ИСТИНА

Клепикова Анна Владимировна пользователь

Соавторы: Логачёва М.Д., Пенин А.А., Kasianov A., Герасимов Е.С., Кондрашов А.С., Лазаревич Н.Л., Базыкин Г.А., Кудашкин Н.Е., Макарова А.С., Мюге Н.С., Путляева Л.В., Чесноков М.С., Шавочкина Д.А. показать полностью..., Шварц А.М., Kulakovskiy I.V., Patyutko Y.I., Vorontsov I.E., Дмитриев С.Е., Котельникова Е.А., Купраш Д.В., Науменко С.А., Омельченко Д.О., Сеплярский В.Б., Штратникова В.Ю., Afanasyeva M., Baranova M.A., Besedina E.G., Demin A.V., Demin D.E., Etingova A.E., Fesenko A.N., James T.Y., Kirov I.V., Kondrashov F.A., Kotelnikova E.A., Kremenetskaya O.S., Kudryakova N.V., Nabieva E.R., Novakovsky G.E., Paleeva A.G., Polanovsky O.L., Prokofjeva M., Pyatnitskiy M.A., Safonova Y.Y., Shnayder E.D., Sidorenko S.P., Tatosyan K.A., Vinogradov D., Белоусов П.В., Богданов В.П., Воробьев И.А., Гараева А.А., Глаголева Е.С., Голышев С.А., Горбачева А.М., Данилова М.Н., Демиденко Н.В., Дорошенко А.С., Евстафьева А.Г., Жарикова А.А., Ковалева И.Е., Корнеев К.В., Кременецкая О.С., Кривцова О.М., Кузнецов В.В., Кустова И.Ф., Лашкевич К.А., Леушкин Е.В., Макаренко М.С., Миронов А.А., Мороз Е.А., Набиева Е.Р., Новикова Л.А., Патютко Ю.И., Полуконова А.В., Поташникова Д.М., Пятницкий М.А., Ремизова М.В., Соколов Д.Д., Уварова А.Н., Устюгова А.С., Федотова А.В., Хесина П.А., Хуторненко А.А., Чович М., Чумаков П.М., Шеваль Е.В., Щелкунов М.И., Ямпольский Л.Ю.

20 статей, 13 докладов на конференциях, 1 тезисы доклада, 6 НИР

Количество цитирований статей в журналах по данным Web of Science: 117, Scopus: 391

IstinaResearcherID (IRID): 1767218

Деятельность

• Статьи в журналах

  • 
    • 2023 The genome of the toxic invasive species Heracleum sosnowskyi carries an increased number of genes despite absence of recent whole‐genome duplications
    • Schelkunov Mikhail I., Shtratnikova Viktoria Yu, Klepikova Anna V., Makarenko Maksim S., Omelchenko Denis O., Novikova Lyudmila A., Obukhova Ekaterina N., Bogdanov Viktor P., Penin Aleksey A., Logacheva Maria D.
    • в журнале Plant Journal, издательство Blackwell Publishing Inc. (United Kingdom) DOI
  • • 2021 High-Resolution Transcriptome Atlas and Improved Genome Assembly of Common Buckwheat, Fagopyrum esculentum
    • Penin Aleksey A., Kasianov Artem S., Klepikova Anna V., Kirov Ilya V., Gerasimov Evgeny S., Fesenko Aleksey N., Logacheva Maria D.
    • в журнале Frontiers in plant science, издательство Frontiers Research Foundation (Switzerland), том 12 DOI
  • 
    • 2021 lepidium-like, a naturally occurring mutant of Capsella bursa-pastoris and its implications for the evolution of petal loss in Cruciferae
    • Klepikova Anna, Shnayder Elina D., Kasianov Artem, Remizowa Margarita V., Sokoloff Dmitry D., Penin Aleksey
    • в журнале Frontiers in plant science, издательство Frontiers Research Foundation (Switzerland), том 12 DOI
  • • 2020 Взаиморегуляция сигнальных путей цитокинина и ауксина в контроле естественного старения листьев Arabidopsis thaliana
    • Данилова М.Н., Дорошенко А.С., Кудрякова Н.В., Клепикова А.В., Штратникова В.Ю., Кузнецов В.В.
    • в журнале Физиология растений, издательство ФГБУ "Издательство "Наука" (Москва), том 67, № 6, с. 616-624 DOI
  • • 2019 Comparative Analysis of Developmental Transcriptome Maps of Arabidopsis thaliana and Solanum lycopersicum
    • Penin Aleksey, Klepikova Anna, Kasianov Artem, Gerasimov Evgeny, Logacheva Maria
    • в журнале Genes, издательство MDPI (Basel, Switzerland), том 10, № 1 DOI
  • 
    • 2019 Constitutive Expression of NRAS with Q61R Driver Mutation Activates Processes of Epithelial–Mesenchymal Transition and Leads to Substantial Transcriptome Change of Nthy-ori 3–1 Thyroid Epithelial Cells
    • Demin D.E., Afanasyeva M.A., Uvarova A.N., Prokofjeva M.M., Gorbachova A.M., Ustiugova A.S., Klepikova A.V., Putlyaeva L.V., Tatosyan K.A., Belousov P.V., Schwartz A.M.
    • в журнале Biochemistry (Moscow), издательство Pleiades Publishing, Ltd (Road Town, United Kingdom), том 84, № 4, с. 416-425
  • 
    • 2018 FACS isolation of viable cells in different cell cycle stages from asynchronous culture for RNA sequencing
    • Potashnikova DM, Golyshev SA, Penin AA, Logacheva MD, Klepikova AV, Zharikova AA, Mironov AA, Sheval EV, Vorobjev IA
    • в журнале Methods in molecular biology (Clifton, N.J.), издательство Humana Press, Inc. (United States), том 1745, с. 315-335 DOI
  • 
    • 2017 Effect of method of deduplication on estimation of differential gene expression using RNA-seq
    • Klepikova Anna V., Kasianov Artem S., Chesnokov Mikhail S., Lazarevich Natalia L., Penin Aleksey A., Logacheva Maria
    • в журнале PeerJ, издательство PeerJ (San Francisco), том 5, с. e3091 DOI
  • 
    • 2017 High quality genome assembly of Capsella bursa-pastoris reveals asymmetry of regulatory elements at early stages of polyploid genome evolution
    • Kasianov Artem S., Klepikova Anna V., Kulakovskiy Ivan V., Gerasimov Evgeny S., Fedotova Anna V., Besedina Elizaveta G., Kondrashov Alexey S., Logacheva Maria D., Penin Aleksey A.
    • в журнале Plant Journal, издательство Blackwell Publishing Inc. (United Kingdom), с. n/a-n/a DOI
  • 
    • 2017 The Minor Variant of the Single-Nucleotide Polymorphism rs3753381 Affects the Activity of a SLAMF1 Enhancer
    • Putlyaeva L.V., Schwartz A.M., Klepikova A.V., Vorontsov I.E., Kulakovskiy I.V., Kuprash D.V.
    • в журнале Acta Naturae (англоязычная версия), издательство Park Media Ltd (Moscow, Russia (Federation)), том 9, № 3, с. 94-102
  • • 2017 Transcriptome-based phylogeny of endemic Lake Baikal amphipod species flock: fast speciation accompanied by frequent episodes of positive selection
    • Naumenko S.A., Logacheva M.D., Popova N.V., Klepikova A.V., Penin A.A., Bazykin G.A., Etingova A.E., Mugue N.S., Kondrashov A.S., Yampolsky L.Y.
    • в журнале Molecular Ecology, издательство Blackwell Publishing Inc. (United Kingdom) DOI
  • 
    • 2016 A High Resolution Map of the Arabidopsis thaliana Developmental Transcriptome Based on RNA-seq Profiling
    • Klepikova Anna V., Kasianov Artem S., Gerasimov Evgeny S., Logacheva Maria D., Penin Aleksey A.
    • в журнале Plant Journal, издательство Blackwell Publishing Inc. (United Kingdom), с. n/a-n/a DOI
  • 
    • 2016 Early B-cell factor 1 (EBF1) is critical for transcriptional control of SLAMF1 gene in human B cells
    • Schwartz A.M., Putlyaeva L.V., Covich M., Klepikova A.V., Akulich K.A., Vorontsov I.E., Korneev K.V., Dmitriev S.E., Polanovsky O.L., Sidorenko S.P., Kulakovskiy I.V., Kuprash D.V.
    • в журнале Biochimica et Biophysica Acta - Gene Regulatory Mechanisms, издательство Elsevier BV (Netherlands), том 1859, № 10, с. 1259-1268 DOI
  • 
    • 2016 Transcriptome-based identification of PDGFA as a candidate secreted biomarker for hepatocellular carcinoma
    • Chesnokov M.S., Krivtsova O.M., Skovorodnikova P.A., Makarova A.S., Kustova I.F., Logacheva M.D., Penin A.A., Klepikova A.V., Shavochkina D.A., Kudashkin N.E., Moroz E.A., Patyutko Y.I., Kotelnikova E.A., Lazarevich N.L.
    • в журнале Biopolymers and Cell, издательство Naukova Dumka (Ukraine), том 32, № 6, с. 418-432 DOI
  • 
    • 2015 Extraordinary genetic diversity in a wood decay mushroom
    • Baranova Maria A., Logacheva Maria D., Penin Aleksey A., Seplyarskiy Vladimir B., Safonova Yana Y., Naumenko Sergey A., Klepikova Anna V., Gerasimov Evgeniy S., Bazykin Georgii A., James Timothy Y., Kondrashov Alexey S.
    • в журнале Molecular Biology and Evolution, издательство Oxford University Press (United Kingdom), том 32, № 10, с. 2775-2783 DOI
  • 
    • 2015 NGS-based identification of druggable alterations and signaling pathways - hepatocellular carcinoma case report
    • Kotelnikova E.A., Logacheva M.D., Nabieva E.R., Pyatnitskiy M.A., Vinogradov D.V., Makarova A.S., Demin A.V., Paleeva A.G., Kremenetskaya O.S., Penin A.A., Klepikova A.V., Kasianov A.S., Shavochkina D.A., Kudashkin N.E., Patyutko Yu I., Mugue N.S., Kondrashov A.S., Lazarevich N.L.
    • в журнале Biopolymers and Cell, издательство Naukova Dumka (Ukraine), том 31, № 6, с. 436-445 DOI
  • 
    • 2015 RNA-seq analysis of an apical meristem time series reveals a critical point in Arabidopsis thaliana flower initiation
    • Klepikova Anna V., Logacheva Maria D., Dmitriev Sergey E., Penin Aleksey A.
    • в журнале BMC Genomics, издательство BioMed Central (London), том 16, № 466, с. 1-15 DOI
  • • 2015 Комплексный анализ молекулярных нарушений при патогенезе гепатоцеллюлярной карциномы методами экзомного и транскриптомного секвенирования
    • Лазаревич Н.Л., Логачева М.Д., Набиева Е.Р., Пятницкий М.А., Виноградов Д.В., Макарова А.С., Кременецкая О.С., Клепикова А.В., Шавочкина Д.А., Чесноков М.С., Полуконова А.В., Кудашкин Н.Е., Мороз Е.А., Герасимов Е.С., Патютко Ю.И., Пенин А.А., Базыкин Г.А., Кондрашов А.С., Мюге Н.С., Котельникова Е.А.
    • в журнале Молекулярная биология, № 5, с. 857-858
  • 
    • 2014 A sustained deficiency of mitochondrial respiratory complex III induces an apoptotic cell death through the p53-mediated inhibition of pro-survival activities of the Activating Transcription Factor 4
    • Evstafieva A.G., Garaeva A.A., Khutornenko A.A., Klepikova A.V., Logacheva M.D., Penin A.A., Novakovsky G.E., Kovaleva I.E., Chumakov P.M.
    • в журнале Cell death & disease, издательство Nature Pub. Group (United Kingdom), том 5 DOI
  • • 2014 Crossing-over in a hypervariable species preferentially occurs in regions of high local similarity
    • Seplyarskiy Vladimir B., Logacheva Maria D., Penin Aleksey A., Baranova Maria A., Leushkin Evgeny V., Demidenko Natalia V., Klepikova Anna V., Kondrashov Fyodor A., Kondrashov Alexey S., James Timothy Y.
    • в журнале Molecular Biology and Evolution, издательство Oxford University Press (United Kingdom) DOI

• Доклады на конференциях

  • • 2023 Agrobacterium-mediated transformation of non-model plants Fagopyrum esculentum and Capsella bursa-pastoris (Стендовый)
    • Авторы: Omelchenko D.O., Batyreva A.M., Glagoleva E.S., Klepikova A.V., Logacheva M.D., Penin A.A.
    • VII International scientific conference “PLANT GENETICS, GENOMICS, BIOINFORMATICS AND BIOTECHNOLOGY” PlantGen 2023, г. Казань, Спартаковская ул. 2, IT-Park, Россия, 11-15 июля 2023
  • • 2019 Влияние белка Tat вируса иммунодефицита человека (HIV-1) на клеточные процессы в B-лимфоцитах (Стендовый)
    • Авторы: Валяева А.А., Жарикова А.А., Пенин А.А., Клепикова А.В., Шеваль Е.В., Миронов А.А.
    • Информационные технологии и системы (ИТиС'19), Пермь, Демидково, Россия, 17-22 сентября 2019
  • • 2018 Влияние белка Tat вируса иммунодефицита человека на экспрессию генов в B-лимфобластах (Стендовый)
    • Авторы: Валяева А.А., Жарикова А.А., Пенин А.А., Клепикова А.В., Шеваль Е.В., Миронов А.А.
    • Информационные технологии и системы (ИТиС'18), Казань, Россия, 25-29 сентября 2018
  • • 2017 Влияние длительного космического полета на экспрессию генов в сердечной мышце мышей (Стендовый)
    • Авторы: Валяева Анна, Жарикова Анастасия, Пенин Алексей, Логачева Мария, Клепикова Анна, Миронов Андрей, Гусев Олег
    • ИТиС'17, Уфа, Россия, 14-18 сентября 2017
  • • 2016 Rhopalocnemis Phalloides - a Plant Without a Plastid Genome (Стендовый)
    • Авторы: Mikhail Schelkunov, Anna Klepikova, Maxim Nuraliev, Maria Logacheva
    • «Информационные технологии и системы 2016», 40-я междисциплинарная школа-конференция , Репино, Санкт-Петербург, Россия, 25-30 сентября 2016
  • • 2015 Идентификация потенциальных маркеров и эффекторов гепатоканцерогенеза по результатам транскриптомного секвенирования. (Стендовый)
    • Авторы: Сковородникова П.А., Чесноков М.С., Кустова И.Ф., Шавочкина Д.А., Логачева М.Д., Пенин А.А., Клепикова А.В., Кудашкин Н.Е., Патютко Ю.И., Лазаревич Н.Л.
    • Конференция «Молекулярная онкология: итоги и перспективы», Москва, 16-17 декабря 2015 г., Москва, Россия, 16-17 декабря 2015
  • • 2015 RNA-seq gene expression analysis of Arabidopsis thaliana apical meristem time series during flower initiation (Стендовый)
    • Авторы: Клепикова А.В., Логачева М.Д., Дмитриев С.Е., Пенин А.А.
    • The 26th International Conference on Arabidopsis Research, Париж, Франция, 5-9 июля 2015
  • • 2014 Анализ экспрессии генов в системах со сложной морфологической структурой
    • Автор: Пенин А.А., Логачёва М.Д., Клепикова А.В.
    • VI СЪЕЗД ВАВИЛОВСКОГО ОБЩЕСТВА ГЕНЕТИКОВ И СЕЛЕКЦИОНЕРОВ (ВОГиС) И АССОЦИИРОВАННЫЕ ГЕНЕТИЧЕСКИЕ СИМПОЗИУМЫ , г. РОСТОВ-НА-ДОНУ, 15-20 июня 2014
  • • 2014 ИДЕНТИФИКАЦИЯ НОВОГО АЛЛЕЛЯ ГЕНА DNA TOPOISOMERASE I ALPHA (TOP1) ARABIDOPSIS THALIANA И АНАЛИЗ ФУНКЦИИ ЭТОГО ГЕНА С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ МЕТОДА RNA-SEQ
    • Авторы: Альберт Е.В., Клепикова А.В., Пенин А.А., Ежова Т.А., Логачева М.Д., Демиденко Н.В.
    • VI СЪЕЗД ВАВИЛОВСКОГО ОБЩЕСТВА ГЕНЕТИКОВ И СЕЛЕКЦИОНЕРОВ (ВОГиС) И АССОЦИИРОВАННЫЕ ГЕНЕТИЧЕСКИЕ СИМПОЗИУМЫ , г. РОСТОВ-НА-ДОНУ, 15-20 июня 2014
  • • 2013 Large scale gene expression analysis in ABC model homeotic mutants
    • Автор: Пенин А.А., Логачёва М.Д., Клепикова А.В.
    • The 24th International Conference on Arabidopsis Research (ICAR), Сидней, Австралия, Австралия, 2013
  • • 2012 THE GENETIC FUNCTION OF ARABIDOPSIS THALIANA GENE LEL
    • Автор: Клепикова А.В., Пенин А.А., Логачёва М.Д.
    • The 23rd International Conference on Arabidopsis Research (ICAR), Австрия, Вена, Австрия, 2012
  • • 2012 The interspecific comparison of expression level of genes in different species from Brassicaceae
    • Автор: Клепикова А.В., Пенин А.А., Логачёва М.Д.
    • Congress of the European Society for Evolutionary Developmental BIology, Португалия, Лиссабон, Португалия, 2012
  • • 2012 THE LARGE-SCALE ANALYSIS OF ARABIDOPSIS THALIANA MUTANT LEL USING RNA-SEQ
    • Автор: Клепикова А.В., Пенин А.А., Логачёва М.Д.
    • Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology — BGRS\SB-2012, Россия, Новосибирск, Россия, 25-29 июня 2012

• Тезисы докладов

  • • 2023 Agrobacterium-mediated transformation of non-model plants Fagopyrum esculentum and Capsella bursa-pastoris
    • Omelchenko D.O., Batyreva A.M., Glagoleva E.S., Klepikova A.V., Logacheva M.D., Penin A.A.
    • в сборнике Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics, and Biotechnology (PlantGen2023): abstracts / Eds. A.A. Kalachev., T.A. Gorhkova, M.L. Ponomareva; FIC KazSC RAS, место издания FEN Kazan Kazan, Russia, тезисы, с. 289-289

• НИРы

  • • 1 января 2019 - 31 декабря 2021 Изучение морфологических и генетических основ реверсий у цветковых растений на примере изменения типа листа в роде Curio
    • Кафедра высших растений
    • Руководитель: Тимонин А.К. Ответственный исполнитель: Пенин А.А. Участники НИР: Клепикова А.В., Ремизова М.В., Федотов А.П., Чукавин Н.Н.
  • • 4 октября 2018 - 1 марта 2022 Создание интегрированной системы для межвидового сравнения экспрессии генов у цветковых растений.
    • Кафедра генетики
    • Руководитель: Пенин А.А. Участники НИР: Герасимов Е.С., Касьянов А.С., Клепикова А.В., Логачёва М.Д., Федотова А.В., Шнайдер Э.Д., Щелкунов М.И.
  • • 25 августа 2014 - 31 декабря 2016 Выявление перспективных молекулярных мишеней для терапии гепатоцеллюлярной карциномы на основе системно-биологического анализа транскриптомных данных, полученных методом NGS.
    • Научно-исследовательский институт физико-химической биологии имени А.Н.Белозерского
    • Руководитель: Кондрашов А.С. Участники НИР: Базыкин Г.А., Герасимов Е.С., Клепикова А.В., Лазаревич Н.Л., Логачёва М.Д., Мюге Н.С., Пенин А.А.
  • • 1 июня 2013 - 31 октября 2013 «Организации и проведению экспедиции по сбору биологического материала для исследований по изучению молекулярно-генетических и популяционно-генетических механизмов обеспечивающих эволюционные преобразования растительных природных популяций в экстремальных условиях обитания»
    • Кафедра генетики
    • Руководитель: Куприянова Е.В. Участники НИР: Демиденко Н.В., Клепикова А.В., Курбидаева А.С., Федоренко О.М.
  • • 9 июня 2010 - 30 ноября 2011 Структурно-функциональный анализ геномов и генных сетей у растений и цианобактерий
    • Кафедра генетики
    • Руководитель: Шестаков С.В. Участники НИР: Альберт Е.В., Гостимский С.А., Демиденко Н.В., Карбышева Е.А., Клепикова А.В., Коробан Н.В., Куприянова Е.В., Курбидаева А.С., Пенин А.А., Синюшин А.А.
  • • 31 мая 2010 - 20 декабря 2012 Структура и эволюция геномов органелл в свете филогенетических отношений животных и растений
    • Научно-исследовательский институт физико-химической биологии имени А.Н.Белозерского
    • Руководитель: Вальехо-Роман К.М. Участники НИР: Алёшин В.В., Клепикова А.В., Логачёва М.Д., Михайлов К.В., Никитин М.А., Самигуллин Т.Х.