|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
Интеллектуальная Система Тематического Исследования НАукометрических данных |
||
Реконструкция эволюции белковых доменов малой сложностидипломная работа (Специалист)
- Научный руководитель: Алексеевский А.В.
- Автор: Котюргин Александр Павлович
- Тип: Специалист
- Организация, в которой проходила защита: МГУ имени М.В. Ломоносова, НИИ физико-химической биологии имени А.Н. Белозерского
- Год защиты: 2021
- Аннотация: Целью этой работы является поиск способа удовлетворительной реконструкции филогении последовательностей низкой сложности. В этой работе рассматривается два возможных подхода к этой проблеме. Во-первых, оставаясь в рамках методов, основанных на выравниваниях, можно изменить построение выравнивания таким образом, чтобы уменьшить шум, препятствующий реконструкции филогении. Во-вторых, можно попробовать реконструировать функцию расстояния между последовательностями по существующим данным. Для достижения этой цели решались следующие задачи: 1. Найти набор данных последовательностей низкой сложности, для которого можно считать доказанным, что они гомологичны, и для которых существует надежное референсное филогенетическое древо. 2. Определить особенности выравниваний последовательностей низкой сложности, которые мешают корректному восстановлению филогении и найти способы модификации выравниваний, компенсирующие эти особенности. 3. Оценить качество этих способов модификации сравнением деревьев реконструированных на основе модифицированных и немодифицированных выравниваний с референсным деревом. 4. Найти и протестировать новые способы представления последовательностей, которые могут воспроизвести филогенетические отношения между последовательностями низкой сложности
- Добавил в систему: Алексеевский Андрей Владимирович