|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
Интеллектуальная Система Тематического Исследования НАукометрических данных |
||
Делеционный анализ промоторной области ретротранспозона L1дипломная работа (Специалист)
- Научный руководитель: Дмитриев С.Е.
- Автор: Оловников Иван Алексеевич
- Тип: Специалист
- Организация, в которой проходила защита: МГУ имени М.В. Ломоносова
- Год защиты: 2007
- Аннотация: Мобильными генетическими элементами (МЭ) называются последовательности ДНК, обладающие особой организацией и способные перемещаться в пределах генома хозяина. Мобильные элементы характерны для прокариот и эукариот. Они различаются по строению, размеру и механизму перемещения. У некоторых организмов МЭ играют второстепенные роли, у других же они необходимы для поддержания жизненно важных физиологических процессов. Они могут занимать очень большую часть генома хозяина: например, около половины всей ДНК человека образована именно МЭ. В целом, существование мобильных элементов считают особым видом паразитизма, который, однако, по тем или иным причинам не был выбракован в процессе эволюции. Интеграция (встраивание) мобильных элементов в гены или в окрестности генов может вызывать аномалии, зачастую сопровождающиеся фенотипическими эффектами, что и привело к обнаружению многих МЭ. К важнейшему классу МЭ эукариот относятся ретроэлементы. Для всех ретроэлементов свойственно размножение с помощью РНК-посредника. Главной особенностью автономных ретроэлементов является их самодостаточность: активные копии содержат все необходимые области для поддержания активности после транспозиции. Для того, чтобы копия ретроэлемента могла генерировать новые копии, необходимо сохранение всех открытых рамок считывания для синтеза белков, промотора, который мог бы запускать транскрипцию МЭ и специальных регуляторных участков, специфичных для разных типов ретроэлементов. Ретроэлементы семейства LINE1 являются единственными из известных на сегодняшний день активных автономных МЭ человека. Промотор МЭ семейства LINE1 расположен в их 5`-нетранслируемой области (5`-НТО) и имеет ряд особенностей. В отличие от большинства генных промоторов, он является «внутренним», то есть запускает транскрипцию последовательности, внутри которой сам находится. Наличие такого промотора - необходимое условие автономности мобильного элемента, так как при этом возможно создание полноразмерной копии, начиная с первого нуклеотида, причем вне зависимости от геномного контекста, сохраняя все последовательности МЭ внутри копии. Изучению внутреннего промотора ретротранспозонов семейства LINE посвящено немало работ, однако ясности в понимании принципов его функционирования по-прежнему нет. Ранее считалось, что основные детерминанты внутреннего промотора LINE-1-элементов человека, подобно классическим LINE-элементам дрозофилы, расположены в пределах первых ста пар оснований 5`-НТО этих МЭ (Swergold, 1990). Однако, в нашей лаборатории получены данные (Dmitriev et al., 2007), указывающие на то, что первые сто нуклеотидов («минимальный промотор») выполняют лишь вспомогательную роль в функционировании этого промотора. Данная работа посвящена изучению свойств 5`-НТО L1-элемента человека. В работе сделаны следующие выводы: 1. Транскрипционная активность первых ста пар оснований («минимального промотора») 5`-нетранслируемой области ретротранспозона LINE1 человека существенно ниже активности полноразмерной 5`-нетранслируемой области LINE1. 2). При удалении «минимального промотора» эффективность транскрипции гена-репортера, направляемая 5`-нетранслируемой областью LINE1, падает не критически. 3. Внутренний участок (+386-+910) 5`-НТО LINE1 человека достаточен для эффективной экспрессии гена-репортера на уровне, сравнимом с уровнем экспрессии для полноразмерной 5`- НТО. 4. Область (+386-+910) независимо от ее ориентации способна стимулировать транскрипционную активность минимального промотора из его 5`-прилежащей области, но не из удаленного положения (~2 т.п.о.)
- Добавил в систему: Дмитриев Сергей Евгеньевич