Аннотация:Острый лейкоз – злокачественное заболевание кроветворной системы, при котором клетки утрачивают способность дифференцироваться в зрелые формы. В большинстве случаев сопровождаются хромосомными перестройками, инверсиями и делециями. Примерно в 10% случаев в хромосомные перестройки вовлекается ген лизиновой гистон метилтрансферазы KMT2A.
В настоящее время известно более 100 генов-партнёров, с которыми KMT2A вовлекается в хромосомные перестройки. Для изучения механизмов канцерогенеза и подходов к лечению необходимо создание клеточных моделей. В настоящее время модели созданы только для нескольких самых частых перестроек, и они не всегда приближены к реальной ситуации в лейкозных клетках. Другой проблемой является невозможность сравнения разных перестроек на существующих моделях, так как они отличаются способом моделирования транслокации, исходным типом клеток и другими характеристиками. Для релевантного сравнения перестроек по их влиянию на клетку необходим набор клеточных моделей, отличающихся между собой по типу перестройки, но идентичных по остальным признакам.
В настоящей работе апробированы 2 подхода к получению клеточных моделей острого лейкоза с участием гена KMT2A. Для создания моделей с сохранением нативного геномного окружения в настоящей работе апробированы 2 подхода с использованием системы CRISPR-Cas9. В качестве генов-партнёров взяты гены AF4, ARHGAP26 и GCG. AF4 является одним из наиболее частых генов-партнёров, ARHGAP26, напротив, редко вовлекается в хромосомные перестройки с участием KMT2A. Ген GCG ранее не был замечен в хромосомных перестройках и используется для создания перестройки в клеточной модели, выполняющей роль контроля для оценки эффектов остальных моделируемых перестроек.