|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
Интеллектуальная Система Тематического Исследования НАукометрических данных |
||
ИССЛЕДОВАНИЕ ТОПОЛОГИИ МЕТАГЕНОМА МИКРОБНЫХ СООБЩЕСТВдипломная работа (Бакалавр)
- Научный руководитель: Ульянов Сергей Владимирович
- Автор: Соловьёв Михаил Андреевич
- Тип: Бакалавр
- Организация, в которой проходила защита: МГУ имени М.В. Ломоносова
- Год защиты: 2021
- Аннотация: Линейные размеры молекул ДНК, входящих в состав генома, на много порядков превышают размеры ядер или нуклеоидов живых клеток. Для хранения ДНК в клетке она должна быть эффективно компактизована, причем компактизация не должна препятствовать нормальной транскрипции и репликации ДНК. Исследования последних десятилетий показали, что компактизация ДНК, осуществляемая при помощи ДНК-связывающих белков, не только не препятствует этим процессам, но и непосредственно связана с их регуляцией. В связи с развитием медицины, генной инженерии и биотехнологии это делает пространственную организацию генома интереснейшим объектом для изучения. Топология генома организмов, не имеющих хозяйственного значения, также представляет большой интерес для биологии, поскольку позволяет установить неизвестные прежде закономерности функционирования генома и прояснить причинно-следственные связи между известными явлениями. Рассмотрение её с эволюционной точки зрения способно пролить свет на процессы мегаэволюции. В этом отношении особый интерес представляет пространственная организация генома архей, поскольку её изучение может приблизить нас к решению вопроса о происхождении эукариот. С другой стороны, многие археи являются экстремофилами, и изучение данного аспекта организации генома поможет определить особенности организации хроматина, функционирующего в экстремальных условиях. К сожалению, работы по изучению пространственной организации генома архей начались лишь в последние годы, и накопленный на данный момент объем данных недостаточен для решения вышеописанных задач. Отчасти это связано с особенностями физиологии этих организмов: необходимость культивации в экстремофильных условиях и особенности клеточных оболочек усложняют экспериментальные процедуры и требуют корректировки стандартных методик при работе с ними. В последние годы были разработаны методы, позволяющие получать информацию о топологии многих геномов одновременно, что оказалось ценно для изучения микробных сообществ. Однако описанные методы непригодны для работы с клетками архей по вышеописанным причинам. В данной работе мы задались целью исследовать топологию индивидуальных геномов в сложном микробном сообществе. Для этого мы поставили перед собой следующие задачи: • Отработать технику 3C-seq и Hi-C на бактериальных клетках • Получить Hi-C-данные для микробных сообществ из пищевых продуктов спонтанного брожения • Картировать топологию генома архей Thermofilum adornatum, Thermogladius calderae, Pyrobaculum ferrireducens. • Получить Hi-C-данные для микробных сообществ из термальных источников.
- Добавил в систему: Ульянов Сергей Владимирович
Прикрепленные файлы
| № | Имя | Описание | Имя файла | Размер | Добавлен |
|---|---|---|---|---|---|
| 1. | Полный текст | Solovyov_diplom.pdf | 2,1 МБ | 2 июня 2021 [SergeyUlyanov] |