ИСТИНА

Никифоров Андрей Анатольевич пользователь

кандидат биологических наук с 2004 года

Институт цитологии РАН, лаборатория клеточного метаболизма и сигналинга, заведующий лабораторией

Соавторы: Светлова М.П., Барлев Н.А., Соловьева Л.В., Фирсанов Д.В., Kulikova V., Nerinovski K., Shabalin K., Niere M.d., Федорова О.А., Agrimi G.d., Dyrstad S.E., Dölle C., Dölle C.a. показать полностью..., Dölle C.g., Khodorkovskiy M., Khodorkovskiy M.a., Migaud M.E., Nerinovski K.a., Niere M.a., Onopa L., Palmieri F.d., Pettersen I.K., Redpath P.e., Skoge R., Tomilin N.V., Tronstad K.J., VanLinden M.R., Ziegler M.H., Ван Л.М., Иванов В.А., Кузнецова И.М., Ливинcкая В.А., Липинская В.А., Нериновский К.Б., Туроверов К.К., Федорова О.А., Цимоха А.С.

10 статей, 13 докладов на конференциях, 23 тезисов докладов, 1 НИР, 1 диссертация, 4 дипломные работы

Количество цитирований статей в журналах по данным Web of Science: 486, Scopus: 523

IstinaResearcherID (IRID): 51591731

ResearcherID: B-6643-2012

Scopus Author ID: 7202140427

Деятельность

• Статьи в журналах

  • 
    • 2017 Compartment-specific poly-ADP-ribose formation as a biosensor for subcellular NAD pools
    • VanLinden M., Niere M., Nikiforov A., Ziegler M., Doelle C.
    • в журнале Methods in molecular biology (Clifton, N.J.), издательство Humana Press, Inc. (United States), том 1608, с. 45-56 DOI
  • 
    • 2015 Generation, release, and uptake of the NAD precursor nicotinic acid riboside by human cells
    • Kulikova V.a., Shabalin K.a.b, Nerinovski K.a.c, Dölle C.g.h, Niere M.d., Yakimov A.a.b, Redpath P.e., Khodorkovskiy M.a., Migaud M.E.f, Ziegler M.c.d, Nikiforov A.a.g
    • в журнале Journal of Biological Chemistry, издательство American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc. (United States), том 290, № 45, с. 27124-27137 DOI
  • 
    • 2015 Subcellular distribution of NAD+ between cytosol and mitochondria determines the metabolic profile of human cells
    • VanLinden M.R.a, Dölle C.a.g, Pettersen I.K.N.b, Kulikova V.A.c, Niere M.a., Agrimi G.d., Dyrstad S.E.b, Palmieri F.d.e, Nikiforov A.A.c.f, Tronstad K.J.b, Ziegler M.a.
    • в журнале Journal of Biological Chemistry, издательство American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc. (United States), том 290, № 46, с. 27644-27659 DOI
  • 
    • 2015 The human NAD metabolome: Functions, metabolism and compartmentalization
    • Nikiforov A., Kulikova V., Ziegler M.
    • в журнале Critical Reviews in Biochemistry and Molecular Biology, издательство Taylor & Francis (United Kingdom), том 50, № 4, с. 284-297
  • 
    • 2014 Immunoaffinity purification of the functional 20S proteasome from human cells via transient overexpression of specific proteasome subunits
    • Livinskaya V.A.a.b, Barlev N.A.a.c, Nikiforov A.A.a.b
    • в журнале Protein Expression and Purification, издательство Academic Press (United States), том 97, с. 37-43 DOI
  • 
    • 2012 Polyclonal antibodies against human proteasome subunits PSMA3, PSMA5, and PSMB5
    • Livinskaya V.A.a, Ivanov V.A.a, Fedorova O.A.a, Vorontsova D.N.a, Barlev N.A.a.b, Nikiforov A.A.a.c
    • в журнале Hybridoma, издательство Mary Ann Liebert Inc. (United States), том 31, № 4, с. 272-278 DOI
  • 
    • 2011 Pathways and Subcellular Compartmentation of NAD Biosynthesis in Human Cells: FROM ENTRY OF EXTRACELLULAR PRECURSORS TO MITOCHONDRIAL NAD GENERATION
    • Nikiforov A., Dolle C., Niere M., Ziegler M.
    • в журнале Journal of Biological Chemistry, издательство American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc. (United States), том 286, № 24, с. 21767-21778
  • 
    • 2011 Proteomic analysis of the 20S proteasome (PSMA3)-interacting proteins reveals a functional link between the proteasome and mRNA metabolism
    • Fedorova O.A., Moiseeva T.N., Nikiforov A.A., Tsimokha A.S., Livinskaya V.A., Hodson M., Bottrill A., Evteeva I.N., Ermolayeva J.B., Kuznetzova I.M., Turoverov K.K., Eperon I., Barlev N.A.
    • в журнале Biochemical and Biophysical Research Communications, издательство Academic Press (United States), том 416, № 3-4, с. 258-265 DOI
  • 
    • 2004 DNA damage-induced accumulation of Rad18 protein at stalled replication forks in mammalian cells involves upstream protein phosphorylation
    • Nikiforov A., Svetlova M., Solovjeva L., Sasina L., Siino J., Nazarov I., Bradbury M., Tomilin N.
    • в журнале Biochemical and Biophysical Research Communications, издательство Academic Press (United States), том 323, № 3, с. 831-837 DOI

• Статьи в сборниках

  • • 2016 NAD metabolome analysis in cultured human cells using 1H NMR spectroscopy
    • Shabalin Konstantin, Nerinovski Kirill, Yakimov Alexandr, Kulikova Veronika, Khodorkovskiy Mikhail, Ziegler Mathias, Nikiforov Andrey
    • в сборнике Proceedings of The 1st International Electronic Conference on Metabolomics, место издания MDPI

• Доклады на конференциях

  • • 2017 The potential of various extracellular NAD precursors to maintain the synthesis of intracellular NAD in cultivated human cells (Стендовый)
    • Авторы: Maria Svetlova, Ljudmila Solovjeva, Denis Firsanov, Konstantin Shabalin, Kirill Nerinovski, Andrey Nikiforov, Mikhail Khodorkovskiy, Philip Redpath, Migaud Marie E., Mathias Ziegler, Veronika Kulikova
    • 42nd FEBS Congress "From molecules to cells and back", Иерусалим, Израиль, 10-14 сентября 2017
  • • 2017 Cellular uptake and release of NAD precursors (Приглашенный)
    • Автор: Nikiforov A.
    • FASEB SRC “NAD Metabolism & Signaling”. July 9 - 14, 2017, New Orleans, USA. , Новый Орлеан, США, 9-14 июля 2017
  • • 2015 NAD и его ключевые метаболиты: механизмы образования и взаимодействия внутри- и внеклеточных пулов (Устный)
    • Авторы: Куликова В.А., Шабалин К.А., Никифоров А.А., Нериновский К.Б., Циглер М., Якимов А.П.
    • II Всероссийская конференция «Внутриклеточная сигнализация, транспорт, цитоскелет», Санкт-Петербург, Россия, 20-22 октября 2015
  • • 2015 Generation, release and uptake of the NAD precursor nicotinic acid riboside by human cells (Стендовый)
    • Авторы: Nikiforov A., Kulikova V., Shabalin K., Nerinovski K., Dölle C., and Ziegler M., Yakimov A., Redpath P., Khodorkovskiy M., Migaud M., Niere M.
    • FASEB SRC “NAD Metabolism & Signaling”. August 9 - 14, 2015, Timmendorfer Strand, Germany, Timmendorfer Strand, Германия, 9-14 августа 2015
  • • 2014 Generation, release and uptake of the NAD precursor nicotinic acid riboside by human cells (Стендовый)
    • Авторы: Nikiforov A., Livinskaya V., Shabalin K., Ziegler M., Doelle C., Niere M., Khodorkovskiy M., Nerinovski K.
    • FEBS EMBO 2014 Conference, Paris, France, Франция, 30 августа - 4 сентября 2014
  • • 2015 Изучение механизмов образования и взаимодействия внутри- и внеклеточных пулов ключевых NAD-метаболитов (Устный)
    • Авторы: Ливинcкая В.А., Никифоров А.А., Циглер М., Ходорковский М.А.
    • Всероссийский симпозиум по биологии клетки в культуре. 21 – 25 октября 2013 г. Санкт-Петербург, Санкт-Петербург, Россия, 21-25 октября 2013
  • • 2013 Nicotinamide riboside (NR) and nicotinic acid riboside (NAR) homeostasis in humans: potential mechanism of intracellular generation and release from cells (Устный)
    • Авторы: Nikiforov A., Livinskaya V., Ziegler M., Niere M., Khodorkovskiy M., Dölle C.
    • FASEB SRC “NAD Metabolism & Signaling”. July 14 - 19, 2013. Chicago, IL, USA, Chicago, IL, США, 14-19 июля 2013
  • • 2013 Potential role of cytosolic 5′-nucleotidases in human NAD metabolism (Стендовый)
    • Авторы: Livinskaya V., Afanasyeva A., Dolle C., Nikiforov A., Khodorkovskiy M., Ziegler M., Niere M.
    • FEBS Congress 2013 "Mechanisms in Biology". July 6 - 11, 2013. Saint-Petersburg, Russia, Saint-Petersburg, Россия, 6-11 июля 2013
  • • 2010 Механизмы биосинтеза митохондриального НАД в клетках человека (Приглашенный)
    • Авторы: Никифоров А., Циглер М., Ниери М., Долле К.
    • XVI Всероссийский Симпозиум «Структура и функция клеточного ядра», С-Петербург, 5-7 октября 2010
  • • 2010 Pathways and subcellular compartmentation of NAD biosynthesis in human cells (Устный)
    • Автор: Nikiforov A.
    • Scandomit 2010 (Scandinavian Mitochondrial Meeting). January 20-22, 2010. Bergen, Norway, Bergen, Норвегия, 20-22 января 2010
  • • 2009 The biosynthetic routes of cytosolic and mitochondrial NAD pools in cultured human cells (Устный)
    • Авторы: Ziegler M., Nikiforov A.
    • 5th PARP regio meeting. March 26-27, 2009. RWTH, Aachen University Hospital, Aachen, Germany, Aachen , Германия, 26-27 марта 2009
  • • 2008 Biosynthesis of cytosolic and mitochondrial NAD pools in cultured human cells (Устный)
    • Авторы: Nikiforov A., Ziegler M., Niere M.
    • Normit 2008 (Norwegian Mitochondrial Meeting). November 5-7, 2008. Bergen/Glesvær, Norway, Bergen, Норвегия, 5-7 ноября 2008
  • • 2008 The biosynthetic routes of cytosolic and mitochondrial NAD pools in cultured human cells (Стендовый)
    • Авторы: Nikiforov A., Ziegler M., Niere M.
    • NAD2008. September 14-17, 2008. Elsa-Brändström-Haus, Hamburg-Blankenese, Germany, Hamburg, Германия, 14-17 сентября 2008

• Тезисы докладов

  • • 2017 Cellular uptake and release of NAD precursors
    • Kulikova V., Shabalin K., Nerinovski K., Svetlova M., Solovjeva L., Firsanov D., Dölle C., Niere M., VanLinden M.R., Migaud M., Ziegler M., Nikiforov A.
    • в сборнике FASEB SRC “NAD Metabolism & Signaling” (July 9 - 14, 2017, New Orleans, USA), Abstract book, тезисы, с. 73
  • 
    • 2017 Mechanism of nicotinamide riboside and nicotinic acid riboside import into human cells
    • Kulikova V., Onopa L., Svetlova M., Solovjeva L., Firsanov D., Shabalin K., Nerinovski K., Redpath P., Migaud M.E., Ziegler M., Nikiforov A.
    • в сборнике FEBS JOURNAL, серия Special issue 1, том 284, тезисы, с. 370
  • 
    • 2017 The potential of various extracellular NAD precursors to maintain the synthesis of intracellular NAD in cultivated human cells
    • Svetlova M., Solovjeva L., Firsanov D., Shabalin K., Nerinovski K., Kulikova V., Khodorkovskiy M., Redpath P., Migaud M., Ziegler M., Nikiforov A.
    • в сборнике FEBS JOURNAL, серия Special issue 1, том 284, тезисы, с. 371
  • • 2016 A potential role of the Nudix pyrophosphatase NUDT13 in the regulation of the mitochondrial NAD contents
    • Kulikova V., Kharchenko V., Van_Linden M., Khodorkovskiy M., Ziegler M., Nikiforov A.
    • в сборнике The FEBS Congress 2016 (September 3 – 8, 2016, Ephesus, Turkey). FEBS Journal. 2016. 283 (Suppl. 1), место издания Ephesus, Turkey, тезисы, с. 214-214
  • • 2016 Исследование эффективности и механизмов синтеза NAD из различных внеклеточных предшественников в культивируемых клетках человека. Сборник тезисов V молодежной конференции по молекулярной и клеточной биологии
    • Куликова В.А., Шабалин К.А., Фирсанов Д.В., Светлова М.П., Якимов А.П., Нериновский К.Б., Ходорковский М.А., Циглер М., Никифоров А.А.
    • в сборнике Сборник тезисов V молодежной конференции по молекулярной и клеточной биологии Института цитологии РАН, том 18, тезисы, с. 38-38
  • • 2016 Количественная спектроскопия ЯМР в приложениях метаболомики
    • Якимов А.П., Куликова В.А., Нериновский К.Б., Никифоров А.А., Шабалин К.А.
    • в сборнике XVII Зимняя молодежная школа по биофизике и молекулярной биологии (Гатчина 29 февраля – 5 марта 2016 г.). Сборник тезисов. 2016, тезисы, с. 101-101
  • • 2016 Потенциальная роль Nudix пирофосфатазы NUDT13 в регуляции уровня митохондриального NAD в клетках человека
    • Куликова В.А., Харченко В.Д., Ван Линден М., Ходорковский М.А., Циглер М., Никифоров А.А.
    • в сборнике Научные труды «V Съезд биохимиков России» (Сочи – Дагомыс, 4 - 8 октября 2016 г.). ActaNaturae. 2016. Спецвыпуск том 2, тезисы, с. 107-108
  • • 2016 Расщепление внеклеточного NAD и его метаболитов в культурах клеток человека
    • Куликова В.А., Шабалин К.А., Якимов А.П., Нериновский К.Б., Ходорковский М.А., Циглер М., Никифоров А.А.
    • в сборнике Научные труды «V Съезд биохимиков России» (Сочи – Дагомыс, 4 - 8 октября 2016 г.). ActaNaturae. 2016. Спецвыпуск том 2, тезисы, с. 245-245
  • • 2015 Degradation of extracellular NAD and its metabolites in cultures of human cells
    • Kulikova V., Shabalin K., Yakimov A., Nerinovski K., Nikiforov A., Ziegler M.
    • в сборнике FEBS Congress 2015 "The Biochemical Basis of Life" (July 4 - 9, 2015, Berlin, Germany). FEBS Journal. 2015. 282 (Suppl. 1), место издания Berlin, Germany, тезисы, с. 127-127
  • • 2015 Generation, release and uptake of the NAD precursor nicotinic acid riboside by human cells
    • Nikiforov A., Kulikova V., Shabalin K., Nerinovski K., Dölle C., Niere M., Yakimov A., Redpath P., Khodorkovskiy M., Migaud M., Ziegler M.
    • в сборнике FASEB SRC “NAD Metabolism & Signaling” (August 9 - 14, 2015, Timmendorfer Strand, Germany). Abstract book, место издания Timmendorfer Strand, Germany, тезисы, с. 24-24
  • • 2015 NAD и его ключевые метаболиты: механизмы образования и взаимодействия внутри- и внеклеточных пулов
    • Куликова В.А., Шабалин К.А., Якимов А.П., Нериновский К.Б., Циглер М., Никифоров А.А.
    • в сборнике Тезисы докладов и сообщений, представленных на II Всероссийскую конференцию "Внутриклеточная сигнализация, транспорт, цитоскелет" (Санкт-Петербург, 20–22 октября 2015 г.). Цитология. 2015. 57 (9), тезисы, с. 637-638
  • • 2015 Изучение роли белков NUDT12 и NUDT13 в регуляции уровня NAD в клетках человека
    • Харченко В.Д., Никифоров А.А., Куликова В.А.
    • в сборнике БИОЛОГИЯ – НАУКА ХХI ВЕКА: 19-я Международная Пущинская школа-конференция молодых ученых (Пущино, 20 - 24 апреля 2015 года). Сборник тезисов, место издания Пущино, тезисы, с. 147-147
  • • 2015 Разработка методики для измерения количества внеклеточного NAD и его метаболитов методом ЯМР
    • Якимов А.П., Куликова В.А., Нериновский К.Б., Никифоров А.А., Шабалин К.А.
    • в сборнике Тезисы докладов и сообщений, представленных на II Всероссийскую конференцию "Внутриклеточная сигнализация, транспорт, цитоскелет" (Санкт-Петербург, 20–22 октября 2015 г.). Цитология. 2015. 57 (9), тезисы, с. 668-668
  • • 2015 Создание векторов для сверхэкспрессии белков NUDT12 и NUDT13 в клетках человека и в бактериальных клетках
    • Харченко В.Д., Никифоров А.А., Ливинская В.А.
    • в сборнике Сборник «Научный форум с международным участием «Неделя науки СПбПУ». Материалы научно-практической конференции. Институт физики, нанотехнологий и телекоммуникаций СПбПУ, место издания Санкт-Петербург, тезисы, с. 457-459
  • • 2014 Generation and regulatory functions of the mitochondrial NAD pool
    • Dölle C., Van_Linden M., Skoge R., Niere M., Nikiforov A., Ziegler M.
    • в сборнике EBEC 2014 (12-17 July 2014, Lisbon, Portugal). Biochimica et Biophysica Acta (BBA)-Bioenergetics. 2014. 1837, место издания Lisbon, Portugal, тезисы, с. 68-68
  • • 2014 Generation, release and uptake of the NAD precursor nicotinic acid riboside by human cells
    • Nikiforov A., Livinskaya V., Shabalin K., Nerinovski K., Doelle C., Niere M., Khodorkovskiy M., Ziegler M.
    • в сборнике The FEBS EMBO 2014 Conference (August 30 – September 4 2014, Paris, France). FEBS Journal. 2014. 281 (Suppl. 1), место издания Paris, France, тезисы, с. 566-567
  • • 2014 Vitamin B3-derived ribosides are authentic intermediates of human NAD metabolism
    • Livinskaya V., Shabalin K., Nerinovski K., Doelle C., Niere M., Khodorkovskiy M., Ziegler M., Nikiforov A.
    • в сборнике The FEBS EMBO 2014 Conference (August 30 – September 4 2014, Paris, France). FEBS Journal. 2014. 281 (Suppl. 1), место издания Paris, France, тезисы, с. 615-615
  • • 2014 Рибозиды никотинамида и никотиновой кислоты – ключевые метаболиты путей биосинтеза NAD в клетках человека
    • Ливинcкая В.А., Шабалин К.А., Нериновский К.Б., Ходорковский М.А., Циглер М., Никифоров А.А.
    • в сборнике Тезисы докладов и сообщений, представленных на XVII всероссийский симпозиум "Структура и функции клеточного ядра" (Санкт-Петербург, 28–30 октября 2014 г.). Цитология. 2014. том 56. N 9, тезисы, с. 668-668
  • • 2013 5’-нуклеотидазы человека CN - II и CN - III дефосфорилируют мононуклеотиды NMN и NAMN in vitro
    • Ливинская В.А., Никифоров А.А.
    • в сборнике Материалы работ молодежной конференции «Студенты и молодые ученые инновационной России». Санкт-Петербург. 2013, тезисы, с. 149-151
  • • 2013 Nicotinamide riboside (NR) and nicotinic acid riboside (NAR) homeostasis in humans: potential mechanism of intracellular generation and release from cells
    • Nikiforov A., Livinskaya V., Dölle C., Niere M., Khodorkovskiy M., Ziegler M.
    • в сборнике 2013 FASEB SRC “NAD Metabolism & Signaling” (July 14 - 19, 2013, Chicago, IL, USA). Abstract book, место издания Timmendorfer Strand, Germany, тезисы, с. 19-19
  • • 2013 Potential role of cytosolic 5′-nucleotidases in human NAD metabolism
    • Livinskaya V., Afanasyeva A., Dolle C., Niere M., Khodorkovskiy M., Ziegler M., Nikiforov A.
    • в сборнике FEBS Congress 2013 "Mechanisms in Biology" (July 6 - 11, 2013, Saint-Petersburg, Russia). FEBS Journal. 2013. 280 (Suppl. 1), место издания Saint-Petersburg, Russia, тезисы, с. 181-181
  • • 2013 Изучение механизмов образования и взаимодействия внутри- и внеклеточных пулов ключевых NAD-метаболитов
    • Ливинcкая В.А., Ходорковский М.А., Циглер М., Никифоров А.А.
    • в сборнике Тезисы докладов и сообщений, представленных на Всероссийский симпозиум и Школу-конференцию для молодых ученых по биологии клетки в культуре (Санкт-Петербург, 23-25 октября 2013 г.). Цитология. 2013. том 55. N 9, тезисы, с. 23-25
  • • 2013 Получение антител к субъединицам PSMA3, PSMA5 и PSMB5 протеасом человека и их экспериментальное применение
    • Ливинcкая В.А., Иванов В.А., Федорова О.А., Барлев Н.А., Никифоров А.А.
    • в сборнике Тезисы докладов и сообщений, представленных на Всероссийский симпозиум и Школу-конференцию для молодых ученых по биологии клетки в культуре (Санкт-Петербург, 23-25 октября 2013 г.). Цитология. 2013. том 55. N 9, тезисы, с. 347-347

• НИРы

  • • 1 января 2008 - 31 декабря 2010 Индуцируемые протеасомы и альфа-РНП: структурно-функциональный анализ альфа-РНП, протеасом и ассоциированных с ними малых некодирующих РНК, индуцируемых при апоптозе и дифференцировке клеток человека в культуре
    • Лаборатория регуляции экспрессии генов
    • Руководитель: Миттенберг А.Г. Ответственный исполнитель: Куличкова В.А. Участники НИР: Гаузе Л.Н., Зайкова Ю.Я., Кожухарова И.В., Моисеева Т.Н., Никифоров А.А., Федорова О.А., Цимоха А.С.

• Руководство диссертациями

  • • МЕХАНИЗМЫ ОБРАЗОВАНИЯ И ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ ВНУТРИ- И ВНЕКЛЕКТОЧНЫХ ПУЛОВ РИБОЗИДОВ НИКОТИНАМИДА И НИКОТИНОВОЙ КИСЛОТЫ В КЛЕТКАХ ЧЕЛОВЕКА
    • Принята к защите
    • Кандидатская диссертация по специальности 03.01.03 - Молекулярная биология (биол. науки)
    • Соискатель: КУЛИКОВА Вероника Алексеевна
    • Научный руководитель: Никифоров Андрей Анатольевич, к.б.н.
    • Организация, в которой выполнялась работа: Научно-исследовательский комплекс «Нанобиотехнологии» Федерального государственного автономного образовательного учреждения высшего образования «Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого»

• Руководство дипломными работами

  • • 2015 Создание векторов и сверхэкспрессия белков NUDT12 и NUDT13 в клетках человека и в бактериальных клетках
    • Научный руководитель: Никифоров А.А.
    • Автор: Харченко В.Д. (Бакалавр)
  • • 2013 Разработка метода иммуно-аффинной очистки протеасом из клеток человека
    • Научный руководитель: Никифоров А.А.
    • Автор: Ливинская В.А. (Магистр)
  • • 2011 Создание векторов, кодирующих FLAG-слитые протеасомные белки PSMA1 и PSMA5
    • Научный руководитель: Никифоров А.А.
    • Автор: Воронцова Д.Н. (Бакалавр)
  • • 2011 Получение антител к субъединицам протеасом человека PSMA3 и PSMB5
    • Научный руководитель: Никифоров А.А.
    • Автор: Ливинская В.А. (Бакалавр)