Аннотация:Данные, полученные с использованием метода Hi-C,
свидетельствуют о том, что топологии геномов мыши и человека очень похожи, но, в то же
время, есть ряд принципиальных отличий в пространственной организации генома дрозофилы и
млекопитающих. Несмотря на активное применение Hi-C для анализа пространственной
организации генома различных организмов, недостаточно известно об отличиях в топологии
генома у близких клеточных линий одного организма. Для изучения данного вопроса мы
решили применить Hi-C к двум физиологически близким, но отличающимся по транскриптому
(Cherbas et al, 2011) клеточным линиям эмбриональных гемоцитов дрозофилы, S2 и Kc167.
Ранее с помощью Hi-C была изучена вторая из этих линий (Hou et al, 2012), поэтому мы можем
использовать ее в качестве контроля качества нашего эксперимента; обе эти линии являются
одними из наиболее изученных клеточных линий дрозофилы, что дает широкие возможности
для использования информации о них из баз данных. В нашей работе мы поставили следующую
экспериментальную задачу: c помощью Hi-C сравнить топологии генома в двух
физиологически близких клеточных линиях дрозофилы.