ИСТИНА

Глутаматдегидрогеназа (ГДГ) является важным ферментом метаболизма глутамата, ключевого возбуждающего нейромедиатора и молекулы, связывающей метаболизм углерода и азота. Несмотря на то, что ГДГ является одним из первых ферментов, у которых была обнаружена аллостерическая регуляция [1], до сих пор актуальна проблема структурной характеристики аллостерических сайтов ГДГ, особенно с учетом наличия двух изоферментов ГДГ у человека [2]. До недавнего времени среди комплексов ГДГ млекопитающих с аллостерическими активаторами были доступны только структуры с АДФ с низким (3,5 Å) разрешением. Стремясь расширить понимание структурных основ аллостерической активации ГДГ, для которой большое значение может иметь ацетилирование остатков лизина белка [3], мы использовали ГДГ быка в качестве модели. Впервые удалось расшифровать структуру ГДГ млекопитающих в тройном комплексе с активаторами лейцином и АДФ, закристаллизованными вместе с ионом калия – с разрешением 2,45 Å (PDB ID: 8AR7) [4]. Также удалось существенно улучшить разрешение комплекса ГДГ с АДФ – до 2,4 Å (PDB ID: 8AR8). Тройной комплекс с лейцином и АДФ отличается от бинарного комплекса с АДФ конформацией С-концевого участка ГДГ, участвующего в связывании лейцина и взаимодействии субъединиц фермента. Обнаруженный в ГДГ быка сайт связывания калия может опосредовать взаимодействие между сайтами связывания лейцина и АДФ. Новые структурные данные улучшили понимание роли ацетилирования ГДГ в регуляции ее активности. Таким образом, полученные результаты дают новое представление о механизмах активации ГДГ лейцином и АДФ. Работа выполнена при поддержке гранта РФФИ №20-54-7804 и стипендии имени М.В. Остроградского для аспирантов от посольства Франции в Москве.