|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
Интеллектуальная Система Тематического Исследования НАукометрических данных |
||
Исследование образования комплекса белков пластоцианина и цитохрома f с использованием объединенного метода броуновской и молекулярной динамикидипломная работа (Специалист)
- Научные руководители: Хрущев С.С., Коваленко И.Б.
- Автор: Федоров В.А.,
- Тип: Специалист
- Организация, в которой проходила защита: МГУ имени М.В. Ломоносова
- Год защиты: 2014
- Аннотация: Взаимодействие белков играет ключевую роль в большинстве биологических систем и включает в себя множество процессов, происходящих в живой клетке на различных пространственных и временных масштабах: от перераспределения электронной плотности на атомах в молекуле (времена порядка фемтосекунд и расстояния доли ангстрема), движения атомов в молекуле (пикосекунды), до диффузии белков в клетке (микросекунды и микрометры). Для каждого из этих уровней организации биологической системы разработаны свои методы экспериментального исследования и моделирования, но для понимания всего процесса в целом необходимо сопряжение различных подходов. Цель работы и постановка задачи Целью работы является исследование и полная компьютерная реконструкция процесса образования комплекса белков пластоцианина и цитохрома f. В работе предполагается решить следующие задачи: Разработать метод компьютерной реконструкции процесса образования белкового комплекса, объединяющий подходы броуновской и молекулярной динамики. Определить параметры полноатомной молекулярно-динамической модели взаимодействия белков пластоцианина и цитохрома f в явно заданном растворителе. Оценить время, за которое диффузионно-столкновительные комплексы могут эволюционировать к состоянию финального комплекса. При использовании метода получить набор траекторий броуновской/молекулярной динамики Оценить константу скорости образования комплекса по набору траекторий броуновской/молекулярной динамики.
- Добавил в систему: Хрущев Сергей Сергеевич