Исследование конформационных перестроек гемов цитохромов с и с1 в процессе образования белок-белкового комплекса методами молекулярного моделированиядипломная работа (Магистр)
Аннотация:В данной работе изучалось изменение конформации порфиринового кольца гемов цитохрома с и с1 в процессе образования комплекса между ними. Большинство научных работ в данной области сосредоточены на изучении гемов в отдельных белках, что делает исследование комплекса между цитохромом с и с1 особенно актуальным. Нами обнаружено скоординированное поведение гемов в процессе образования комплекса между цитохромами. Несмотря на то, что связь гема с белком одинакова для всех гемов типа с, а именно через тиоэфирные связи цистеинов и координацию атома железа посредством метионина и гистидина, поведение гема остается различным для гемов свободных цитохромов с и с1. Однако, как только цитохромы связываются друг с другом и образуют комплекс, характер поведения гемов становится похожим. Результаты, полученные на данном этапе исследования, могут являться перспективными для дальнейших исследований в данной области. Передача электрона с одной функциональной группы на другую несомненно имеет квантовую природу, которую нельзя описать в рамках применяемых в работе методов. Однако, этот факт также необходимо учитывать при интерпретации полученных данных.