Аннотация:6S РНК – это малая некодирующая РНК, способная связываться с активным центром бактериальной РНК-полимеразы и за счет этого ингибировать транскрипцию. Однако ее физиологическая роль в клетках требует дополнительного изучения.
Объектами нашего исследования были выбраны 6S РНК E. coli и 6S-1 и 6S-2 РНК B. subtilis, поскольку предполагается, что их роль в жизнедеятельности бактерий связана с клеточным ответом на стрессовые условия. Основной целью данной работы был сравнительный анализ функциональной роли 6S РНК E. coli и B. subtilis в условиях клеточного стресса.
Из проведенной работы можно сделать следующие выводы:
1. Впервые обнаружен фенотип клеток E. coli с делецией гена 6S РНК, выражающийся в задержке перехода в экспоненциальную фазу роста под воздействием окислительного стресса (в присутствии H2O2). Установлено, что отсутствие 6S РНК приводит к повышению чувствительности клеток к перекиси водорода и снижает их выживаемость по сравнению с клетками дикого типа.
2. Установлено, что в условиях окислительного стресса профиль экспрессии 6S РНК в клетках E. coli не изменяется.
3. Продемонстрировано, что делеция гена 6S РНК влияет на экспрессию белков E. coli как в стандартных условиях, так и в присутствии 5 мМ H2O2. Влияние 6S РНК наиболее ярко выражено в экспоненциальной фазе роста клеток в условиях окислительного стресса. Большинство идентифицированных белков, экспрессия которых регулируется с помощью 6S РНК участвуют, в процессах клеточного метаболизма.
4. Показано, что нокауты 6S-1 и 6S-2 РНК не оказывают существенного влияния на жизнеспособность и рост клеток B. subtilis в опробованных нами стрессовых условиях.
Полученные результаты подтверждают гипотезу о связи функциональной роли 6S РНК E. coli со стрессовым ответом клеток.