Конформационный анализ пирролидина, тетрагидротиофена и тетрагидротиофен-1-оксида по данным квантово-механических расчетов и ЯМРдипломная работа (Специалист)
Аннотация: Настоящая работа посвящена изучению конформационного состояния серии насыщенных пятичленных гетероциклов – пирролидина, тетрагидротиофена и тотрагидротиофен-1-оксида. Интерес к этим соединениям определяется их исключительной важностью как удобных модельных систем для множества важнейших биологических молекул, таких как сахара, нуклеиновые кислоты и т.д. Наличие в этих системах гибких пятичленных циклов делает, например, скелет ДНК исключительно мобильным, что по данным последних исследований необходимо для надежного и быстрого распознавания субстратов.
В дипломной работе получены следующие результаты:
Проведен синтез объектов исследования: тетрагидротиофена и тетрагидротиофен-1-оксида. Зарегистрированы спектры ЯМР 1H тетрагидротиофена, пирролидина и тетрагидротиофен-1-оксида в CDCl3 и CD3CN. С использованием программного комплекса Valisa расшифрована сложная мультиплетная структура спектров. Для тетрагидротиофена и пирролидина впервые определены по две геминальные и по четыре константы спин-спинового взаимодействия через четыре связи; значительно уточнены вицинальные константы спин-спинового взаимодействия. Спектральные параметры тетрагидротиофен-1-оксида измерены впервые.
Для всех изученных молекулярных систем проведен расчет координаты реакционного пути и построен “вакуумный” потенциал системы (метод Хартри-Фока (RHF) с базисными функциями типа 6-311G**). Каждая точка на координате реакционного пути процесса псевдовращения охарактеризована параметрами складчатости: фазовым углом псевдовращения и амплитудой складчатости. Детально проанализированы конформационные зависимости констант спин-спинового взаимодействия, рассчитанные методом конечных возмущений в приближении DFT (ub3lyp) c волновыми функциями 6-311G**.
Предпринята попытка решения обратной колебательной задачи. Показано, что при реставрации потенциала для всех изученных гетероциклов оценка больших барьеров сопряжена со значительными погрешностями.
Показано, что в соответствии с литературными данными для ТГТ минимум потенциала соответствует конформациям “твист” 3Т4 и 4Т3, а для пирролидина – “конверт” с выведенным из плоскости атомом азота и аксиально ориентированным протоном связи N-H. Для ТГТО наблюдается более сложная зависимость функции потенциальной энергии: минимум наблюдается для конформаций “твист” 5Т1 и 4Т3.