ИСТИНА

Агапкина Юлия Юрьевна пользователь

МГУ имени М.В. Ломоносова, Химический факультет, Кафедра химии природных соединений, доцент, с 1 марта 2008

МГУ имени М.В. Ломоносова, Научно-исследовательский институт физико-химической биологии имени А.Н.Белозерского, старший научный сотрудник, с 4 июля 2022, по совместительству

кандидат химических наук с 2004 года

Прежние места работы (Нажмите для отображения)

Соавторы: Готтих М.Б., Королев С.П., Зацепин Т.С., Mouscadet J., Анисенко А.Н., Smolov M., Шадрина О.А., Pustovarova M., Исагулянц М.Г., Княжанская Е.С., Бастраков М.А., Ташлицкий В.Н., Шевелев С.А. показать полностью..., Starosotnikov A., Yanvarev D., Zhuze A.L., Гашникова Н.М., Зубин Е.М., Зырянова Д.П., Ивлев В.В., Кондрашина О.В., Стародубова Е.С., Тотменин А.В., Barbe S., Deprez E., Gromyko A.V., Latyshev O., Lukashov V., Viklund A., Кихай Т.Ф., Кочетков С.Н., Поройков В.В., Приказчикова Т.А., Смолов М.А., Aleksandrov D.A., Bayurova E., Benarous R., Bret M.L., Brochon J., Crucifix C., Dillenbeck T., Druzhilovsky D., Dzeina M., Eiler S., Eliseeva O., Emiliani S., Fridrihsone I., Gelius E., Granger F., Hallengärd D., Jansons J., Kikhay T.F., Kilpelainen A., Kostic L., Krotova O., Latanova A., Le B.M., Magnani M., Medstrand P., Michel F., Moras D., Nazabal A., Petkov S., Podschwadt P., Ruff M., Saleem M., Schultz P., Shugalii A.V., Vepsäläinen J., Wahren B., Zagorodnikov A.V., Ziganshin R.K., Алексеев Я.И., Анашкин В.А., Антипова О.М., Арутюнян А.А., Бачева А.В., Вайман А.В., Валуев-Эллистон В.Т., Ванцева С.И., Васьковский Б.В., Далингер И.Л., Дружиловский Д.С., Дутов М.Д., Елкина Д.А., Елякова Л.А., Завильгельский Г.Б., Залевский А.О., Карпов В.Л., Климова Р.Р., Королева О.Н., Коршунова Г.А., Костюков А.А., Кубарева Е.А., Кущ А.А., Мелькина О.Е., Орецкая Т.С., Родина Е.В., Романова Е.А., Рыбалкина Е.Ю., Сизов А.И., Скворцов Д.А., Сусова О.Ю., Филимонов Д.А., Хорошилова Н.И.

39 статей, 1 книга, 6 докладов на конференциях, 3 тезисов докладов, 20 НИР, 2 патента, 1 членство в диссертационном совете, 1 диссертация, 3 дипломные работы, 4 курсовые работы, 1 учебный курс

Количество цитирований статей в журналах по данным Web of Science: 229, Scopus: 360
РИНЦ:

IstinaResearcherID (IRID): 1426057

ResearcherID: I-5558-2012

Scopus Author ID: 6507707235

ORCID: 0000-0001-6809-4670

Деятельность

---

• Статьи в журналах

  • • 2023 Both ATM and DNA-PK Are the Main Regulators of HIV-1 Post-Integrational DNA Repair
    • Anisenko Andrey, Nefedova Anastasiia, Agapkina Yulia, Gottikh Marina
    • в журнале International Journal of Molecular Sciences, издательство MDPI (Basel, Switzerland), том 24, с. 2797 DOI
  • • 2022 SFPQ and NONO Proteins and Long Non-Coding NEAT1 RNA: Cellular Functions and Role in the HIV-1 Life Cycle
    • Shadrina O.A., Kikhay T.F., Agapkina Yu Yu, Gottikh M.B.
    • в журнале Molecular Biology, издательство Maik Nauka/Interperiodica Publishing (Russian Federation), том 56, № 2, с. 196-209 DOI
  • • 2022 Белки SFPQ, NONO и длинная некодирующая РНК NEAT1: функции в клетке и в жизненном цикле ВИЧ-1
    • Шадрина О.А., Кихай Т.Ф., Агапкина Ю.Ю., Готтих М.Б.
    • в журнале Молекулярная биология, том 56, № 2, с. 259-274 DOI
  • 
    • 2021 Cellular Immune Response Induced by DNA Immunization of Mice with Drug Resistant Integrases of HIV-1 Clade A Offers Partial Protection against Growth and Metastatic Activity of Integrase-Expressing Adenocarcinoma Cells
    • Isaguliants Maria, Krotova Olga, Petkov Stefan, Jansons Juris, Bayurova Ekaterina, Mezale Dzeina, Fridrihsone Ilze, Kilpelainen Athina, Podschwadt Philip, Agapkina Yulia, Smirnova Olga, Kostic Linda, Saleem Mina, Latyshev Oleg, Eliseeva Olesja, Malkova Anastasia, Gorodnicheva Tatiana, Wahren Britta, Gordeychuk Ilya, Starodubova Elizaveta, Latanova Anastasia
    • в журнале Microorganisms, издательство MDPI (Basel, Switzerland), том 9, № 6, с. 1219-1219 DOI
  • • 2021 The role of human SFPQ protein in HIV1 replication
    • Kikhai T., Agapkina Y., Shadrina O., Gottikh M.
    • в журнале FEBS open bio, издательство John Wiley & Sons Inc. (United States), том 11, № S1, с. 383-383 DOI
  • 
    • 2020 DNA sequence-specific ligands. XVIII. Synthesis, physico-chemical properties, genetic, virological, and biochemical studies of fluorescent dimeric bisbenzimidazoles DBPA(n)
    • Koval Vasiliy S., Arutyunyan Albert F., Salyanov Victor I., Kostyukov Alexey A., Melkina Olga E., Zavilgelsky Gennadii B., Klimova Regina R., Kushch Alla A., Korolev Sergey P., Agapkina Yulia Yu, Gottikh Marina B., Vaiman Andrey V., Rybalkina Ekaterina Yu, Susova Olga Yu, Zhuze Alexei L.
    • в журнале Bioorganic and Medicinal Chemistry, издательство Pergamon Press Ltd. (United Kingdom), с. 115378 DOI
  • 
    • 2019 Consensus Integrase of a New HIV-1 Genetic Variant CRF63_02A1
    • Agapkina Y.Y., Pustovarova M.A., Korolev S.P., Zyryanova D.P., Ivlev V.V., Totmenin A.V., Gashnikova N.M., Gottikh M.B.
    • в журнале Acta Naturae (англоязычная версия), издательство Park Media Ltd (Moscow, Russia (Federation)), том 11, № 1(40), с. 14-22
  • • 2019 Консенсусная интеграза нового генетического варианта CRF63_02A1 ВИЧ-1
    • Агапкина Ю.Ю., Пустоварова М.А., Королев С.П., Зырянова Д.П., Ивлев В.В., Тотменин А.В., Гашникова Н.М., Готтих М.Б.
    • в журнале Acta Naturae (русскоязычная версия), издательство Парк-медиа (М.), том 11, № 1(40), с. 14-22
  • • 2017 Characterization of HIV-1 integrase interaction with human Ku70 protein and initial implications for drug targeting
    • Anisenko Andrey N., Knyazhanskaya Ekaterina S., Zalevsky Artur O., Agapkina Julia Yu, Sizov Aleksander I., Zatsepin Timofey S., Gottikh Marina B.
    • в журнале Scientific reports, издательство Nature Publishing Group (United Kingdom), том 7, № 1 DOI
  • 
    • 2017 Nitrobenzofuroxane derivatives as dual action HIV-1 inhibitors
    • Korolev S.P., Pustovarova M.A., Starosotnikov A.M., Bastrakov M.A., Agapkina Yu Yu, Shevelev S.A., Gottikh M.B.
    • в журнале Biochemistry, Supplemental Series B, издательство Maik Nauka/Interperiodica Publishing (Russian Federation), том 11, № 3, с. 286-290 DOI
  • 
    • 2016 Производные нитробензофуроксанов в качестве ингибиторов ВИЧ-1 двойного действия
    • Королев С.П., Пустоварова М.А., Старосотников А.М., Бастраков М.А., Агапкина Ю.Ю., Шевелев С.А., Готтих М.Б.
    • в журнале Биомедицинская химия, том 62, № 6, с. 725-728 DOI
  • 
    • 2015 Influence of Drug Resistance Mutations on the Activity of HIV-1 Subtypes A and B Integrases: a Comparative Study
    • Shadrina O.A., Zatsepin T.S., Agapkina Yu Yu, Isaguliants M.G., Gottikh M.B.
    • в журнале Acta Naturae (англоязычная версия), издательство Park Media Ltd (Moscow, Russia (Federation)), том 7, № 1, с. 20-28
  • • 2015 Сравнительный анализ влияния мутаций лекарственной устойчивости на активность интеграз ВИЧ-1 субтипов А и В
    • Шадрина О.А., Зацепин Т.С., Агапкина Ю.Ю., Исагулянц М.Г., Готтих М.Б.
    • в журнале Acta Naturae (русскоязычная версия), издательство Парк-медиа (М.), том 7, № 1, с. 43-52
  • 
    • 2014 Consensus HIV-1 subtype A integrase and its raltegravir-resistant variants: Design and characterization of the enzymatic properties
    • Shadrina O., Krotova O., Agapkina J., Knyazhanskaya E., Korolev S., Starodubova E., Viklund A., Lukashov V., Magnani M., Medstrand P., Karpov V., Gottikh M., Isaguliants M.
    • в журнале Biochimie, издательство Elsevier BV (Netherlands), том 102, с. 92-101 DOI
  • 
    • 2014 Specific features of HIV-1 integrase inhibition by bisphosphonate derivatives
    • Agapkina J., Yanvarev D., Anisenko A., Korolev S., Vepsäläinen J., Kochetkov S., Gottikh M.
    • в журнале European Journal of Medicinal Chemistry, издательство Elsevier BV (Netherlands), том 73, с. 73-82 DOI
  • • 2013 Consensus HIV-1 FSU-A Integrase Gene Variants Electroporated into Mice Induce Polyfunctional Antigen-Specific CD4+ and CD8+ T Cells
    • Krotova O., Starodubova E., Petkov S., Kostic L., Agapkina J., Hallengärd D., Viklund A., Latyshev O., Gelius E., Dillenbeck T., Karpov V., Gottikh M., Belyakov IM, Lukashov V.
    • в журнале PLoS ONE, издательство Public Library of Science (United States), том 8, № 8(5) DOI
  • 
    • 2013 Structural-Functional Analysis of 2,1,3-Benzoxadiazoles and Their N-oxides As HIV-1 Integrase Inhibitors
    • Korolev SP1, Kondrashina OV, Druzhilovsky DS, Starosotnikov AM, Dutov MD, Bastrakov MA, Dalinger IL, Filimonov DA, Shevelev SA, Poroikov VV, Agapkina YY, Gottikh MB
    • в журнале Acta Naturae (англоязычная версия), издательство Park Media Ltd (Moscow, Russia (Federation)), том 5, № 1, с. 63-72
  • • 2013 Структурно-функциональный анализ 2,1,3-бензоксадиазолов и их N-оксидов в качестве ингибиторов интегразы ВИЧ-1
    • Королев С.П., Кондрашина О.В., Дружиловский Д.С., Старосотников А.М., Дутов М.Д., Бастраков М.А., Далингер И.Л., Филимонов Д.А., Шевелев С.А., Поройков В.В., Агапкина Ю.Ю., Готтих М.Б.
    • в журнале Acta Naturae (русскоязычная версия), издательство Парк-медиа (М.), том 5, № 1, с. 63-72
  • 
    • 2012 A new fluorometric assay for the study of DNA-binding and 3’-processing activities of retroviral integrases and its use for screening of HIV-1 integrase inhibitors
    • Anisenko A., Agapkina J., Zatsepin T., Yanvarev D., Gottikh M.
    • в журнале Biochimie, издательство Elsevier BV (Netherlands), том 94, № 11, с. 2382-2390 DOI
  • 
    • 2011 Clinical Use of Inhibitors of HIV-1 Integration: Problems and Prospects
    • Korolev SP1, Agapkina YY, Gottikh MB
    • в журнале Acta Naturae (англоязычная версия), издательство Park Media Ltd (Moscow, Russia (Federation)), том 3, № 3, с. 12-28
  • 
    • 2011 Modulation of HIV-1 integrase activity by single-stranded oligonucleotides and their conjugates with eosin
    • Korolev Sergey, Knyazhanskaya Ekaterina, Anisenko Andrey, Tashlitskii Vadim, Zatsepin Timofei S., Gottikh Marina, Agapkina Julia
    • в журнале Nucleosides, Nucleotides and Nucleic Acids, издательство Marcel Dekker Inc. (United States), том 30, № 7-8, с. 651-666 DOI
  • 
    • 2011 Structure–Activity Relationship Studies of HIV-1 Integrase Oligonucleotide Inhibitors
    • Agapkina J., Zatsepin T., Knyahzanskaya E., Mouscadet JF, Gottikh M.
    • в журнале ACS Medicinal Chemistry Letters, издательство American Chemical Society (United States), том 2, № 7, с. 532-537 DOI
  • 
    • 2011 Новый пептидный ингибитор интегразы ВИЧ-1 из морских червей
    • Елякова Л.А., Васьковский Б.В., Хорошилова Н.И., Ванцева С.И., Агапкина Ю.Ю.
    • в журнале Биоорганическая химия, издательство Российская академия наук (Москва), том 37, № 2, с. 233-243
  • 
    • 2011 Проблемы и перспективы клинического применения ингибиторов интеграции ВИЧ-1
    • Королев С.П., Агапкина Ю.Ю., Готтих М.Б.
    • в журнале Acta Naturae (русскоязычная версия), издательство Парк-медиа (М.), том 3, с. 13-30
  • 
    • 2010 HIV-1 integrase inhibition by dimeric bisbenzimidazoles with different spacer structures
    • Korolev S.P., Tashlitsky V.N., Smolov M.A., Gromyko A.V., Zhuze A.L., Agapkina Yu Yu, Gottikh M.B.
    • в журнале Molecular Biology, издательство Maik Nauka/Interperiodica Publishing (Russian Federation), том 44, № 4, с. 633-641 DOI
  • 
    • 2010 Novel allosteric inhibitors of HIV-1 integrase on the base of multimodified oligonucleotides
    • Zatsepin T., Korolev S., Smolov M., Gottikh M., Agapkina J.
    • в журнале FEBS Journal, издательство Blackwell Publishing Inc. (United Kingdom), том 277, с. 94-94
  • 
    • 2010 Ингибирование интегразы ВИЧ-1 димерными бисбензимидазолами с различной структурой линкера
    • Королев С.П., Ташлицкий В.Н., Смолов М.А., Громыко А.В., Жузе А.Л., Агапкина Ю.Ю., Готтих М.Б.
    • в журнале Молекулярная биология, том 44, № 4, с. 718-727
  • 
    • 2009 Structural basis for HIV-1 DNA integration in the human genome, role of the LEDGF/P75 cofactor
    • Michel Fabrice, Crucifix Corinne, Granger Florence, Eiler Sylvia, Mouscadet Jean-Francois, Korolev Sergei, Agapkina Julia, Ziganshin Rustam, Gottikh Marina, Nazabal Alexis, Emiliani Stephane, Benarous Richard, Moras Dino, Schultz Patrick, Ruff Marc
    • в журнале EMBO Journal, издательство Nature Publishing Group (United Kingdom), том 28, № 7, с. 980-991 DOI
  • • 2008 Ингибиторы интегразы ВИЧ-1 как новый компонент противовирусной терапии
    • Приказчикова Т.А., Сычева А.М., Агапкина Ю.Ю., Александров Д.А., Готтих М.Б.
    • в журнале Успехи химии, издательство АНО «Успехи химии» (Москва), том 77, с. 445-459
  • 
    • 2007 Study of the new HIV-1 integrase inhibitors mechanism of action using modified substrates
    • Agapkina Y., Korolev S., Aleksandrov D., Romanova E., Shevelev S., Poroikov V., Gottikh M.
    • в журнале FEBS Journal, издательство Blackwell Publishing Inc. (United Kingdom), том 274, с. 239-239
  • 
    • 2006 Probing of HIV-1 integrase/DNA interactions using novel analogs of viral DNA
    • Agapkina Julia, Smolov Maksim, Barbe Sophie, Zubin Evgenii, Zatsepin Timofei, Deprez Eric, Bret Marc Le, Mouscadet Jean-François, Gottikh Marina
    • в журнале Journal of Biological Chemistry, издательство American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc. (United States), том 281, № 17, с. 11530-11540 DOI
  • 
    • 2005 Characterization of DNA binding by HIV-1 integrase using Schiff-base formation
    • Smolov M., Agapkina J., Buckle M., Mouscadet J.F., Gottikh M.
    • в журнале FEBS Journal, издательство Blackwell Publishing Inc. (United Kingdom), том 272, с. 19-20
  • 
    • 2005 Interactions of HIV-1 integrase with modified analogs of viral DNA: implications for understanding integration mechanism
    • Agapkina J., Smolov M., Gottikh M.
    • в журнале FEBS Journal, издательство Blackwell Publishing Inc. (United Kingdom), том 272, с. 5-6
  • • 2005 Структура и функции интегразы ВИЧ-1
    • Агапкина Ю.Ю., Приказчикова Т.А., Смолов М.А., Готтих М.Б.
    • в журнале Успехи биологической химии, том 45, с. 87-122
  • 
    • 2004 HIV-1 integrase can process a 3 ’-end crosslinked substrate - Implications of DNA end-fraying requirement during the 3 ’-processing reaction
    • Agapkina J., Smolov M., Zubin E., Mouscadet J.F., Gottikh M.
    • в журнале European Journal of Biochemistry, том 271, № 1, с. 205-211
  • 
    • 2004 Interactions of HIV-1 DNA heterocyclic bases with viral integrase
    • Agapkina J.J., Tashlitskii V.N., Deprez E., Brochon J.C., Shugalii A.V., Mouscadet J.F., Gottikh M.B.
    • в журнале Molecular Biology, издательство Maik Nauka/Interperiodica Publishing (Russian Federation), том 38, № 5, с. 718-727 DOI
  • 
    • 2004 Molecular modeling of duplex DNAs containing 2 ’-aminonucleosides and non-nucleoside 1,3 propanediol
    • Barbe S., Agapkina J., Mouscadet J.F., Gottikh M., Le Bret M.
    • в журнале Biophysical Journal, издательство Biophysical Society (United States), том 86, № 1, с. 311-311
  • 
    • 2003 A new approach to the synthesis of DNA duplexes with covalently bonded chains
    • Smolov M.A., Agapkina Y.Y., Zubin E.M.
    • в журнале Doklady Chemistry, издательство Pleiades Publishing, Ltd (Road Town, United Kingdom), том 390, № 4-6, с. 168-171
  • 
    • 2002 [Synthesis of nucleotide derivatives containing 1-(4-(3-(trifluoromethyl)-3H-diazirin-3-yl)benzamido)-2,3-propanediol for photoaffinity modification of proteins and nucleic acid]
    • Agapkina Iu Iu, Agapkin D.V., Zagorodnikov A.V., Alekseev Ia I., Korshunova G.A., Gottikh M.B.
    • в журнале Bioorganicheskaia khimiia, том 28, № 4, с. 324-31

• Книги

  • • 2023 Экспериментальные методы исследования белков и нуклеиновых кислот. Раздел II. Комплексные задачи
    • Агапкина Ю.Ю., Анашкин В.А., Анисенко А.Н., Антипова О.М., Бачева А.В., Елкина Д.А., Королев С.П., Королева О.Н., Кубарева Е.А., Орецкая Т.С., Родина Е.В., Скворцов Д.А.
    • место издания МДМпринт Москва, 64 с.

• Доклады на конференциях

  • • 2022 Участие клеточных белков SFPQ и NONO в ранних стадиях репликации ВИЧ-1 (Устный)
    • Авторы: Агапкина Ю.Ю., Шадрина О.А., Кихай Т.Ф., Силкина М.О., Белова У.Д., Готтих М.Б.
    • III Объединенный Научный Форум Физиологов, Биохимиков И Молекулярных Биологов, Сочи, Россия, 3-7 октября 2022
  • • 2022 Влияние клеточного белка SFPQ на ранние стадии репликативного цикла ВИЧ (Устный)
    • Авторы: Кихай Т.Ф., Агапкина Ю.Ю., Шадрина О.А., Приказчикова Т.А., Готтих М.Б.
    • ВСЕРОССИЙСКАЯ КОНФЕРЕНЦИЯ «СИНТЕТИЧЕСКАЯ БИОЛОГИЯ И БИОФАРМАЦЕВТИКА», Новосибирск, Россия, 24-28 июля 2022
  • • 2022 Участие клеточного белка SFPQ во взаимодействии с обратной транскриптазой и интегразой ВИЧ-1 (Стендовый)
    • Авторы: Шехтман С.П., Кихай Т.Ф., Приказчикова Т.А., Агапкина Ю.Ю., Готтих М.Б.
    • ВСЕРОССИЙСКАЯ КОНФЕРЕНЦИЯ «СИНТЕТИЧЕСКАЯ БИОЛОГИЯ И БИОФАРМАЦЕВТИКА», Новосибирск, Россия, 24-28 июля 2022
  • • 2017 Сравнительный анализ ферментативной активности и устойчивости к ингибиторам интеграз наиболее распространенных на территории России субтипов ВИЧ-1: А, В и CRF63_021A (Стендовый)
    • Авторы: Исагулянц М.Г., Готтих М.Б., Гашникова Н.М., Тотменин А.В., Стародубова Е.С., Зырянова Д.П., Ивлев В.В., Агапкина Ю.Ю., Пустоварова М.А.
    • 12th International Scientific Conference on Bioorganic Chemistry devoted to the Memory of Professor Ovchinnikov/Международная научная конференция "XII чтения памяти академика Юрия Анатольевича Овчинникова" VIII Российский симпозиум "Белки и пептиды", Москва, Россия, 18-22 сентября 2017
  • • 2013 Methylenebysphosphonates as new class of HIV-1 integrase inhibitors (Стендовый)
    • Авторы: Yanvarev D., Kochetkov S., Gottikh M., Anisenko A., Agapkina J., Korolev S.
    • 38th Congress of the Federation of European Biochemical Societies (FEBS), Saint Petersburg, Россия, 6-11 июля 2013
  • • 2011 Inhibition of HIV-1 integrase and viral replication by modified oligonucleotides (Стендовый)
    • Авторы: Агапкина Ю.Ю., Зацепин Т.С., Королев С.П., Готтих М.Б.
    • 6th International AIDS Society conference on HIV pathogenesis, treatment and prevention, Rome, Italy, 17-20 July 2012, Рим, Италия, 17-20 июля 2011

• Тезисы докладов

  • • 2017 Сравнительный анализ ферментативной активности и устойчивости к ингибиторам интеграз наиболее распространенных на территории России субтипов ВИЧ-1: А, В и CRF63_021A
    • Пустоварова М.А., АгапкинаЮ Ю., Ивлев В.В., Зырянова Д.П., Стародубова Е.С., Тотменин А.В., Гашникова Н.М., Исагулянц М.Г., Готтих М.Б.
    • в сборнике Acta Naturae. СПЕЦВЫПУСК. Международная научная конференция по биоорганической химии "XII чтения памяти академика Юрия Анатольевича Овчинникова" и VIII Российский симпозиум "Белки и пептиды", место издания Перо Москва, ИБХ РАН, 18-22 сентября 2017, тезисы, с. 139-139
  • 
    • 2013 Methylenebysphosphonates as new class of HIV-1 integrase inhibitors
    • Anisenko A., Agapkina J., Korolev S., Yanvarev D., Kochetkov S., Gottikh M.
    • в сборнике FEBS JOURNAL, серия Special issue 1, место издания Blackwell Publishing Inc United Kingdom, том 280, тезисы, с. 365-366
  • 
    • 2013 Modified oligonucleotides as inhibitors of HIV-1 enzymes
    • Gottikh M., Korolev S., Agapkina Y., Kondrashina O., Knyazhanskaya E., Valuev-Elliston V.
    • в сборнике FEBS JOURNAL, серия Special issue 1, место издания Blackwell Publishing Inc United Kingdom, том 280, тезисы, с. 85-86

• НИРы

  • • 27 июня 2023 - 31 декабря 2025 Функциональные белковые агрегаты беспозвоночных животных: состав, строение и функции (химический факультет)
    • Кафедра химии природных соединений
    • Руководитель: Анисенко А.Н. Ответственный исполнитель: Агапкина Ю.Ю.
  • • 3 августа 2022 - 30 июня 2024 Изучение механизмов репарации повреждений ДНК, возникающих в ходе интеграции ДНК ВИЧ-1 в геном человека
    • Научно-исследовательский институт физико-химической биологии имени А.Н.Белозерского
    • Руководитель: Анисенко А.Н. Ответственные исполнители: Агапкина Ю.Ю., Королев С.П., Шадрина О.А.
  • • 16 мая 2022 - 31 декабря 2024 Поиск новых клеточных партнеров интегразы ВИЧ-1 и их валидация как потенциальных терапевтических мишеней
    • Научно-исследовательский институт физико-химической биологии имени А.Н.Белозерского
    • Руководитель: Готтих М.Б. Ответственные исполнители: Агапкина Ю.Ю., Анисенко А.Н., Королев С.П. Участники НИР: Кихай Т.Ф., Розина А.А., Силкина М.О.
  • • 1 января 2021 - 31 декабря 2024 Структурно-функциональный анализ белков, нуклеиновых кислот и белково-нуклеиновых комплексов как основа для создания синтетических регуляторов экспрессии генов и лекарственных препаратов нового поколения
    • Кафедра химии природных соединений
    • Руководитель: Донцова О.А. Участники НИР: Агапкина Ю.Ю., Айсин К.Н., Анисенко А.Н., Антипова О.М., Баландина Г.Н., Банникова В.А., Бачева А.В., Богданов А.А., Буренина О.Ю., Василькова Д.П., Величко Т.И., Волков Е.М., Готманова Н.Н., Готтих М.Б., Громова Е.С., Долинная Н.Г., Завьялова Е.Г., Зацепин Т.С., Зверева М.Э., Кирсанова О.В., Кихай Т.Ф., Копылов А.М., Королев С.П., Королева О.Н., Кочетков С.Н., Лойко А.Г., Лукьянов Д.А., Малявко А.Н., Марьясина С.С., Метелев В.Г., Муравьева А.Н., Назаренко А.В., Никифорова (Абросимова) Л.А., Остерман И.А., Павлова А.В., Павлова Ю.А., Плетнёв Ф.И., Приказчикова Т.А., Родина Е.В., Рубцова М.П., Савицкая В.Ю., Свеженцева Г.А., Сергеев А.В., Сергиев П.В., Силкина М.О., Скворцов Д.А., Смирнов И.В., Смирнова И.Г., Сныга В.Г., Сумбатян Н.В., Ташлицкий В.Н., Терехов С.С., Терещенкова В.Ф., Трефилов В.С., Филиппова И.Ю., Шадрина О.А.
  • • 21 июля 2020 - 20 июля 2022 Создание клеточной высокопроизводительной системы для изучения механизмов репликации и транскрипции коронавирусов на примере SARS-CoV-2
    • Отдел химии нуклеиновых кислот
    • Руководитель: Готтих М.Б. Ответственные исполнители: Агапкина Ю.Ю., Анисенко А.Н. Участник НИР: Королев С.П.
  • • 1 января 2020 - 31 декабря 2022 Роль белков SFPQ и NONO в репликации ВИЧ-1
    • НИЛ химии нуклеиновых кислот
    • Руководитель: Агапкина Ю.Ю. Ответственные исполнители: Королев С.П., Шадрина О.А. Участники НИР: Анисенко А.Н., Белова У.Д., Кихай Т.Ф., Королев С.П., Силкина М.О., Силкина М.О., Шехтман С.П.
  • • 1 января 2020 - 31 декабря 2021 Исследование регуляции транскрипции ВИЧ-1 белком человека Ku и поиск клеточных факторов, участвующих в Ku-опосредованной регуляции транскрипции, с использованием методов секвенирования РНК нового поколения
    • Научно-исследовательский институт физико-химической биологии имени А.Н.Белозерского
    • Руководитель: Готтих М.Б. Ответственные исполнители: Агапкина Ю.Ю., Анисенко А.Н., Королев С.П., Мазуров Д.В. Участники НИР: Гаранина И.А., Зиганшин Р.Х., Шадрина О.А.
  • • 9 августа 2019 - 30 июня 2022 Изучение механизмов репарации повреждений ДНК, возникающих в ходе интеграции ДНК ВИЧ-1 в геном человека
    • Отдел химии нуклеиновых кислот
    • Руководитель: Анисенко А.Н. Ответственные исполнители: Агапкина Ю.Ю., Королев С.П., Шадрина О.А. Участники НИР: Бабадей О.А., Галкин С.О., Кан М.П., Розина А.А.
  • • 17 июля 2018 - 17 июля 2021 Разработка системы молекулярного узнавания комплекса интегразы ВИЧ-1 и клеточного белка Ku70 как новой мишени для создания анти-ВИЧ препаратов на основе биоподобных структур
    • Отдел химии нуклеиновых кислот
    • Руководитель: Готтих М.Б. Ответственные исполнители: Агапкина Ю.Ю., Анисенко А.Н. Участники НИР: Княжанская Е.С., Королев С.П.
  • • 24 апреля 2017 - 31 декабря 2019 Исследование регуляции транскрипции ВИЧ-1 белком человека Ku и поиск клеточных факторов, участвующих в Ku-опосредованной регуляции транскрипции, с использованием методов секвенирования РНК нового поколения
    • Научно-исследовательский институт физико-химической биологии имени А.Н.Белозерского
    • Руководитель: Готтих М.Б. Ответственные исполнители: Агапкина Ю.Ю., Анисенко А.Н., Королев С.П., Мазуров Д.В. Участники НИР: Анисенко А.Н., Зацепин Т.С., Княжанская Е.С., Королев С.П., Шадрина О.А.
  • • 6 апреля 2016 - 15 декабря 2016 Создание новых препаратов, ингибирующих интеграцию ВИЧ-1, на основе ген-направленных и антисмысловых олигонуклеотидов
    • Федеральное бюджетное учреждение науки "Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии "Вектор"
    • Руководитель: Гашникова Н.М. Участники НИР: Агапкина Ю.Ю., Пышная И.А., Тотменин А.В.
  • • 1 января 2016 - 1 декабря 2020 Структурно-функциональный анализ белков, нуклеиновых кислот и белково-нуклеиновых комплексов как основа для создания синтетических регуляторов экспрессии генов и лекарственных препаратов нового поколения
    • Кафедра химии природных соединений
    • Руководитель: Донцова О.А. Участники НИР: Агапкина Ю.Ю., Анисенко А.Н., Антипова О.М., Баландина Г.Н., Банникова В.А., Бачева А.В., Бизяева А.А., Богданов А.А., Буренина О.Ю., Василькова Д.П., Величко Т.И., Волков Е.М., Воробьева Н.Н., Габибов А.Г., Готманова Н.Н., Громова Е.С., Долинная Н.Г., Евфратов С.А., Елкина Д.А., Завьялова Е.Г., Зацепин Т.С., Зверева М.Э., Кирсанова О.В., Княжанская Е.С., Копылов А.М., Королев С.П., Королева О.Н., Костин Н.Н., Кочетков С.Н., Кузина Е.С., Кузнецова С.А., Лаптев И.Г., Логвина Н.А., Макаров Г.И., Макарова Т.М., Малявко А.Н., Марьясина С.С., Метелев В.Г., Монахова М.В., Никифорова (Абросимова) Л.А., Орецкая Т.С., Остерман И.А., Плетнёв Ф.И., Родина Е.В., Романов Р.С., Рубцова М.П., Руденская Г.Н., Савельев Н.В., Сергеев А.В., Сергеева О.В., Сергиев П.В., Скворцов Д.А., Смирнов И.В., Смирнова И.Г., Сумбатян Н.В., Ташлицкий В.Н., Терехов С.С., Терещенков А.Г., Терещенкова В.Ф., Устинов Н.Б., Филиппова И.Ю., Хайруллина З.З., Храброва Д.А., Чугунова А.А., Шадрина О.А., Шафиков Р.Р., Шпанченко О.В.
  • • 1 января 2013 - 31 декабря 2014 Оптимизация и проверка in vivo новой комбинации микробицидов
    • Отдел химии нуклеиновых кислот
    • Руководитель: Готтих М.Б. Участники НИР: Агапкина Ю.Ю., Анисенко А.Н., Королев С.П.
  • • 3 августа 2012 - 31 декабря 2013 Изучение структуры НК-белковых комплексов с помощью химической модификации остатков аргинина
    • Научно-исследовательский институт физико-химической биологии имени А.Н.Белозерского
    • Руководитель: Зацепин Т.С. Участники НИР: Агапкина Ю.Ю., Анисенко А.Н., Княжанская Е.С., Кондрашина О.В., Королев С.П.
  • • 1 января 2011 - 31 декабря 2015 Структурно-функциональный анализ белков, нуклеиновых кислот и белково-нуклеиновых комплексов как основа для создания синтетических регуляторов экспрессии генов и лекарственных препаратов нового поколения
    • Кафедра химии природных соединений
    • Руководитель: Донцова О.А. Участники НИР: Агапкина Ю.Ю., Баландина Г.Н., Бачева А.В., Богданов А.А., Буренина О.Ю., Василькова Д.П., Величко Т.И., Волков Е.М., Воробьева Н.Н., Габибов А.Г., Громова Е.С., Долинная Н.Г., Евфратов С.А., Елкина Д.А., Завьялова Е.Г., Зацепин Т.С., Зверева М.Э., Кирсанова О.В., Княжанская Е.С., Козлов А.Е., Копылов А.М., Королев С.П., Королева О.Н., Костин Н.Н., Кочетков С.Н., Кузнецова С.А., Логвина Н.А., Макаров Г.И., Малявко А.Н., Марьясина С.С., Нестерчук М.В., Никифорова (Абросимова) Л.А., Орецкая Т.С., Остерман И.А., Парфенова Ю.Ю., Плетнёв Ф.И., Родина Е.В., Рубцова М.П., Руденская Г.Н., Савельев Н.В., Сергеева О.В., Сергиев П.В., Скворцов Д.А., Смекалова Е.М., Смирнова И.Г., Сумбатян Н.В., Ташлицкий В.Н., Терещенков А.Г., Терещенкова В.Ф., Устинов Н.В., Устинов Н.Б., Филиппова И.Ю., Шпанченко О.В.
  • • 1 января 2011 - 31 декабря 2013 Изучение структурных изменений интасомы ВИЧ-1 в процессе интеграции
    • Научно-исследовательский институт физико-химической биологии имени А.Н.Белозерского
    • Руководитель: Агапкина Ю.Ю. Участники НИР: Анисенко А.Н., Зацепин Т.С., Княжанская Е.С., Латышев Г.С., Смолов М.А., Шешукова Е.В.
  • • 8 сентября 2010 - 15 ноября 2012 СОЗДАНИЕ НОВЫХ БИОКАТАЛИЗАТОРОВ МЕТОДАМИ КОМБИНАТОРНОЙ ХИМИИ И БИОЛОГИИ
    • Кафедра химии природных соединений
    • Руководитель: Габибов А.Г. Ответственный исполнитель: Бачева А.В. Участники НИР: Агапкина Ю.Ю., Величко Т.И., Готтих М.Б., Княжанская Е.С., Кондрашина О.В., Королев С.П., Кудряева А.А., Кузина Е.С., Куркова И.Н., Нестерова П.С., Сергиев П.В., Смирнов И.В., Смолов М.А., Филиппова И.Ю.
  • • 1 января 2009 - 31 декабря 2011 Дизайн и характеристика ингибиторов интегразы ВИЧ-1 на базе соединений олигомерной природы
    • Научно-исследовательский институт физико-химической биологии имени А.Н.Белозерского
    • Руководитель: Ташлицкий В.Н. Участники НИР: Агапкина Ю.Ю., Готтих М.Б., Зацепин Т.С., Королев С.П.
  • • 1 января 2009 - 31 декабря 2011 Модифицированные пептидо-олигонуклеотидные комплексы как потенциальные противоретровирусные агенты
    • Научно-исследовательский институт физико-химической биологии имени А.Н.Белозерского
    • Руководитель: Зацепин Т.С. Участники НИР: Агапкина Ю.Ю., Королев С.П., Судьина А.Е.
  • • 1 января 2009 - 31 января 2011 Использование модифицированных олигонуклеотидов для изучения структуры и функций интегразы ВИЧ-1
    • Научно-исследовательский институт физико-химической биологии имени А.Н.Белозерского
    • Руководитель: Агапкина Ю.Ю. Участники НИР: Готтих М.Б., Зацепин Т.С., Зиганшин Р.Х., Смолов М.А.

• Патенты

  • • 2014 Производные 1,2,5-оксадиазолов, обладающие анти-вич активностью, фармацевтическая композиция, способ ингибирования интегразы вич-1
    • Авторы: Агапкина Юлия Юрьевна, Королев Сергей Павлович, Княжанская Екатерина Сергеевна, Анисенко Андрей Николаевич, Готтих Марина Борисовна, Кондрашина Ольга Владимировна, Зацепин Тимофей Сергеевич
    • #RU 2515413, 10 мая
  • • 2012 Functionalized nucleic acids and particles comprising them for the treatment of HIV infections
    • Авторы: Jean-françois Mouscadet, Olivier Delelis, Frédéric Subra, Gilles Divita, Timofey Zatsepin, Yulia Agapkina, Marina Gottikh
    • #EP2468303, 27 июня

• Членство в диссертационных советах

  • • с 20 декабря 2021 МГУ.014.2, МГУ имени М.В. Ломоносова, Химический факультет
    • 1.4.9 - Биоорганическая химия (хим. науки)
    • ученый секретарь
    • Действующие члены совета: Донцова О.А., Зверева М.Э., Копылов А.М., Агапкина Ю.Ю., Байков А.А., Богданов А.А., Габибов А.Г., Готтих М.Б., Громова Е.С., Деев С.М., Кочетков С.Н., Кубарева Е.А., Миронов А.А., Орецкая Т.С., Рубцова М.П., Сергиев П.В., Тишков В.И., Цетлин В.И., Шатский И.Н.

• Диссертация

  • • 2004 Интеграза ВИЧ-1: Влияние структуры ДНК-субстрата на активность в реакции 3’-концевого процессинга
    • Кандидатская диссертация по специальности 02.00.10 - Биоорганическая химия (хим. науки)
    • Автор: Агапкина Юлия Юрьевна, к.х.н., МГУ имени М.В. Ломоносова
    • Научный руководитель: Готтих М.Б., д.х.н., проф., МГУ имени М.В. Ломоносова
    • Защищена в совете Д 501.001.41 при МГУ имени М.В. Ломоносова, Химический факультет

• Руководство дипломными работами

  • • 2023 Роль белка SFPQ в постинтеграционной репарации ВИЧ-1
    • Научный руководитель: Агапкина Юлия Юрьевна
    • Автор: Силкина М.О. (Специалист)
  • • 2020 Роль клеточного белка SFPQ в регуляции репликации вируса иммунодефицита человека
    • Научные руководители: Агапкина Ю.Ю., Шадрина О.А.
    • Автор: Кихай Т.Ф. (Специалист)
  • • 2018 Характеристика интегразы вируса иммунодефицита человека нового генетического варианта CRF63_02A1
    • Научный руководитель: Юлия Юрьевна Агапкина
    • Автор: Мария Алексеевна Пустоварова (Специалист)

• Руководство курсовыми работами

  • • 2020 Изучение взаимодействия клеточного белка SFPQ c TAR-РНК вируса иимунодефицита человека
    • Научный руководитель: Агапкина Ю.Ю.
    • Автор: Белова Ульяна Дмитриевна (Специалист)
  • • 2017 Тестирование новых производных аденина и урацила в качестве ингибиторов интегразы ВИЧ-1
    • Научный руководитель: Агапкина Юлия Юрьевна
    • Автор: Бабадей О.А. (Специалист)
  • • 2017 Изучение ингибирующего действия новых соединений из ряда димерных бисбензимидазолов на активность интегразы ВИЧ-1
    • Научный руководитель: Агапкина Ю.Ю.
    • Автор: Семенов И.П. (Специалист)
  • • 2010 Определение констант диссоциации комплексов мутантных форм интегразы вируса иммунодефицита человека I типа с ДНК-субстратом
    • Научные руководители: Агапкина Ю.Ю., Королев С.П.
    • Автор: Латышев Г.С (Специалист)

• Авторство учебных курсов

  • • 2022 Биоорганическая химия
    • Авторы: Антипин Р.Л., Родина Е.В., Агапкина Ю.Ю.

---