Аннотация:Начальным уровнем компактизации хроматина является нуклеосома – фрагмент ДНК
длиной 147 пар нуклеотидов (п.н.), обернутый вокруг октамера гистонов. Формирование
нуклеосом способствует сохранению ДНК от разрушающих воздействий, но при этом
снижает ее доступность для различных факторов транскрипции, репликации и репарации. В
связи с этим в дифференциации и жизнедеятельности клеток важную роль играют
механизмы, контролирующие состояние хроматина. Одними из факторов, которые способны
влиять на доступность генетической информации, являются архитектурные белки и
комплексы ремоделирования.
HMGB (high mobility group B) – семейство архитектурных негистоновых белков, для
которых характерно наличие уникального ДНК-связывающего домена. По числу в ядре
данное семейство уступает только коровым гистонам. К представителям данного семейства у
Saccharomyces cerevisiae относят белки Nhp6 и Hmo1. В структуре Hmo1 выделяют два
глобулярных ДНК-связывающих домена (А и В) и положительно заряженный C-концевой
участок. Он напрямую участвует в транскрипции генов рибосомальных белков и рДНК (Hall
et al., 2006; Albert et al., 2013). Предполагается, что Hmo1 стабилизирует хроматин, выступая
в роли линкерного гистона (Panday, Grove, 2017).
Nhp6 содержит один ДНК-связывающий домен и самостоятельно не влияет на
структуру нуклеосом, но необходим для работы АТФ-независимого ремоделирующего
комплекса дрожжей FACT (facilitates chromatin transcription) (Valieva et al., 2016). Ранее
выдвигались предположения, что и другие HMGB белки пекарских дрожжей могут быть
функциональными аналогами Nhp6 в работе yFACT (Stillman, 2010). Однако исследования
по данной теме, как и детальное изучение природы взаимодействия Hmo1 с нуклеосомами и
его влияния на их структуру, еще не были проведены. В данной дипломной работе
исследуется влияние Hmo1 на структуру коровых нуклеосом и способность Hmo1 выступать
в роли третьей субъединицы дрожжевого комплекса FACT.