ИСТИНА

Пикорнавирусы – это семейство (+)РНК-содержащих вирусов, вызывающих разнообразные заболевания человека и животных. Их мРНК содержат участки внутренней посадки рибосом (IRES), большинству из которых для эффективной работы, помимо классических трансляционных факторов, требуются клеточные РНК-связывающие белки – ITAF (IRES trans-acting factors). Репертуар ITAF, используемых IRES-элементами разных пикорнавирусов, изучен недостаточно. Мы провели нокаутные CRISPR/Cas-скрининги на устойчивость культивируемых клеток HEK293T к цитопатической инфекции, вызываемой несколькими представителями пикоравирусов из разных групп: вирусом энцефаломиокардита (EMCV), несколькими серотипами эховирусов (ECV) и вирусов Коксаки (CVA и CVB). Среди идентифицированных «хитов» обнаружились гены РНК-связывающих белков: PA2G4 в случае EMCV (был известен ранее как ITAF45 – фактор, необходимый для работы IRES-элемента вируса ящура FMDV), STRAP в случае двух CVA (он и его партнёр CDSE1/unr были ранее идентифицированы в качестве ITAF риновируса HRV) и MBNL1 в случае нескольких ECV и CVA (роль которого в вирусных инфекциях ранее не была показана, однако он является партнёром PTBP1 – известного ITAF, необходимого почти всем пикорнавирусным IRES-элементам). Клетки, нокаутные по генам PA2G4, STRAP, CSDE1 и MBNL1, были проанализированы на устойчивость к разным пикорнавирусам и на способность поддерживать IRES-зависимую трансляцию репортерных мРНК в культивируемых клетках и в бесклеточных системах, приготовленных на их основе. Результаты этой работы показали сложный и неоднозначный характер зависимости неканонической трансляции от присутствия данных белков. Работа выполнена при финансовой поддержке РНФ, грант 23-14-00218.