ИСТИНА

Для поиска потенциальных биомаркеров рака мочевого пузыря было проведено ненаправленное метаболомное профилирование образцов мочи (более 100 образцов) методом ВЭЖХ-МСВР. Были выбраны оптимальные методы обработки сигнала (разметка и выравнивание пиков, заполнение пропущенных значений, коррекция дрейфа, нормализация, учет фенотипической изменчивости). Отбор биомаркеров проводили путем применения мультикритериального подхода (статистические тесты, метод частных наименьших квадратов, размах средних). Для валидации панели биомаркеров исходную когорту образцов случайным образом разбивали на два поднабора и оценивали площадь под ROC-кривой (после классификации методом машины опорных векторов с радиальной базисной функцией), а также вычисляя распределение значений точности классификации на полном наборе данных после 1000 бутстрэповских выборок (с тем же классификатором). Идентификацию биомаркеров проводили одновременно путем сравнения библиотечных значений точных масс аддуктов (HMDB, RefMet) и сопоставления масс-спектров 2-го поколения ионов (MetFrag, CFM-ID).