Описание:В спецкурсе будут рассмотрены методы и алгоритмы биоинформатики. В рамках спецкурса будут изучены следующие темы. Модели эволюции нуклеотидных и аминокислотных последовательностей. Методы сравнения последовательностей.
Алгоритмы выравнивания последовательностей. Методы динамического программирования. Скрытые цепи Маркова (HMM) и их применение в биоинформатике. Методы анализа данных секвенирования нового поколения (NGS). Методы сборки геномов de novo; графы де Брюйна. Методы RNA-Seq. Методы Chip-Seq. Методы MeDIP-seq. Методы анализа метагеномов и квазивидов. Методы анализа больших данных. Слушатели будут ознакомлены с основными биоинформатическими ресурсами, включая базы данных, веб-порталы, компьютерные программы для работы с базами данных молекулярной биологии, а также программами, реализующими биоинформатические методы.