаза рестрикции. Рестрикционный фрагмент. Рестрикционная карта. Система рестрикции-модификации. Сайт рестрикции
Кубарева Е.А.
в сборнике
Нуклеиновые кислоты. От А до Я
, место издания
Бином. Лаборатория знаний Москва
2008
Restriction endonuclease. Restriction fragment. Restriction map. Restriction-modification system
Kubareva E.A.
в сборнике
Nucleic Acids from A to Z. A concise encyclopedia
, место издания
Willey-VCH Verlag GmbH & Co KGaA Weinheim, Germany
, с. 234-238
1994
A novel approach for studing the activation mechanism of EcoRII restriction endonuclease. Molecular Enzymology
Gromova E.S.
,
Petrauskene O.V.
,
Kubareva E.A.
,
Shabarova Z.A.
в сборнике
Problems and Trends (B.I.Kurganov, S.N.Kochetkov, V.I.Tishkov eds) Nova Science
, место издания
Publishers, Inc. NY
, с. 335-341
Книги
2023
Экспериментальные методы исследования белков и нуклеиновых кислот. Раздел II. Комплексные задачи
Агапкина Ю.Ю.
,
Анашкин В.А.
,
Анисенко А.Н.
,
Антипова О.М.
,
Бачева А.В.
,
Елкина Д.А.
,
Королев С.П.
,
Королева О.Н.
,
Кубарева Е.А.
,
Орецкая Т.С.
,
Родина Е.В.
,
Скворцов Д.А.
место издания
МДМпринт Москва
, 64 с.
1993
Экспериментальные методы исследования белков и нуклеиновых кислот
Склянкина В.А.
,
Баландина Г.Н.
,
Лавренова Г.И.
,
Кубарева Е.А.
,
Филиппова И.Ю.
,
Макарова Т.Н.
место издания
Отдел печати химфак МГУ Москва
, 41 с.
Доклады на конференциях
2023
НАНОПОРОВОЕ СЕКВЕНИРОВАНИЕ ДЛЯ DE NOVO ОПРЕДЕЛЕНИЯ БАКТЕРИАЛЬНЫХ ГЕНОМОВ.
(Устный)
Авторы:
Хренова М.Г.
,
Панова Т.В.
,
Родин В.А.
,
Сергеев А.С.
,
Кубарева Е.А.
,
Трефилов В.С.
,
Зверева М.Э.
4-й Российский Микробиологический Конгресс
, Томск, Россия, 24-29 сентября 2023
2023
Влияние G-квадруплексной структуры промотора гена hTERT на функционирование белков системы эксцизионной репарации оснований
(Устный)
Авторы:
Савицкая В.Ю.
,
Новоселов К.А.
,
Сныга В.Г.
,
Дятлова Е.А.
,
Ерошенко Д.А.
,
Долинная Н.Г.
,
Жарков Д.О.
,
Кубарева Е.А.
,
Зверева М.Э.
13-я Международная научная конференция «БИОКАТАЛИЗ. ФУНДАМЕНТАЛЬНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ И ПРИМЕНЕНИЯ» (БИОКАТАЛИЗ - 2023)
, Москва, Россия, 25-29 июля 2023
2023
Influence of BER system on the fixation of mutations in the human TERT gene promoter
(Стендовый)
Авторы:
Песковацкова Е.
,
Сныга В.Г.
,
Савицкая В.Ю.
,
Кубарева Е.А.
Международная научная конференция студентов, аспирантов и молодых ученых "Ломоносов-2023" ( Секция "Химия", подсекция "«Неорганическая химия II. Аспиранты и молодые учёные»)
, МГУ имени М.В. Ломоносова, Химический факультет, Россия, 11 апреля - 18 мая 2023
2023
Влияние 6S-1 РНК Bacillus subtilis на транскрипцию генов сурфактин-синтетазы и синтез сурфактина
(Устный)
Авторы:
Трефилов В.С.
,
Буренина О.Ю.
,
Елкина Д.А.
,
Зверева М.Э.
,
Кубарева Е.А.
КУРЧАТОВСКАЯ МОЛОДЕЖНАЯ НАУЧНАЯ ШКОЛА
, г. Москва, площадь Академика Курчатова, д. 1, НИЦ «Курчатовский институт»., Россия, 20-23 марта 2023
2023
Синтез биосурфактанта сурфактина в клетках B. subtilis: влияние 6S-1 РНК
(Стендовый)
Авторы:
Трефилов В.С.
,
Елкина Д.А.
,
Буренина О.Ю.
,
Хартманн Р.К.
,
Кубарева Е.А.
,
Зверева М.Э.
XXXV ЗИМНЯЯ МОЛОДЁЖНАЯ НАУЧНАЯ ШКОЛА "ПЕРСПЕКТИВНЫЕ НАПРАВЛЕНИЯ ФИЗИКО-ХИМИЧЕСКОЙ БИОЛОГИИ И БИОТЕХНОЛОГИИ
, г. москва, Россия, 7-10 февраля 2023
2022
Малая некодирующая 6S-1 РНК - регулятор биосинтеза биосурфактанта сурфактина в клетках Bacillus subtilis
(Устный)
Авторы:
Трефилов В.С.
,
Елкина Д.А.
,
Буренина О.Ю.
,
Hartmann R.K.
,
Кубарева Е.А.
,
Зверева М.Э.
Геномика, метагеномика и молекулярная биология микроорганизмов
, Сколтех, Россия, 17-20 ноября 2022
2022
Структурные особенности опухолевой ДНК с потенциалом для неинвазивной диагностики рака (на примере области промотора гена TERT
(Устный)
Авторы:
Зверева М.Э.
,
Павлова А.В.
,
Писарев Э.К.
,
Монахова М.В.
,
Кубарева Е.А.
III Объединенный Научный Форум Физиологов, Биохимиков И Молекулярных Биологов
, Сочи, Россия, 3-7 октября 2022
2022
G-quadruplex formed by the promoter region of the hTERT gene: structure-driven effects on DNA mismatch repair functions
(Устный)
Авторы:
Pavlova A.
,
Savitskaya V.
,
Dolinnaya N.
,
Monakhova M.
,
Litvinova A.
,
Zvereva M.
,
Kubareva Е.
«Биоинформатика и системная биология регуляции и структуры геномов» BGRS/SB-2022
, Новосибирск, Россия, 4-8 июля 2022
2019
Взаимодействия между ключевыми белками бактериальных систем репарации ДНК-«мисматчей» и внутримолекулярным параллельным G-квадруплексом в ДНК
(Устный)
Авторы:
Павлова А.В.
,
Монахова М.В.
,
Долинная Н.Г.
,
Савицкая В.Ю.
,
Орецкая Т.С.
,
Кубарева Е.А.
II Объединенный научный форум, включающий VI Cъезд физиологов СНГ, VI Съезд биохимиков России и IX Российский симпозиум «Белки и пептиды»
, Дагомыс, Россия, 1-6 октября 2019
2019
КОРОТКИЕ НЕКОДИРУЮЩИЕ РНК – ПРОДУКТЫ ТРАНСКРИПЦИИ 6S РНК В БАКТЕРИИ RHODOBACTER SPHAEROIDES
(Стендовый)
Авторы:
Елкина Д.А.
,
Буренина О.Ю.
,
Банникова В.А.
,
Транкова Н.А.
,
Лисицкая Л.А.
,
Кульбачинский А.В.
,
Первушин Д.Д.
,
Кубарева Е.А.
II Объединенный научный форум, включающий VI Cъезд физиологов СНГ, VI Съезд биохимиков России и IX Российский симпозиум «Белки и пептиды»
, Дагомыс, Россия, 1-6 октября 2019
2019
Bacterial 6S RNAs under stress conditions
(Стендовый)
Авторы:
Elkina D.
,
Burenina O.
,
Bannikova V.
,
Kubareva Е.
The 44th FEBS Congress, Krakow, Poland, July 6-11.
, Краков, Польша, 6-11 июля 2019
2019
Bacterial DNA-mismatch repair endonucleases MutL: structure and interaction with molecular partners
(Устный)
Авторы:
Monakhova M.V.
,
Milakina M.A.
,
Kubareva E.A.
,
Rao N.D.
,
Oretskaya T.S.
,
Alexeevski A.V.
12-я международная конференция Биокатализ-2019 «Биокатализ: фундаментальные основы и применение»
, теплоход "Леонид Соболев", Россия, 24-28 июня 2019
2018
6S RNAs under stress conditions in different bacteria
(Стендовый)
Авторы:
Elkina D.
,
Burenina O.
,
Oretskaya T.
,
Kubareva E.
The 2nd Russia-Japan Joint Forum for Education and Research
, Москва, Россия, 24-25 сентября 2018
2018
Investigation of the interactions of BspD6I endonuclease and MutL protein with molecular partners using crosslinking and mass spectrometric approaches
(Стендовый)
Авторы:
Абросимова Л.А.
,
Ларионова Е.Е.
,
Монахова М.В.
,
Орецкая Т.С.
,
Рао Д.Н.
,
Кубарева Е.А.
The 2nd Russia-Japan Joint Forum for Education and Research
, Москва, Россия, 24-25 сентября 2018
2018
The influence of G-quadruplexes in DNA on E. coli mismatch repair proteins functioning
(Стендовый)
Авторы:
Pavlova A.V.
,
Monakhova M.V.
,
Laptev G.Yu
,
Kubareva E.A.
,
Polshakov V.I.
,
Oretskaya T.S.
,
Dolinnaya N.G.
The 2nd Russia-Japan Joint Forum for Education and Research
, Москва, Россия, 24-25 сентября 2018
2017
Investigations of interactions between proteins and nucleic acids occurring in cell processes: restriction-modification, repair and transcription
(Устный)
Автор:
Kubareva E.А.
First Russia-Japan MSU-TokyoTech Joint Conference for Young Scientists "Proteins, Nucleic Acids and Nucleoproteins"
, Москва, Россия, 11-12 декабря 2017
2017
Белки MutS и MutL: изучение механизма начальных этапов репарации «мисматчей» в ДНК методом «кросслинкинга»
(Устный)
Авторы:
Монахова М.В.
,
Кубарева Е.А.
,
Орецкая Т.С.
,
Фридхофф П.
12th International Scientific Conference on Bioorganic Chemistry devoted to the Memory of Professor Ovchinnikov/Международная научная конференция "XII чтения памяти академика Юрия Анатольевича Овчинникова" VIII Российский симпозиум "Белки и пептиды"
, Москва, Россия, 18-22 сентября 2017
2017
Novel small (non)coding RNAs with an extended Shine-Dalgarno sequence
(Стендовый)
Авторы:
Burenina O.
,
Hahn J.
,
Evguenieva-Hackenberg E.
,
Kubareva E.
,
Korepina J.
42nd FEBS Congress "From molecules to cells and back"
, Иерусалим, Израиль, 10-14 сентября 2017
2017
Conjugation of modified DNA substrates with nicking endonuclease BspD6I. Role of cysteine residues in enzymatic binding and catalysis
(Стендовый)
Авторы:
Кубарева Е.А.
,
Абросимова Л.А.
,
Самсонова А.Р.
,
Орецкая Т.С.
7th Cambridge Symposium on Nucleic Acids Chemistry and Biology
, Кембридж, Великобритания, 3-6 сентября 2017
2017
DNA duplexes containing a disulfide group as an instrument for studying DNA mismatch repair
(Стендовый)
Авторы:
Monakhova M.V.
,
Friedhoff P.
,
Oretskaya T.S.
,
Kubareva Е.А.
7th Cambridge Symposium on Nucleic Acids Chemistry and Biology
, Кембридж, Великобритания, 3-6 сентября 2017
2016
Малые некодирующие 6S РНК прокариот
(Стендовый)
Авторы:
Буренина О.Ю.
,
Елкина Д.А.
,
Хартманн Р.К.
,
Орецкая Т.С.
,
Кубарева Е.А.
Научная конференция грантодержателей РНФ «Фундаментальные химические исследования XXI-го века»
, ИОХ, Россия, 20-24 ноября 2016
2016
Функциональная роль малой некодирующей 6S РНК из бактерии Rhodobacter sphaeroides
(Устный)
Авторы:
Елкина Д.А.
,
Вебер Л.
,
Буренина О.Ю.
,
Кубарева Е.А.
Научная конференция грантодержателей РНФ «Фундаментальные химические исследования XXI-го века»
, ИОХ, Россия, 20-24 ноября 2016
2016
Белок MutL из системы репарации ДНК-«мисматчей»: взаимодействие с молекулярными партнерами
(Устный)
Авторы:
Монахова М.В.
,
Пенкина А.И.
,
Кубарева Е.А.
,
Павлова А.В.
,
Фридхофф П.
,
Шилкин Е.С.
V Съезд физиологов СНГ, V Съезд Биохимиков России
, Сочи, Россия, 4-8 октября 2016
2016
Влияние неканонических структур ДНК на функционирование системы репарации «мисматчей»
(Стендовый)
Авторы:
Гавшина А.В.
,
Андреева Н.А.
,
Кубарева Е.А.
,
Оглоблина А.М.
,
Долинная Н.Г.
,
Монахова М.В.
V Съезд физиологов СНГ, V Съезд Биохимиков России
, Сочи, Россия, 4-8 октября 2016
2016
Малая некодирующая 6S РНК из Rhodobacter sphaeroides
(Стендовый)
Авторы:
Елкина Д.А.
,
Вебер Л.
,
Буренина О.Ю.
,
Кубарева Е.А.
,
Хартманн Р.
,
Клуг Г.
V Съезд физиологов СНГ, V Съезд Биохимиков России
, Сочи, Россия, 4-8 октября 2016
2016
Изучение короткоживущих комплексов системы репарации «мисматчей» E. сoli c помощью фиксации белка MutS на ДНК
(Устный)
Авторы:
Монахова М.В.
,
Фридхофф П.
,
Кубарева Е.А.
,
Рязанова А.Ю.
Химическая биология. Международная конференция посвященная 90-летию академика Д.Г.Кнорре.
, Новосибирск, Россия, 24-28 июля 2016
2016
Особенности взаимодействия гетеродимерной эндонуклеазы рестрикции BspD6I с модифицированными фрагментами ДНК.
(Устный)
Авторы:
Абросимова Л.А.
,
Гавшина А.В.
,
Кубарева Е.А.
,
Железная Л.А.
,
Орецкая Т.С.
Химическая биология. Международная конференция посвященная 90-летию академика Д.Г.Кнорре.
, Новосибирск, Россия, 24-28 июля 2016
2016
Ковалентная фиксация белков реакционноспособными аналогами ДНК как метод изучения начальных этапов функционирования системы репарации неканонических пар нуклеотидов
(Стендовый)
Авторы:
Монахова М.В.
,
Фридхофф П.
,
Кубарева Е.А.
,
Рязанова А.Ю.
XXVIII Зимняя молодежная научная школа "Перспективные направления физико-химической биологии и биотехнологии"
, Институт Биоорганической Химии РАН, Россия, 8-11 февраля 2016
2015
6S-1 and 6S-2 RNAs from B. subtilis: from mechanistic research to understanding of their functional roles in vivo
(Устный)
Авторы:
Burenina Olga Y.
,
Clemens Thölken
, Logacheva Maria D.,
Elkina Daria A.
,
Kubareva Elena A.
,
Hartmann Roland K.
Symposium “Enzymes and enzyme complexes acting on nucleic acids”
, Гиссен, Германия, 14-15 сентября 2015
2015
Peculiarities of the interaction between the subunits of restriction endonuclease BspD6I
(Стендовый)
Авторы:
Oretskaya T.S.
,
Abrosimova L.A.
,
Gavshina A.V.
,
Migur A.Yu
,
Wende W.
,
Zheleznaya L.A.
,
Kubareva E.A.
International Research Training Group Symposium
, Гиссен, Германия, 14-15 сентября 2015
2015
Comparative transcriptome and proteome analyses of Bacillus subtilis 6S-1 and 6S-2 RNA deletion strains
(Устный)
Авторы:
Clemens Thoelken
, Logacheva Maria D.,
Burenina Olga Y.
,
Elkina Daria A.
,
Marcus Lechner
,
Hoch Philipp G.
,
Oretskaya Tatiana S.
,
Kubareva Elena A.
,
Hartmann Roland K.
The 40th FEBS Congress
, Берлин, Германия, 4-9 июля 2015
2014
Chromatographic isolation of the functionally active MutS protein covalently fixed to DNA
(Стендовый)
Авторы:
Perevozchikova S.
,
Viryasov M.
,
Hentschel A.
,
Monakhova M.
,
Oretskaya T.
,
Friedhoff P.
,
Kubareva E.
30th International Symposium on Chromatography
, Salzburg, Австрия, 14-18 сентября 2014
2013
Comparative functional analyses of 6S-1 and 6S-2 RNAs from Bacillus subtilis
(Устный)
Авторы:
Burenina O.
,
Hoch P.
,
Nesterchuk M.
,
Kubareva E.
,
Dontsova O.
,
Hartmann R.
Workshop “Global and mechanistic approaches in nucleic acid biology” of the International Research Training Group Gießen/Marburg‐Moscow (DFG/RFBR‐funded)
, Saint Petersburg, Russia, Россия, 2013
2013
Influence of thymidine glycol on DNA mismatch repair
(Стендовый)
Авторы:
Кубарева Е.А.
,
Perevoztchikova S.
,
Trikin R.M.
,
Friedhoff P.
,
Romanova E.
,
Орецкая Т.С.
,
Heinze R.J.
Federation of European Biochemical Societies CONGRESS 2013 “Mechanisms in Biology”
, Sankt Peterburg, Russia, Россия, 2013
2012
Light- and termoregulation of the enzymatic DNA hydrolysis
(Стендовый)
Авторы:
Никифорова (Абросимова) Л.А.
,
Монахова М.В.
,
Schierling B.
,
Романова Е.А.
,
Wende W.
,
Кубарева Е.А.
,
Орецкая Т.С.
,
Волков Е.М.
,
Пингоуд А.
International Conference on the Postgenomic Technology for Biomedicine
, Novosibirsk, 2012
2012
Synthesis and properties of modified oligodeoxyribonucleotides containing nucleotide residue with β-diketogroup at C2' atom
(Стендовый)
Авторы:
Naberezhnov D.S.
,
Sekerina S.A.
,
Oretskaya T.S.
,
Romanova E.A.
,
Kubareva E.A.
,
Monakhova M.V.
International Conference on the Postgenomic Technology for Biomedicine
, Novosibirsk, 2012
2011
Controlling DNA hydrolysis by light
(Стендовый)
Авторы:
Oretskaya T.S.
,
Hien Le Thi
,
Shierling B.
,
Monakhova M.V.
,
Abrosimova L.A.
,
Volkov E.M.
,
Romanova E.A.
,
Wende W.
,
Kubareva E.A.
,
Pingoud A.
Sixth Cambridge Symposium on Nucleic Acids Chemistry and Biology
, Cambridge, UK, 2011
2011
Crosslinking of (cytosine-5)-DNA methyltransferase SsoII and its complexes with specific DNA duplexes provides an insight into their structures
Авторы:
Рязанова А.Ю.
,
Winkler I.
,
Friedhoff P.
,
Орецкая Т.С.
,
Кубарева Е.А.
French-Russian Workshop “Chemistry in molecular biology”
, Moscow, Россия, 2011
2011
Dissecting the differential roles of the two 6S RNAs from Bacillus subtilis
(Устный)
Авторы:
Hartmann R.K.
,
Burenina O.Y.
,
Hoch P.G.
,
Beckmann B.M.
,
Kubareva E.A.
Progress Report Meeting “Sensory and regulatory RNAs in prokaryotes”
, Kassel (Germany), Германия, 2011
2011
Peculiarities of 6S RNAs from Bacillus subtilis functioning
(Стендовый)
Авторы:
Кубарева Е.А.
,
Буренина О.Ю.
,
Beckmann B.M.
,
Hoch P.G.
,
Hartmann R.K.
Sixth Cambridge Symposium on Nucleic Acids Chemistry and Biology
, Cambridge, UK, 2011
2010
(Cytosine-5)-DNA methyltransferase SsoII interaction with its target DNAs: structural aspects
(Устный)
Авторы:
Рязанова А.Ю.
,
Никифорова (Абросимова) Л.А.
,
Winkler I.
,
Орецкая Т.С.
,
Friedhoff P.
,
Кубарева Е.А.
6th New England Biolabs Meeting on Restriction/Modification
, Bremen, Germany, Германия, 2010
2010
(Cytosine-5)-DNA methyltransferase SsoII interaction with its target DNAs: structural aspects
(Стендовый)
Авторы:
Ryazanova A.Y.
,
Abrosimova L.A.
,
Burenina O.Y.
,
Kubareva E.A.
6th New England Biolabs Meeting on DNA Restriction and Modification, Bremen, Germany
, 2010
2010
Investigation of 6S-2 RNA of Bacillus subtilis
(Стендовый)
Авторы:
Burenina O.Y.
,
Beckmann B.M.
,
Kubareva E.A.
,
Hartmann R.K.
the Third GGL (International Giessen Graduate School for the Life Sciences) Conference on Life Sciences Conference on Life Sciences
, Giessen (Germany), Германия, 2010
2010
Investigation of 6S-2 RNA of Bacillus subtilis
(Устный)
Авторы:
Burenina O.Y.
,
Beckmann B.M.
,
Kubareva E.A.
,
Hartmann R.K.
One-site evaluation conference «Enzymes and multienzyme complexes acting on nucleic acids» of the International Research Training Group Giessen/Marburg-Moscow
, Giessen (Germany), Германия, 2010
2010
Trapping MutS on DNA Using Chemical Crosslinking
Авторы:
Секерина С.А.
,
Heinze R.J.
,
Friedhoff P.
,
Кубарева Е.А.
,
Орецкая Т.С.
,
Winkler I.
Third GGL-Conference on Life Sciences
, Giessen, Germany, Германия, 2010
2010
Heterodimeric restriction endonuclease BspD6I: investigation of protein–DNA interactions using synthetic DNA duplexes
(Устный)
Авторы:
Секерина С.А.
,
Железная Л.А.
,
Юнусова А.К.
,
Никифорова (Абросимова) Л.А.
,
Рязанова А.Ю.
,
Орецкая Т.С.
,
Кубарева Е.А.
Workshop “Enzymes and enzyme complexes acting on nucleic acids” of the International Research Training Group Gießen/Marburg–Moscow (DFG/RFBR-funded)
, Vilnius, Lithuania, Литва, 16-20 мая 2010
2010
Investigation of transcription regulation by 6S RNAs from Bacillus subtilis
(Стендовый)
Авторы:
Burenina O.Y.
,
Beckmann B.M.
,
Kubareva E.A.
,
Hartmann R.K.
Workshop “Enzymes and enzyme complexes acting on nucleic acids” of the International Research Training Group Gießen/Marburg–Moscow (DFG/RFBR-funded)
, Vilnius, Lithuania, Литва, 16-20 мая 2010
2008
(Cytosine-5)-DNA methyltransferase Ecl18kI: interrelation between methylation and regulatory functions
Авторы:
Fedotova Е.
,
Проценко А.С.
,
Орецкая Т.С.
,
Солонин А.С.
,
Кубарева Е.А.
,
Zakharova M.Y.
Spring-Meeting and Workshop "Protein-protein interactions" of the International Research Training Group Gissen/Marburg-Moscow (DFG/RFBR-funded)
, 2008
2008
Small-angle X-ray scattering (SAXS): characterizing the structure of biological macromolecules in solution
Авторы:
Рязанова А.Ю.
,
Kachalova G.
,
Bartunik H.D.
,
Svergun D.I.
,
Кубарева Е.А.
,
Konarev P.V.
Offspring-Meeting of the International Research Training Group Gießen/Marburg–Moscow (DFG/RFBR-funded)
, Moscow, Россия, 2008
2007
A comprehensive approach to study DNA-protein interactions
Авторы:
Кубарева Е.А.
,
Pingoud V.
,
Пингоуд А.
,
Орецкая Т.С.
,
Bujnicki J.M.
Workshop "Protein-nucleic acid interactions" of the International Research Training Group Gissen/Marburg/Moscow (DFG/RFBR-funded)
, Suzdal, Russia, Россия, 2007
2007
In silico analysis of hydrophobic clusters in proteins and DNA-protein complexes
Авторы:
Спирин А.С.
,
Ершова А.С.
,
Titov M.
,
Оловников И.А.
,
Рязанова А.Ю.
,
Кубарева Е.А.
,
Алексеевский А.В.
,
Карягина-Жулина А.С.
,
Аксянов Е.А.
Workshop “Protein–nucleic acid interactions” of the International Research Training Group Gießen/Marburg–Moscow (DFG/RFBR-funded)
, Suzdal, 2007
2006
DNA reagents for affinity modification of proteins and cross-linked DNAs
Авторы:
Кубарева Е.А.
,
Зубин Е.М.
,
Орецкая Т.С.
,
Зацепин Т.С.
,
Метелев В.Г.
Final Meeting of the Research Training Group "Biochemistry of Nucleo-protein-complexes". Kick-Off-Meeting of the International Research Training Group Giessen/Marburg-Moscow "Enzymes and multienzyme complexes acting on nucleic acids"
, Giessen, Germany, Германия, 2006
2005
Analysis of conserved hydrophobic cores in proteins and supramolecular complexes
Авторы:
Карягина-Жулина А.С.
,
Оловников И.А.
,
Рязанова А.Ю.
,
Salimonova T.
,
Никулова А.А.
,
Алексеевский А.В.
,
Кубарева Е.А.
,
Ершова А.С.
,
Аксянов Е.А.
,
Спирин А.С.
,
Titov M.
International Moscow Conference on Computational Molecular Biology
, Moscow, Россия, 2005
2004
How does methyltransferase SsoII interact with its methylation and operator binding sites in DNA?
(Устный)
Авторы:
Кубарева Е.А.
,
Vorob'eva O.V.
,
Орецкая Т.С.
,
Карягина-Жулина А.С.
,
Романенков А.С.
,
Ямскова О.В.
5th New England Biolabs Meeting on Restriction/Modification
, Bristol, UK, 2004
2004
Peculiarities of DNA recognition by methyltransferase SsoII
(Устный)
Авторы:
Vorob'eva O.V.
,
Спирин А.С.
,
Алексеевский А.В.
,
Кубарева Е.А.
,
Карягина-Жулина А.С.
IQN Winter Meeting "Biochemistry of Nucleic Acids"
, Giessen, Germany, Германия, 2004
2003
DNA-ligands with 2'-reactive groups as novel reagents for DNA-protein crosslinking
Авторы:
Кубарева Е.А.
,
Зубин Е.М.
,
Зацепин Т.С.
,
Орецкая Т.С.
,
Романенков А.С.
,
Метелев В.Г.
,
Vorob'eva O.V.
5th Cambridge Symposium "Nucleic Acids Chemistry and Biology"
, Cambridge, UK, 2003
2003
Design and properties of DNA reagents for protein crosslinking
Авторы:
Кубарева Е.А.
,
Орецкая Т.С.
IQN Spring Meeting "Nucleic Acids and Nucleo-Protein-Complexes"
, Giessen, 2003
2001
Analysis of DNA recognition by (cytosine-5)-methyltransferase SsoII
Авторы:
Vorob'eva O.V.
,
Кубарева Е.А.
,
Карягина-Жулина А.С.
,
Vasil'ev S.A.
5th International Meeting on Recognition Studies in Nucleic Acids (NACON-V)
, Sheffild, UK, 2001
1998
Cobalt phthalocyanine complexes as catalysts of free radical formation: oxidative degradation of nucleic acids and inhibition of DNA-protein interactions
Авторы:
Krynetskaya N.F.
,
Кубарева Е.А.
,
Шабарова З.А.
,
Первушина Е.В.
,
Тимченко М.А.
UNESCO Society for Free Radical Research (Europe) "Regulation of biological processes by free radicals: Role of antioxidants, free radical scavengers, and chelators"
, Yaroslavl, Russia, Россия, 1998
1997
DNA dumbbells as substrates for the study of R-M and repair enzymes
Авторы:
Кузнецова С.А.
,
Кубарева Е.А.
,
Kanevsky I.A.
,
Nikol’skaya I.V.
,
Шабарова З.А.
,
Карягина-Жулина А.С.
4th New England Biolabs Workshop on Biological DNA modification
, Innsbruck, UK, 1997
1996
Activated DNA-duplexes binding and covalent cross-linking to transcription factors.
Авторы:
Кузнецова С.А.
,
Козлов И.А.
,
Kanevsky I.A.
,
Ивановская М.Г.
,
Кубарева Е.А.
,
Vasser M.
,
Шабарова З.А.
,
Blumenfeld M.
XII Int. Roundtable "Nucleosides, nucleotides and their biological application".
, La Jolla. USA., 1996
1996
Interaction of restriction-modification enzymes with unusial DNA structures.
Авторы:
Кубарева Е.А.
,
Kanevsky I.A.
,
Максименко А.В.
,
Готтих М.Б.
,
Кaryagina Nikol'skaya A.S.
,
Шабарова З.А.
,
Федорова О.А.
,
Кузнецова С.А.
FASEB Summer Res. Conference "Enzymes that act on nucleic acids".
, Vermont. USA., 1996
1994
Modified substrates as probes for studying uracil-excision DNA repair enxymes
Авторы:
Кубарева Е.А.
,
Волков Е.М.
,
Kanevsky I.A.
,
Кузнецова С.А.
,
Nevinsky G.A.
,
Шабарова З.А.
,
Vasilenko N.L.
,
Бревнов М.Г.
XVIth IUBMB, India,
, 1994
1994
Modified substrates as probes for studying uracil-excision DNA repair enzymes
Авторы:
Кубарева Е.А.
,
Волков Е.М.
,
Vasilenko N.L.
,
Kanevsky I.A.
,
Кузнецова С.А.
,
Бревнов М.Г.
,
Nevinsky G.A.
,
Шабарова З.А.
Third New England Biolabs Workshop on Biological DNA modification
, Vilnius, Lithuania, Литва, 1994
1994
Modified substrates as probes for studying uracil-excision DNA repair enzymes
Авторы:
Кубарева Е.А.
,
Волков Е.М.
,
Vasilenko N.L.
,
Шабарова З.А.
,
Кузнецова С.А.
,
Бревнов М.Г.
,
Nevinsky G.A.
,
Kanevsky I.A.
16th Int. Congress of Biochem. and Ма Biol.
, New Dethy, India, Индия, 1994
1994
Modified substrates as probes for studying uracil-excision DNA repair enzymes
Авторы:
Кубарева Е.А.
,
Volkov Е.М.
,
Vasilenko N.L.
,
Kanevsky I.A.
,
Кузнецова С.А.
,
Бревнов М.Г.
,
Nevinsky G.A.
,
Шабарова З.А.
Third New England Biolabs Workshop on Biological DNA modification
, Vilnius, Lithuania, Литва, 1994
1993
Interaction of SsoII and EcoRII restriction enzymes with synthetic DNA duplexes containing structural anomalies into the recognition sequence. Change of endonucleases cleavage specificity
Авторы:
Кубарева Е.А.
,
Шефлян Г.Я.
,
Громова Е.С.
,
Карягина-Жулина А.С.
,
Бревнов М.Г.
FASEB Summer Research Conference "Restriction Endonucleases and Modification Methyltransferases: Structures and Mechanisms"
, Vermont, USA, 1993
1991
DNA duplexes with non-nucleotide inserts: interaction with restriction endonucleases
Авторы:
Кубарева Е.А.
,
Petrauskene O.V.
,
Громова Е.С.
,
Nikol’skaya I.V.
,
Карягина-Жулина А.С.
International Symposium "Synthetic oligonucleotides: problems and frontiers of practical application"
, Moscow, USSR, Россия, 1991
1990
Acceleration of the cleavage of 30-membered DNA duplex by EcoRII restriction endonuclease in the presence of substrates with canonical and modified recognition sites
Авторы:
Кубарева Е.А.
,
Громова Е.С.
,
Petrauskene O.V.
Second New England Biolabs Workshop on Biological DNA modifcation
, Berlin, Germany, Германия, 1990
1987
Взаимодействие эндонуклеаз рестрикции EcoRII и MvaI с углеводофосфатным остовом участка узнавания
(Устный)
Автор:
Кубарева Е.А.
Третье всесоюзное совещание по органической химии ДНК-дуплексов
, г. Тбилиси, Грузия, Грузия, 1987
Тезисы докладов
2023
Влияние 6S-1 РНК Bacillus subtilis на транскрипцию генов сурфактин-синтетазы и синтез сурфактина
Трефилов В.С.
,
Буренина О.Ю.
,
Елкина Д.А.
,
Зверева М.Э.
,
Кубарева Е.А.
в сборнике
Сборник аннотаций XVII Курчатовской молодежной научной школы
, тезисы
2023
Синтез биосурфактанта сурфактина в клетках B. subtilis: влияние 6S-1 РНК
Трефилов В.С.
,
Елкина Д.А.
,
Буренина О.Ю.
,
Хартманн Р.К.
,
Зверева М.Э.
,
Кубарева Е.А.
в сборнике
Сборник тезисов XXXV ЗИМНЕЙ МОЛОДЁЖНОЙ НАУЧНОЙ ШКОЛЫ "ПЕРСПЕКТИВНЫЕ НАПРАВЛЕНИЯ ФИЗИКО-ХИМИЧЕСКОЙ БИОЛОГИИ И БИОТЕХНОЛОГИИ"
, место издания
Москва
, тезисы, с. 52
2023
Транскрипция генов сурфактин-синтетазы и генов белков-регуляторов в Bacillus subtilis активируется при делеции 6S-1 РНК
Трефилов В.С.
,
Буренина О.Ю.
,
Елкина Д.А.
,
Зверева М.Э.
,
Кубарева Е.А.
в сборнике
Сборник тезисов 26-ой Пущинской школы-конференции молодых ученых с международным участием «БИОЛОГИЯ – НАУКА XXI ВЕКА»
, место издания
Федеральное государственное бюджетное учреждение науки «Федеральный исследовательский центр «Пущинский научный центр биологических исследований Российской академии наук» Пущино
, тезисы
2022
Активация транскрипции оперона srfA посредством 6S-1 РНК в клетках Bacillus subtilis
Трефилов В.С.
,
Елкина Д.А.
,
Буренина О.Ю.
,
Хартманн Р.К.
,
Кубарева Е.А.
в сборнике
Сборник тезисов 25-ой Пущинской школы-конференции молодых ученых с международным участием «БИОЛОГИЯ – НАУКА XXI ВЕКА»
, тезисы, с. 157
2022
Анализ структуры белка MutS из бактерии Rhodobacter sphaeroides
Якушкина Ю.В.
,
Монахова М.В.
,
Кубарева Е.А.
в сборнике
Сборник тезисов 25-ой Пущинской школы-конференции молодых ученых с международным участием «БИОЛОГИЯ – НАУКА XXI ВЕКА»
, тезисы, с. 183-184
2022
Влияние G-квадруплексов промотора гена обратной транскриптазы теломеразы человека на функции белка MutL из системы репарации "мисматчей"
Савицкая В.Ю.
,
Монахова М.В.
,
Сныга В.Г.
,
Кубарева Е.А.
в сборнике
Сборник тезисов 25-ой Пущинской школы-конференции молодых ученых с международным участием «БИОЛОГИЯ – НАУКА XXI ВЕКА»
, место издания
ФИЦ ПНЦБИ РАН г. Пущино Московской области
, тезисы, с. 150
2022
Влияние белка MutS из системы репарации «мисматчей» Neisseria gonorrhoeae на антигенную вариацию pilE
Стрекаловских В.В.
,
Савицкая В.Ю.
,
Кубарева Е.А.
в сборнике
Сборник тезисов конференции "ГЕНОМИКА, МЕТАГЕНОМИКА И МОЛЕКУЛЯРНАЯ БИОЛОГИЯ МИКРООРГАНИЗМОВ", Сколтех 19-20 ноября 2022 года, Laboratory of Metagenome Analysis
, место издания
Сколковский институт науки и технологий г. Москва
, тезисы, с. 43
2022
Малая некодирующая 6S-1 РНК – регулятор биосинтеза биосурфактанта сурфактина в клетках Bacillus subtilis
Трефилов В.С.
,
Елкина Д.А.
,
Буренина О.Ю.
,
Хартманн Р.К.
,
Кубарева Е.А.
,
Зверева М.Э.
в сборнике
Сборник тезисов конференции "ГЕНОМИКА, МЕТАГЕНОМИКА И МОЛЕКУЛЯРНАЯ БИОЛОГИЯ МИКРООРГАНИЗМОВ", Сколтех 19-20 ноября 2022 года, Laboratory of Metagenome Analysis
, место издания
Сколковский институт науки и технологий г. Москва
, тезисы, с. 45
2022
Новые результаты в определении функциональной роли 6S РНК бактерии Rhodobacter sphaeroides
Карпов А.С.
,
Елкина Д.А.
,
Григоров А.С.
,
Ажикина Т.Л.
,
Кубарева Е.А.
в сборнике
Сборник тезисов 25-ой Пущинской школы-конференции молодых ученых с международным участием «БИОЛОГИЯ – НАУКА XXI ВЕКА»
, место издания
ФИЦ ПНЦБИ РАН г. Пущино Московской области
, тезисы, с. 118-119
2022
Система репарации "мисматчей" распознает N2-гетероарильные аддукты гуанозина в ДНК
Павлова А.В.
,
Маруяма А.
,
Масаки И.
,
Монахова М.В.
,
Сейо К.
,
Кубарева Е.А.
в сборнике
Сборник тезисов 25-ой Пущинской школы-конференции молодых ученых с международным участием «БИОЛОГИЯ – НАУКА XXI ВЕКА»
, место издания
ФИЦ ПНЦБИ РАН г. Пущино Московской области
, тезисы, с. 139-140
2019
6S РНК B. japonicum и S. meliloti: сходства и различия
Елкина Д.А.
,
Буренина О.Ю.
,
Кубарева Е.А.
в сборнике
Acta Naturae спецвыпуск
, том 2, тезисы, с. 20-21
2019
Bacterial DNA-mismatch repair endonucleases MutL: structure and interaction with molecular partners
Monakhova M.V.
,
Milakina M.A.
,
Alexeevski A.V.
,
Rao N.D.
,
Oretskaya T.S.
,
Kubareva E.A.
в сборнике
Abstracts of 12th International conference BIOCATALYSIS-2019: Fundamentals and Applications / Editor V. Tishkov - Moscow
, место издания
Innovations and High Technologies MSU Ltd, 2019 Moscow
, тезисы, с. 45
2019
Studying the interaction of nicking endonuclease BspD6I and its variants with DNA
Abrosimova L.A.
,
Perevyazova T.A.
,
Yunusova A.K.
,
Larionova E.E.
,
Andreeva N.A.
,
Kubareva E.A.
в сборнике
Abstracts of 12th International Conference BIOCATALYSIS-2019: fundamentals & applications
, место издания
Innovations and High Technologies MSU Ltd Moscow Moscow
, том 1, тезисы, с. 106-106
2019
АНАЛИЗ РОЛИ ОСТАТКОВ ЦИСТЕИНА В ФУНКЦИОНИРОВАНИИ НИКУЮЩЕЙ ЭНДОНУКЛЕАЗЫ BSPD6I
Абросимова Л.А.
,
Артюх Р.И.
,
Перевязова Т.А.
,
Юнусова А.К.
,
Агаева З.Ф.
,
Ларионова Е.Е.
,
Кубарева Е.А.
в сборнике
Сборник тезисов 23-ой Международной Пущинской школы-конференции молодых ученых "Биология - наука XXI века"
, тезисы, с. 327-327
2019
Взаимодействия между ключевыми белками бактериальных систем репарации ДНК-«мисматчей» и внутримолекулярным параллельным G-квадруплексом в ДНК
Павлова А.В.
,
Монахова М.В.
,
Долинная Н.Г.
,
Савицкая В.Ю.
,
Орецкая Т.С.
,
Кубарева Е.А.
в сборнике
Acta Naturae спецвыпуск
, том 2, тезисы, с. 63-64
2019
Влияние квадруплексных структур ДНК на функционирование системы репарации «мисматчей»
Павлова А.В.
,
Монахова М.В.
,
Абросимова Л.А.
,
Долинная Н.Г.
,
Якубовская М.Г.
,
Орецкая Т.С.
,
Кубарева Е.А.
в сборнике
Успехи молекулярной онкологии
, серия
Материалы V Всероссийской конференции по молекулярной онкологии
, издательство
ООО "Издательский дом "АБВ-пресс"
(Москва)
, том 6, тезисы, с. 84-85
2019
Изучение лабильных комплексов белков MutS И MutL системы репарации «мисматчей» E. coli с ДНК
Монахова М.В.
,
Рязанова А.Ю.
,
Орецкая Т.С.
,
Фридхофф П.
,
Кубарева Е.А.
в сборнике
Acta Naturae спецвыпуск
, том 2, тезисы, с. 24-24
2019
Короткие некодирующие РНК - продукты транскрипции 6S РНК в бактерии Rhodobacter sphaeroides
Елкина Д.А.
,
Буренина О.Ю.
,
Банникова В.А.
,
Транкова Н.А.
,
Лисицкая Л.А.
,
Кульбачинский А.В.
,
Первушин Д.Д.
,
Кубарева Е.А.
в сборнике
Acta Naturae спецвыпуск
, том 2, тезисы, с. 22-22
2019
ХАРАКТЕРИСТИКА 6S РНК ИЗ АЛЬФА-ПРОТЕОБАКТЕРИЙ
Елкина Д.А.
,
Буренина О.Ю.
,
Банникова В.А.
,
Кубарева Е.А.
в сборнике
Сборник тезисов 23-ой Международной Пущинской школы-конференции молодых ученых "Биология - наука XXI века"
, место издания
Пущино
, тезисы, с. 344
2018
6S RNAs under stress conditions in different bacteria
Elkina D.
,
Burenina O.
,
Oretskaya T.
,
Kubareva E.
в сборнике
The 2nd Russia-Japan Joint Forum for Education and Research
, место издания
Москва
, тезисы, с. 68
2018
Construction of DNA-protein conjugates with thermo-switchable enzymatic properties
Абросимова Л.А.
,
Монахова М.В.
,
Кубарева Е.А.
,
Орецкая Т.С.
в сборнике
The 2nd Russia-Japan Joint Forum for Education and Research
, место издания
Москва
, тезисы, с. 86
2018
DNA-protein crosslinking for studying the initial steps of DNA mismatch repair
Monakhova M.V.
,
Friedhoff P.
,
Rao D.N.
,
Oretskaya T.S.
,
Kubareva Е.А.
в сборнике
The 2nd Russia-Japan Joint Forum for Education and Research
, место издания
Москва
, тезисы, с. 32
2018
Investigation of the interactions of BspD6I endonuclease and MutL protein with molecular partners using crosslinking and mass spectrometric approaches
Абросимова Л.А.
,
Ларионова Е.Е.
,
Монахова М.В.
,
Орецкая Т.С.
,
Рао Д.Н.
,
Кубарева Е.А.
в сборнике
The 2nd Russia-Japan Joint Forum for Education and Research
, место издания
Москва
, тезисы, с. 78
2018
Oxidative stress in Escherichia coli: the role of 6S RNA in the regulation of gene expression
Bannikova V.A.
,
Elkina D.A.
,
Kubareva E.A.
,
Burenina O.Y.
в сборнике
The 2nd Russia-Japan Joint Forum for Education and Research
, место издания
Москва
, тезисы, с. 73
2018
The influence of G-quadruplexes in DNA on E. coli mismatch repair proteins functioning
Pavlova A.V.
,
Monakhova M.V.
,
Laptev G.Yu
,
Dolinnaya N.G.
,
Polshakov V.I.
,
Oretskaya T.S.
,
Kubareva E.A.
в сборнике
The 2nd Russia-Japan Joint Forum for Education and Research
, место издания
Москва
, тезисы, с. 75
2017
Conjugation of modified DNA substrates with nicking endonuclease BspD6I. Role of cysteine residues in enzymatic binding and catalysis
Абросимова Л.А.
,
Самсонова А.Р.
,
Кубарева Е.А.
,
Орецкая Т.С.
в сборнике
7th Cambridge Symposium on Nucleic Acids Chemistry and Biology
, место издания
Cambridge, UK
, тезисы, с. 68-68
2017
DNA duplexes containing a disulfide group as an instrument for studying DNA mismatch repair
Monakhova M.V.
,
Friedhoff P.
,
Oretskaya T.S.
,
Kubareva Е.А.
в сборнике
7th Cambridge Symposium on Nucleic Acids Chemistry and Biology
, место издания
Cambridge, UK
, тезисы, с. 120-120
2017
Белки MutS и MutL: изучение механизма начальных этапов репарации "мисматчей" в ДНК методом "кросслинкинга"
Монахова М.В.
,
Фридхофф П.
,
Орецкая Т.С.
,
Кубарева Е.А.
в сборнике
Acta Naturae. СПЕЦВЫПУСК. Международная научная конференция по биоорганической химии "XII чтения памяти академика Юрия Анатольевича Овчинникова" и VIII Российский симпозиум "Белки и пептиды"
, место издания
Перо Москва, ИБХ РАН, 18-22 сентября 2017
, тезисы, с. 42
2016
Белок MutL из системы репарации ДНК-«мисматчей»: взаимодействие с молекулярными партнерами
Монахова М.В.
,
Пенкина А.И.
,
Шилкин Е.С.
,
Павлова А.В.
,
Фридхофф П.
,
Кубарева Е.А.
в сборнике
ACTA NATURAE
, серия
СПЕЦВЫПУСК
, том 2, тезисы, с. 9-9
2016
Влияние неканонических структур ДНК на функционирование системы репарации «мисматчей»
Гавшина А.В.
,
Андреева Н.А.
,
Монахова М.В.
,
Оглоблина А.М.
, Долинная Н.Г.,
Кубарева Е.А.
в сборнике
ACTA NATURAE
, серия
СПЕЦВЫПУСК
, том 2, тезисы, с. 14-14
2016
Малая некодирующая 6S РНК из Rhodobacter sphaeroides
Елкина Д.А.
,
Вебер Л.
,
Буренина О.Ю.
,
Кубарева Е.А.
,
Хартманн Р.
,
Клуг Г.
в сборнике
Acta Naturae
, серия
Спецвыпуск
, том 2, тезисы, с. 25
2016
Малые некодирующие 6S РНК прокариот
Буренина О.Ю.
,
Елкина Д.А.
,
Хартманн Р.К.
,
Орецкая Т.С.
,
Кубарева Е.А.
в сборнике
Научная конференция РНФ «Фундаментальные химические исследования XXI-го века», ИОХ, Россия, 20-24 ноября 2016
, место издания
Москва
, тезисы, с. 335
2016
Регуляция экспрессии генов в прокариотах с помощью малых некодирующих 6S РНК
Буренина О.Ю.
,
Елкина Д.А.
,
Хартманн Р.К.
,
Орецкая Т.С.
,
Кубарева Е.А.
в сборнике
Acta Naturae
, серия
Спецвыпуск
, том 2, тезисы, с. 15
2016
Регуляция экспрессии генов в прокариотах с помощью малых некодирующих 6S РНК
Буренина О.Ю.
,
Елкина Д.А.
,
Хартманн Р.К.
,
Орецкая Т.С.
,
Кубарева Е.А.
в сборнике
Acta Naturae (русскоязычная версия)
, место издания
Парк-медиа М М
, том 2, тезисы, с. 15-15
2016
Функциональная роль малой некодирующей 6S РНК из бактерии Rhodobacter sphaeroides
Елкина Д.А.
,
Вебер Л.
,
Буренина О.Ю.
,
Кубарева Е.А.
в сборнике
Научная конференция РНФ «Фундаментальные химические исследования XXI-го века», ИОХ, Россия, 20-24 ноября 2016
, место издания
Москва
, тезисы, с. 82
2015
6S-1 and 6S-2 RNAs from B. subtilis: from mechanistic research to understanding of their functional roles in vivo
Burenina O.Y.
,
Thoelken C.
,
Logacheva M.D.
,
Elkina D.A.
,
Lechner M.
,
Hartmann R.K.
,
Kubareva E.A.
в сборнике
Abstract Book of Symposium “Enzymes and multienzyme complexes acting on nucleic acids” of the International Research Training Group, September 14-15, 2014, Giessen, Germany
, место издания
Justus-Liebig-University Giessen
, тезисы
2015
Mismatch repair proteins MutS and MutL from Rhodobacter sphaeroides: purification and properties
Monakhova M.
,
Penkina A.
,
Lyashchuk A.
,
Lunin V.
,
Klug G.
,
Friedhoff P.
,
Kubareva E.
в сборнике
Abstract Book of Symposium “Enzymes and multienzyme complexes acting on nucleic acids” of the International Research Training Group, September 14-15, 2014, Giessen, Germany
, место издания
Justus-Liebig-University Giessen
, тезисы, с. 41
2015
Regulation of gene expression by small non-coding 6S-1 and 6S-2 RNAs from Bacillus subtilis
Burenina O.Y.
,
Elkina D.A.
,
Thoelken C.
,
Logacheva M.D.
,
Hartmann R.K.
,
Kubareva E.A.
в сборнике
Proceedings of the 19th International Conference of Young Scientists “Biology – the Science of the XI Century”
, место издания
Москва
, тезисы, с. 222
2015
Хроматографическое выделение функционально активного белка MutS из системы репарации «мисматчей», ковалентно связанного с реакционноспособной ДНК
Монахова М.В.
,
Перевозчикова С.А.
,
Вирясов М.Б.
,
Фридхофф П.
,
Кубарева Е.А.
в сборнике
Тезисы докладов IV Всероссийского симпозиума с международным участием «Кинетика и динамика обменных процессов», 1-8 ноября 2015, Сочи, Россия
, серия
Кинетика и динамика обменных процессов
, издательство
Издательский дом «Граница»
(Москва)
, тезисы, с. 217
2014
6S RNAs in Bacillus subtilis
Elkina D.A.
,
Burenina O.Y.
,
Nesterchuk M.
,
Kubareva E.A.
,
Hoch P.G.
,
Hartmann R.K.
в сборнике
Abstract book of the Workshop "Imaging (biology) down to the single molecule level" of the International Reseach Training Group Giessen/Marburg-Moscow
, место издания
Giessen
, тезисы, с. 41
2014
Bacillus subtilis 6S-1 and 6S-2 RNAs – similar but different
Elkina D.A.
,
Burenina O.Y.
,
Kubareva E.A.
,
Hartmann R.K.
в сборнике
Abstract book of the International Conference of Young Scientists “Biology – the Science of the 21 Century”
, место издания
Москва
, тезисы, с. 21
2014
Functional interdependence of two subunits in heterodimeric restriction endonuclease BspD6I
Abrosimova L.A.
,
Migur A.Yu
,
Artyukh R.I.
,
Zheleznaya L.A.
,
Oretskaya T.S.
,
Kubareva E.A.
в сборнике
Abstract Book of 15th IUBMB-24th FAOBMB-TSBMB International Conference
, место издания
Taipei, Taiwan
, тезисы, с. 151
2013
Comparative functional analyses of 6S-1 and 6S-2 RNAs from Bacillus subtilis
Burenina O.
,
Hoch P.
,
Nesterchuk M.
,
Kubareva E.
, Dontsova O.,
Hartmann R.
в сборнике
Proceedings of the Workshop “Global and mechanistic approaches in nucleic acid biology” of the International Research Training Group Giessen/Marburg-Moscow
, место издания
Giessen
, тезисы, с. 31
2012
Synthesis and properties of modified oligodeoxyribonucleotides containing nucleotide residue with beta-diketogroup at 2'-atom
Nabereznov D.S.
,
Sekerina S.A.
,
Monakhova M.V.
,
Romanova E.A.
,
Kubareva E.A.
,
Oretskaya T.S.
в сборнике
Postgenomic Technology for Biomedicine
, место издания
ФГУП "Издательство СО РАН" г. Новосибирск, Россия
, тезисы, с. 157
2011
Dissecting the differential roles of the two 6S RNAs from Bacillus subtilis
Hartmann R.K.
,
Burenina O.Y.
,
Hoch P.G.
,
Beckmann B.M.
,
Kubareva E.A.
в сборнике
Proceedings of the Progress Report Meeting “Sensory and regulatory RNAs in prokaryotes”
, место издания
Kassel
, тезисы, с. 23
2011
Peculiarities of 6S RNAs from Bacillus subtilis functioning
Kubareva E.A.
,
Burenina O.Y.
,
Hoch P.G.
,
Beckmann B.M.
,
Hartmann R.K.
в сборнике
Abstractbook of The Sixth Cambridge Symposium on Nucleic Acids Chemistry and Biology
, место издания
Сambridge
, тезисы, с. 47
2010
(Cytosine-5)-DNA methyltransferase SsoII interaction with its target DNAs: structural aspects
Ryazanova A.Y.
,
Abrosimova L.A.
,
Burenina O.Y.
,
Kubareva E.A.
в сборнике
6th New England Biolabs Meeting on DNA Restriction and Modification
, место издания
Bremen, Germany
, тезисы, с. 101
2010
Application of surface acoustic method to study the interaction of proteins with nucleic acids
Hianik T.
,
Ryazanova A.Yu
,
Kubareva E.A.
,
Grman I.
,
Lavrova N.V.
,
Ryazanova E.M.
,
Oretskaya T.S.
в сборнике
IV Slovak Biophysical Symposium "Modra-Harmonia"
, место издания
Slovakia
, тезисы, с. 43-44
2010
Investigation of 6S-2 RNA of Bacillus subtilis
Burenina O.Y.
,
Beckmann B.M.
,
Kubareva E.A.
,
Hartmann R.K.
в сборнике
Thesis for the One-site evaluation conference «Enzymes and multienzyme complexes acting on nucleic acids» of the International Research Training Group Giessen/Marburg-Moscow
, место издания
Giessen
, тезисы, с. 58
2010
Investigation of 6S-2 RNA of Bacillus subtilis
Burenina O.Y.
,
Beckmann B.M.
,
Kubareva E.A.
,
Hartmann R.K.
в сборнике
Thesis for the Third GGL (International Giessen Graduate School for the Life Sciences) Conference on Life Sciences Conference on Life Sciences
, место издания
Giessen
, тезисы, с. 125
2009
Investigation of transcription regulation by 6S RNAs from Bacillus subtilis
Burenina O.Y.
,
Beckmann B.M.
,
Kubareva E.A.
,
Hartmann R.K.
в сборнике
Thesis for the Workshop «Enzymes and enzyme complexes acting on nucleic acids» of the International Research Training Group Giessen/Marburg-Moscow
, место издания
Giessen
, тезисы, с. 5
2008
Исследование структуры С5-цитозиновых ДНК-метилтрансфераз SsoII и NlaX в растворе
Рязанова А.Ю.
,
Качалова Г.С.
,
Конарев П.В.
,
Свергун Д.И.
,
Кубарева Е.А.
,
Бартуник Х.Д.
в сборнике
IV съезд Российского общества биохимиков и молекулярных биологов
, место издания
Новосибирск
, тезисы, с. 86-86
2006
Small-angle X-ray scattering studies of the (cytosine-5)-DNA methyltransferase NlaX from Neisseria lactamica
Ryazanova A.
,
Kubareva E.
, Lavrova N.,
Karyagina A.
,
Kachalova G.
,
Konarev P.
,
Svergun D.I.
,
Bartunik H.D.
в сборнике
HASYLAB Annual Report 2006
, серия
Part II
, место издания
Hamburg, Germany
, тезисы, с. 369-370
2003
Mutational analysis and biochemical characterisation of type II restriction endonuclease MboI
Sudina A.E.
,
Pingoud V.
,
Kubareva E.A.
,
Pingoud A.
в сборнике
Conference for young scientists, PhD students and students on molecular biology and genetics, dedicated to the golden jubilee of the double helix of the DNA and 30 anniversary of the Institute of molecular biology and genetics NAS of Ukraine
, место издания
Kyiv, Ukraine
, тезисы, с. 219-219
2003
Probing the protein-DNA interface of the SsoII (cytosine-5)-methyltransferase bound to its own promoter region binding site
Vorob'eva Olga V.
,
Zatsepin Timofei S.
,
Karyagina Anna S.
,
Kubareva Elena A.
в сборнике
Conference for young scientists, PhD students and students on molecular biology and genetics, dedicated to the golden jubilee of the double helix of the DNA and 30 anniversary of the Institute of molecular biology and genetics NAS of Ukraine
, место издания
Kyiv, Ukraine
, тезисы, с. 139-139
2002
Синтез и свойства ДНК-реагентов, ковалентно связывающихся с цистеинсодержащими белками
Борисова О.А.
,
Романенков А.С.
,
Зубин Е.М.
,
Кубарева Е.А.
,
Метелев В.Г.
в сборнике
Материалы III съезда российского биохимического общества
, место издания
Издательство ЗАО "Фармацевтическое издательство Фарос-Плюс Санкт-Петербург, Россия
, тезисы, с. 478-479
2000
Sulfur-containing DNA duplexes as decoys for NF-kB transcription factor
Борисова О.А.
,
Турутин Д.В.
,
Долинная Н.Г.
,
Кубарева Е.А.
,
Метелев В.Г.
в сборнике
Abstract book of International conference: “Trends in nucleic acid chemistry"
, место издания
Moscow
, тезисы, с. 28-28
2000
The determination of methylation site of DNA - methyltransferase NlaX
Walter J.
,
Vorob'eva O.V.
,
Razumihin M.V.
,
Karyagina A.S.
,
Trautner T.
,
Kubareva E.A.
в сборнике
Book of Abstracts of International Conference Biocatalysis–2000: Fundamentals and Applications
, тезисы, с. 111-111
2000
Влияние фталоцианинового комплекса кобальта на ДНК-белковые взаимодействия
Тимченко М.А.
,
Кубарева Е.А.
в сборнике
Материалы школы-конференции "Горизонты физико-химической биологии"
, место издания
Пущино, Россия
, том 1, тезисы, с. 104-104
1997
DNA dumbbells as substrates for studying of restriction-modification and repair enzymes
Kubareva E.
,
Kuznetsova S.
,
Kanevsky I.
в сборнике
FASEB Journal
, место издания
Federation of American Societies for Experimental Biology USA
, том 11, тезисы, с. A1309
1997
Optimization of experimental conditions for analysis and isolation of protein-DNA covalent complexes by HPLC
Kubareva E.A.
,
Kozlov I.A.
,
Timoshik M.S.
,
Viryasov M.V.
,
Baratova L.A.
,
Shabarova Z.A.
в сборнике
Proceedings of International Congress on Analytical Chemistry (Moscow, Russia; June 15-21, 1997)
, место издания
Москва
, тезисы, с. Р50
1995
Inhibition of the NF-kB transcription factor activity via cross-linking to DNA duplex containing a monosubstituted pyrophosphate internucleotide bond
Kubareva E.
,
Fedorova O.
,
Gottikh M.
,
Shabarova Z.
в сборнике
Proceedings of the 7th FAOBMB Congress "Advances in Biochemistry and Molecular Biology"
, место издания
Australian Society for Biochemistry and Molecular Biology Sydney, Australia
, том 27, тезисы, с. POS-2-14
1995
Probing of the molecular mechanism of DNA recognition by uracil-DNA glycosylase from human placenta
Kubareva E.A.
,
Volkov E.M.
,
Oretskaya T.S.
,
Vinogradova N.L.
,
Gromova E.S.
,
Nevinsky G.A.
,
Shabarova Z.A.
в сборнике
Third IUBMB Conference "Molecular recognition"
, место издания
IUBMB Republic of Singapore
, тезисы, с. 155
1994
Restriction endonucleases EcoRII, MvaI and SsoII: mechanism of the interaction with DNA
Gromova E.S.
,
Kubareva E.A.
,
Shabarova Z.A.
в сборнике
Abstracts 16th International Congress of Biochemistry and Molecular Biology
, место издания
New Delhi, India
, том 2, тезисы, с. 121
1991
DNA duplexes with non-nucleotide inserts: interaction with restriction endonucleases
Kubareva E.A.
,
Petrauskene O.V.
,
Karyagina A.S.
,
Nikolskaya I.I.
,
Gromova E.S.
в сборнике
Nucleic Acids Research Symposium Series
, том 24, тезисы, с. 308-308
1991
Study of the mechanism of EcoRII endonuclease activation by synthetic substrates
Gromova E.S.
,
Petrauskene O.V.
,
Kubareva E.A.
в сборнике
Nucleic Acids Research Symposium Series
, том 24, тезисы, с. 217-218
1991
Стимулирование действия эндонуклеазы рестрикции EcoRII с помощью синтетических субстратов
Кубарева Е.А.
,
Пятраускене О.В.
,
Громова Е.С.
в сборнике
Второй Всесоюзный Симпозиум "Теоретические и прикладные аспекты молекулярной биологии", Самарканд
, место издания
Министерство здравоохранения СССР. Всесоюзный научный центр молекулярной диагностики и лечения Москва
, тезисы, с. 111-111
1987
Interaction of the MvaI restriction enzyme with synthetic DNA fragments
Pein C.D.
,
Cech D.
,
Gromova E.S.
, Oretskaya T.S.,
Shabarova Z.A.
,
Kubareva E.A.
в сборнике
Nucleic Acids Research Symposium Series
, том 18, тезисы, с. 225-228
НИРы
26 октября 2021 - 31 декабря 2023
"Анализ микробиомов растений и беспозвоночных животных экстремальных мест обитания с целью разработки штаммов-продуцентов новых метаболитов и ферментов (химический факультет)"
Химический факультет
Руководитель:
Бонч-Осмоловская Е.А.
Ответственные исполнители:
Зверева М.Э.
,
Каменский П.А.
,
Тишков В.И.
Участники НИР:
Александров Ю.Д.
,
Атрошенко Д.Л.
,
Беркович А.К.
,
Биккулова Г.Р.
,
Ворожцова Е.И.
,
Головина Д.И.
,
Зейнетдинова Г.Р.
,
Комарова Е.С.
,
Кубарева Е.А.
,
Кулакова А.М.
,
Малявко А.Н.
,
Марина В.И.
,
Монахова М.В.
,
Мулашкина Т.И.
,
Павлова А.В.
,
Панова Т.В.
,
Паршин П.Д.
,
Поляков И.В.
,
Пометун А.А.
,
Пышкина О.А.
,
Родин В.А.
,
Савин С.С.
,
Савицкая В.Ю.
,
Свеженцева Г.А.
,
Сергеев А.В.
,
Сергеев В.Г.
,
Скворцов Д.А.
,
Трефилов В.С.
,
Федорчук В.В.
,
Федорчук Е.А.
,
Хренова М.Г.
26 апреля 2021 - 31 декабря 2023
Влияние G-квадруплексных структур ДНК на функционирование систем репарации при канцерогенезе на примере промоторной области гена TERT
Химический факультет
Руководитель:
Зверева М.Э.
Ответственные исполнители:
Долинная Н.Г.
,
Кубарева Е.А.
,
Монахова М.В.
Участники НИР:
Алексеевский А.В.
,
Ерошенко Д.А.
,
Монахова М.В.
,
Никифорова (Абросимова) Л.А.
,
Павлова А.В.
,
Панова В.В.
,
Писарев Э.К.
,
Савицкая В.Ю.
22 января 2019 - 31 декабря 2021
Короткие некодирующие РНК - продукты транскрипции 6S РНК прокариот: синтез, свойства, функции
Отдел химии нуклеиновых кислот
Руководитель:
Кубарева Е.А.
Ответственный исполнитель:
Елкина Д.А.
Участники НИР:
Банникова В.А.
,
Буренина О.Ю.
,
Зацепин Т.С.
,
Карпов А.С.
,
Кузьменко Е.О.
,
Ларионова Е.Е.
,
Миропольская Н.А.
,
Никифорова (Абросимова) Л.А.
,
Петушков И.В.
,
Романова Е.А.
,
Трефилов В.С.
18 июля 2017 - 31 декабря 2018
Характеристика взаимодействий между белками системы репарации «мисматчей» из бактерии Neisseria gonorrhoeae масс-спектрометрическим анализом ковалентно связанных биомолекул
Отдел химии нуклеиновых кислот
Руководитель:
Кубарева Е.А.
Ответственный исполнитель:
Монахова М.В.
Участники НИР:
Астафурова (Андреева) Н.А.
,
Вирясова Г.М.
,
Зацепин Т.С.
,
Милакина М.А.
,
Никифорова (Абросимова) Л.А.
,
Павлова А.В.
,
Романова Е.А.
,
Рязанова А.Ю.
10 февраля 2016 - 31 декабря 2018
Инициация репарации "мисматчей" белком MutL из альфа-протеобактерии Rhodobacter sphaeroides: факторы, определяющие гидролиз и дискриминацию цепей ДНК
Отдел химии нуклеиновых кислот
Руководитель:
Кубарева Е.А.
Ответственный исполнитель:
Романова Е.А.
Участники НИР:
Астафурова (Андреева) Н.А.
,
Буренина О.Ю.
,
Гавшина А.В.
,
Долинная Н.Г.
,
Елкина Д.А.
,
Кузнецов Н.А.
,
Кучеренко В.В.
,
Монахова М.В.
,
Никифорова (Абросимова) Л.А.
,
Павлова А.В.
9 октября 2014 - 31 декабря 2018
Некодирующие РНК: изучение механизмов функционирования и поиск потенциальных мишеней для терапии
Кафедра химии природных соединений
Руководитель:
Орецкая Т.С.
Ответственные исполнители:
Готтих М.Б.
,
Кубарева Е.А.
Участники НИР:
Богданов А.А.
,
Кубарева Е.А.
,
Остерман И.А.
,
Рубцова М.П.
3 июня 2014 - 31 декабря 2015
Особенности взаимодействия уникального инструмента геномной инженерии - никующей эндонуклеазы BspD6I - с ДНК; направленная модуляция гидролитической функции
Отдел химии нуклеиновых кислот
Руководитель:
Кубарева Е.А.
Участники НИР:
Гавшина А.В.
,
Никифорова (Абросимова) Л.А.
28 марта 2013 - 31 декабря 2015
Молекулярный механизм репарации неканонических пар нуклеотидов: структурно-функциональная характеристика комплексов с участием белка MutL и поиск подходов к регулированию его активности
Отдел химии нуклеиновых кислот
Руководитель:
Кубарева Е.А.
Ответственный исполнитель:
Монахова М.В.
Участники НИР:
Долинная Н.Г.
,
Зацепин Т.С.
,
Монахова М.В.
,
Никифорова (Абросимова) Л.А.
,
Романова Е.А.
,
Рязанова А.Ю.
1 января 2013 - 31 декабря 2025
Создание нового класса регуляторов активности белков нуклеинового обмена – потенциальных биомедицинских препаратов на основе модифицированных нуклеиновых кислот
Научно-исследовательский институт физико-химической биологии имени А.Н.Белозерского
Руководители:
Готтих М.Б.
,
Орецкая Т.С.
Ответственный исполнитель:
Романова Е.А.
Участники НИР:
Быкова Н.И.
,
Гавшина А.В.
,
Готтих М.Б.
,
Друца В.Л.
,
Елкина Д.А.
,
Королев С.П.
,
Кубарева Е.А.
,
Мальцева Л.В.
,
Монахова М.В.
,
Недюхина Я.В.
,
Орецкая Т.С.
,
Романова Е.А.
,
Рязанова А.Ю.
1 января 2012 - 31 декабря 2014
Ковалентная региоселективная фиксация белок-белковых и белково-нуклеиновых комплексов, образующихся на стадиях узнавания и функционирования супрамолекулярных ассоциатов
Кафедра химии природных соединений
Руководитель:
Орецкая Т.С.
Участники НИР:
Буренина О.Ю.
,
Волков Е.М.
,
Долинная Н.Г.
,
Зацепин Т.С.
,
Кубарева Е.А.
,
Никифорова (Абросимова) Л.А.
,
Романова Е.А.
Патенты
1993
Способ получения рестриктазы SsoII
Авторы:
Никольская -Санович И.И.
,
Упорова Т.М.
,
Громова Е.С.
,
Левченко И.Я.
,
Арутюнян Е.Е.
,
Грубер И.М.
,
Кубарева Е.А.
#SU1822877 A1, 23 июня
Награды и премии
2022
"В ознаменование столетия образования СССР"
Лауреат:
Кубарева Е.А.
Коммунистическая партия Российской Федерации. Центральный комитет, Россия
2022
Премия по Программе развития МГУ
Лауреат:
Кубарева Елена Александровна
МГУ, Россия
2021
Премия по Программе развития МГУ
Лауреат:
Кубарева Е.А.
Московский государственный университет имени М.В. Ломоносова, Россия
2020
Премия по Программе развития МГУ
Лауреат:
Кубарева Е.А.
МГУ, Россия
2020
Лучшая публикация 2019 года
Лауреаты:
Абросимова Л.А.
,
Кисиль О.В.
,
Романова Е.А.
,
Орецкая Т.С.
,
Кубарева Е.А.
Журнал "Биоорганическая химия", Россия
2019
Диплом II степени по результатам конкурса на лучшие публикации 2018 года
Лауреаты:
Перевязова Т.А.
,
Юнусова А.К.
,
Артюх Р.И.
,
Вирясов М.Б.
,
Кубарева Е.А.
,
Железная Л.А.
Журнал "Биоорганическая химия", Россия
2006
Ветеран труда
Лауреат:
Кубарева Е.А.
Управление социальной защиты населения района Щукино г. Москвы, Северо-Западный административный округ, Россия
2006
Грант поддержки талантливых студентов, аспирантов и молодых ученых МГУ
Лауреат:
Кубарева Е.А.
Московский государственный университет имени М.В. Ломоносова, Россия
2005
Благодарность Ректора
Лауреат:
Кубарева Е.А.
Московский государственный университет имени М.В. Ломоносова, Россия
1997
В память 850-летия Москвы
Лауреат:
Кубарева Е.А.
1994
Премия Европейской Академии для молодых российских ученых
Лауреат:
Кубарева Е.А.
Европейская Академия, Россия
Участие в программных комитетах конференций
25 сентября 2020
The 4th Russia-Japan Joint Forum for Education and Research
Член программного комитета
Видеоконференция, Япония
24-25 сентября 2018
The 2nd Russia-Japan Joint Forum for Education and Research
Член организационного комитета
Москва, Россия
2013
Workshop "Global and mechanistic approaches in nucleic acid biology" of International Research Training Group
Член программного комитета
Saint Petersburg, Russia, Россия
2009
Minisymposium of the International Research Training Group Gießen/Marburg-Moscow (DFG/RFBR-funded)
Председатель программного комитета
г. Москва, Россия, Россия
2007
Workshop "Protein-nucleic acid interactions"
Член программного комитета
г. Суздаль, Россия, Россия
2000
International conference "Trends in nucleic acid chemistry"
Член программного комитета
г. Москва, Россия, Россия
Членство в диссертационных советах
с 14 апреля 2017
МГУ.014.2, МГУ имени М.В. Ломоносова, Химический факультет
1.4.9 - Биоорганическая химия (хим. науки)
Действующие члены совета:
Донцова О.А.
,
Зверева М.Э.
,
Копылов А.М.
,
Агапкина Ю.Ю.
,
Байков А.А.
,
Богданов А.А.
,
Габибов А.Г.
,
Готтих М.Б.
,
Громова Е.С.
,
Деев С.М.
,
Кочетков С.Н.
,
Кубарева Е.А.
,
Миронов А.А.
,
Орецкая Т.С.
,
Рубцова М.П.
,
Сергиев П.В.
,
Тишков В.И.
,
Цетлин В.И.
,
Шатский И.Н.
25 июня 2013 - 31 августа 2017
Д 501.001.41, МГУ имени М.В. Ломоносова, Химический факультет
Руководство диссертациями
2017
Гетеродимерная эндонуклеаза рестрикции BspD6I и конъюгаты гомодимерной эндонуклеазы рестрикции SsoII с олигодезоксирибонуклеотидами: особенности взаимодействия с ДНК
Кандидатская диссертация по специальности 02.00.10 - Биоорганическая химия (хим. науки)
Автор:
Абросимова Л.А.
, к.х.н., МГУ имени М.В. Ломоносова
Научный руководитель:
Кубарева Е.А.
, д.х.н., проф., МГУ имени М.В. Ломоносова
Защищена в совете
Д 501.001.41
при МГУ имени М.В. Ломоносова, Химический факультет
2014
Малые некодирующие 6S-1 и 6S-2 РНК из Bacillus subtilis: сравнительный анализ свойств и функций
Кандидатская диссертация по специальности 02.00.10 - Биоорганическая химия (хим. науки)
Автор:
Буренина О.Ю.
, к.х.н., МГУ имени М.В. Ломоносова
Научный руководитель:
Кубарева Е.А.
, д.х.н., проф., МГУ имени М.В. Ломоносова
Защищена в совете
Д 501.001.41
при МГУ имени М.В. Ломоносова, Химический факультет
2013
Характеристика начальных этапов функционирования системы репарации ДНК-«мисматчей» Escherichia coli с использованием модифицированных ДНК
Кандидатская диссертация по специальности 02.00.10 - Биоорганическая химия (хим. науки)
Автор:
Перевозчикова С.А.
Научный руководитель:
Кубарева Е.А.
, д.х.н., проф., МГУ имени М.В. Ломоносова
Защищена в совете
Д 501.001.41
при МГУ имени М.В. Ломоносова, Химический факультет
2012
Структурно-функциональная характеристика С5-цитозиновой ДНК-метилтрансферазы SsoII и ее комплексов с ДНК-лигандами
Кандидатская диссертация по специальности 02.00.10 - Биоорганическая химия (хим. науки)
Автор:
Рязанова А.Ю.
, к.х.н.
Научный руководитель:
Кубарева Е.А.
, д.х.н., проф., МГУ имени М.В. Ломоносова
Защищена в совете
Д 501.001.41
при МГУ имени М.В. Ломоносова, Химический факультет
2010
Конструирование эндонуклеаз рестрикции с фоторегулируемой активностью
Кандидатская диссертация по специальности 02.00.10 - Биоорганическая химия (хим. науки)
Автор:
Ле Т.Х.
Научные руководители:
Орецкая Т.С.
, д.х.н., проф., МГУ имени М.В. Ломоносова,
Кубарева Е.А.
, д.х.н., проф., МГУ имени М.В. Ломоносова
Защищена в совете
Д 501.001.41
при МГУ имени М.В. Ломоносова, Химический факультет
2010
Модифицированные ДНК-дуплексы с включениями тимидингликоля, физико-химические свойства и взаимодействие с ДНК-узнающими белками
Кандидатская диссертация по специальности 02.00.10 - Биоорганическая химия (хим. науки)
Автор:
Ян Ф.
Научные руководители:
Кубарева Е.А.
, д.х.н., проф., МГУ имени М.В. Ломоносова,
Орецкая Т.С.
, д.х.н., проф., МГУ имени М.В. Ломоносова
Защищена в совете
Д 501.001.41
при МГУ имени М.В. Ломоносова, Химический факультет
2009
Особенности регуляции генной экспрессии в системе рестрикции-модификации SsoII
Кандидатская диссертация по специальности 02.00.10 - Биоорганическая химия (хим. науки)
Автор:
Федотова Е.А.
Научный руководитель:
Кубарева Е.А.
, д.х.н., проф., МГУ имени М.В. Ломоносова
Защищена в совете
Д 501.001.41
при МГУ имени М.В. Ломоносова, Химический факультет
2006
ДНК-дуплексы, содержашие реакционноспособные группировки в углеводофосфатном остове, как реагенты для аффинной модификации остатков цистеина и лизина белков
Кандидатская диссертация по специальности 02.00.10 - Биоорганическая химия (хим. науки)
Автор:
Романенков А.С.
Научные руководители:
Метелев В.Г.
, д.х.н., МГУ имени М.В. Ломоносова,
Кубарева Е.А.
, д.х.н., проф., МГУ имени М.В. Ломоносова
Защищена в совете
Д 501.001.41
при МГУ имени М.В. Ломоносова, Химический факультет
2004
С5-Цитозиновая ДНК-метилтрансфераза SsoII как бифункциональный белок: изучение взаимодействия с участком метилирования и с промоторной областью генов системы рестрикции-модификации SsoII
Кандидатская диссертация по специальности 02.00.10 - Биоорганическая химия (хим. науки)
Автор:
Воробьева О.В.
Научный руководитель:
Кубарева Е.А.
, д.х.н., проф., МГУ имени М.В. Ломоносова
Защищена в совете
Д 501.001.41
при МГУ имени М.В. Ломоносова, Химический факультет
2004
Эндонуклеазы рестрикции SsoII, PspGI и MboI: изучение свойств и определение ДНК-связывающих мотивов
Кандидатская диссертация по специальности 02.00.10 - Биоорганическая химия (хим. науки)
Автор:
Судьина А.Е.
Научный руководитель:
Кубарева Е.А.
, д.х.н., проф., МГУ имени М.В. Ломоносова
Защищена в совете
Д 501.001.41
при МГУ имени М.В. Ломоносова, Химический факультет
1997
Метилтрансфераза SsoII как регуляторный белок: регуляция в системе рестрикции-модификации SsoII
Кандидатская диссертация по специальности 02.00.10 - Биоорганическая химия (хим. науки)
Автор:
Шилов И.А.
Научный руководитель:
Кубарева Е.А.
, д.х.н., проф., МГУ имени М.В. Ломоносова
Защищена в совете
Д 501.001.41
при МГУ имени М.В. Ломоносова, Химический факультет
1997
Региоспецифичное ковалентное связывание ДНК-дуплексов с субъединицей р50 фактора транскрипции NF-κB
Кандидатская диссертация по специальности 02.00.10 - Биоорганическая химия (хим. науки)
Автор:
Козлов Игорь Александрович
Научный руководитель:
Кубарева Е.А.
, д.х.н., проф., МГУ имени М.В. Ломоносова
Защищена в совете
Д 501.001.41
при МГУ имени М.В. Ломоносова, Химический факультет
Диссертации
2007
Структурно-функциональный анализ ДНК-узнающих белков с помощью синтетических фрагментов ДНК
Докторская диссертация по специальности 02.00.10 - Биоорганическая химия (хим. науки)
Автор:
Кубарева Елена Александровна
, д.х.н., проф., МГУ имени М.В. Ломоносова
Научный консультант:
нет
Защищена в совете
Д 501.001.41
при МГУ имени М.В. Ломоносова, Химический факультет
1988
Эндонуклеазы рестрикции MvaI и EcoRII: элементы механизма узнавания и расщепления синтетических субстратов
Кандидатская диссертация по специальности 02.00.10 - Биоорганическая химия (хим. науки)
Автор:
Кубарева Елена Александровна
, д.х.н., проф., МГУ имени М.В. Ломоносова
Научные руководители:
Шабарова З.А.
,
Громова Е.С.
, д.х.н., проф., МГУ имени М.В. Ломоносова
Защищена в совете
Д 053.05.47
при МГУ имени М.В. Ломоносова
Руководство дипломными работами
2023
Взаимодействие APE1 — фермента системы эксцизионной репарации оснований, с модифицированными фрагментами промотора гена TERT
Научные руководители:
Савицкая В.Ю.
,
Кубарева Е.А.
Автор: Новоселов К.А. (Специалист)
2023
8-Оксогуанин в составе G-богатых мотивов: влияние на структуру ДНК и функционирование гликозилазы OGG1 человека
Научные руководители:
Савицкая В.Ю.
,
Кубарева Е.А.
Автор: Сныга В.Г. (Специалист)
2022
Функциональная роль 6S РНК альфа-протеобактерии Rhodobacter sphaeroides
Научные руководители:
Елкина Д.А.
,
Кубарева Е.А.
Автор: Карпов А.С. (Специалист)
2021
Роль остатков цистеина в функционировании белка MutL из системы репарации «мисматчей» организма Neisseria gonorrhoeae
Научные руководители:
Кубарева Е.А.
,
Монахова М.В.
Автор: Савицкая В.Ю. (Специалист)
2021
Влияние неканонических структур в ДНК на функционирование системы репарации «мисматчей»
Научные руководители:
Кубарева Е.А.
,
Монахова М.В.
Автор: Павлова А.В. (Специалист)
2020
Малые бактериальные некодирующие РНК как антисенс-регуляторы экспрессии генов
Научные руководители:
Первушин Д.Д.
,
Кубарева Е.А.
Автор: Транкова Н.А., (Специалист)
2020
Анализ кинетики взаимодействия никующей эндонуклеазы BspD6I с ДНК
Научные руководители:
Кубарева Е.А.
,
Абросимова Л.А.
Автор: Андреева Н.А. (Специалист)
2019
Влияние факторов окружающей среды на функционирование системы репарации «мисматчей» ДНК в клетках
Научные руководители:
Елкина Д.А.
,
Кубарева Е.А.
Автор: Кузьменко Евгений Олегович (Специалист)
2018
Поиск партнеров хроматин-ассоциированных белков у Drosophila melanogaster
Научные руководители:
Шидловский Ю.В.
,
Кубарева Е.А.
Автор: Трофимов Д.В. (Специалист)
2018
Особенности взаимодействия с ДНК белка MutL системы репарации «мисматчей»
Научные руководители:
Монахова М.В.
,
Кубарева Е.А.
Автор: Милакина М.А. (Специалист)
2018
Окислительный стресс в Escherichia coli: роль 6S РНК в регуляции экспрессии генов
Научные руководители:
Кубарева Е.А.
,
Елкина Д.А.
Автор: Банникова В.А. (Специалист)
2017
Характеристика взаимодействия никующей эндонуклеазы BspD6I и ее мутантных форм с ДНК
Научные руководители:
Кубарева Е.А.
,
Абросимова Л.А.
Автор: Самсонова А.Р. (Специалист)
2017
Новые малые РНК из бактерии Sinorhizobium meliloti
Научные руководители:
Кубарева Е.А.
,
Буренина О.Ю.
Автор: Корепина Ю.О. (Специалист)
2015
Характеристика эндонуклеазной активности белка MutL системы репарации из Rhodobacter sphaeroides
Научные руководители:
Кубарева Е.А.
,
Монахова М.В.
Автор: Пенкина А.И. (Специалист)
2014
Взаимодействие эндонуклеазы рестрикции BspD6I с синтетическими фрагментами ДНК
Научные руководители:
Кубарева Е.А.
,
Абросимова Л.А.
Автор: Мигур А.Ю. (Специалист)
2013
Сравнение функциональной роли 6S-1 и 6S-2 РНК Bacillus subtilis
Научные руководители:
Кубарева Е.А.
,
Буренина О.Ю.
Автор: Елкина Дарья Александровна (Специалист)
2011
Синтез и свойства олигодезоксирибонуклеотидов, содержащих производные азобензола
Научные руководители:
Кубарева Е.А.
,
Никифорова (Абросимова) Л.А.
Автор: Монахова М.В. (Специалист)
2011
Взаимодействие белка MutS системы репарации неканонических пар нуклеотидов с ДНК
Научные руководители:
Кубарева Е.А.
,
Секерина С.А.
Автор: Трикин Р.М. (Специалист)
2010
Изучение структурной организации С5-цитозиновой ДНК-метилтрансферазы SsoII
Научные руководители:
Кубарева Е.А.
,
Рязанова А.Ю.
Автор: Абросимова Л.А. (Специалист)
2009
Характеристика ДНК, содержащих диольную или альдегидную группировку в 2'-положении углеводоного фрагмента
Научные руководители:
Кубарева Е.А.
,
Головин А.В.
Автор: Лукьянов М.М. (Специалист)
2009
Изучение особенностей регуляции в системе рестрикции-модификации Ecl18kI
Научные руководители:
Кубарева Е.А.
,
Федотова Е.А.
Автор: Буренина О.Ю. (Специалист)
2009
Анализ структуры и биологических свойств ДНК-дуплексов, содержащих остаток тимидингликоля
Научные руководители:
Кубарева Е.А.
,
Головин А.В.
Автор: Андреева М.А. (Специалист)
2007
Синтез и изучение свойств ДНК-дуплексов с ковалентно связанными цепями
Научные руководители:
Кубарева Е.А.
,
Зубин Е.М.
Автор: Болаева К.В. (Специалист)
2007
Определение субъединичной структуры ДНК-метилтрансфераз NlaX и SsoII
Научные руководители:
Кубарева Е.А.
,
Бартуник Х.Д.
Автор: Рязанова А.Ю. (Специалист)
2006
Исследование свойств мутантных форм ДНК-метилтрансферазы SsoII
Научный руководитель:
Кубарева Е.А.
Автор: Федотова Е.А. (Специалист)
2005
Анализ ДНК-белковых взаимодействий в комплексах р50 субъединицы фактора транскрипции NF-kB с синтетическими аналогами ДНК
Научные руководители:
Кубарева Е.А.
,
Романенков А.С.
Автор: Бриллиантова А.Н. (Специалист)
2004
Аффинная модификация метилтрансферазы SsoII ДНК-лигандами, содержащими 2'-альдегидную группировку
Научный руководитель:
Кубарева Е.А.
Автор: Ямскова О.В. (Специалист)
2002
ДНК-дуплексы с фосфорилдисульфидной или йодацетамидной группировками как реагенты для аффинной модификации ДНК-узнающих белков
Научные руководители:
Метелев В.Г.
,
Кубарева Е.А.
Автор: Романенков А.С. (Специалист)
2000
Тестирование активности ферментов репарации, рестрикции и модификации
Научный руководитель:
Кубарева Е.А.
Автор: Судьина А.Е. (Специалист)
2000
Закономерности активации фактора транскрипции NF-kappaB в полиморфноядерных лейкоцитах человека
Научные руководители:
Судьина Г.Ф.
,
Кубарева Е.А.
Автор: Турутин Д.В., (Специалист)
1999
Исследование ДНК-белковых взаимодействий в комплексе метилтрансферазы SsoII с промоторной областью системы рестрикции-модификации SsoII
Научный руководитель:
Кубарева Е.А.
Автор: Воробьева О.В. (Специалист)
1998
Особенности взаимодействия нативной и рекомбинантной форм эндонуклеазы рестрикции SsoII с синтетическими аналогами ДНК
Научный руководитель:
Кубарева Е.А.
Автор: Тимошик М.С. (Специалист)
1998
Влияние фталоцианинового комплекса кобальта на ДНК-белковые взаимодействия
Научный руководитель:
Кубарева Е.А.
Автор: Тимченко М.А. (Специалист)
1991
Разработка методов ковалентного присоединения ферментов рестрикции-модификации к субстратам
Научные руководители:
Громова Е.С.
,
Кубарева Е.А.
Автор: Шефлян Г.Я. (Специалист)
1991
Активация эндонуклеазы рестрикции EcoRII метилированными субстратами
Научные руководители:
Громова Е.С.
,
Кубарева Е.А.
,
Пятраускене О.В.
Автор: Бакман Я. (Специалист)
1988
Изучение взаимодействия эндонуклеаз рестрикции EcoRII и MvaI с модифицированными ДНК-дуплексами, содержащими 2'-дезоксиинозин или 6-метил-2'-дезоксиаденозин
Научные руководители:
Громова Е.С.
,
Кубарева Е.А.
Автор: Морозова А.В. (Специалист)
Руководство курсовыми работами
None
Термодинамические параметры моделей промоторной области гена hTERT
Научные руководители:
Монахова М.В.
,
Кубарева Е.А.
Автор: Якушкина Ю.В. (Бакалавр)
2023
Предсказание белок-белковых взаимодействий на примере комплекса белков MutL и бета-зажима из системы репарации "мисматчей" Neisseria gonorrhoeae
Научные руководители:
Савицкая В.Ю.
,
Кубарева Е.А.
Автор: Литвинова А.В. (Бакалавр)
2023
Подавление репарации мисматчей в клетках патогенных видов Neisseria усиливает антигенную вариабельность пилина
Научные руководители:
Савицкая В.Ю.
,
Кубарева Е.А.
Автор: Стрекаловских В.В. (Бакалавр)
2023
Влияние системы эксцизионной репарации оснований на закрепление мутаций в промоторе гена TERT человека
Научные руководители:
Савицкая В.Ю.
,
Кубарева Е.А.
Автор: Песковацкова Е.С. (Бакалавр)
2023
Влияние окислительного повреждения гуанина на структуру параллельных G-квадруплексов
Научные руководители:
Савицкая В.Ю.
,
Кубарева Е.А.
Автор: Коркунова Е.А. (Бакалавр)
2022
Сборка и анализ генома Bacillus sp. D6 на основе данных методов секвенирования нового поколения
Научные руководители:
Кубарева Е.А.
,
Алексеевский А.В.
Автор: Боровикова И.И. (Специалист)
2022
Влияние кверцетина и кемпферола на G-квадруплексы промотора гена HRAS
Научные руководители:
Кубарева Е.А.
,
Зенков Р.Г.
Автор: Беляев Г.Д. (Бакалавр)
2022
Влияние замен Cys на эндонуклеазную активность белка MutL Neisseria gonorrhoeae
Научные руководители:
Кубарева Е.А.
,
Савицкая В.Ю.
Автор: Литвинова А.В. (Бакалавр)
2022
Влияние G-квадруплексной структуры в ДНК на функционирование белка APEX 1 человека
Научный руководитель:
Кубарева Е.А.
Автор: Коркунова Е.А. (Бакалавр)
2021
Сравнительный транскриптомный анализ штаммов Bacillus subtilis без 6S-1 и/или 6S-2 РНК и дикого типа
Научные руководители:
Кубарева Е.А.
,
Григоров А.С.
Автор: Рачкова А.А. (Бакалавр)
2021
Анализ структуры белка MutS из бактерии Rhodobacter sphaeroides
Научный руководитель:
Кубарева Е.А.
Автор: Якушкина Ю.В. (Бакалавр)
2020
Исследование взаимосвязи частоты соматических мутаций в некодирующей части генома человека от потенциала образования G-квадруплексов
Научные руководители:
Зверева М.Э.
,
Кубарева Е.А.
Автор: Тулаева Е.Р. (Бакалавр)
2020
Белок MutS системы репарации "мисматчей" : структура, анализ контактов с ДНК, моделирование взаимодействий с молекулярными партнерами
Научный руководитель:
Кубарева Е.А.
Автор: Косарецкий Е.М. (Бакалавр)
2020
Анализ структурных изменений в гомологах белка MutL системы "мисматч"-репарации, приводящих к возникновению онкологических заболеваний
Научные руководители:
Кубарева Е.А.
,
Зверева М.Э.
Автор: Иванов М.М. (Бакалавр)
2020
Bacillus species D6: филогенез, аннотация генома, анализ систем рестрикции-модификации
Научные руководители:
Алексеевский А.В.
,
Кубарева Е.А.
Автор: Боровикова И.И. (Бакалавр)
2019
Сравнительный анализ трехмерных структур и свойств природной и мутантных форм никующей эндонуклеазы BspD6I из Bacillus species D6
Научные руководители:
Абросимова Л.А.
,
Кубарева Е.А.
Автор: Агаева Зарифа Фарман Кызы (Бакалавр)
2017
Белок MutL из системы репарации ДНК-«мисматчей» бактерии Rhodobacter sphaeroides: структура и функции
Научный руководитель:
Кубарева Е.А.
Автор: Кучеренко В.В. (Бакалавр)
2014
Малые некодирующие 6S-1 и 6S-2 РНК из Bacillus subtilis как ингибиторы транскрипции.
Научные руководители:
Кубарева Е.А.
,
Елкина Д.А.
Автор: Федорова А.Д. (Бакалавр)
2012
Изучение свойств никазы BspD6I и эндонуклеазы рестрикции BspD6I с использованием азобензолсодержащих ДНК-дуплексов
Научные руководители:
Кубарева Е.А.
,
Абросимова Л.А.
Автор: Мигур А.Ю. (Бакалавр)
2011
Физико-химические свойства олигонуклеотидов, содержащих азобензол, и перспективы их использования для фоторегулирования активности белков
Научные руководители:
Кубарева Е.А.
,
Абросимова Л.А.
Автор: Мигур А.Ю. (Бакалавр)
Преподавание учебных курсов
25 октября 2021 - 25 ноября 2021
Практикум по химии природных соединений для студентов 5 курса (осенний семестр)
МГУ имени М.В. Ломоносова
,
Химический факультет
обязательная, по выбору (спецкурс), практические занятия, 6 часов
с 21 декабря 2020
Advanced Research Topics for Life Innovation II
МГУ имени М.В. Ломоносова
,
Научно-исследовательский институт физико-химической биологии имени А.Н.Белозерского
в Токийский технологический институт (государственная организация, университет, Япония)
факультативная, лекции, 2 часов
с 21 октября 2015
Геном человека: страхи и надежды
МГУ имени М.В. Ломоносова
,
Химический факультет
,
Кафедра химии природных соединений
обязательная, по выбору (межфакультетский курс), лекции, 2 часов
1 октября 1995 - 1 декабря 2000
Химические основы генетической инженерии
МГУ имени М.В. Ломоносова
,
Химический факультет
,
Кафедра химии природных соединений
обязательная, по выбору (спецкурс), семинары, 40 часов
7 февраля 1993 - 30 декабря 1993
Органическая химия
МГУ имени М.В. Ломоносова
,
Химический факультет
обязательная, базовой части, семинары, 152 часов
7 февраля 1993 - 30 апреля 1993
Практикум по органической химии
МГУ имени М.В. Ломоносова
,
Химический факультет
обязательная, базовой части, практические занятия, 64 часов
1 марта 1991 - 30 апреля 1994
Экспериментальные методы исследования белков и нуклеиновых кислот. Раздел II. Задачи по выбору
МГУ имени М.В. Ломоносова
,
Химический факультет
,
Кафедра химии природных соединений
обязательная, по выбору (спецкурс), практические занятия, 32 часов
Выступление в СМИ
28 июля 2021 г.
Будущее нашей науки за молодежью. Государство должно осознать это.
(Газета "Щукино")
Автор (участник):
Кубарева Елена Александровна