ИСТИНА

В настоящей работе представлены результаты молекулярно-динамического моделирования конформационной динамики β2-адренорецептора – при наличии и при отсутствии холестерина в системе. Модельная система состояла из молекулы рецептора, помещенной в гидратированный липидный бислой. Моделирование было проведено с использованием программного пакета GROMACS [2] на базе суперкомпьютера «Ломоносов» НИВЦ МГУ в NPТ-ансамбле с использованием силового поля CHARMM36 (для молекул воды использовалась модель TIP3P) [3]. Были проанализированы молекулярно-динамических траектории длиной 700 нс с записью точек траектории каждые 10 пс. Получено, что наличие или отсутствие холестерина в модельной мембране приводит к смещению равновесия между ансамблями конформеров. В частности, в присутствии холестерина стабилизируется особое неактивное состояние рецептора, что свидетельствует о роли холестерина как потенциального аллостерического модулятора функционального поведения β2-адренорецептора.