ИСТИНА

Балдин Семён Михайлович пользователь

МГУ имени М.В. Ломоносова, Научно-исследовательский институт физико-химической биологии имени А.Н.Белозерского, Отдел биокинетики, Лаборатория ферментативных модификаций физиологически активных соединений, ведущий специалист (инженер, геолог, геофизик, программист, технолог и т.п.), с 1 июня 2015

МГУ имени М.В. Ломоносова, Научно-исследовательский вычислительный центр, 4.07.Лаборатория информатики, младший научный сотрудник, с 1 апреля 2021, по совместительству

Прежние места работы (Нажмите для отображения)

Соавторы: Швядас В.К., Щербакова Т.А., Гущина И.В., Нилов Д.К., Misiura N.M., Shumkov M., Кирилин Е.М., Мисюра Н.М., Панин Н.В., Суплатов Д.А., Щеголев В.О.

7 статей, 6 докладов на конференциях, 2 тезисов докладов, 10 НИР, 2 патента, 2 дипломные работы, 1 курсовая работа

Количество цитирований статей в журналах по данным Web of Science: 3, Scopus: 6

IstinaResearcherID (IRID): 34360809

Деятельность

---

• Статьи в журналах

  • • 2022 Computational Alchemy Using Accelerated GPU Calculations: Fine Structural Tuning Inhibitors of L,D-transpeptidase 2 from Mycobacterium tuberculosis
    • Baldin S.M., Shegolev V.O., Svedas V.K.
    • в журнале Supercomputing Frontiers and Innovations, том 9, № 3, с. 72-86 DOI
  • • 2022 Isolation and biochemical characterization of recombinant transketolase from Mycobacterium tuberculosis
    • Shcherbakova T.A., Baldin S.M., Shumkov M.S., Gushchina I.V., Nilov D.K., Švedas V.K.
    • в журнале Acta Naturae (англоязычная версия), издательство Park Media Ltd (Moscow, Russia (Federation)), том 14, № 2, с. 93-97 DOI
  • • 2022 Выделение и биохимическая характеристика рекомбинантной транскетолазы Mycobacterium tuberculosis
    • Щербакова Т.А., Балдин С.М., Шумков М.С., Гущина И.В., Нилов Д.К., Швядас В.К.
    • в журнале Acta Naturae (русскоязычная версия), издательство Парк-медиа (М.), том 14, № 2, с. 93-97 DOI
  • 
    • 2019 Isolation, Purification and Characterization of L,D-transpeptidase 2 from Mycobacterium tuberculosis
    • Baldin S.M., Shcherbakova T.A., Švedas V.K.
    • в журнале Acta Naturae (англоязычная версия), издательство Park Media Ltd (Moscow, Russia (Federation)), том 11, № 1, с. 23-28 DOI
  • • 2019 Выделение, очистка и характеристика L,D-транспептидазы 2 Mycobacterium tuberculosis
    • Балдин С.М., Щербакова Т.А., Швядас В.К.
    • в журнале Acta Naturae (русскоязычная версия), издательство Парк-медиа (М.), том 11, № 1 (40), с. 23-28
  • 
    • 2017 Building a Full-Atom Model of L,D-transpeptidase 2 from Mycobacterium tuberculosis for Screening New Inhibitors
    • Baldin S.M., Misiura N.M., Svedas V.K.
    • в журнале Acta Naturae (англоязычная версия), издательство Park Media Ltd (Moscow, Russia (Federation)), том 9, № 1, с. 44-51
  • • 2017 Построение полноатомной модели L,D-транспептидазы 2 из Mycobacterium tuberculosis для скрининга новых ингибиторов
    • Балдин С.М., Мисюра Н.М., Швядас В.К.
    • в журнале Acta Naturae (русскоязычная версия), издательство Парк-медиа (М.), том 9, № 1, с. 47-54 DOI

• Доклады на конференциях

  • • 2020 Разработка методов дизайна селективных ингибиторов ферментов на основе биоинформатического анализа суперсемейств и молекулярного моделирования (Устный)
    • Авторы: Швядас В.К., Суплатов Д.А., Нилов Д.К., Балдин С.М., Гущина И.В., Щербакова Т.А., Шмальгаузен Е.В.
    • XXVI Симпозиум «Биоинформатика и компьютерное конструирование лекарств» в рамках XXVII Российского Национального Конгресса «Человек и Лекарство», Научно-исследовательский институт биомедицинской химии имени В.Н. Ореховича, Россия, 6-25 апреля 2020
  • • 2019 Modeling of substrate binding with L,D-transpeptidase 2 from Mycobacterium tuberculosis by advanced metadynamics (Стендовый)
    • Авторы: Baldin S.M., Kirilin E.M., Švedas V.K.
    • 12th International Conference “Biocatalysis: Fundamentals and Applications”, Санкт Петербург, Россия, 24-28 июня 2019
  • • 2018 ПОИСК СЕЛЕКТИВНЫХ ИНГИБИТОРОВ ФЕРМЕНТОВ ПАТОГЕНОВ С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ МЕТОДОВ БИОИНФОРМАТИКИ И МОЛЕКУЛЯРНОГО МОДЕЛИРОВАНИЯ (Устный)
    • Авторы: Швядас В.К., Суплатов Д.А., Нилов Д.К., Шмальгаузен Е.В., Гущина И.В., Щербакова Т.А., Балдин С.М.
    • Международный Форум "Биотехнология: состояние и перспективы развития. Науки о жизни" (BIOTECH WORLD 2018), Москва, Гостиный двор, Ильинка, 4, Россия, 23-25 мая 2018
  • • 2017 Modeling of interactions of L,D - transpeptidase 2 from Mycobacterium tuberculosis with substrate and inhibitors (Устный)
    • Авторы: Член редколлегии Швядас (Svedas В.К., Baldin S.M.
    • Biocatalysis-2017: Fundamentals & applications. June 25-30, 2017, Moscow Region, Russian Federation., Истра, Россия, 25-30 июля 2017
  • • 2017 Modeling of interactions of L,D-transpeptidase 2 from Mycobacterium tuberculosis with substrate and inhibitors (Устный)
    • Авторы: Baldin S.M., Švedas V.K., Misiura N.M.
    • Biocatalysis-2017: Fundamentals & applications. June 25-30, 2017, Moscow Region, Russian Federation., Истра, Россия, 25-30 июля 2017
  • • 2012 Engineered D-amino acid oxidase for medicine diagnostics
    • Авторы: Тишков В.И., Комарова Н.В., Савин С.С., Baldin S.M., Golubev I.V.
    • V International Meeting “Early events in Human Pathologies”, Listvyanka, Baikal, Irkutsk region, Russian Federation, Россия, 2012

• Тезисы докладов

  • • 2019 Modeling of substrate binding with L,D-transpeptidase 2 from Mycobacterium tuberculosis by advanced metadynamics
    • Baldin S.M., Kirilin E.M., Švedas V.K.
    • в сборнике Abstracts of 12th International conference BIOCATALYSIS-2019: Fundamentals and Applications / Editor V. Tishkov - Moscow, место издания Innovations and High Technologies MSU Ltd, 2019 Moscow, тезисы, с. 108
  • • 2017 Использование методов биоинформатики и молекулярного моделирования для поиска путей модуляции функциональных свойств ферментов
    • Суплатов Д.А., Балдин С.М., Панин Н.К., Швядас В.К.
    • в сборнике Acta Naturae. СПЕЦВЫПУСК. Международная научная конференция по биоорганической химии "XII чтения памяти академика Юрия Анатольевича Овчинникова" и VIII Российский симпозиум "Белки и пептиды", место издания Перо Москва, ИБХ РАН, 18-22 сентября 2017, тезисы, с. 121-121

• НИРы

  • • 17 марта 2021 - 31 декабря 2024 Разработка и реализация принципов суперкомпьютерного кодизайна для развития сквозных цифровых технологий и создания высокопроизводительных вычислительных платформ для предсказательного моделирования и применения искусственного интеллекта: от микромира, до живых организмов и Земной системы
    • 4.07.Лаборатория информатики
    • Руководитель: Швядас В.К. Ответственные исполнители: Антонов А.С., Воеводин В.В., Кирилин Е.М. Участники НИР: Балдин С.М., Богомолов В.Ю., Бычкова В.И., Варенцов А.И., Воеводин В.В., Волков Е.В., Дебольский А.В., Добров Б.В., Дробот В.В., Жуматий С.А., Кирилин Е.М., Коннов С.И., Копылов К.Е., Лукашевич Н.В., Лыкосов В.Н., Медведев А.И., Молокоедов В.С., Мортиков Е.В., Нилов Д.К., Подшивалов Д.Д., Попов С.М., Пушкарев С.В., Рубцова Ю.В., Серов В.А., Сидоров И.Ю., Смирнов А.В., Смирнов В.А., Степаненко В.М., Стефанов К.С., Тихомиров М.М., Чернышев Д.И., Чернышев Р.В., Чухарев Ф.С., Шайхисламов Д.И., Шоков В.Н., Яковлев Р.В.
  • • 1 января 2021 - 31 декабря 2025 Разработка программных средств поддержки жизненного цикла и обеспечения эффективности суперкомпьютерных приложений, систем и центров
    • 4.08.Лаборатория параллельных информационных технологий
    • Руководитель: Воеводин В.В. Ответственные исполнители: Антонов А.С., Воеводин В.В., Соболев С.И. Участники НИР: Антонова А.П., Афанасьев И.В., Балдин С.М., Винокуров В.И., Винокуров В.И., Гамаюнова Т.С., Герасимова А.А., Домрачева Д.А., Дробот В.В., Жуматий С.А., Кирилин Е.М., Копылов К.Е., Крымский С.А., Кулагин А.В., Кулагин А.В., Кулагин А.В., Кулагин А.В., Кулагин А.В., Лалетина А.А., Леоненков С.Н., Личманов Д.И., Лутков Г.А., Майер Р.В., Макарова-Землянская Т.Б., Матвеев А.Д., Мещеряков А.О., Мокров К.С., Никитенко Д.А., Нилов Д.К., Паокин А.В., Попов С.М., Разлогова Е.Э., Рощина О.П., Сетяев А.В., Сетяев А.В., Сидоров И.Ю., Степанов Д.А., Стефанов К.С., Тарумова Н.Т., Тимошкин М.А., Тыркалов Е.О., Фатеев И.Д., Худолеева А.А., Шайхисламов Д.И., Швец П.А., Швядас В.К., Шоков В.Н.
  • • 13 ноября 2020 - 31 января 2021 Синтез субстрата омега-амидазы α-кето-глутарамата и кето-аналога селенометионина α-кето-метил-селено-бутирата
    • Научно-исследовательский институт физико-химической биологии имени А.Н.Белозерского
    • Руководитель: Швядас В.К. Ответственный исполнитель: Никулин М.В. Участники НИР: Балдин С.М., Гуранда Д.Ф., Дробот В.В., Панин Н.В., Суплатов Д.А., Успенская Т.В., Щербакова Т.А.
  • • 1 января 2019 - 31 декабря 2025 Поиск регуляторов биологических процессов, воздействующих на белки, ферменты, полиферментные комплексы и рецепторные системы
    • Научно-исследовательский институт физико-химической биологии имени А.Н.Белозерского
    • Руководитель: Швядас В.К. Ответственный исполнитель: Муронец В.И. Участники НИР: Алешин В.А., Артюхов А.В., Астахова А.А., Балдин С.М., Баринова К.В., Буник-Фаренвальд В.И., Вирясов М.Б., Вирясова Г.М., Голенкина Е.А., Гуранда Д.Ф., Дарбинян Т.Г., Дробот В.В., Калмыков П.В., Кирилин Е.М., Кочетов Г.А., Кудрявцева С.С., Кузнеченкова Е.Ю., Курочкина Л.П., Магретова Н.Н., Мельникова А.К., Мичурина В.Н., Никулин М.В., Нилов Д.К., Орлов В.Н., Панин Н.В., Панина (Вавилова) А.М., Пирожкова Е.Б., Позднякова Н.В., Поздышев Д.В., Романов А.В., Севостьянова И.А., Семенюк П.И., Сергеева М.Г., Сидорова Н.Н., Соловьев В.В., Соловьева О.Н., Стройлова Ю.Ю., Судьина Г.Ф., Суплатов Д.А., Успенская Т.В., Чистяков Д.В., Шарапова Я.А., Шмальгаузен Е.В., Щербакова Т.А.
  • • 12 апреля 2018 - 31 декабря 2019 Изучение особенностей структурной организации центров связывания в ферментах патогенов и разработка новых антибиотиков для лечения заболеваний нижних дыхательных путей с использованием системных подходов биоинформатики и молекулярного моделирования
    • Научно-исследовательский институт физико-химической биологии имени А.Н.Белозерского
    • Руководитель: Швядас В.К. Ответственные исполнители: Нилов Д.К., Суплатов Д.А., Щербакова Т.А. Участники НИР: Балдин С.М., Гущина И.В., Дробот В.В., Кирилин Е.М., Шарапова Я.А., Шмальгаузен Е.В.
  • • 1 января 2016 - 31 декабря 2020 Молекулярный дизайн, структурно-функциональный анализ и регуляция ферментных систем, клеточных конструкций, бионаноматериалов: фундаментальные основы и приложения в технологии, медицине, охране окружающей среды
    • Кафедра химической энзимологии
    • Руководитель: Варфоломеев С.Д. Ответственный исполнитель: Осипова Т.А. Участники НИР: Makhlis T.A., Айсина Р.Б., Алексашкин А.Д., Алексеева А.А., Алиев Т.К., Андреев Е.А., Андреева И.П., Асланлы А.Г., Атрошенко Д.Л., Балабушевич Н.Г., Балдин С.М., Белова А.Б., Белогурова Н.Г., Белый Т.С., Биневский П.В., Брагин П.Е., Бруяко М.Г., Будашов И.А., Букатина В.А., Веселов М.М., Власова К.Ю., Володькин Д.В., Вохмянина Д.В., Газарян И.Г., Гайдамака С.Н., Гачок И.В., Гладилин А.К., Гладченко М.А., Грибас А.В., Григоренко В.Г., Гудков Д.А., Гусаков А.В., Дабосс Е.В., Давыдова В.В., Дейко Д.А., Евтушенко Е.Г., Егоров А.М., Еленская Г.Т., Еремеев Н.Л., Еремин С.А., Ефременко Е.Н., Ефремова М.В., Ефремова М.В., Зайцева Е.А., Зарубина С.А., Зарянов Н.В., Зоров И.Н., Кабанов А.В., Казанков Г.М., Каргов И.С., Карякина Е.Е., Киржанова Е.А., Клячко Н.Л., Комкова М.А., Кост О.А., Крюкова О.В., Кудряшова Е.В., Кузнецов И.И., Кузнецов М.А., Кузнечиков И.О., Курзеев С.А., Курочкин И.Н., Курочкина И.М., Ле-Дейген И.М., Левашов А.В., Левашов П.А., Легоцкий С.А., Ломакина Г.Ю., Лопухов А.В., Лягин И.В., Маслова О.В., Матолыгина Д.А., Мерзлов Д.А., Модестова Ю.А., Морозова И.А., Мурыгина В.П., Мухаметова Л.И., Наметкин С.Н., Нестеренко И.С., Никольская И.И., Никулин М.В., Нойманн (Вдовенко) М.М., Осипов А.П., Поболелова Ю.И., Попова В.А., Преснова Г.В., Рожкова А.М., Рубцова М.Ю., Рябоконь А.М., Савин С.С., Сакодынская И.К., Самсонова Ж.В., Сахаров И.Ю., Сенько О.В., Серебренникова К.В., Сиголаева Л.В., Синицын А.П., Синицына О.А., Скиргелло О.Е., Смирнов С.А., Смирнова Д.В., Соловьев И.Д., Степанов Н.А., Суховерков К.В., Тихомирова В.Е., Тишков В.И., Угарова Н.Н., Уляшова М.М., Упоров И.В., Федорчук В.В., Федорчук Е.А., Филатова Л.Ю., Фрунджян В.Г., Чубарь Т.А.
  • • 26 мая 2015 - 15 декабря 2017 Изучение особенностей структурной организации центров связывания в ферментах патогенов и разработка новых антибиотиков для лечения заболеваний нижних дыхательных путей с использованием системных подходов биоинформатики и молекулярного моделирования
    • Научно-исследовательский институт физико-химической биологии имени А.Н.Белозерского
    • Руководитель: Швядас В.К. Участники НИР: Балдин С.М., Кирилин Е.М., Мешалкина Л.Е., Нилов Д.К., Семенюк П.И., Суплатов Д.А., Шарапова Я.А., Шмальгаузен Е.В., Щербакова Т.А.
  • • 1 января 2014 - 31 декабря 2018 Центр биомедицинских исследований, Компонент по инфекционным заболеваниям
    • Отдел биокинетики
    • Руководитель: Швядас В.К. Участники НИР: Балдин С.М., Кирилин Е.М., Мисюра Н.М., Муронец В.И., Никулин М.В., Нилов Д.К., Панин Н.В., Суплатов Д.А., Успенская Т.В., Халиуллин И.Г., Шаповалова И.В., Щербакова Т.А.
  • • 1 января 2014 - 23 декабря 2016 Получение мутантных форм пенициллинацилазы и Д-аминопептидазы с улучшенными каталитическими свойствами при помощи методов компьютерного дизайна и генетической инженерии
    • Факультет биоинженерии и биоинформатики
    • Руководитель: Швядас В.К. Участники НИР: Балдин С.М., Белый Т.С., Мисюра Н.М., Морозова И.А., Никулин М.В., Панин Н.В., Суплатов Д.А., Тажигулов Р.Н., Шаповалова И.В., Щербакова Т.А.
  • • 1 января 2013 - 31 декабря 2018 Управление биологическими процессами путем воздействия низкомолекулярными регуляторами на ферменты, полиферментные комплексы, рецепторные системы и другие супрамолекулярные структуры
    • Научно-исследовательский институт физико-химической биологии имени А.Н.Белозерского
    • Руководитель: Швядас В.К. Участники НИР: Астахова А.А., Балдин С.М., Буник-Фаренвальд В.И., Вирясова Г.М., Голенкина Е.А., Гуранда Д.Ф., Дарбинян Т.Г., Дробот В.В., Загряжская А.Н., Кирилин Е.М., Ливенский А.Д., Никулин М.В., Нилов Д.К., Панин Н.В., Пирожкова Е.Б., Сергеева М.Г., Судьина Г.Ф., Суплатов Д.А., Успенская Т.В., Чистяков Д.В., Щербакова Т.А.

• Патенты

  • • 2019 ПРИМЕНЕНИЕ ФУРАНСУЛЬФОНАТОВ ДЛЯ ИНГИБИРОВАНИЯ ТРАНСКЕТОЛАЗЫ ПАТОГЕНА Mycobacterium tuberculosis
    • Авторы: Нилов Д.К., Гущина И.В., Щербакова Т.А., Балдин С.М., Швядас В.К.
    • #RU2703465, 17 октября
  • • 2014 Мутантная оксидаза D-аминокислот (варианты)
    • Авторы: Тишков В.И., Комарова Н.В., Савин С.С., Савина Л.И., Балдин С.М.
    • #RU 2507262, 20 февраля

• Руководство дипломными работами

  • • 2022 Конструирование ингибиторов L,D-транспептидазы 2 из M. tuberculosis методами молекулярного моделирования
    • Научные руководители: Балдин С.М., Швядас В.К.
    • Автор: Щеголев В. О. (Специалист)
  • • 2021 In silico скрининг библиотеки низкомолекулярных соединений для поиска новых ингибиторов L,D-транспептидазы из M. tuberculosis
    • Научные руководители: Швядас В.К., Балдин С.М.
    • Автор: Марочкин Владислав Геннадьевич (Специалист)

• Руководство курсовыми работами

  • • 2017 Определение свободной энергии связывания фрагмента пептидогликана с L,D-транспептидазой второго типа из M.tubeculosis методом MM/GBSA
    • Научные руководители: Балдин С.М., Швядас В.К.
    • Автор: Татаренцева Анастасия (Специалист)

---