ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
|
Интеллектуальная Система Тематического Исследования НАукометрических данных |
||
Наиболее важными хозяйственно-ценными признаками такой культуры как томат являются размер плодов, сроки созревания и вкусовые качества, которые зависят от апопластической доставки углеводов в нефотосинтезирующие органы и их качественного и количественного состава. Одним из основных ферментов, участвующих в процессе доставки сахарозы в клетку по апопластическому пути во время развития плодов являются инвертазы. В настоящей работе определены полноразмерные последовательности генов- гомологов кислой апопластической инвертазы LIN7 у диких и культивируемых видов томатов (Solanum section Lycopersicon). Идентифицировано 12 новых генов-гомологов. Все гены состояли из шести экзонов и пяти интронов и включали высоко консервативный экзон 2, состоящий из 9 пн. Помимо интронного полиморфизма выявлен высокий уровень полиморфизма в экзонах (226 SNPs, 7.89%), что указывает на сильную межвидовую дивергенцию тестированных видов томатов. Определены экспрессионные паттерны гомологичных генов LIN7. Показана специфичность экспрессии в зрелых плодах и цветках, что указывает на важную роль данного гена в формировании плодов томатов. Биоинформатическое прогнозирование выявило первичную, вторичную и третичную структуру, характерную для семейства белков инвертаз, и показано наличие у всех консервативных каталитических сайтов, описанных ранее. Показана возможность использования генов-гомологов LIN7 для установления филогении представителей секции Lycopersicon рода Solanum. С большой достоверностью все исследованные виды томатов сформировали два кластера, соответствующие самоопыляемым и перекрестноопыляемым, а также красноплодным и зеленоплодным видам. Найденные вариабельные сайты, различия в уровнях экспрессии у отдельных видов томатов, наряду с выявленными радикальными замещениями аминокислот могут быть причиной функциональных различий в работе кислых инвертаз. Характеристика аминокислотной вариабельности кислых инвертаз различных представителей секции Lycopersicon может быть полезна для оценки генетического потенциала генов-гомологов и будет использоваться в селекции новых сортов томата, так как LIN7 имеет существенное значение для процесса закладки и развития плодов.