ИСТИНА

С помощью технологии получения полноразмерной копии транскрипта (RACE) были амплифицированы 5’- и 3’-концевые фрагменты транскриптов генов ортологов Profilin и IL-17, анализ полученных полноразмерных последовательностей транскриптов ортологов генов Profilin и IL-17 длиной 753 и 2050 пн подтверждает родство с известными ортологами и предполагает участие продуктов их трансляции в защитных реакциях морской звезды. На приборе MiSeq2000 (Illumina, США) было получено 2,7 млн парно-концевых чтений нормализванной библиотеки РНК, на их основе была получена черновая de-novo сборка транскриптома. Аннотированы около 2,5 тысяч транскриптов сборки, в том числе ортологи Profilin, Vitellogenin, Toll-подобного рецептора и нескольких связанных с ним молекул, двух рецепторов суперсемейства TNF, рецептора к TGFβ, RAG-рекомбиназ, C3 и С5 компонентов комплемента, лектинов c-типа, нескольких каспаз, транскрипционных факторов Bcl-2 и NFκB, интерлейкин-подобных молекул, молекул иммуноглобулинового суперсемейства, множества рецепторов с лейцин-богатыми повторами. В дальнейшем планируется секвенирование кДНК-библиотеки из наивных и из активированных бактериальным липополисахаридом целомоцитов морской звезды с получением 30-50 миллионов чтений для сборки транскриптома с хорошим покрытием с дальнейшим картированием чтений каждой библиотеки на общую сборку.