Аннотация:Биосинтез белков является одним из самых важных и энергозатратных процессов в клетке. Поэтому со времен открытия он активно и тщательно изучается не одним поколением исследователей. И хотя за этот период были опубликованы десятки тысяч статей, формирующих наше современное представление о его протекании как в клетках прокариот, так и эукариот, до сих пор некоторые моменты остаются неизвестными.
В 2010 году было показано, что белки eIF2D, MCTS1 и DENR могут выполнять некую важную функцию в белковом синтезе у эукариот. С тех пор было опубликовано несколько работ, демонстрирующих, как отсутствие перечисленных факторов в клетках влияет на трансляцию некоторых мРНК. Эти новые трансляционные факторы привлекли внимание исследователей еще и тем, что они оказались вовлечены в развитие таких серьезных заболеваний человека, как рак, аутизм, шизофрения и синдром Аспергера. К настоящему времени накопилось немало работ, предлагающих разные версии ответа на вопрос о том, какую же роль в биосинтезе белка стоит отвести новым участникам. По одной из версий, eIF2D и гетеродимер, образуемый белками MCTS1 и DENR, являются функциональными аналогами: оба способны участвовать в неканонической инициации трансляции, осуществлять разборку пост-терминационного комплекса 40S-тРНК-мРНК и влиять на эффективность реинициации трансляции. Однако есть ряд аргументов, указывающих на различия в функциях этих факторов, поэтому мы решили систематизированно подойти к изучению их функциональных особенностей. Поскольку многие вопросы о механизмах работы eIF2D, MCTS1 и DENR до сих пор остаются нерешенными, актуальность их исследования очевидна.
Перед нами стояла задача комплексно подойти к изучению роли белков eIF2D, MCTS1 и DENR в различных клеточных процессах. Для этого мы провели филогенетический анализ этих белков на наличие ортологов среди обширной группы представителей эукариот, а также сравнили их с ближайшими прокариотическими гомологами. Далее мы провели транскриптомный анализ линий клеток Jurkat (T-клеточная лимфома) с подавленной экспрессией генов eIF2D, MCTS1 и DENR с последующим поиском функциональных групп генов, подвергшихся наиболее значимому изменению уровня экспрессии. Затем с помощью технологии CRISPR/Cas мы осуществили нокаут по генам eIF2D, MCTS1 и DENR в клеточной линии Jurkat для изучения роли соответствующих белков в трансляции различных репортерных мРНК.