ИСТИНА

6S РНК – это малая некодирующая РНК (нкРНК), осуществляющая регуляцию экспрессии генов в прокариотических клетках. В отличие от большинства бактериальных нкРНК, которые взаимодействуют с мРНК определенных генов, 6S РНК связывает белок – РНК-полимеразу (РНКП) – и блокирует ее активность. Это приводит к глобальному нгибированию транскрипции в клетке. Имитируя промотор ДНК, 6S РНК может служить матрицей для синтеза коротких РНК-транскриптов (пРНК), что при определенных обстоятельствах приводит к высвобождению РНКП из прочного комплекса с 6S РНК. Основные исследования в этой области проведены для Escherichia coli и Bacillus subtilis, при этом были выявлены значительные отличия в особенностях функционирования в этих бактериях. В данной работе мы сравнили характерные свойства 6S РНК из трех различных альфа-протеобактерий: R. sphaeroides, B. japonicum и S. meliloti. В первую очередь с помощью Нозерн-блоттинга были получены профили экспрессии всех трех 6S РНК, которые также были подтверждены методом ОТ-кПЦР. Несмотря на близкое родство B. japonicum и S. meliloti, максимальная концентрация 6S РНК в этих бактериях приходилась на разные фазы клеточного роста. Также было показано, что все три 6S РНК образуют комплекс с холоферментом РНКП E. coli. В экспериментах по транскрипции in vitro с радиоактивно-меченными нуклеозидтрифосфатами был впервые продемонстрирован синтез 17–24-звенных пРНК для всех трех 6S РНК. При этом образующиеся пРНК остаются связанными с соответствующими 6S РНК, что является их характерной особенностью. Работа поддержана грантом РФФИ № 19-04-00791.