Аннотация:IRES-элементы (англ. Internal Ribosome Entry Site) – это цис-действующие элементы вирусных РНК, способные привлекать рибосомы на внутренние участки транскриптов и обеспечивать их кэп-независимую трансляцию (Cорокин и др., 2021).
По всей видимости, это достигается путём активного манипулирования рибосомой, что позволяет укладывать мРНК в мРНК-связывающий канал рибосомы и одновременно обеспечивать сборку инициаторного комплекса независимо от 5`-концевого m7G-кэпа. Неканонические способы образования инициаторного комплекса дают возможность IRES-содержащим мРНК направлять синтез вирусных белков в условиях частичной инактивации факторов инициации трансляции (eIFs) – ситуация, которая зачастую наблюдается при вирусной инфекции и может быть связана как с работой защитных систем клетки, так и с активностью самого вируса (Cорокин и др., 2021).
IRES-элементам некоторых пикорнавирусов для эффективной работы требуются определённые клеточные белки, так называемые ITAF (англ. IRES trans-acting factors). Как правило, в роли ITAF выступают РНК-связывающие белки, которые в норме не являются активными участниками инициации трансляции. По-видимому, они выполняют функцию РНК-шаперонов, влияя на трехмерную структуру вирусного IRES-элемента и стабилизируя его активную конформацию.
В литературе показано, что IRES-элементу вируса ящура FMDV, (англ. foot-and-mouth disease virus) для образования 48S инициаторного комплекса, помимо канонических eIF, нужен клеточный белок ITAF45/PA2G4 (Pilipenko et al., 2000; Yu et al., 2011). Этот белок присутствует только в делящихся клетках, возможно, именно поэтому вирус ящура не способен эффективно размножаться в нейронах. В то же время на IRES-элементе родственного FMDV вируса мышиного энцефаломиокардита (EMCV, англ. encephalomyocarditis virus) 48S комплекс эффективно собирается в отсутствие PA2G4 (Yu et al., 2011).
Проведенный в нашей лаборатории полногеномный нокаутный CRISPR-скрининг показал, что в культивируемых клетках человека, переживших заражение вирусом EMCV, был нокаутирован ген белка PA2G4. Этот результат позволяет предположить, что белок PA2G4 критически важен для протекания инфекции EMCV в клетках млекопитающих.