Аннотация:Объектом исследования являлась система репарации неканонических пар нуклеотидов или «мисматчей» (mismatch repair, MMR), функционирование которой необходимо для поддержания стабильности генома. В клетке эта система отвечает за исправление «ошибок» биосинтеза ДНК. Кроме того, она способна восстанавливать некоторые повреждения ДНК, возникающие в результате действия эндогенных и экзогенных факторов.
Целью данной работы являлось изучение влияния факторов окружающей среды, а именно теплового и окислительного стрессов, воздействия УФ-облучения и азотистой кислоты, а также присутствия высоких концентраций Mn2+, на функционирование системы MMR в прокариотических клетках.
Для исследований была выбрана факультативная фотосинтетическая α-протеобактерия Rhodobacter sphaeroides, которая является удобным модельным организмом для изучения клеточного ответа, так как обладает широкой вариативностью метаболических путей. Также в работе использована Escherichia coli, в которой среди бактерий наиболее изучена система MMR. Исследование функционирования системы MMR в стрессовых условиях является актуальной задачей, решение которой позволит глубже понять реакцию бактериальных клеток на повреждения ДНК, и расширить наши знания о механизмах адаптации клеток к различным условиям.
В работе оценена относительная эффективность транскрипции генов ключевых белков системы MMR — МutS и МutL. Впервые установлено, что в бактерии R. sphaeroides относительное количество мРНК гена mutS в 20 раз выше, чем mutL, в то время как клетках E. coli относительное количество мРНК гена mutS в 3 раза ниже, чем mutL. Полученный результат может быть связан с различиями в механизмах функционирования MMR в этих бактериях. Показано, что отсутствие в клетках R. sphaeroides и E. coli глобального регулятора транскрипции генов 6S РНК не влияет на эффективность транскрипции генов белков MutS и MutL. Воздействие стрессов на клетки R. sphaeroides и E. coli приводит к уменьшению относительного количества мРНК генов mutS и mutL в 1,5-2,5 раза, что, по-видимому, связано с активацией других видов репарации ДНК, например, SOS.