Моделирование влияния среды на фотофизические свойства внутриклеточного кальциевого индикатора на основе флуоресцентного красителя Fura-2дипломная работа (Бакалавр)
Аннотация:Разработана методика моделирования оптических свойств красителя Fura-2 в водном растворе с помощью методов молекулярной динамики и комбинированных методов квантовой и молекулярной механики. Из анализа молекулярно-динамических траекторий сделан вывод о том, что свободная молекула красителя обладает большой конформационной подвижностью в водном растворе, в отличие от связанного состояния в комплексе с ионами кальция. Анализ характера низколежащего электронно-возбуждённого состояния свидетельствует о наличии внутримолекулярного переноса заряда, что объясняет наблюдающийся экспериментально большой стоксов сдвиг и сильное влияние полярности среды на фотофизические свойства Fura-2. Установлено, что основной вклад в значительное уширение спектра поглощения Fura-2 в свободном виде вносит внутримолекулярное вращение аминогруппы сопряженной системы красителя в основном электронном состоянии. Сдвиг максимума поглощения в более коротковолновую область при связывании ионов кальция молекулой красителя связан с нарушением сопряжения в молекуле Fura-2.