ИСТИНА

На сегодняшний день исследование репертуаров Т-лимфоцитов и поиск клонов, ассоциированных с тем или иным заболеванием, является актуальной задачей иммунологии. Терапия моноклональными антителами к альфа/бета цепям Т-клеточных рецепторов (TCR) представляется перспективной для лечения некоторых аутоиммунных и онкологических заболеваний. На первом этапе в работе была проведена валидация специфичности коммерческих антител к бета-цепям TCR путем NGS-секвенирования сортированных CD3+-клеток. У 7 из 10 антител этот показатель специфичности был близок к 100%. В некоторых случаях иммунодиагностика проводится с помощью NGS-секвенирования, например, bulk-RNA-TCR-seq, которое показывает экспрессию генов TCR по уровню мРНК. Однако до сих пор корреляция между экспрессией мРНК и уровнем функционального белка вызывает сомнения. В связи с этим, на втором этапе мы сравнили репертуары бета-цепей TCR, полученные с помощью bulk-RNA-TCR-seq и спектральной цитометрии. Мы выявили слабую взаимосвязь между двумя методами (коэффициент корреляции Спирмена, r = 0,5). Полученные данные подчеркивают важность функциональной валидации данных NGS-секвенирования для иммунодиагностики.